Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "Skolnick, Jeffrey" wg kryterium: Autor


Wyświetlanie 1-3 z 3
Tytuł:
Computer simulations of protein folding with a small number of distance restraints.
Autorzy:
Sikorski, Andrzej
Kolinski, Andrzej
Skolnick, Jeffrey
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1043733.pdf
Data publikacji:
2002
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
lattice models
NMR structure refinement
Monte Carlo method
reduced protein models
protein folding
Opis:
A high coordination lattice model was used to represent the protein chain. Lattice points correspond to amino-acid side groups. A complicated force field was designed in order to reproduce a protein-like behavior of the chain. Long-distance tertiary restraints were also introduced into the model. The Replica Exchange Monte Carlo method was applied to find the lowest energy states of the folded chain and to solve the problem of multiple minima. In this method, a set of replicas of the model chain was simulated independently in different temperatures with the exchanges of replicas allowed. The model chains, which consisted of up to 100 residues, were folded to structures whose root-mean-square deviation (RMSD) from their native state was between 2.5 and 5 Å. Introduction of restrain based on the positions of the backbone hydrogen atoms led to an improvement in the number of successful simulation runs. A small improvement (about 0.5 Å) was also achieved in the RMSD of the folds. The proposed method can be used for the refinement of structures determined experimentally from NMR data.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2002, 49, 3; 683-692
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Prediction of protein secondary structure by neural networks: encoding short and long range patterns of ammo acid packing
Autorzy:
Vieth, Michał
Koliński, Andrzej
Skolnick, Jeffrey
Sikorski, Andrzej
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1045567.pdf
Data publikacji:
1992
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 1992, 39, 4; 369-392
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-3 z 3

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies