Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "SNP" wg kryterium: Wszystkie pola

  Lista filtrów
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-15 z 33
Tytuł:
Wpływ polimorfizmu w regionie promotorowym 5’ genu TG na cechy użytkowości mlecznej bydła rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej
Effect of polymorphism in the 5’ promoter region of the TG gene on the milk production traits of Polish Holstein-Friesian cattle
Autorzy:
Czerniawska-Piatkowska, E.
Kowalewska-Luczak, I.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2119753.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Zootechniczne
Tematy:
tyreoglobulina
bydło
SNP
użytkowość mleczna
Opis:
Celem podjętych badań było określenie zależności między występowaniem trzech różnych mutacji punktowych (257C>T, 335A>G, 422 C>T) w regionie promotorowym genu kodują- cego tyreoglobulinę (powodujących jego polimorfizm) a cechami użytkowości mlecznej by- dła. Badaniami objęto stado krów rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej. Ustalenie genotypów prowadzono z wykorzystaniem metody PCR i jej modyfikacji ACRS. Określono frekwencję częściej występujących alleli dla analizowanych mutacji punktowych: C ‒ 0,830 (257C>T), A ‒ 0,765 (335A>G) i C ‒ 0,635 (422C>T). Analiza statystyczna pokazała, że wszystkie trzy analizowane mutacje punktowe w regonie promotorowym genu TG istotnie (P≤0,05; P≤0,01) wpływają na analizowane cechy użytkowości mlecznej, tj. na dobową wydajność mleka, za- wartość tłuszczu i białka w mleku oraz liczbę komórek somatycznych.
Źródło:
Roczniki Naukowe Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego; 2020, 16, 1; 9-16
1733-7305
Pojawia się w:
Roczniki Naukowe Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
VDR gene single nucleotide polymorphisms and their association with risk of oral cavity carcinoma
Autorzy:
Małodobra-Mazur, Małgorzata
Paduch, Agnieszka
Lebioda, Arleta
Konopacka, Maria
Rogoliński, Jacek
Szymczyk, Cezary
Wierzgoń, Janusz
Maciejewski, Adam
Chmielik, Ewa
Jonkisz, Anna
Półtorak, Stanisław
Dobosz, Tadeusz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039670.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
VDR gene
SNP
oral cavity cancer
Opis:
Vitamin D3 (1,25(OH)2D3 (1,25-dihydroxyvitamin D3)) is a hormone playing a crucial role in numerous biological processes in the human body, including induction and control of cell proliferation and differentiation. Numerous data relate the vitamin D3 level with various types of cancer. It has been suggested that SNPs in the vitamin D3 receptor (VDR) gene might influence both the risk of cancer occurrence and cancer progression. The aim of this study was to search for genetic correlations between individual SNPs in the VDR gene and the risk of oral cavity carcinoma. Two SNPs were selected based on the literature and our previous results. Seventy-three patients with squamous cell carcinoma of the head and neck and one hundred control subjects were investigated. Two SNPs in the VDR gene were genotyped in minisequencing reactions followed by capillary electrophoresis. Hardy-Weinberg equilibrium (HWE), the χ2 test and logistic regression were used for statistical analysis. The SNP rs2238135 in the VDR gene displayed statistical differences in frequency between the tested groups (p=0,0007). Furthermore, the G/C genotype of the rs2238135 in the VDR gene was characterized by a 3.16 fold increased risk of oral cavity carcinoma. The obtained results provide evidence for a genetic association between rs2238135 in the VDR gene and the occurrence and risk of oral cavity cancer.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2012, 59, 4; 627-630
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The relationship between nitric oxide and plant hormones in SNP administrated sunflower plants under salt stress condition
Relacje między tlenkiem azotu a hormonami roślinnymi słonecznika w obecności SNP w warunkach stresu solnego
Autorzy:
Yurekli, F.
Kirecci, O.A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11543435.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Opis:
Nitric oxide (NO) and sodium nitro prusside (SNP) are striking molecules and play important roles in animals and plants. SNP serves as nitric oxide donor in both group. NO can act free radical and impaires important biomolecules functions beside this it has beneficial effect recovery from salinity, drought etc. NO and SNP are beneficial and protectant molecules in cope with stressfull conditions. In plants these molecules are very important, and regulate many physiological events. In the present study, endogen abscisic acid (ABA), indole acetic acid (IAA), gibberellic acid (GA3 ) and NO levels were investigated in NaCl, SNP and plant growth regulators treated sunflower plant (Helianthus annuus L.) leaves and roots. The content of NO was higher in GA3 + SNP treated plant leaves at 72 h. The highest IAA level was determined in IAA + SNP treated plant roots at 72 h. In NaCl + ABA treated plant leaves ABA was higher at 72 and GA3 levels were equal or less than the control group. Our results showed that coadministration of SNP and plant growth regulators cope with salinity stress via elevated internal hormone and NO level versus salinity.
Tlenek azotu (NO) oraz nitroprusydek sodu (SNP) to molekuły odgrywające ważną rolę u zwierząt i roślin. SNP służy jako dawca tlenku azotu w obydwu grupach. NO może działać jako wolny rodnik i pogarszać ważne funkcje biomolekuł, poza tym ma dobry wpływ na zdrowienie po zasoleniu, suszy, itp. NO i SNP są dobroczynnymi ochronnymi molekułami, które radzą sobie z warunkami stresu. U roślin molekuły te są bardzo ważne i regulują wiele zjawisk fizjologicznych. W doświadczeniu badano poziomy kwasu abscysynowego (ABA), kwasu giberelinowego (GA3 ) oraz NO w liściach i korzeniach słonecznika (Helianthus annuus L.), na którego działano NaCl, SNP oraz regulatorami wzrostu roślin. Zawartość NO była większa w liściach roślin pod wpływem GA3 + SNP w 72 godzinie. Największy poziom IAA stwierdzono w korzeniach roślin pod wpływem IAA + SNP w 72 godzinie. W liściach roślin traktowanych za pomocą NaCl + ABA, ABA był większy w 72 godzinie, a poziomy GA3 były równe lub mniejsze niż w grupie kontrolnej. Wnioskuje się, że jednoczesne zastosowanie SNP i regulatorów wzrostu pomaga sprostać stresowi zasolenia poprzez podniesienie poziomu wewnętrznego hormonu i NO w porównaniu z zasoleniem.
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus; 2016, 15, 6; 177-191
1644-0692
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The em Algorithm and Its Implementation for the Estimation of Frequencies of snp-Haplotypes
Autorzy:
Polańska, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/908153.pdf
Data publikacji:
2003
Wydawca:
Uniwersytet Zielonogórski. Oficyna Wydawnicza
Tematy:
genetyka
informatyka
algorithms
haplotypes
likelihood functions
gene frequency
Opis:
A haplotype analysis is becoming increasingly important in studying complex genetic diseases. Various algorithms and specialized computer software have been developed to statistically estimate haplotype frequencies from marker phenotypes in unrelated individuals. However, currently there are very few empirical reports on the performance of the methods for the recovery of haplotype frequencies. One of the most widely used methods of haplotype reconstruction is the Maximum Likelihood method, employing the Expectation-Maximization (EM) algorithm. The aim of this study is to explore the variability of the EM estimates of the haplotype frequency for real data. We analyzed haplotypes at the BLM, WRN, RECQL and ATM genes with 8-14 biallelic markers per gene in 300 individuals. We also re-analyzed the data presented by Mano et al. (2002). We studied the convergence speed, the shape of the loglikelihood hypersurface, and the existence of local maxima, as well as their relations with heterozygosity, the linkage disequilibrium and departures from the Hardy-Weinberg equilibrium. Our study contributes to determining practical values for algorithm sensitivities.
Źródło:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science; 2003, 13, 3; 419-429
1641-876X
2083-8492
Pojawia się w:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Stymulacja nerwu podjęzykowego [SNP] w leczeniu obturacyjnego bezdechu sennego [OBPS] – przegląd piśmiennictwa
Autorzy:
Bilińska, Małgorzata
Niemczyk, Kazimierz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1400441.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Index Copernicus International
Tematy:
obturacyjny bezdech senny
neurostymulacja
nerw podjęzykowy
Opis:
Obturacyjny bezdech senny (OBPS) jest chorobą charakteryzującą się nawracającymi epizodami zwężenia (spłycenie oddechu) lub zamknięcia (bezdech) dróg oddechowych. Zaburzeniom towarzyszy spadek saturacji krwi, hiperkapnia oraz powtarzające się wybudzenia. Schorzenie to dotyka częściej mężczyzn niż kobiety. Za powikłania OBPS uważa się nadciśnienie tętnicze, udar mózgu, chorobę wieńcową, cukrzycę typu 2 oraz zwiększone ryzyko wypadków komunikacyjnych. Diagnostyka oraz skuteczne leczenie powinny być wdrożone jak najwcześniej. Leczenie opiera się na chirurgic¬znej korekcie przeszkód anatomicznych, jeżeli stwierdza się je w badaniu klinicznym oraz stosowaniu aparatu CPAP (con¬tinuus positive airway pressure), który generując dodatnie ciśnienie, zapobiega zapadaniu się ścian dróg oddechowych. Stymulatory nerwu podjęzykowego są nową metodą leczenia i uważane są za dobrą alternatywę dla pacjentów ze średnim lub ciężkim OSAS, u których leczenie CPAP nie przyniosło oczekiwanych rezultatów lub było źle tolerowane. Lec¬zenie obturacyjnego bezdechu sennego za pomocą SNP staje się rutynową metodą leczenia w trudnych przypadkach.
Źródło:
Polski Przegląd Otorynolaryngologiczny; 2017, 6, 3; 67-72
2084-5308
2300-7338
Pojawia się w:
Polski Przegląd Otorynolaryngologiczny
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
SNP-minisequencing as an excellent tool for analysing degraded DNA recovered from archival tissues
Autorzy:
Bąbol-Pokora, Katarzyna
Berent, Jarosław
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1040691.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
formalin-fixed paraffin-embedded tissues
SNP
minisequencing
low copy number DNA
Opis:
SNP-minisequencing has become common in forensic genetics, especially for analysing degraded or low copy number DNA (LCN DNA). The aim of this study was to examine the usefulness of five SNP (single nucleotide polymorphism) markers for analyzing degraded and LCN DNA recovered from archival samples. DNA extractions of eight formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues were performed and DNA fragments were amplified in one multiplex PCR (polymerase chain reaction). SNPs were identified in a minisequencing reaction and a gel electrophoresis in ABI Prism® 377 Sequencer. The research confirmed the usefulness of SNP-minisequencing for analysing FFPE tissues.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2008, 55, 4; 815-819
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
SNP panel for evaluation of genetic variability and relationship in roe deer (Capreolus capreolus)
Autorzy:
Oleński, K.
Zalewski, D.
Kamiński, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/16647455.pdf
Data publikacji:
2023
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czasopisma i Monografie PAN
Tematy:
Capreolus capreolus
genetic diversity
roe deer
Single Nucleotide Polymorphism marker
Opis:
Blood samples from forty-six roe deer (Capreolus capreolus) acquired during officially approved hunting in six hunting divisions throughout Poland were used to isolate the genomic DNA. All individuals were genotyped by MD_Bovine BeadChip (Illumina) for 46.750 Single Nucleotide Polymorphism (SNP) markers. SNPs of inappropriate clusters, with a marker call rate lower than 90% and with a minor allele frequency (MAF) lower than 0.01, located on sex chromosomes and mitochondrial DNA, were removed. Altogether, 21.033 SNP markers were included for further analysis. Observed and expected heterozygosity amounted to 0.098 and 0.119, respectively. Among 21.033 markers, a panel of 148 SNPs were selected for relationship analysis. They were unlinked and had a MAF higher than 0.2. This set of SNPs showed a probability of parentage exclusion of 1.29x10 -6 and 2.37x10 -19 for one, and two known parents, respectively. The probability of identity was estimated at 1.8x10 -40. The probabilities obtained in this study are sufficient for the monitoring and effective management of the genetic diversity of roe deer in Poland and is a cost-effective complementary tool for forensic applications.
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2023, 26, 1; 29-37
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Sire pedigree error estimation and sire verification of the Taiwan dairy cattle population by using SNP markers
Autorzy:
Chao, C.H.
Yeh, Y.H.
Chen, Y.M.
Lee, K.H.
Wang, S.H.
Lin, T.Y.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/16539078.pdf
Data publikacji:
2022
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czasopisma i Monografie PAN
Tematy:
Holstein cattle
genetic testing
sire pedigree
Opis:
Information regarding the correct pedigree of and relationship between animals is useful for managing dairy breeding, reducing inbreeding, estimating breeding value, and establishing correct breeding programs. Additionally, the successful implementation of progeny testing is crucial for improving the genetics of dairy cattle, which depends on the availability of correct pedigree information. Incorrect pedigree information leads to bias in bull evaluation. In this study, Neogen GeneSeek Genomic Profiler (GGP) 50K SNP chips were used to identify and verify the sire of Taiwanese Holstein dairy cattle and analyze the reasons that lead to incorrect sire records. Samples were collected from 2,059 cows of 36 dairy farms, and the pedigree information was provided by breeders. The results of sire verification can be divided into three categories: submitted unconfirmed sire, submitted confirmed sire, and incorrectly submitted verified sire. Data on the sires of 1,323 (64.25%) and 572 (27.78%) dairy cows were verified and discovered, respectively. Sires of 1,895 (92.03%) dairy cattle were identified, which showed that the paternal pedigree of dairy cattle could be discovered and verified through genetic testing. An error-like analysis revealed that the data of 37 sires were incorrectly recorded because the bull’s NAAB code number was incorrectly entered into the insemination records: for 19 sires, the wrong bull was recorded because the frozen semen of a bull placed in the wrong storage tank was used, 6 had no sire records, and for 12 sires, the NAAB code of the correct bull was recorded but with a wrong stud code, marketing code, or unique number for the stud or breed. To reduce recorded sire error rates by at least 27.78%, automated identification of the mated bull must be adopted to reduce human error and improve dairy breeding management on dairy farms.
Źródło:
Polish Journal of Veterinary Sciences; 2022, 25, 1; 61-65
1505-1773
Pojawia się w:
Polish Journal of Veterinary Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Senior Non-preferred Bonds as an Instrument to Meet the MREL Requirement
Obligacje typu senior non-preferred jako instrument spełnienia wymogu MREL
Autorzy:
Kozińska, Magdalena
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/36106547.pdf
Data publikacji:
2023
Wydawca:
Uniwersytet Łódzki. Wydawnictwo Uniwersytetu Łódzkiego
Tematy:
przymusowa restrukturyzacja
MREL
podrzędny dług uprzywilejowany
SNP
finansowanie bankowe
resolution
senior non-preferred
SNP bonds
bank financing
Opis:
The purpose of the article is to present the results of the first assessment of the senior non-preferred (SNP) bond market’s development in Poland. SNP bonds were introduced to facilitate meeting the banks’ MREL, which aims to build banks’ loss absorption and recapitalization capacity. At the same time, they are the next source of bank funding. The development of the SNP bond market has been initiated relatively recently with the full establishment of resolution systems and the introduction of the MREL requirement for banks. Although the first non-binding decisions to impose the MREL requirement were issued in 2016, the concept of SNP was formally introduced in 2017. In 2019, an amendment to the rules for determining the MREL requirement was adopted, which was implemented into the Polish legal framework in 2021, and in 2022, an amendment to the regulations on bonds was introduced, enabling the issuance of SNP bonds counted to MREL. Since then (2022), there has been a full legal framework for setting and maintaining the MREL requirement, and therefore full conditions for the development of this market in Poland. Therefore, it is justified to say that this market is relatively young. Moreover, it is under-investigated by scientists. This justifies the assessment of the potential scale of this market, its ability to achieve the goal for which it was created, as well as the premises and barriers to its development. Methodology. The research methods were quantitative analysis (calculation of the potential shortage of the MREL requirement and needs in the field of securities issuance based on reporting data) and qualitative analysis (in terms of assessing the challenges). Results of the research. The main determinant of its potential is the amount of MREL shortfall, which depends on the financial situation of banks and partly on the strategy of resolution authorities (responsible for setting the level of this requirement). The main challenges for the Polish SNP bond market are related to the prospects for further development of the banking sector and its environment (business and strategic). Nevertheless, it seems that the potential of the SNP bond market in Poland is underrated. The article contributes to general knowledge about bank funding sources.
Cel artykułu/hipoteza. Celem artykułu jest przedstawienie wyników pierwszej oceny rozwoju rynku obligacji niepreferowanych (SNP) w Polsce. Obligacje SNP zostały wprowadzone, aby ułatwić osiągnięcie przez banki MREL, którego celem jest budowanie zdolności banków do absorpcji strat i dokapitalizowania. Jednocześnie są kolejnym źródłem finansowania banków. Rozwój rynku obligacji SNP został zapoczątkowany stosunkowo niedawno wraz z pełnym utworzeniem systemów przymusowej restrukturyzacji i wprowadzeniem wymogu MREL dla banków. Choć pierwsze niewiążące decyzje o nałożeniu wymogu MREL wydano już w 2016 r., to już w 2017 r. formalnie wprowadzono koncepcję SNP. W 2019 r. przyjęto nowelizację zasad ustalania wymogu MREL, która została wdrożona do polskiego prawa w 2021 r. i 2022 r. wprowadzono nowelizację przepisów o obligacjach, umożliwiającą emisję obligacji SNP zaliczanych do MREL. Od tego czasu (2022 r.) istnieją pełne ramy prawne umożliwiające ustalanie i utrzymywanie wymogu MREL, a co za tym idzie pełne warunki rozwoju tego rynku w Polsce. Uzasadnione jest zatem stwierdzenie, że jest to rynek stosunkowo młody. Co więcej, jest on niedostatecznie zbadany przez naukowców. Uzasadnia to ocenę potencjalnej skali tego rynku, realizacji celu, dla którego został stworzony, a także przesłanek i barier jego rozwoju. Metodyka. Zastosowanymi metodami badawczymi była analiza ilościowa (obliczenie potencjalnego niedoboru wymogu MREL i potrzeb w zakresie emisji papierów wartościowych na podstawie danych sprawozdawczych) oraz analiza jakościowa (pod kątem oceny wyzwań). Wyniki/Rezultaty badania. Główną determinantą jego potencjału jest wielkość niedoboru MREL, która jest uzależniona od sytuacji finansowej banków, a częściowo od strategii organów przymusowej restrukturyzacji (odpowiedzialnych za ustalenie poziomu tego wymogu). Główne wyzwania stojące przed polskim rynkiem obligacji SNP związane są z perspektywami dalszego rozwoju sektora bankowego i jego otoczenia (biznesowego i strategicznego). Niemniej jednak wydaje się, że potencjał rynku obligacji SNP w Polsce jest niedoceniany. Artykuł wzbogaca ogólną wiedzę na temat źródeł finansowania banków.
Źródło:
Finanse i Prawo Finansowe; 2023, 2 (Numer Specjalny); 145-167
2391-6478
2353-5601
Pojawia się w:
Finanse i Prawo Finansowe
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Search for SNP mutations of chosen genes of the hypothalamic-pituitary axis in laying hens
Poszukiwanie mutacji SNP wybranych genów osi podwzgórzowo-przysadkowej kur nieśnych
Autorzy:
Rozempolska-Rucińska, I.
Ciechocińska, M.
Ślaska, B.
Zięba, G.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2197069.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Źródło:
Annales Universitatis Mariae Curie-Skłodowska. Sectio EE: Zootechnica; 2011, 29, 1; 36-41
0239-4243
2083-7399
Pojawia się w:
Annales Universitatis Mariae Curie-Skłodowska. Sectio EE: Zootechnica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
SCD1 SNP in relation to breeding value of milk production traits in Polish Holstein-Friesian cows
SNP w genie SCD1 w powiązaniu z wartością hodowlaną dla cech użytkowości mlecznej u krów rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej
Autorzy:
Kulig, H.
Kowalewksa-Luczak, I.
Zukowski, K.
Kunicka, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/45069.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie. Wydawnictwo Uczelniane ZUT w Szczecinie
Opis:
The aim of this study was to investigate associations between SCD1 polymorphism and the estimated breeding value of milk production traits (milk, fat and protein yield, kg; fat and protein content, %) in the Polish Holstein-Friesian cows’ herd. The genotype and allele frequencies for g.10329C>T SNP in exon 5 of SCD1 gene were estimated in the examined herd. Statistical analysis revealed that studied polymorphism significantly affected the breeding value of protein content in milk (P ≤ 0.05). The results indicated that selection for the SCD1-TT individuals might contribute to increased protein content in milk in the Polish Holstein-Friesian cows. Further studies are needed to confirm these results
Celem badań było zbadanie zależności między polimorfizmem genotypu SCD1 a oszacowaną wartością hodowlaną dla cech użytkowości mlecznej (wydajnoś ci mleka, tłuszczu i białka, kg oraz zawartością tłuszczu i białka w mleku, %) w stadzie krów rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej. Oszacowano częstość występowania genotypów i alleli SNP g.10329C>T zlokalizowanego w eksonie 5. genu SCD1. Analiza statystyczna wykazała, że badany polimorfizm wpływał istotnie na wartość hodowlaną dla zawartości białka (P ≤ 0,01). Wyniki wskazują, że uwzględnienie w selekcji osobników z genotypem SCD1-TT mogłoby przyczynić się do zwiększenia zawartości białka w mleku krów rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej.Wymagane jest jednak kontynuowanie badań aby móc zweryfikować uzyskane wyniki.
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica; 2013, 12, 1
1644-0714
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Sampling Properties of Estimators of Nucleotide Diversity at Discovered snp Sites
Autorzy:
Renwick, A.
Bonnen, P. E.
Trikka, D.
Nelson, D. L.
Chakraborty, R.
Kimmel, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/908150.pdf
Data publikacji:
2003
Wydawca:
Uniwersytet Zielonogórski. Oficyna Wydawnicza
Tematy:
genetyka
statystyka
single nucleotide polymorphisms
ascertainment bias
nucleotide diversity
molecular evolution
Opis:
SNP sites are generally discovered by sequencing regions of the human genome in a limited number of individuals. This may leave SNP sites present in the region, but containing rare mutant nucleotides, undetected. Consequently, estimates of nucleotide diversity obtained from assays of detected SNP sites are biased. In this research we present a statistical model of the SNP discovery process, which is used to evaluate the extent of this bias. This model involves the symmetric Beta distribution of variant frequencies at SNP sites, with an additional probability that there is no SNP at any given site. Under this model of allele frequency distributions at SNP sites, we show that nucleotide diversity is always underestimated. However, the extent of bias does not seem to exceed 10-15% for the analyzed data. We find that our model of allele frequency distributions at SNP sites is consistent with SNP statistics derived based on new SNP data at ATM, BLM, RQL and WRN gene regions. The application of the theory to these new SNP data as well as to the literature data at the LPL gene region indicates that in spite of ascertainment biases, the observed differences of nucleotide diversity across these gene regions are real. This provides interesting evidence concerning the heterogeneity of the rates of nucleotide substitution across the genome.
Źródło:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science; 2003, 13, 3; 385-394
1641-876X
2083-8492
Pojawia się w:
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Preliminary study to explore gene-$\text{PM}_\text{2.5}$ interactive effects on respiratory system in traffic policemen
Autorzy:
Zhao, Jinzhuo
Bo, Liang
Gong, Changyi
Cheng, Peng
Kan, Haidong
Xie, Yuquan
Song, Weimin
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2177102.pdf
Data publikacji:
2015-08-07
Wydawca:
Instytut Medycyny Pracy im. prof. dra Jerzego Nofera w Łodzi
Tematy:
inflammation
Fine Particles
traffic workers
respiratory system
single nucleotide polymorphism
SNP
Opis:
Objectives Traffic-related particulate matter (PM) is one of the major sources of air pollution in metropolitan areas. This study is to observe the interactive effects of gene and fine particles (particles smaller than 2.5 μm – $\text{PM}_\text{2.5}$) on the respiratory system and explore the mechanisms linking $\text{PM}_\text{2.5}$ and pulmonary injury. Material and Methods The participants include 110 traffic policemen and 101 common populations in Shanghai, China. Continuous 24 h individual-level $\text{PM}_\text{2.5}$ is detected and the pulmonary function, high-sensitivity C-reactive protein (hs-CRP), Clara cell protein 16 (CC16) and the polymorphism in CXCL3, NME7 and C5 genes are determined. The multiple linear regression method is used to analyze the association between $\text{PM}_\text{2.5}$ and health effects. Meanwhile, the interactive effects of gene and $\text{PM}_\text{2.5}$ on lung function are analyzed. Results The individual $\text{PM}_\text{2.5}$ exposure for traffic policemen was higher than that in the common population whereas the forced expiratory volume in 1 s (FEV₁), the ratio of FEV₁ to forced vital capacity (FEV₁/FVC) and lymphocytes are lower. In contrast, the hs-CRP level is higher. In the adjusted analysis, $\text{PM}_\text{2.5}$ exposure was associated with the decrease in lymphocytes and the increase in hs-CRP. The allele frequencies for NME7 and C5 have significant differences between FEV₁/FVC ≤ 70% and FEV₁/FVC > 70% participants. The results didn’t find the interaction effects of gene and $\text{PM}_\text{2.5}$ on FEV₁/FVC in all the 3 genes. Conclusions The results indicated that traffic exposure to high levels of $\text{PM}_\text{2.5}$ was associated with systemic inflammatory response and respiratory injury. Traffic policemen represent a high risk group suffering from the respiratory injury.
Źródło:
International Journal of Occupational Medicine and Environmental Health; 2015, 28, 6; 971-983
1232-1087
1896-494X
Pojawia się w:
International Journal of Occupational Medicine and Environmental Health
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Prediction of indels and SNP’s in coding regions of glutathione peroxidases - an important enzyme in redox homeostasis of plants
Autorzy:
Ganguli, S.
Datta, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11303.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:
prediction
indel
single nucleotide polymorphism
coding region
glutathione peroxidase
enzyme
redox
homeostasis
plant
genotype
stress tolerance
Opis:
Plant glutathione peroxidases are an important class of enzymes which play key roles in the stress adaptability of plants both in context of biotic and abiotic stress pathways. They have been over the years much studied in animals since the catalytic residues are comprised of selenocysteine a variant amino acid which is ribosomally encoded with the help of an RNA structural element known as SECIS. Various workers over the years have shown that plant glutathione peroxidases play active roles in ROS sequestration, lipid hydroperoxidation as well as regulate glutathione levels. However, each plant has various patterns of glutathione peroxidase expression and action and in some plants certain isoforms have not been detected at all. This work focuses on the prediction and identification of single nucleotide polymorphisms (SNPs) and INDELs in the coding regions of plant glutathione peroxidases, with the help of a Bayesian based algorithm subsequently validated. A large number of informative sites were detected 279 of which had variant frequency of ≥ 50 %. This data should be beneficial for future studies involving genetic manipulation and population based breeding experiments.
Źródło:
International Letters of Natural Sciences; 2014, 02
2300-9675
Pojawia się w:
International Letters of Natural Sciences
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Polimorfizmy rs2058539 oraz rs10953505 genu wisfatyny, jej stężenie w surowicy krwi a występowanie nadwagi i otyłości u pacjentów zgłaszających się do poradni podstawowej opieki zdrowotnej
Rs2058539 and rs10953505 visfatin gene polymorphisms their plasma concentrations and occurrence of overweight and obesity among patients reporting to primary healthcare clinic
Autorzy:
Kała, Ewa
Bodek, Izabela
Trelińska, Oliwia
Gładysz, Patrycja
Lepiarczyk, Oskar
Śmigel, Aleksandra
Gola, Mateusz
Śnit, Mirosław
Grzeszczak, Władysław
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1037754.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
Tematy:
nadwaga
otyłość
polimorfizm snp
wisfatyna
overweight
obesity
polymorphism snp
visfatin
Opis:
INTRODUCTION: Visfatin is a newly discovered adipocytokine displaying insulino-mimetic properties. The role of the investigated polymorphisms in visfatin coding genes and their blood plasma levels in the development of increased body mass remains controversial. AIM: The aim of the study is to assess a potential correlation between selected visfatin gene polymorphisms, their plasma concentration, and the prevalence of overweight and obesity in patients reporting to a primary healthcare clinic. MATERIALS AND METHODS: The study included 476 adult patients from southern regions of Poland reporting to a primary healthcare clinic. The subjects were divided into 3 groups based on the value of waist circumference. The genotyping of visfatin gene polymorphisms (rs2058539 and rs10953505) was conducted with fluorescently marked probes by using predesigned single nucleotide polymorphisms assessment sets – TaqMan Pre-designed SNP Genotyping Assay (Applied Biosystems). The visfatin plasma levels were established using the ELISA method. RESULTS: The study showed no correlation between visfatin plasma concentration and the examined gene polymorphisms. A statistically relevant difference in the occurrence of the rs2058539 polymorphism in obese persons in contrast to those with normal waist girth, was initially noted. An “A” allele of the rs2058539 polymorphism was significantly more often present in obese patients. CONCLUSIONS: Based on the carried-out research, it can be concluded that the rs2058539 polymorphism of the visfatin gene can take part in the pathogenesis of excessive body weight increase. There is no correlation between the studied polymorphisms and visfatin plasma concentration.
WSTĘP: Wisfatyna jest stosunkowo niedawno odkrytą adipocytokiną, wykazującą m.in. efekt insulinomimetyczny. Udział badanych polimorfizmów genu kodującego wisfatynę oraz poziom jej stężenia w surowicy krwi w rozwoju nadwagi i otyłości pozostaje nadal kontrowersyjny. CEL PRACY: Ocena potencjalnego związku między wybranymi polimorfizmami genu wisfatyny, jej stężeniem w surowicy krwi a występowaniem nadwagi i otyłości w populacji pacjentów zgłaszających się do poradni ogólnej podstawowej opieki zdrowotnej (POZ). MATERIAŁ I METODYKA: Badaniem objęto łącznie 476 dorosłych pacjentów z rejonu Polski Południowej, którzy kolejno zgłaszali się po poradę do POZ. Badanych podzielono na 3 grupy, opierając się na wartości obwodu pasa (grupa kontrolna, grupa z otyłością, grupa z nadwagą). Genotypowanie polimorfizmów genu wisfatyny (rs2058539 oraz rs10953505) prowadzono z wykorzystaniem znakowanych fluorescencyjnie sond, używając gotowych zestawów do oznaczania polimorfizmu pojedynczego nukleotydu-TaqManPre-designed SNP Genotypie Assai (Applied Biosystems). Stężenia wisfatyny w surowicy krwi oznaczano metodą ELISA. Do obliczeń statystycznych wykorzystano program Statistica 8.0. WYNIKI: Badania wykazały brak korelacji między występowaniem badanych polimorfizmów genu wisfatyny a jej stężeniem w surowicy krwi. Stwierdzono istotną statystycznie różnicę w występowaniu polimorfizmu rs2058539 między osobami z nadwagą a osobami z prawidłowym obwodem pasa. Ponadto zaobserwowano znamiennie częstsze występowanie allelu „C” polimorfizmu rs2058539 u osób z nadwagą. WNIOSKI: 1. Na podstawie przeprowadzonych badań można wnioskować, że polimorfizm rs2058539 genu wisfatyny może brać udział w patogenezie nadmiernego wzrostu masy ciała. 2. Nie stwierdza się zależności między badanymi polimorfizmami a stężeniem wisfatyny w surowicy krwi.
Źródło:
Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2015, 69; 184-190
1734-025X
Pojawia się w:
Annales Academiae Medicae Silesiensis
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Wyświetlanie 1-15 z 33

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies