Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "two-dimensional gel electrophoresis" wg kryterium: Wszystkie pola

  Lista filtrów
Wyrównaj
    Wyświetlanie 1-6 z 6
    Tytuł:
    Mapping of polar fox renal cortex proteins using two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry – a preliminary study
    Autorzy:
    Ciechanowicz, A.K.
    Ozgo, M.
    Stanski, L.R.
    Herosimczyk, A.
    Piotrowska, A.
    Szymeczko, R.
    Laszczynska, M.
    Skrzypczak, W.F.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/30461.pdf
    Data publikacji:
    2014
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Opis:
    The aim of the present study was to establish protein map of polar fox (Alopex lagopus) renal cortex. Kidney cortex proteins of isoelectric point ranging from 3 to 10 were analysed using two-dimensional electrophoresis and MALDI-TOF mass spectrometry. Sixteen protein spots corresponding to thirteen different gene products were identified. These proteins were divided into following groups: lipid and fatty acid metabolism, amino acid metabolism, energetic pathways, regulatory proteins, transport proteins and structural proteins. This is the first attempt to create reproducible 2-D map, of renal cortex proteins characteristic for polar foxes, used as animal model for carnivores. It is worth emphasizing that the results of this study may broaden currently available protein databases.
    Źródło:
    Polish Journal of Veterinary Sciences; 2014, 17, 2; 231-237
    1505-1773
    Pojawia się w:
    Polish Journal of Veterinary Sciences
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Primary results of 2-dimensional electrophoresis for protein studies of Gentiana kurroo Royle somatic embryos derived from long-term embryogenic cell suspensions
    Autorzy:
    Niedziela, A.
    Rybczynski, J.J.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/56507.pdf
    Data publikacji:
    2014
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Botaniczne
    Tematy:
    two dimensional gel electrophoresis
    protein
    Gentiana kurroo
    somatic embryo
    embryogenic cell
    cell suspension
    Opis:
    Two-dimensional gel electrophoresis was used to compare protein expression profiles between various stages of Gentiana kurroo Royle somatic embryos. Seven distinct stages (I–VII) were pointed out and measured from long-term embryogenic cell suspension. Isoelectric focusing was done in the pH intervals 3–10, and the second dimension was carried out with 13% SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. Dependent on the stage from about 400 (stage IV) to more than 700 (stage II) protein spots were totally detected. The molecular weight of abundant proteins range from 12 to 70 kDa, however, majority of proteins were located between 20–49 kDa spots on the gels. The highest difference in the number of spots appeared in the case of globular embryo (stage I) and elongated cotyledonary stage (stage VII) with differences being about 130 spots. The relevance of embryogenic cell suspension choice for proteomic analysis as well as expediency of the increasing number of particular embryo stages is discussed.
    Źródło:
    Acta Societatis Botanicorum Poloniae; 2014, 83, 3
    0001-6977
    2083-9480
    Pojawia się w:
    Acta Societatis Botanicorum Poloniae
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Proteome responses to herbicidal stress in maize
    Autorzy:
    Tyczewska, A.
    Bielinska, I.
    Gracz, J.
    Sikora, M.
    Twardowski, T.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/951291.pdf
    Data publikacji:
    2015
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    abiotic stress
    plant response
    maize
    proteomic analysis
    gene expression
    two dimensional gel electrophoresis
    Źródło:
    BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2015, 96, 1
    0860-7796
    Pojawia się w:
    BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Dwuwymiarowa elektroforeza żelowa: od eksperymentu po profile ekspresji. Część pierwsza - eksperyment
    Two-dimensional gel electrophoresis: from experiment to protein expresion profiles. Part one - experiment
    Autorzy:
    Suchwałko, A.
    Podbielska, H.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/262044.pdf
    Data publikacji:
    2010
    Wydawca:
    Politechnika Wrocławska. Wydział Podstawowych Problemów Techniki. Katedra Inżynierii Biomedycznej
    Tematy:
    elektroforeza żelowa
    2DE
    eksperyment
    analiza obrazu
    schemat analizy 2-DE
    gel electrophoresis
    2-DE
    experiment
    image analysis
    2-DE analysis workflow
    Opis:
    Dwuwymiarowa (dwukierunkowa) elektroforeza żelowa (2-DE) jest metodą znaną od lat 70. poprzedniego stulecia. Zainteresowanie badaczy metodą 2-DE wynika z możliwości separacji nawet kilku tysięcy białek w jednym żelu, co pozwala na ich detekcję i identyfikację. Dzięki wysokiej rozdzielczości wyników separacji możliwe staje się ustalenie roli biologicznej poszczególnych białek czy odkrywanie wpływu czynników zewnętrznych na organizmy żywe na poziomie proteomu. Metoda 2-DE wciąż ewoluuje. W ostatniej dekadzie nastąpił ogromny postęp w sposobie przeprowadzania eksperymentów z dużą powtarzalnością. Zmieniło się też całkowicie podejście do analizy obrazów żeli i wykorzystywane do tego celu algorytmy. Ze względu na tak szybki rozwój technik dwuwymiarowej elektroforezy żelowej autorzy postanowili przedstawić obecny stan wiedzy w tym zakresie. Praca składa się z dwu części. W pierwszej opisano zmiany, jakie zaszły w technikach przeprowadzania eksperymentów elektroforetycznych. Druga część skupia się na analizie obrazów uzyskanych za pomocą metody 2-DE, z uwzględnieniem zmian w schemacie analizy. Pierwsza część pracy koncentruje się na eksperymencie dwuwymiarowej elektroforezy żelowej. Opisano poszczególne kroki eksperymentu: od przygotowania próbki, przez ładowanie próbek do pierwszego wymiaru, IEF, SDS-PAGE, barwienie żeli, aż po zapis obrazów żeli. Praca nie porusza szczegółów biochemicznych eksperymentu. Opisane zostały również formaty plików, technika DIGE, wpływ eksperymentu na dalszą analizę, modyfikacje posttranslacyjne oraz pozyskanie próbek protein z żeli do ewentualne identyfikacji za pomocą innych technik proteomicznych.
    Two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) is a method commonly used since seventies of the previous century. It owns its non weakening interest of researchers because of the possibility of separation even a few thousands of proteins in one gel, what allows for protein detection and identification. Thanks to high resolution of separation results, it is possible to determine a biological role of particular proteins or to discover influence of external factors on living organisms on the proteome level. Though 2-DE is still evolving. In the last decade, a great progress has been made in the way of performing experiments and their reproducibility. Approach to the analysis of gel images and algorithms used for the analysis have been entirely changed. For the reason of such instant changes of methods and techniques of the two-dimensional gel electrophoresis, the authors decided to describe state of the art. This work consists of two parts. The first part describes changes that have been made in performing of electrophoretic experiments. The second part concentrates on the analysis of obtained images, with emphasis the analysis workflow. The first part focuses on the experiment of the dwo-dimensional gel electrophoresis. Description of particular steps of the experiment is given: from the sample preparation, through loading of samples for the first dimension, IEF, SDS-PAGE, gels staining, to recording of gel images. This work does not bring up biochemical details of the experiment. File formats, DIGE technology, influence of the expriment on the further analysis, posttraslational modifications and acquisition of protein samples from gels for identification using other proteomic techniques have been described in detail.
    Źródło:
    Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna; 2010, 16, 3; 285-292
    1234-5563
    Pojawia się w:
    Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Comparative proteomic analysis of Bombyx mori hemolymph and fat body after calorie restriction
    Autorzy:
    Chen, Huiqing
    Li, Yijia
    Chen, Keping
    Yao, Qin
    Li, Guohui
    Wang, Lin
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1040312.pdf
    Data publikacji:
    2010
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Biochemiczne
    Tematy:
    calorie restriction
    Bombyx mori
    two-dimensional gel electrophoresis
    proteomic analysis
    MALDI-TOF/TOF MS
    Opis:
    Calorie restriction (CR) is known to extend life span from yeast to mammals. To gain an insight into the effects of CR on growth and development of the silkworm Bombyx mori at protein level, we employed comparative proteomic approach to investigate proteomic differences of hemolymph and fat body of the silkworm larvae subjected to CR. Thirty-nine differentially expressed proteins were identified by MALDI TOF/TOF MS. Among them, 19 were from the hemolymph and 20 from the fat body. The hemolymph of the CR group contained two down-regulated and 17 up-regulated proteins, whereas the fat body contained 15 down-regulated and five up-regulated ones. These proteins belonged to those functioning in immune system, in signal transduction and apoptosis, in regulation of growth and development, and in energy metabolism. Our results suggest that CR can alter the expression of proteins related to the above four aspects, implying that these proteins may regulate life span of the silkworm through CR.
    Źródło:
    Acta Biochimica Polonica; 2010, 57, 4; 505-511
    0001-527X
    Pojawia się w:
    Acta Biochimica Polonica
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Dwuwymiarowa elektroforeza żelowa: od eksperymentu po profile ekspresji. Część druga - analiza obrazu
    Two-dimensional gel electrophoresis: from experiment to protein expresion profiles. Part two - image analysis
    Autorzy:
    Suchwałko, A.
    Podbielska, H.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/261982.pdf
    Data publikacji:
    2010
    Wydawca:
    Politechnika Wrocławska. Wydział Podstawowych Problemów Techniki. Katedra Inżynierii Biomedycznej
    Tematy:
    elektroforeza żelowa
    2DE
    analiza porównawcza
    schemat analizy 2-DE
    mapa proteomowa
    segmentacja obrazu
    detekcja plam
    identyfikacja protein
    gel electrophoresis
    2-DE
    differential image analysis
    2-DE analysis workflow
    proteome map
    image segmentation
    spot detection
    protein identification
    Opis:
    Dwuwymiarowa (dwukierunkowa) elektroforeza żelowa (2-DE) jest metodą znaną od lat siedemdziesiątych poprzedniego stulecia. Zainteresowanie badaczy metodą 2-DE wynika z możliwości separacji nawet kilku tysięcy białek w jednym żelu, co pozwala na i ch detekcję i identyfikację. Dzięki wysokiej rozdzielczości wyników separacji możliwe staje się ustalenie roli biologicznej poszczególnych białek czy odkrywanie wpływu czynników zewnętrznych na organizmy żywe na poziomie proteomu. Metoda 2-DE wciąż ewoluuje. W ostatniej dekadzie nastąpił ogromny postęp w sposobie przeprowadzania eksperymentów z dużą powtarzalnością. Zmieniło się też całkowicie podejście do analizy obrazów żeli i wykorzystywane do tego celu algorytmy. Ze względu na tak szybki rozwój technik dwuwymiarowej elektroforezy żelowej, autorzy postanowili przedstawić obecny stan wiedzy w tym zakresie. Praca składa się z dwu części. W pierwszej opisano zmiany, jakie zaszły w technikach przeprowadzania eksperymentów elektroforetycznych. Draga część skupia się na analizie obrazów uzyskanych za pomocą metody 2-DE, z uwzględnien i em zmian w schemacie analizy. Druga część pracy to opis dwóch schematów analizy: klasycznego i obecnie stosowanego. Szczegółowo opracowane zostały metody analizy pojedynczego obrazu 2-DE oraz analizy porównawczej serii obrazów. Przedstawione są algorytmy stosowane do normalizacji, segmentacji obrazu, detekcji plam, dopasowywania do siebie obrazów czy tworzenia map proteomowych jako najważniejsze w całej analizie. Opisano również generowanie profili ekspresji, metody identyfikacji protein oraz internetowe bazy danych 2-DE. Autorzy nie pominęli tak ważnego zagadnienia, jak sposoby porównywania systemów analizujących dane 2-DE. Ta część pracy podsumowuje rozwój, jaki nastąpił wostatnim dziesięcioleciu w metodach stosowanych w analizie komputerowej obrazów 2-DE, którego najważniejszym krokiem było opracowanie nowego schematu analizy, opartego na tworzeniu map proteomowych.
    Two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) is a method commonly used since seventies of the previous cesatury. It owns its non weakening interest of researchers because of the possibility of separation even a few thousands of proteins in one gel, what allows for protein detection a n d identification. Thanks to high resolution of separation results, it is possible to determine a biological role of particular proteins or to discover influence of extemal factors on living organisms on t h e proteome level. 2-DE i s stilł evolving. In t h e last decade, a great progress has be en made in t h e way of performing experiments and their reproducibility. Approach to the analysis of gel images and algorthms used for the analysis have been entirely changed. For the reason of suchinstant changes of methods a n d techniques of the two-dimensional gel electrophoresis, the authors decided to describe state of the art. This work consists of two parts. The first part describes changes that have b e e n made in performing of electrophoretic experiments. The second part concentrates on the analysis of obtained images, with emphasis the analysis workflow. Second part is a description of two analysis workflows: the classical one and the currentiy used one. Analysis methods of the single 2-DE image and differential analysis of the image series are discussed in detail. Algorthms used for normalization, image segmentation, spot detection, image warping and creation of proteome maps are intrcduced as th e most crucial in the whole analysis. Generation of expression profiles, protein Identification methods, and the Internet databases of the 2-DE data are described. Authors have not missed as important issue as methods of comparison of systems for 2-DE data analysis. This part of the work summarises development that has been made for the last ten years in th e methods used for the computer analysis of 2-DE images. The most important step of this development was elaborat i on of the workflow based on creation of proteome maps.
    Źródło:
    Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna; 2010, 16, 4; 372-380
    1234-5563
    Pojawia się w:
    Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
      Wyświetlanie 1-6 z 6

      Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies