Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "Schmidt, Marcin" wg kryterium: Autor


Wyświetlanie 1-6 z 6
Tytuł:
The HPV16 E2 transcriptional regulator mode of action depends on the physical state of the viral genome
Autorzy:
Schmidt, Marcin
Olejnik, Agnieszka
Goździcka-Józefiak, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1041324.pdf
Data publikacji:
2005
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
E2
chromatin
transcription
HPV
retinol
steroid hormones
LCR
Opis:
Human papillomavirus (HPV) infection is a major risk factor for the development of cervical cancer. The HPV-induced immortalization of epithelial cell usually requires integration of the viral DNA into the host cell genome. The integration event causes disruption of the E2 gene and this is followed by overexpression of the E6 and E7 oncoproteins. The E2 protein is a transcription factor that regulates expression of the E6 and E7 oncoproteins by binding to four sites within the viral long control region. We used an in vitro cell culture model to explore the role of the E2 protein in the transcriptional control of the HPV16 long control region. Employing transient and stable transfection experiments we simulated the episomal and integrated states of the viral genome, respectively. We show that the E2 protein up-regulates E6/E7 transcription from episomal DNA but represses it in the case of integrated DNA. The activator function of the E2 protein seems to counteract the repressive chromatin structure formed over episomal DNA. Steroid hormones and retinol also modulate oncogene transcription differently depending on the physical structure of the viral DNA. Our data suggest regulatory mechanisms involving interactions between the E2 protein and nuclear hormone receptors.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2005, 52, 4; 823-832
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
SpaCBA sequence instability and its relationship to the adhesion efficiency of Lactobacillus casei group isolates to Caco-2 cells
Autorzy:
Markowicz, Corinna
Olejnik-Schmidt, Agnieszka
Borkowska, Monika
Schmidt, Marcin
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039301.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
Lactobacillus
adhesion
spaCBA
Opis:
The ability to adhere to enterocytes is one of the key features of probiotics. This process involves a number of factors, among which the important role of pili was demonstrated. Some Lactobacillus species are confirmed to have heterotrimeric spaCBA type pili. The aim of this study was to identify spaCBA pili in strains of selected Lactobacillus spp. and assess the impact of their presence and sequence polymorphism on the adhesion of these strains to enterocytes. Total 20 bacterial strains of L. rhamnosus, L. casei and L. paracasei were tested. The presence of pilus specific proteins coding genes spaA, spaB and spaC was verified by PCR in order to identify the presence of sequence polymorphism in the genes possibly affecting the structure of the spaCBA pilus. To correlate spaCBA polymorphism to adhesion capability the adhesion assay was carried out using Caco-2 cell line. The effectiveness of the adhesion was measured using a scintillation counter. The Lactobacillus strains analyzed showed the adhesion to Caco-2 enterocytes capability from 0.6% to 19.6%. The presence of spaCBA pili is a factor increasing the adhesion efficiency of Lactobacillus spp. to Caco-2 enterocytes. Lack of these structures on the surface of bacterial cells results in the reduction in adhesion efficiency, indicating its important role in the adhesion process. But not in all cases the correlation between the presence of protein spaCBA structures and adhesion efficiency was observed, what may indicate the important role of other factors in adhesion of analyzed strains to Caco-2 cells.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2014, 61, 2; 341-347
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Impact of DNA microarray data transformation on gene expression analysis - comparison of two normalization methods
Autorzy:
Schmidt, Marcin
Handschuh, Luiza
Zyprych, Joanna
Szabelska, Alicja
Olejnik-Schmidt, Agnieszka
Siatkowski, Idzi
Figlerowicz, Marek
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039855.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
microarray
data normalization
enterocyte
transcriptome analysis
probiotic
adhesion
gene expression profiling
Opis:
Two-color DNA microarrays are commonly used for the analysis of global gene expression. They provide information on relative abundance of thousands of mRNAs. However, the generated data need to be normalized to minimize systematic variations so that biologically significant differences can be more easily identified. A large number of normalization procedures have been proposed and many softwares for microarray data analysis are available. Here, we have applied two normalization methods (median and loess) from two packages of microarray data analysis softwares. They were examined using a sample data set. We found that the number of genes identified as differentially expressed varied significantly depending on the method applied. The obtained results, i.e. lists of differentially expressed genes, were consistent only when we used median normalization methods. Loess normalization implemented in the two software packages provided less coherent and for some probes even contradictory results. In general, our results provide an additional piece of evidence that the normalization method can profoundly influence final results of DNA microarray-based analysis. The impact of the normalization method depends greatly on the algorithm employed. Consequently, the normalization procedure must be carefully considered and optimized for each individual data set.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2011, 58, 4; 573-580
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wielowymiarowa analiza zmienności genotypowej cech rolniczych w kolekcji zasobów genowych kupkówki pospolitej (Dactylis glomerata L.)
Multivariate analysis of genotypic diversity of agronomic traits in orchardgrass (Dactylis glomerata L.) germplasm collection
Autorzy:
Studnicki, Marcin
Mądry, Wiesław
Schmidt, Jan
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2198216.pdf
Data publikacji:
2012-03-29
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
kupkówka pospolita
wielowymiarowe metody statystyczne
zasoby genowe
germplasm collection
multivariate analyses
orchardgrass
Opis:
W pracy przedstawiono analizę jedno- i wielocechowej zmienności 1971 obiektów, pocho¬dzących z polskiej kolekcji zasobów genowych kupkówki pospolitej, pod względem 8 cech ilościowych. W pierwszym kroku analizy wykonano wstępną ocenę zmienności obiektów, oddzielnie dla każdej cechy, z wykorzystaniem metod statystyki opisowej. Dalsze kroki polegały na przepro¬wadzeniu analizy składowych głównych oraz analizy skupień za pomocą metody UPGMA na standaryzowanych danych dla badanych cech. Zastosowano także analizę zmiennych kanonicznych dla wydzielonych grup (skupień). Stwierdzono, że wysokość roślin i plon zielonej masy są cechami o największej zmienności genotypowej spośród wszystkich badanych cech w kolekcji. Pierwsze trzy składowe główne wyjaśniały ponad 69% ogólnej zmienności 8 cech ilościowych w badanej kolekcji. Wyniki analizy zmiennych kanonicznych wskazują, że wysokość roślin oraz liczba dni do kłoszenia i kwitnienia odznaczały się relatywnie najsilniejszą zdolnością dyskryminacyjną pomiędzy dziesięcio¬ma grupami, wydzielonymi za pomocą analizy skupień.
In this paper an analysis of genotypic diversity for 8 quantitative agronomic traits in 1971 accessions belonging to the Polish orchardgrass germplasm collection was presented. Evaluation of diversity in the accessions was performed in four steps. In the first step a preliminary analysis of variation was done separately for each trait using descriptive statistics. Then, principal component analysis (PCA) and cluster UPGMA analysis (CA) were used on standardized data for the studied traits. Also, canonical discriminate analysis (CDA) was done to assess discriminating value of the traits to distinguish clusters delivered by CA. Plant height and total seasonal yield were most variable traits among all the traits. The first three principal components explained above 69% of the total variation within the accessions in the collection for the 8 traits. The results of the CDA suggested that plant height and days to inflorescence emergence and flowering were the major discriminatory characteristics for the ten distinguished clusters.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2012, 263; 105-127
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Nie wierzę w obiektywizm
Autorzy:
Schmidt, Mária (1953- ).
Powiązania:
Tygodnik Powszechny 2012, nr 18/19. Dod. "Anamneses 5 - Totalitaryzm w przestrzeniach muzealnych", s. 16-17
Współwytwórcy:
Żyła, Marcin. Opracowanie
Data publikacji:
2012
Tematy:
Terror Háza (Budapeszt)
Międzynarodowy Festiwal Historyczny Wiek XX. Anamneses (1 ; 2012 ; Wrocław)
Muzea historyczne Węgry
Totalitaryzm Węgry
Opis:
Fot.
Dostawca treści:
Bibliografia CBW
Artykuł
Tytuł:
Egzoszkielet na rękę - koncepcja i rozwój w ramach grantu "Rzeczy są dla ludzi"
Arm exoskeleton - concept and development under the grant "Things are for people"
Autorzy:
Rojek, Izabela
Kaczmarek, Mariusz
Kotlarz, Piotr
Kempiński, Marcin
Mikołajewski, Dariusz
Szczepański, Zbigniew
Kopowski, Jakub
Nowak, Joanna
Macko, Marek
Schmidt, Tomasz
Leszczyński, Paweł
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/41205929.pdf
Data publikacji:
2022
Wydawca:
Uniwersytet Kazimierza Wielkiego w Bydgoszczy
Tematy:
ręka
druk 3D
biomechanika
projektowanie wspomagane komputerowo
egzoszkielet
hand
additive manufacturing
biomechanics
computer-aided design
exoskeleton
Opis:
Instytut Informatyki oraz Wydział Mechatroniki Uniwersytetu Kazimierza Wielkiego wraz z firmą Edurewolucje Sp. z o. o. z/s w Bydgoszczy w ramach konkursu Narodowego Centrum Badań i Rozwoju "Rzeczy są dla ludzi" otrzymali dofinansowanie na realizację przedsięwzięcia pn. „Opracowanie funkcjonalnego egzoszkieletu ręki do aktywnego treningu i rehabilitacji”. Celem projektu jest realizacja prac badawczo-rozwojowych prowadzących do opracowania innowacyjnej technologii pozwalającej na samodzielną rehabilitację osób ze szczególnymi potrzebami (przy udziale rehabilitantów i fizjoterapeutów). Projekt przewiduje skonstruowanie prototypu mechanicznego robota rehabilitacyjnego tzw. egzoszkieletu ręki, który wspomoże proces rehabilitacji osób z jej niedowładem oraz innymi szczególnymi potrzebami dotyczącymi braku mobilności w obszarze ręki. W ramach projektu powstanie specjalistyczne, dedykowane oprogramowanie, które będzie dostosowywało siłę i rodzaj pracy egzoszkieletu na rękę do aktualnych potrzeb i celów programu rehabilitacyjnego pacjenta. Celem niniejszej pracy jest przybliżenie powstania i rozwoju ww. koncepcji w ramach zespołu projektowego podczas dotychczasowych prac projektowych.
The Institute of Computer Science and the Faculty of Mechatronics at Kazimierz Wielki University, together with Edurewolucje Sp. z o. o. z/s in Bydgoszcz, received funding under the 'Things are for people' competition of the National Centre for Research and Development for the project entitled 'Development of a functional arm exoskeleton for active training and rehabilitation'. The aim of the project is to carry out research and development work leading to the development of an innovative technology allowing for the independent rehabilitation of people with special needs (with the participation of rehabilitators and physiotherapists). The project envisages the construction of a prototype of a mechanical rehabilitation robot, the so-called hand exoskeleton, which will support the process of rehabilitation of people with paresis and other specific needs regarding lack of mobility in the hand area. The project will develop specialised, dedicated software that will adapt the strength and type of work of the hand exoskeleton to the current needs and goals of the patient's rehabilitation programme. The aim of this paper is to provide an insight into the origins and development of the above concept within the project team during the project work to date.
Źródło:
Studia i Materiały Informatyki Stosowanej; 2022, 14, 3; 26-32
1689-6300
Pojawia się w:
Studia i Materiały Informatyki Stosowanej
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-6 z 6

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies