Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "molecular methods" wg kryterium: Wszystkie pola


Tytuł:
Molecular Methods of Characterization and Identification of Globodera Rostochiensis and Globodera Pallida Populations
Autorzy:
Podlewska-Przetakiewicz, Anna
Milczarek, Dorota
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199577.pdf
Data publikacji:
2020-11-27
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
Globodera
inter-and intraspecies identification
molecular methods
potato cyst nematode
Opis:
The cyst nematodes belonging to the genus Globodera are big worldwide problem in countries were Sola-naceaous plants growing. Knowledge of species-composition in populations of Globodera rostochiensis and Globodera pallida is very important for selection of appropriate measure of nematode regulations occurrence. Inter- and intraspecific variability among species of Globodera rostochiensis and Globodera pallida were studied intensively with the use of molecular analyses of DNA methods. This review summarize and compare of methods chosen to distinguishing between Globodera, both pathotypes and species.
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2019, 80; 3-12
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Progress in the molecular methods for the detection and genetic characterization of Cryptosporidium in water samples
Autorzy:
Skotarczak, B
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/52184.pdf
Data publikacji:
2010
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Tematy:
protozoan parasite
Cryptosporidium
genetic characteristics
molecular method
detection
water sample
food-borne way
oocyst
infection control
Źródło:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine; 2010, 17, 1; 1-8
1232-1966
Pojawia się w:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wildlife as an environmental reservoir of Enterocytozoon bieneusi (Microsporidia) – analyses of data based on molecular methods
Autorzy:
Leśniańska, Kinga
Perec-Matysiak, Agnieszka
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/972188.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
microsporidia
genotype
zoonosis
wildlife
reservoir
Enterocytozon bieneusi
Opis:
Enterocytozoon bieneusi is the most commonly identified Microsporidia in humans and has also been detected worldwide in a large group of wild living and domestic animals. The identification of E. bieneusi in wildlife has raised the question of the importance of animal reservoirs in the epidemiology of microsporidiosis and the implications of the infection with this pathogen in hosts. This review summarizes the available molecular data on the variety of E. bieneusi genotypes, both potentially zoonotic and host-specific isolated from wild living mammals and birds. In contrast to microsporidial infections of humans and domestic animals, wildlife deserves attention as a source of significant environmental reservoir of E. bieneusi.
Źródło:
Annals of Parasitology; 2017, 63, 4; 265-281
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykrywanie bakterii Salmonella metodami molekularnymi w produktach żywnościowych
Detection of Salmonella sp. in food using molecular methods
Autorzy:
Misiewicz, A.
Goncerzewicz, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/796639.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie. Wydawnictwo Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie
Tematy:
produkty spozywcze
bakterie
Salmonella
wykrywanie drobnoustrojow
metody molekularne
lancuchowa reakcja polimerazy
food product
bacteria
microorganism detection
molecular method
polymerase chain reaction
Opis:
Bakterie z rodzaju Salmonella są najbardziej znanymi bakteriami patogennymi występującymi w przemyśle spożywczym. Powodują zakażenia prawie wszystkich produktów żywnościowych – od mięsnych, mlecznych, jajecznych po rośliny oleiste i pasze. Wykrycie i identyfi kacja bakterii Salmonella na podstawie tradycyjnej metody mikrobiologicznej, zgodnie z normą PN-EN 6579:2003, jest ciągle powszechnie stosowane w laboratoriach. Analiza ta jest czaso- i pracochłonna, jej wykonanie trwa około 5–7 dni. Wykorzystanie nowoczesnych technik biologii molekularnej, z etapem namnożenia i izolacji DNA, do uzyskania końcowego wyniku trwa znacznie krócej. W niniejszej pracy zastosowano metodę Real-Time PCR i klasyczny PCR do identyfi kacji bakterii Salmonella w różnych produktach żywnościowych. Określono czas potrzebny do wykonania tej analizy molekularnej. Do reakcji Real-Time PCR wykorzystano komercyjny kit. Klasyczną reakcję PCR prowadzono z użyciem starterów Sal465Li Sal142F, uzyskując właściwy produkt o wielkości 343 pz. We wszystkich badanych próbkach wykryto bakterie Salmonella. Wynik analiz molekularnych uzyskano w ciągu 21–25 godzin.
Pathogenic bacteria of Salmonella genus are the most common infections in food industry. They might to contaminate wide range of products, protein food e.g. meat, milk food, eggs and egg foods, plants and its preserves, fodder and feeds. Detection and identifi cation of Salmonella sp. are made using traditional methods corresponding with standard PN-EN 6579:2003. That method is commonly used in the microbiological laboratories its time consuming and laborious analysis. Using a modern molecular biology techniques allow to confi rm the Salmonella infections in 24-hours with enrichment and isolation steps. In our study were used Real-Time PCR and traditional PCR techniques to detect Salmonella pathogens from various foods. In addition we checked time of molecular analysis. In the study was used commercial kit to Real-Time PCR analysis and primer set Sal465L, Sal142F with are based on characteristic and solid genomic fragments of Salmonella genus. In every experiment we got positive results for food contaminated by Salmonella. The results were obtained in 21–25 hours.
Źródło:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych; 2013, 573
0084-5477
Pojawia się w:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molekularne metody stosowane w diagnostyce zespołu long-QT
Molecular methods used in diagnosis of long-QT syndrome
Autorzy:
Moric-Janiszewska, Ewa
Głowacka, Marta
Węglarz, Ludmiła
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038844.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
Tematy:
zespół long-qt
kanały jonowe
analiza molekularna
long-qt syndrome
ion channels
molecular analysis
Opis:
LQTS (long QT syndrome) is a genetic disorder caused by the mutations of genes adversely affecting the ion channel function in the cellular membranes of cardiac myocytes. Prolonged repolarization detected on a ECG as a longer QT interval (> 450 ms) is responsible for syncope, cardiac arrest and sudden cardiac death (SCD), due to transient “torsade de pointes” (TdP) or ventricular fibrillation. Currently, 12 types of long-QT syndrome have been identified, which are caused by 600 mutations of genes located on chromosomes: 3,4,6,7,11,17,21. Depending on the particular gene mutation in the LQT syndrome, subtypes from LQTS1 to LQTS12 were identified. The knowledge of genetic disorders in different types of LQTS has enabled the introduction of genotype-dependent therapy. Due to the frequent absence of clinical signs in 40% of mutant genes carriers, it is very important to develop fast and effective diagnostics. These patients do not always suit the clinical diagnostic criteria and therefore they should be diagnosed using molecular methods. In the present study we describe some molecular methods (SSCP, sequencing, quantitative PCR) most commonly used in genetic diagnostics of the long-QT syndrome.
LQTS (long-QT syndrome) oznacza wrodzony zespół wydłużonego odcinka QT i jest chorobą kanałów jonowych uwarunkowaną genetycznie. U jej podstaw leżą mutacje genów kodujących białka i podjednostki kanałów jonowych błony podstawnej kardiomiocytów, istotne dla prawidłowego ich funkcjonowania. Jej głównymi cechami są: wydłużenie odstępu QT (> 450 ms) widoczne w obrazie EKG, pojawianie się omdleń, zatrzymania akcji serca oraz nagła śmierć sercowa SCD (sudden cardiac death), spowodowana występowaniem wielokształtnego częstoskurczu komorowego typu torsade de pointes (TdP) lub też migotaniem komór. Obecnie zidentyfi kowano 12 odmian zespołu long-QT, które spowodowane są aż 600 mutacjami genów zlokalizowanych w chromosomach: 3, 4, 6, 7, 11, 17, 21. Zależnie od mutacji konkretnego genu, w zespole LQT wyodrębniono podtypy od LQTS1 do LQTS12. Poznanie zaburzeń genetycznych w poszczególnych typach LQTS umożliwiło wprowadzenie terapii zależnej od genotypu. Ze względu na częste niewystępowanie objawów klinicznych aż u 40% nosicieli zmutowanych genów bardzo ważna jest szybka i skuteczna diagnostyka. U pacjentów takich nie zawsze sprawdzają się kliniczne kryteria diagnostyczne i dlatego należy ich diagnozować metodami molekularnymi. W przedstawionej pracy opisano niektóre (SSCP, sekwencjonowanie, ilościowy PCR) najczęściej stosowane, molekularne metody diagnostyki zespołu long-QT.
Źródło:
Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2012, 66, 4; 41-47
1734-025X
Pojawia się w:
Annales Academiae Medicae Silesiensis
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molekularne metody identyfikacji gatunkowej wykorzystywane w ekspertyzach sądowych
Molecular methods of species identification used in forensic examinations
Autorzy:
Nakonieczna, S.
Grela, M.
Listos, P.
Gryzińska, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2191477.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Źródło:
Journal of Animal Science, Biology and Bioeconomy; 2019, 37, 1; 31-39
2544-4468
Pojawia się w:
Journal of Animal Science, Biology and Bioeconomy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody molekularne stosowane w badaniu różnorodności mikroorganizmów glebowych
Molecular methods used in studies of diversity of the soil microorganisms
Autorzy:
Behnke-Borowczyk, J.
Kwaśna, H.
Belka, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1006468.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Leśne
Tematy:
mikroorganizmy glebowe
identyfikacja
roznorodnosc biologiczna
metody badan
metody molekularne
ekstrakcja DNA
amplifikacja DNA
biodiversity
microbiota
molecular methods
soil
Opis:
Application of the correct methods of study is essential for a proper description and understanding of natural communities of microorganisms and their relationships. Classical methods used for detection and identification of soil microorganisms resulted in underestimation of the microbiota. It has been claimed that classical methods, based mainly on morphology, led to the identification of only 1% of the soil microbiota, usually species that predominate in culture because of their fast growth and abundant sporulation. Molecular methods allow rapid, accurate, sensitive and cost−effective identification and enumeration of microorganisms. They are designed to replace and/or support classical approaches. This review summarizes some of the current and emerging nucleic acid−based molecular approaches used for detection, discrimination and quantification of microbes in the environment, mostly in soil.
Źródło:
Sylwan; 2012, 156, 04; 294-304
0039-7660
Pojawia się w:
Sylwan
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Characteristics of selected molecular methods used in identification and assessment of genetic diversity of bacteria belonging to the genus Azotobacter
Autorzy:
Kozieł, Monika
Gałązka, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2147979.pdf
Data publikacji:
2019-09-30
Wydawca:
Instytut Uprawy Nawożenia i Gleboznawstwa – Państwowy Instytut Badawczy
Tematy:
Azotobacter
ITS PCR
16S rRNA gen
PCR MP
RAPD
ARDRA
Opis:
Modern molecular techniques have greatly increased our knowledge concerning phylogenetic and functional diversity of microorganisms inhabiting the soil environment. Soil ecosys-tem is relatively complex with a high level of microbiologically diversity. The application of traditional culture-based techniques dose not reflect the total diversity of microbial community in-habiting in soil environment. On the other hand commonly used molecular methods allow for quick and accurate identification and evaluation of the genetic diversity of microorganisms in-habiting this environment. Free-living bacteria belonging to the genus Azotobacter commonly occurring in soil. Azotobacter spp. are the subject of many studies conducted both in Poland and in the world. The interest in these bacteria is largely related to their properties very useful for agriculture. Owing to their capability of fixing atmospheric nitrogen and making it available to plants and production of plant growth promotion and fungicidal substances, they are used in the production of soil bacterial inoculants. In addition, these bacteria are an excellent indicator of soil fertil-ity, which is why they are often used as test microorganisms in many studies. The paper presents an overview of molecular mi-crobiological techniques used to identify and evaluate the genetic diversity of Azotobacter spp. in studies conducted both in Poland and across the world. The ITS PCR, PCR-RFLP methods and 16S rRNA gene amplification are used to identify bacteria of the ge-nus Azotobacter, and PCR MP, RAPD PCR and ARDRA are used to assess the genetic diversity of these microorganisms.
Źródło:
Polish Journal of Agronomy; 2019, 38; 37-45
2081-2787
Pojawia się w:
Polish Journal of Agronomy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A method for the infectivity discrimination of enveloped DNA viruses using palladium compounds pre-treatment followed by real-time PCR
Autorzy:
Krzyzankova, M.
Krasna, M.
Prodelalova, J.
Vasickova, P.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/16647567.pdf
Data publikacji:
2023
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czasopisma i Monografie PAN
Tematy:
African swine fever virus
bovine herpesvirus-1
palladium compounds
platinum compounds
molecular methods
viability PCR
Opis:
Cultivation-based assays represent the gold standard for the assessment of virus infectivity; however, they are time-consuming and not suitable for every virus type. Pre-treatment with platinum (Pt) compounds followed by real-time PCR has been shown to discriminate between infectious and non-infectious RNA viruses. This study examined the effect of Pt and palladium (Pd) compounds on enveloped DNA viruses, paying attention to two significant pathogens of livestock – bovine herpesvirus-1 (BoHV-1) and African swine fever virus (ASFV). Native or heat-treated BoHV-1 suspension was incubated with the spectrum of Pt/Pd compounds. Bis(benzonitrile)palladium(II) dichloride (BB-PdCl 2) and dichloro(1,5-cyclooctadiene) palladium(II) (PdCl 2-COD) produced the highest differences found between native and heat- -treated viruses. Optimized pre-treatment conditions (1 mM of Pd compound, 15 min, 4°C) were applied on both virus genera and the heat inactivation profiles were assessed. A significant decrease in the detected quantity of BoHV-1 DNA and ASFV DNA after heat-treatment (60°C and 95°C) and consequent incubation with Pd compounds was observed. BB-PdCl 2 and PdCl 2-COD could help to distinguish between infectious and non-infectious enveloped DNA viruses such as BoHV-1 or ASFV.
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2023, 26, 2; 211-221
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie metod molekularnych w identyfikacji gatunku, wieku i płci owadów użytecznych w entomologii sądowej
Use of molecular methods in the identification of the species, age and sex of insects useful in forensic entomology
Autorzy:
Stojak, Joanna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1373968.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Centralne Laboratorium Kryminalistyczne Policji
Tematy:
entomologia sądowa
barkoding DNA
mtDNA
metody molekularne
identyfikacja gatunkowa
forensic entomology
DNA barcoding
molecular methods
identification of species
Opis:
Entomologia sądowa wykorzystuje owady do ustalania czasu i przyczyny śmierci, a nawet miejsca, w którym nastąpiła. W tym celu stosowane są dwie metody. Metoda rozwojowa opiera się na wzorcach rozwoju larw w określonych warunkach temperaturowo-środowiskowych. Metoda sukcesyjna analizuje występujące w różnych środowiskach wzorce pojawiania się poszczególnych taksonów na zwłokach. W obu tych metodach najistotniejszą kwestią jest poprawna identyfikacja gatunków. W poniższym artykule zaprezentowane zostały molekularne metody identyfikacji, takie jak barkoding DNA czy analiza krzywych denaturacji DNA o wysokiej rozdzielczości (DNA-HRM-PCR).
Forensic entomology uses insects to determine the time, cause and place of death. To this end, two entomological methods are used. The development-based method uses the patterns of insect larvae development under the specific thermal and environmental conditions. The succession-based method analyzes the sequence of insect succession on the body in various environmental conditions. The proper insect species identification is essential in both methods. In this article, the molecular methods of species, age and sex identification are presented such as DNA barcoding or DNA-HRM-PCR.
Źródło:
Problemy Kryminalistyki; 2014, 286; 22-26
0552-2153
Pojawia się w:
Problemy Kryminalistyki
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Badania nad opracowaniem molekularnej metody identyfikacji genów warunkujących ważne cechy użytkowe pomidora
Studies on the development of molecular methods for identifying genes responsible for important traits of tomato
Autorzy:
Nowakowska, Marzena
Kłosińska, Urszula
Nowak, Katarzyna
Szczechura, Wojciech
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199521.pdf
Data publikacji:
2019-11-30
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
bakteryjna plamistość
funkcjonalna męska sterylność
fuzaryjne więdniecie
selekcja wspomagana markerami
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2019, 286; 303-307
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Ocena narażenia na aerozol grzybowy na wybranych stanowiskach pracy zanieczyszczonych pyłem organicznym o różnym pochodzeniu
Assessment of fungal aerosol exposure at selected workplaces contaminated with organic dust of different origin
Autorzy:
Ławniczek-Wałczyk, Anna
Cyprowski, Marcin
Gołofit-Szymczak, Małgorzata
Wójcik-Fatla, Angelina
Zając, Violetta
Górny, Rafał L.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2162450.pdf
Data publikacji:
2018-05-22
Wydawca:
Instytut Medycyny Pracy im. prof. dra Jerzego Nofera w Łodzi
Tematy:
narażenie zawodowe
bioaerozol
grzyby
metody molekularne
Aspergillus fumigatus
metody hodowlane
occupational exposure
bioaerosol
fungi
molecular methods
culture methods
Opis:
Wstęp W ostatnich latach obserwowany jest wzrost liczby osób cierpiących na choroby wywołane przez grzyby pleśniowe i drożdżopodobne. Mimo to wiedza na temat bioróżnorodności patogenów grzybowych w środowisku pracy jest ciągle niedostateczna. Celem pracy była ocena narażenia na grzyby rozprzestrzeniające się drogą powietrzną w środowisku pracy zanieczyszczonym pyłem organicznym pochodzenia roślinnego i zwierzęcego. Materiał i metody Próbki bioaerozolu pobrano w 3 zakładach pracy (ferma drobiu, elektrownia spalająca biomasę i oczyszczalnia ścieków) za pomocą zestawów pomiarowych złożonych z uniwersalnych aspiratorów i poborników guzikowych. Ilościową i jakościową analizę aerozolu grzybowego przeprowadzono metodą hodowlaną, opartą na analizie makro- i mikroskopowej. Wybrane szczepy poddano analizie genetycznej za pomocą łańcuchowej reakcji polimerazy (polymerase chain reaction – PCR) z użyciem par primerów do wewnętrznych regionów niekodujących (internal transcribed spacers – ITS): ITS1–ITS2, ITS3–ITS4 i ITS1–ITS4. Wyniki Średnie stężenie aerozolu grzybowego na stanowiskach pracy wynosiło 1,2×102–2,1×106 jtk/m³. Najwyższe stężenie grzybów zaobserwowano na stanowiskach pracy na fermie drobiu, a najniższe w oczyszczalni ścieków. Analiza jakościowa wykazała, że na stanowiskach pracy w elektrowni i oczyszczalni ścieków dominującym gatunkiem w stosunku do całości izolowanej mykobioty był Aspergillus fumigatus. Zgodność wyników identyfikacji tego patogenu uzyskanych metodą hodowlaną i molekularną dotyczyła 100% badanych szczepów. Wnioski Stężenie bioaerozoli zmierzone na stanowiskach pracy w fermach drobiu przekraczało polskie propozycje wartości dopuszczalnych dla grzybów, tj. 5×104 jtk/m³. Wykazano wysoką zgodność identyfikacji patogenu A. fumigatus przy użyciu metody tradycyjnej (hodowlanej) i metody genetycznej. Ponieważ długotrwałe narażenie w środowisku pracy na konidia A. fumigatus może prowadzić do wystąpienia u pracowników dolegliwości zdrowotnych, konieczne jest stosowanie przez nich odpowiednich środków ochronnych. Med. Pr. 2018;69(3):269–280
Background In recent years, the number of people suffering from diseases caused by fungi has been increasing. However, knowledge of the biodiversity of fungal pathogens in the work environment is still insufficient. The aim of this work was to evaluate the exposure to fungi being disseminated in the air of workplaces contaminated with organic dust of plant and animal origin. Material and Methods Bioaerosol samples were collected at 3 occupational settings (poultry farm, biomass burning power plant and wastewater treatment plant) using button samplers. Quantitative and qualitative analysis of fungal aerosol was conducted by employing macro- and microscopic methods. Selected strains were then studied by polymerase chain reaction (PCR) using środointernal transcribed spacers (ITS): ITS1–ITS2, ITS3–ITS4 and ITS1–ITS4 primer pairs. Results Average concentrations of fungal aerosol at workplaces ranged 1.2×102–2.1×106 cfu/m³. The highest fungal concentrations were recorded in the poultry farm, while the lowest were noted at the wastewater treatment plant. Aspergillus fumigatus was a predominant component of the mycobiota in the power plant and wastewater treatment plant. Almost 100% identification agreement of this pathogen between the traditional and molecular method was noted. Conclusions The fungal concentrations in poultry farms exceeded the Polish proposal for the threshold limit value (5×104 cfu/m³). The results of the study demonstrate a high compatibility of A. fumigatus’ identification using the traditional and molecular methods. Taking into account the fact, that a long term exposure to A. fumigatus conidia at workplaces may result in numerous health complaints, the use of proper protective equipment by workers must be a standard procedure. Med Pr 2018;69(3):269–280
Źródło:
Medycyna Pracy; 2018, 69, 3; 269-280
0465-5893
2353-1339
Pojawia się w:
Medycyna Pracy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The importance of molecular identification methods of mosquitoes in epidemiology of vector-borne diseases
Autorzy:
Rydzanicz, K.
Lonc, E.
Becker, N.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/5621.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
vector-borne disease
Culex
Anopheles
molecular identification
molecular method
mosquito
epidemiology
Źródło:
Annals of Parasitology; 2016, 62, Suppl.
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The effect of the Glu342Lys mutation in α1-antitrypsin on its structure, studied by molecular modelling methods.
Autorzy:
Jezierski, Grzegorz
Pasenkiewicz-Gierula, Marta
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1044164.pdf
Data publikacji:
2001
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
serpins
protein structure
energy minimisation
molecular dynamics simulation
Opis:
The structure of native α1-antitrypsin, the most abundant protease inhibitor in human plasma, is characterised primarily by a reactive loop containing the centre of proteinase inhibition, and a β-sheet composed of five strands. Mobility of the reactive loop is confined as a result of electrostatic interactions between side chains of Glu342 and Lys290, both located at the junction of the reactive loop and the β structure. The most common mutation in the protein, resulting in its inactivation, is Glu342→Lys, named the Z mutation. The main goal of this work was to investigate the influence of the Z mutation on the structure of α1-antitrypsin. Commonly used molecular modelling methods have been applied in a comparative study of two protein models: the wild type and the Z mutant. The results indicate that the Z mutation introduces local instabilities in the region of the reactive loop. Moreover, even parts of the protein located far apart from the mutation region are affected. The Z mutation causes a relative change in the total energy of about 3%. Relatively small root mean square differences between the optimised structures of the wild type and the Z mutant, together with detailed analysis of 'conformational searching' process, lead to the hypothesis that the Z mutation principally induces a change in the dynamics of α1-antitrypsin.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2001, 48, 1; 65-75
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies