Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "Kaźmierkiewicz, Rajmund" wg kryterium: Autor


Wyświetlanie 1-8 z 8
Tytuł:
The influence of modification at position 2 on the side-chain conformation in oxytocin analogs
Autorzy:
Śmiech, Bogusław
Kaźmierkiewicz, Rajmund
Lammek, Bernard
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1041276.pdf
Data publikacji:
2006
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
oxytocin analogs
torsional angle distribution
EDMC
Opis:
The nonapeptide oxytocin (OT) is used in medicine to help begin and/or continue childbirth. Its analogs can be also used to control bleeding following fetus delivery. The main function of oxytocin is to stimulate contraction of uterus smooth muscle and the smooth muscle of mammary glands, thus regulating lactation. This paper describes theoretical simulations of the distribution of the torsional angles χ1 in the non-standard methylated phenylalanine residues of three oxytocin analogs: [(Phe)2o-Me]OT, [(Phe)2m-Me]OT, [(Phe)2p-Me]OT. The conformations of the oxytocin analogs were studied both in vacuum and in solution. We found some correlations between the biological activity of the considered peptides and the side-chain conformations of amino-acid residues 2 and 8.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2006, 53, 1; 113-120
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Signal transmission via G protein-coupled receptors in the light of rhodopsin structure determination.
Autorzy:
Ciarkowski, Jerzy
Drabik, Piotr
Giełdoń, Artur
Kaźmierkiewicz, Rajmund
Ślusarz, Rafał
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1044085.pdf
Data publikacji:
2001
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
signal transduction
neurohypophyseal receptors
molecular modeling
GPCRs
Opis:
G protein-coupled receptors (GPCRs) transducing diverse external signals to cells via activation of heterotrimeric GTP-binding (G) proteins, estimated to mediate actions of 60% of drugs, had been resistant to structure determination until summer 2000. The first atomic-resolution experimental structure of a GPCR, that of dark (inactive) rhodopsin, thus provides a trustworthy 3D prototype for antagonist-bound forms of this huge family of proteins. In this work, our former theoretical GPCR models are evaluated against the new experimental template. Subsequently, a working hypothesis regarding the signal transduction mechanism by GPCRs is presented.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2001, 48, 4; 1203-1207
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molecular docking-based test for affinities of two ligands toward vasopressin and oxytocin receptors.
Autorzy:
Ślusarz, Rafał
Kaźmierkiewicz, Rajmund
Giełdoń, Artur
Lammek, Bernard
Ciarkowski, Jerzy
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1044173.pdf
Data publikacji:
2001
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
simulated annealing
bioligand docking
GPCR receptor/bioligand interaction
molecular dynamics
Opis:
Molecular docking simulations are now fast developing area of research. In this work we describe an effective procedure of preparation of the receptor-ligand complexes. The amino-acid residues involved in ligand binding were identified and described.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2001, 48, 1; 131-135
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Design of a knowledge-based force field for off-lattice simulations of protein structure
Autorzy:
Liwo, Adam
Ołdziej, Stanisław
Kaźmierkiewicz, Rajmund
Groth, Małgorzata
Czaplewski, Cezary
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1044925.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 1997, 44, 3; 527-547
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molecular modelling study of the role of cholesterol in the stimulation of the oxytocin receptor.
Autorzy:
Politowska, Ewa
Kaźmierkiewicz, Rajmund
Wiegand, Volker
Fahrenholz, Falk
Ciarkowski, Jerzy
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1044168.pdf
Data publikacji:
2001
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
cholesterol
AutoDock 2.4
cholecystokinin receptor type β
oxytocin receptor
GPCR
sterols
Opis:
Cholesterol, an integral component of membranes in Eucaryota, is a modifier of membrane properties. In vivo studies have demonstrated that cholesterol can also modulate activities of some G protein-coupled receptors (GPCRs), which are integral membrane proteins. This can result either from an effect of cholesterol on the membrane fluidity or from specific interactions of the membrane cholesterol with the receptor, as recently demonstrated for the cholecystokinin type β (CCKRβ) or the oxytocin receptor (OTR). Using molecular modelling, we studied conformational preferences of cholesterol and several of its analogues. Subsequently, we simulated the distributions of their preferred conformations around the surface of OTR, CCKRβ and a chimeric oxytocin/cholecystokinin receptor. Consequently, we suggest residues on the surface of OTR which are potentially significant in the OTR/cholesterol interaction.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2001, 48, 1; 83-93
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molecular simulations with high-performance computers
Autorzy:
Arłukowicz, Piotr
Biernat, Ewa
Ciarkowski, Jerzy
Czaplewski, Cezary
Groth, Małgorzata
Kaźmierkiewicz, Rajmund
Liwo, Adam
Maksimiak, Katarzyna
Nowacka, Małgorzata
Ołdziej, Stanisław
Rodziewicz, Sylwia
Woźniak, Edyta
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1953470.pdf
Data publikacji:
1997
Wydawca:
Politechnika Gdańska
Opis:
In this article, we present the work carried out in our group on various fields of theoretical biochemistry. Our main fields of research are as follows: i) design of an algorithm for de novo prediction of protein structure from amino-acid sequence using energetic criteria, ii) theoretical modeling of the structure and dynamics of neurohypophyseal-hormone receptors, iii) quantum-mechanical investigation of reactions in organic chemistry and biochemistry, and iv) theoretical conformational analysis of small peptides using experimental information. The performance of different machines, depending on the kind of calculations with special focus on the exploitation of parallelism as well as the applicability and performance of various commercial, free, and our home- made software (AMBER. GAUSSIAN, ECEPPAK, GAMESS, SYBYE, MSI/Biosym) available at TASK and the importance of graphical processing of the data are discussed.
Źródło:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk; 1997, 1, 1; 21-37
1428-6394
Pojawia się w:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-8 z 8

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies