Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "chromatin" wg kryterium: Wszystkie pola


Tytuł:
Can chromatin conformation technologies bring light into human molecular pathology?
Autorzy:
Kubiak, Marta
Lewandowska, Marzena
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038988.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
chromosome conformation capture
human molecular pathology
chromatin
chromatin looping
genome organization
Opis:
Regulation of gene expression in eukaryotes involves many complex processes, in which chromatin structure plays an important role. In addition to the epigenetic effects, such as DNA methylation and phosphorylation or histone modifications, gene expression is also controlled by the spatial organization of chromatin. For example, distant regulatory elements (enhancers, insulators) may come into direct physical interaction with target genes or other regulatory elements located in genomic regions of up to several hundred kilobases in size. Such long-range interactions result in the formation of chromatin loops. In the last several years, there has been a rapid increase in our knowledge of the spatial organization of chromatin in the nucleus through the chromosome conformation capture (3C) technology. Here we review and compare the original 3C and 3C-based methods including chromosome conformation capture-on-chip (4C), chromosome conformation capture carbon copy (5C), hi-resolution chromosome confomation capture (HiC). In this article, we discuss different aspects of how the nuclear organization of chromatin is associated with gene expression regulation and how this knowledge is useful in translational medicine and clinical applications. We demonstrate that the knowledge of the chromatin 3D organization may help understand the mechanisms of gene expression regulation of genes involved in the development of human diseases, such as CFTR (responsible for cystic fibrosis) or IGFBP3 (associated with breast cancer pathogenesis). Additionally, 3C-derivative methods have been also useful in the diagnosis of some leukemia subtypes.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2015, 62, 3; 483-489
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Changes in distribution of 5 methylcytosine in male and female gametophyte of Hyacinthus orientalis before and after fertilization
Autorzy:
Kozlowska, M.
Niedojadlo, K.
Bednarska-Kozakiewicz, E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80166.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
gene activity
chromatin structure
5-methylcytosine
female gametophyte
male gametophyte
seed development
flowering plant
Hyacinthus orientalis
fertilization
transcriptional activity
epigenetic factor
DNA methylation
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Changes in DNA methylation in maize under herbicide stress conditions
Autorzy:
Tyczewska, A.
Gracz, J.
Szymkowiak, J.
Twardowski, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/951318.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
DNA methylation
chromatin modification
gene silencing
gene transcription
maize
herbicide stress
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2015, 96, 1
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Chromatin acetylation, β-amyloid precursor protein and its binding partner FE65 in DNA double strand break repair
Autorzy:
Szumiel, Irena
Foray, Nicolas
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039940.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
chromatin acetylation
FE65
MOF acetyltransferase
DNA double strand break repair
β-amyloid precursor protein
Tip60 histone acetyltransferase
heterochromatin protein 1
Opis:
Among post-translational modifications of chromatin proteins taking place in DNA double strand break (DSB) repair, acetylation plays a prominent role. This review lists several facts and hypotheses concerning this process. Lack of acetyltransferase TIP60 (HIV-Tat interacting protein of 60 kDa) activity results in cells with defective DSB repair. The enzyme is present in the nucleus in a multimeric protein complex. TIP60 dependent activation of ATM (ataxia telangiectasia mutated kinase) is an early event in the response to DNA breakage. Other important acetylations are those of histones H4 and γH2AX. Correct reconstruction of the damaged site is critical for survival and prevention of genetic and epigenetic changes in the cell that may affect the function of its daughter cells. Recently, two proteins with previously unsuspected functions in DSB repair have been identified as active in this process: Alzheimer β-amyloid precursor protein (APP) and its binding partner FE65, β-amyloid precursor binding protein. Their participation in DSB repair in both neuronal and non-neuronal cells is related to acetylation carried out by the acetyltransferase complex. The same function is ascribed to heterochromatin protein 1 (HP1). So far, the relations (if any) between TIP60 activation by HP1 and by the FE65 complex remain unidentified.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2011, 58, 1; 11-18
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Chromatin fractionation on hydroxylapatite by centrifugal chromatography method
Frakcjonowanie chroroatyny metodą chromatografii wirówkowej na hydroksyapatycie
Autorzy:
Walter, Zofia
Gawroiiska, Maria
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/945109.pdf
Data publikacji:
1991
Wydawca:
Uniwersytet Łódzki. Wydawnictwo Uniwersytetu Łódzkiego
Opis:
Chromatynę izolowaną z grasicy i leukocytów krwi obwodowej świni rozfrakcjonowano metodą chromatografii wirówkowej na HAP. W wyniku frakcjonowania otrzymano 11 frakcji różniących się termiczną stabilnością, zawartością białka, DNA oraz składem zasad azotowych. Wykazano różnicę międzytkankową profili chromatograficznych preparatów chromatyny izolowanych z badanych tkanek. Przedstawiona przez nas w niniejszej pracy metoda chromatografii wirówkowej na hydroksyapatycie zachowuje wszelkie zalety termicznej chromatografii kolumnowej, a jest znacznie prostsza i skraca czas rozdziału. Pozwala na uzyskanie frakcji o dużym stężeniu w niewielkiej ilości płynu elucyjnego.
Źródło:
Acta Universitatis Lodziensis. Folia Biochimica et Biophysica; 1991, 8
0208-614X
Pojawia się w:
Acta Universitatis Lodziensis. Folia Biochimica et Biophysica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Chromatin immunoprecipitation — new approach for revealing histone modifications in plants under heavy metal stress — theoretical review on advantages, drawbacks and questions
Autorzy:
Kwaśniewski, P.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/115479.pdf
Data publikacji:
2010
Wydawca:
Fundacja na Rzecz Młodych Naukowców
Tematy:
chromatin dynamics
heavy metal stress
ecophysiology
ChIP
immunoprecipitation
histone modifications
epigenetic
Opis:
Heavy metal contamination is a major environmental problem. A coordinated network of molecular processes participates in plant response to heavy metals. The metal-dependent gene expression is regulated on multiple levels and may include chromatin modifi cations. One of the methods which allows to understand the role of histone post-translational modifi cations in plant cell response to heavy metals may be chromatin immunoprecipitation.
Źródło:
Challenges of Modern Technology; 2010, 1, 1; 7-10
2082-2863
2353-4419
Pojawia się w:
Challenges of Modern Technology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Comparison of susceptibility to staphylococcal nuclease and behaviour in metrizamide gradients of normal and 5-bromodeoxyuridine-substituted chromatin from Physarum polycephalum
Autorzy:
Tyniec, Barbara
Jerzmanowski, Krzysztof
Toczko, Kazimierz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1046252.pdf
Data publikacji:
1978
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 1978, 25, 3; 273-280
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Direct interaction of Gas41 and Myc encoded by amplified genes in nervous system tumours
Autorzy:
Piccinni, Eugenia
Chelstowska, Anna
Hanus, Jakub
Widlak, Piotr
Loreti, Simona
Tata, Ada
Augusti-Tocco, Gabriella
Bianchi, Michele
Negri, Rodolfo
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039845.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
transcription regulation
Gas41
n-Myc
brain tumours
chromatin modification
Opis:
In order to understand better the role of the human Tip60 complex component Gas41, we analysed its expression levels in brain tumours and searched for possible interactors. Two-hybrid screening of a human foetal brain library allowed identification of some molecular interactors of Gas41. Among them we found n-Myc transcription factor. The interaction between Gas41 and n-Myc was validated by pull-down experiments. We showed that Gas41 is able to bind both n-Myc and c-Myc proteins, and that the levels of expression of Gas41 and Myc proteins were similar to each other in such brain tumors as neuroblastomas and glioblastomas. Finally, in order to identify which region of Gas41 is involved in the interaction with Myc proteins, we analysed the ability of Gas41 to substitute for its orthologue Yaf9 in yeast; we showed that the N-terminal portions of the two proteins, containing the YEATS domains, are interchangeable, while the C-terminal portions are species-specific. In fact we found that Gas41 C-terminal portion is required for Myc protein interaction in human.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2011, 58, 4; 529-534
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
DNA microarrays, a novel approach in studies of chromatin structure.
Autorzy:
Widłak, Piotr
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1043314.pdf
Data publikacji:
2004
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
chromatin
genomics
epigenomics
DNA microarray
nucleosomes
Opis:
The DNA microarray technology delivers an experimental tool that allows surveying expression of genetic information on a genome-wide scale at the level of single genes - for the new field termed functional genomics. Gene expression profiling - the primary application of DNA microarrays technology - generates monumental amounts of information concerning the functioning of genes, cells and organisms. However, the expression of genetic information is regulated by a number of factors that cannot be directly targeted by standard gene expression profiling. The genetic material of eukaryotic cells is packed into chromatin which provides the compaction and organization of DNA for replication, repair and recombination processes, and is the major epigenetic factor determining the expression of genetic information. Genomic DNA can be methylated and this modification modulates interactions with proteins which change the functional status of genes. Both chromatin structure and transcriptional activity are affected by the processes of replication, recombination and repair. Modified DNA microarray technology could be applied to genome-wide study of epigenetic factors and processes that modulate the expression of genetic information. Attempts to use DNA microarrays in studies of chromatin packing state, chromatin/DNA-binding protein distribution and DNA methylation pattern on a genome-wide scale are briefly reviewed in this paper.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2004, 51, 1; 1-8
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Estimation of the extent of platination and the sites of Pt binding after interaction of cis- and trans- diamminedichloroplatinum(II) with DNA and chromatin
Autorzy:
Oliński, Ryszard
Wiaderkiewicz, Ryszard
Walter, Zofia
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1045992.pdf
Data publikacji:
1985
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 1985, 32, 2; 119-125
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies