Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "Maciejczyk, Maciej" wg kryterium: Autor


Wyświetlanie 1-4 z 4
Tytuł:
Solution structure of conformationally restricted vasopressin analogues.
Autorzy:
Trzepałka, Emilia
Oleszczuk, Marta
Maciejczyk, Maciej
Lammek, Bernard
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1043316.pdf
Data publikacji:
2004
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
vasopressin
X-PLOR
NMR spectroscopy
EDMC
peptide conformation
Opis:
In recent years, a massive effort has been directed towards designing potent and selective antagonists of neurohypophyseal hormones substituted at position 3. Modification of vasopressin at position 3 with 4,4'-biphenylalanine results in pharmacologically inactive analogues. Chemically, this substitution appears to vary only slightly from those previously made by us (1-Nal or 2-Nal), which afforded potent agonists of V2 receptors. In this situation, it seemed worthwhile to study the structure of the analogues with 4,4'-biphenylalanine (BPhe) at position 3 in aqueous solution using NMR spectroscopy and total conformational analysis. This contribution is part of extensive studies aimed at understanding spatial structures of 3-substituted [Arg8]vasopressin analogues of different pharmacological properties. NMR data were used to calculate 3D structures for all the analogues using two methods, EDMC with the ECEPP/3 force field, and molecular dynamic with the simulated annealing (SA) algorithm. The structures obtained by the first method show a better fit between the NMR spectral evidence and the calculation for all the peptides.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2004, 51, 1; 33-49
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Free energy of helix propagation in short polyalanine chains determined from peptide growth simulations of La3+-binding model peptides. Comparison with experimental data
Autorzy:
Maciejczyk, Maciej
Hermans, Jan
Bierzyński, Andrzej
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1041277.pdf
Data publikacji:
2006
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
thermodynamics
peptide
helix-coil equilibrium
thermodynamic integration
molecular dynamics
Opis:
Molecular dynamics (MD) is, at present, a unique tool making it possible to study, at the atomic level, conformational transitions in peptides and proteins. Nevertheless, because MD calculations are always based on a more or less approximate physical model, using a set of approximate parameters, their reliability must be tested by comparison with experimental data. Unfortunately, it is very difficult to find a peptide system in which conformational transitions can be studied both experimentally and using MD simulations so that a direct comparison of the results obtained in both ways could be made. Such a system, containing a rigid α-helix nucleus stabilized by La3+ coordination to a 12-residue sequence taken from an EF-hand protein has recently been used to determine experimentally the helix propagation parameters in very short polyalanine segments (Goch et al. (2003) Biochemistry 42: 6840-6847). The same parameters were calculated here for the same peptide system using the peptide growth simulation method with, alternatively, charmm 22 and cedar potential energy functions. The calculated free energies of the helix-coil transition are about two times too large for cedar and even three times too large for charmm 22, as compared with the experimental values. We suggest that these discrepancies have their origin in the incorrect representation of unfolded peptide backbone in solution by the molecular mechanics force fields.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2006, 53, 1; 121-130
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Oxidative stress assessment in lung of lead-exposed rats
Ocena stresu oksydacyjnego w płucach szczurów narażonych na ołów
Autorzy:
Machoń-Grecka, Anna
Kaletka, Zbigniew
Pryzwan, Tomasz
Szczęsny, Patrycja
Maciejczyk, Maciej
Kasperczyk, Aleksandra
Dobrakowski, Michał
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1035320.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Tematy:
"lead poisoning"
"lung"
"oxidative stress"
Opis:
Objective. Little is known about lead toxic effects on lung tissue. Therefore, the present study was undertaken to estimate the values of selected parameters related to oxidative stress in the lung of rats exposed to lead acetate. Material and methods. Twenty male Wistar rats were randomly divided into two groups: control (n=10) and lead-treated (n=10). The lead-treated group was fed with regular rat chow and distilled water supplemented with lead acetate (1200 ppm) for 7 days. In lung homogenates, the level of malondialdehyde (MDA) and the activities of superoxide dismutase (SOD, CuZn-SOD, Mn-SOD), catalase (CAT), glutathione peroxidase (GPx), glutathione reductase (GR), and glutathione-S-transferase (GST) were determined. Results. The activity of catalase was significantly higher in the lung of lead-treated rats than in controls by 98%. Similarly, the activities of GPx and GR were higher by 57% and 45%, respectively. The level of MDA was also higher in lead-exposed rats than in the control group by 52%. The remaining parameters did not differ between the studied groups. Conclusions. Lead exposure stimulates antioxidant defense mechanisms in rat lung; however, these mechanisms are insufficient to prevent lead-induced oxidative stress development
Wstęp. Toksyczny wpływ ołowiu na tkankę płucną jest słabo poznany. W związku z tym, prezentowany eksperyment miał na celu ocenę zmian w wybranych parametrach związanych ze stresem oksydacyjnym w tkance płucnej u szczurów narażonych na octan ołowiu. Materiał i metody. Dwadzieścia szczurów szczepu Wistar, podzielono na dwie grupy: kontrolną (n=10) i badaną z podawanym ołowiem (n=10). Szczury z grupy badanej były regularnie karmione granulatem dla szczurów i pojone wodą destylowaną z octanem ołowiu (1200 ppm) przez 7 dni. W homogenatach z tanki płucnej oznaczany był poziom malonylodialdehydu (MDA) i aktywność dysmutazy ponadtlenkowej (SOD, CuZn-SOD, Mn-SOD), katalazy (CAT), peroksydazy glutationowej (GPx), reduktazy glutationowej (GR), oraz transferazy glutationowej (GST). Wyniki. Aktywność katalazy była o 98% wyższa w grupie badanej aniżeli w grupie kontrolnej. Podobnie, aktywności GPx i GR były wyższe odpowiednio o 57% i 45%. Poziom MDA był również wyższy w grupie badanej, o 52% w porównaniu do grupy kontrolnej. Pozostałe parametry nie różniły się pomiędzy grupami. Wnioski. Ekspozycja na ołów stymuluje mechanizmy obrony antyoksydacyjnej, jednakże mechanizmy te są niewystarczające by zapobiec stresowi oksydacyjnemu wywołanemu działaniem ołowiu.
Źródło:
Medycyna Środowiskowa - Environmental Medicine; 2018, 21, 1; 21-24
1505-7054
2084-6312
Pojawia się w:
Medycyna Środowiskowa - Environmental Medicine
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Optymalizacja systemu kontroli jakości akceleratora Halcyon
Halcyon accelerator quality control system optimization
Autorzy:
Raczkowski, Maciej
Janiszewska, Marzena
Maciejczyk, Adam
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2146805.pdf
Data publikacji:
2021
Wydawca:
Indygo Zahir Media
Tematy:
optymalizacja VMAT QA
akcelerator Halcyon
MPC – Machine Performance Check
optimization VMAT QA
Halcyon accelerator
Opis:
Cel. Celem pracy jest przedstawienie metody optymalizacji kontroli jakości wiązki oraz poprawności działania kolimatora MLC akceleratora Halcyon. Punktem wyjścia do optymalizacji systemu kontroli był algorytm MPC (Machine Performance Check). Opracowanie niezależnych metod weryfikacji działania kolimatora SX2 oraz kontroli stabilności wiązki akceleratora Halcyon oparto na niezależnych od MPC algorytmach. Opracowany system kontroli jakości skonfrontowano z systemem MPC pod względem jakościowym i ilościowym. Materiały i metoda. Optymalizacja kontroli jakości stabilności wiązki oraz poprawności działania kolimatora SX2 oparta została o algorytmy aplikacji MyQA. Testy dla wiązki promieniowania objęły sprawdzenie stabilności wydajności oraz stałości energii. Druga grupa testów związanych z wiązką to testy geometryczne obejmujące analizę takich parametrów, jak: symetria, płaskość, półcień, rozmiar oraz centrum wiązki promieniowania. Testy kolimatora SX2 to testy stabilności, powtarzalności i dokładności pozycjonowania listków MLC oraz poprawność pracy kolimatora MLC dla złożonych układów, dla techniki IMRT oraz VMAT. Oprogramowanie myQA bazuje na predefiniowanych algorytmach opartych na wytycznych raportu grupy zadaniowej AAPM 142. W celu dostosowania wytycznych raportu AAPM-142 do potrzeb rozwiązań konstrukcyjnych aparatu Halcyon zbudowano bazę niezależnych testów opartych na algorytmach aplikacji myQA i porównano z testami zaproponowanymi przez firmę Varian w oprogramowaniu MPC. Wyniki. Analiza parametrów wiązki dla zbudowanego sytemu QA okazała się głębsza niż w przypadku testów dla algorytmu MPC (obraz 1a i b). Testy MPC dotyczące jakości wiązki to stałość wydajności oraz jednorodności. Wyniki obu testów przedstawione są w formie pojedynczej wartości z ustalonymi poziomami tolerancji: 4% i 2%. Zaproponowany system kontroli, oprócz testu stałości wydajności (obraz 2a) z dwoma poziomami tolerancji (warning 1,0%, error 1,5%), rozszerza kontrole wiązki o stałości energii oraz symetrii, płaskości, półcienia, rozmiaru i położenia środka (obraz 2b). Poziomy tolerancji dla testów jakościowych wiązki, w odróżnieniu od systemu MPC, to szereg wartości opartych na wytycznych raportu IAEA TRS 389. Kontrola pracy kolimatora SX2 w systemie MPC to analiza dokładności i odtwarzalności ustawienia dla pojedynczych listków, dla układów statycznych. Zaproponowany system QA pozwala testować stabilność, powtarzalność i dokładności pozycjonowania listków MLC dla układów dynamicznych. Dyskusja. Zaproponowany, niezależny system QA, w odróżnieniu od systemu MPC, pozwala na znaczące zmniejszenie poziomów tolerancji dla stałości wydajności oraz wprowadza ich zróżnicowanie dla poszczególnych parametrów geometrycznych wiązki. Przedstawiony system QA pozwala na testowanie dokładności pracy kolimatora MLC dla układów dynamicznych stosowanych w technikach IMRT oraz VMAT. Czas realizacji i dostępność czasowa wyników, jak również możliwość analizy trendów czasowych to mocna strona obu systemów.
Purpose/Objective. The purpose of the work is to present a method for optimizing beam quality control and correct operation of the Halcyon MLC collimator. The starting point for optimizing the control system was the MPC (Machine Performance Check) algorithm. The development of independent methods for verifying the operation of the SX2 collimator and checking the beam stability of the Halcyon accelerator was based on algorithms independent of MPC. Material and methods. Optimization of quality control of beam stability and correctness of SX2 collimator operation was based on MyQA application algorithms. Tests for the radiation beam included checking performance stability and energy constancy. The second group of beam-related tests are geometric tests involving the analysis of parameters such as symmetry, flatness, penumbra, size and center of the radiation beam. SX2 collimator tests are tests of stability, repeatability and accuracy of MLC leaf positioning, and correctness of MLC collimator operation for complex systems, for IMRT and VMAT techniques. MyQA software is based on predefined algorithms based on the guidelines of the A APM 142 task group report. In order to adapt the guidelines of the AAPM-142 report to the needs of the Halcyon design solutions, a database of independent tests based on the myQA application algorithms has been built. Results. The analysis of radiation beam parameters for the built-in control system turned out to be more insightful than in the case of tests proposed by the MPC algorithm (image no. 1). Two MPC tests directly addressing the quality of the radiation beam are stability performance and homogeneity, presented in the form of two numerical values along with time trend analysis. The values obtained in the case of the proposed control system give a much deeper analysis, extended to control energy constancy and symmetry, flatness, penumbra, size and center of the radiation beam (image no. 2). Control of the SX2 collimator operation, in the case of the MPC system, is an analysis of the accuracy and reproducibility of the settings of each individual leaf for static MLC systems. The proposed system allows testing the stability, repeatability and accuracy of MLC leaf positioning for dynamic systems that reflect clinical working conditions. Conclusion. The time needed for the implementation of the presented range of tests is similar for both systems. Both systems offer analysis of time trends and the creation of test reports. The proposed system for controlling the basic parameters of the Halcyon accelerator, unlike the MPC system, allows for a deeper analysis of the beam quality and correctness of the MLC collimator in conditions similar to those prevailing during the implementation of the treatment plan.
Źródło:
Inżynier i Fizyk Medyczny; 2021, 10, 1; 27--38
2300-1410
Pojawia się w:
Inżynier i Fizyk Medyczny
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-4 z 4

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies