Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "dioxygenase" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-7 z 7
Tytuł:
Characterization of catechol 2,3-dioxygenase from Planococcus sp. strain S5 induced by high phenol concentration
Autorzy:
Hupert-Kocurek, Katarzyna
Guzik, Urszula
Wojcieszyńska, Danuta
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039708.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
Planococcus
phenol degradation
catechol 2,3- dioxygenase
Opis:
This study aimed at characterization of a new catechol 2,3-dioxygenase isolated from a Gram-positive bacterium able to utilize phenol as the sole carbon and energy source. Planococcus sp. strain S5 grown on 1 or 2 mM phenol showed activity of both a catechol 1,2- and catechol 2,3-dioxygenase while at a higher concentrations of phenol only catechol 2,3-dioxygenase activity was observed. The enzyme was optimally active at 60°C and pH 8.0. Kinetic studies showed that the Km and Vmax of the enzyme were 42.70 µM and 329.96 mU, respectively. The catechol 2,3-dioxygenase showed the following relative meta-cleavage activities for various catechols tested: catechol (100%), 3-methylcatechol (13.67%), 4-methylcatechol (106.33%) and 4-chlorocatechol (203.80%). The high reactivity of this enzyme towards 4-chlorocatechol is different from that observed for other catechol 2,3-dioxygenases. Nucleotide sequencing and homology search revealed that the gene encoding the S5 catechol 2,3-dioxygenase shared the greatest homology with the known genes encoding isoenzymes from Gram-negative Pseudomonas strains.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2012, 59, 3; 345-351
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Altering substrate specificity of catechol 2,3-dioxygenase from Planococcus sp. strain S5 by random mutagenesis
Autorzy:
Hupert-Kocurek, Katarzyna
Wojcieszyńska, Danuta
Guzik, Urszula
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039199.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
Planococcus
catechol 2,3-dioxygenase
substrate specificity
mutagenesis
Opis:
c23o gene, encoding catechol 2,3-dioxygenase from Planococcus sp. strain S5 was randomly mutagenized to generate variant forms of the enzyme with higher degradation activity. Additionally, the effect of introduced mutations on the enzyme structure was analyzed based on the putative 3D models the wild-type and mutant enzymes. C23OB58 and C23OB81 mutant proteins with amino acid substitutions in close proximity to the enzyme surface or at the interface and in the vicinity of the enzyme active site respectively showed the lowest activity towards all catecholic substrates. The relative activity of C23OC61 mutant towards para-substituted catechols was 20-30% lower of the wild-type enzyme. In this mutant all changes: F191I, C268R, Y272H, V280A and Y293D were located within the conserved regions of C-terminal domain. From these F191I seems to have significant implications for enzyme activity. The highest activity towards different catechols was found for mutant C23OB65. R296Q mutation improved the activity of C23O especially against 4-chlorocatechol. The relative activity of above-mentioned mutant detected against this substrate was almost 6-fold higher than the wild-type enzyme. These results should facilitate future engineering of the enzyme for bioremediation.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2014, 61, 4; 705-710
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Enancjoselektywna enzymatyczna desymetryzacja katalizowana oksydoreduktazami. Reakcje utleniania. Część 2
Enantioselective enzymatic desymmetrization catalyzed by oxidoreductases. Oxidation reactions. Part 2
Autorzy:
Karczmarska-Wódzka, A.
Kołodziejska, R.
Tafelska-Kaczmarek, A.
Studzińska, R.
Wróblewski, M.
Augustyńska, B.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/172457.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Chemiczne
Tematy:
dioksygenaza
oksydaza
peroksydaza
reakcja utleniania
dioxygenase
oxidase
peroxidase
oxidation reaction
Opis:
In continuation of our work, we herein describe next enzyme classes applied for oxidation reaction. Dioxygenases, oxidases, and peroxidases are successfully used in the synthesis of desymmetrization products with high yields and enantiomeric excesses. Aromatic dioxygenases, such as toluene dioxygenase (TDO), naphthalene dioxygenase (NDO), and biphenyl dioxygenase (BPDO) found in the prokaryotic microorganisms are enzymes belonging to the dioxygenase class and are the most commonly used in organic synthesis. The α-oxidation of various fatty acids in the presence of an α-oxidase from germinating peas is one of the few examples of oxidases application in asymmetric organic synthesis. The intermediary α-hydroxyperoxyacids can undergo two competing reactions: decarboxylation of the corresponding aldehydes or reduction to the (R)-2-hydroxy acids. In order to eliminate the competitive decarboxylation reaction tin(II) chloride is used as an in situ reducing agent. Peroxidases are the redox enzymes found in various sources such as animals, plants, and microorganisms. Due to the fact that, in contrast to monooxygenases, no additional cofactors are required, peroxidases are highly attractive for the preparative biotransformation. Oxidation reactions catalyzed by (halo)peroxydases are also often used in organic synthesis. N-Oxidation of amines, for instance, leads to the formation of the corresponding aliphatic N-oxides, aromatic nitro-, or nitrosocompounds. From a preparative synthesis standpoint, however, sulfoxidation of thioether is important since it was proven to proceed in a highly stereo- and enantioselective manner. Furthermore, depending on the source of haloperoxidase, chiral sulfoxides of opposite configurations can be obtained.
Źródło:
Wiadomości Chemiczne; 2015, 69, 1-2; 53-64
0043-5104
2300-0295
Pojawia się w:
Wiadomości Chemiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Regulation of abscisic acid metabolism in relation to the dormancy and germination of cereal grains
Autorzy:
Fidler, J.
Zdunek-Zastocka, E.
Bielawski, W.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/56500.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase
abscisic acid
metabolism
dormancy
germination
cereal grain
ABA 8'-hydroxylase gene
Opis:
Seed dormancy is of particular importance in the cultivation of cereals, as it directly affects the quality of crop yield. If the dormancy period is too short, this may lead to pre-harvest sprouting, whereas a dormancy period that is too long may cause uneven germination; both of these scenarios are associated with economic losses. Most enzymes engaged in the metabolism of abscisic acid (ABA) have been identified, and significant progress has been made in understanding the role of this phytohormone in the induction and maintenance of dormancy, mainly as a result of research conducted in Arabi-dopsis. Much less is known about the metabolism and function of ABA in cereal grains, especially in relation to dormancy and germination. This review focuses on the regulation of ABA metabolism in dormant and non-dormant cereal grains, in both the dry state and upon imbibition. Moreover, this review describes the influence of factors such as after-ripening, light, temperature, nitric oxide, and reactive oxygen species (ROS) on the dormancy and germination of cereal grains. These factors, with the exception of ROS, appear to affect the level of dormancy and germination of grains through regulation of ABA metabolism.
Źródło:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae; 2015, 84, 1
0001-6977
2083-9480
Pojawia się w:
Acta Societatis Botanicorum Poloniae
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
LlGA20ox1 and LlGA20ox2 – the Lupinus luteus homologues of Arabidopsis genes involved in gibberellin biosynthesis pathway
Autorzy:
Marciniak, K.
Kesy, J.
Glazinska, P.
Wilmowicz, E.
Kucko, A.
Wojciechowski, W.
Banach, M.
Kopcewicz, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/81168.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
plant growth
plant development
gene encoding
gibberellin
signal transduction pathway
yellow lupin
Lupinus luteus
phytohormone
gamma-lactone
2-oxoglutarate
dioxygenase
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Teoria immunoedycji – sieci immunosupresyjne w mikrośrodowisku nowotworów. Nowe cele dla immunoterapii
Immune edition theory – immunosuppressive network in tumor microenvironment. New targets for immunotherapy
Autorzy:
Sznurkowski, Jacek J.
Emerich, Janusz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1030644.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Medical Communications
Tematy:
FOXP3
IDO
IDO2
Tregs
cancer immunoediting
immune escape
indoleamine 2.3-dioxygenase
3-dioksygenaza
foxp3
ido
ido2
rakowa immunoedycja
ucieczka immunologiczna
indoleamina 2
Opis:
Immunotherapy nowadays becomes an increasingly important topic in oncology. Immunotherapeutic strategies implemented to date focused mainly on stimulation or supplementation of function of effector cells. Past decade witnessed a tremendous progress in our understanding of mechanisms whereby tumors acquire an ability to escape host’s immune surveillance. There appeared the notion of cancer-dependent “immunosuppressive network”. An indicator of immunosuppression in tumor microenvironment is the presence of regulator T lymphocytes (Tregs) of the CD4+T subgroup. Expression of FOXP3 is directly associated with suppressive function of these cells. Other studies revealed that indoleamine 2.3-dioxygenase (IDO) induces peripheral immune tolerance to tumor antigens. In physiological conditions, IDO is indispensable in creation of a microenvironment preventing destruction of selected tissues by “hyperactive” immune system. It is currently believed that IDO-dependent increase of immune suppression enables survival and proliferation of cancer cells. Analysis of expression of FOXP3 antigens and IDO will provide an insight to the extent of “immunosuppressive network” in direct neighborhood of vulvar cancer cells and in adjacent lymphatic system. Further research focused on tumor-dependent “immunosuppressive network” is of paramount importance, as it may provide entirely new targets for therapeutic intervention, this time using low-molecular-weight compounds instead of biological factors used hitherto in immune therapies. This paper explains basic concepts of immunoedition theory and describes the role of IDO and regulatory T lymphocytes (Tregs) in the escape of cancer cells from immune surveillance.
W ostatnim czasie szczególnego znaczenia w onkologii nabiera immunoterapia. Dotychczasowe strategie immunoterapeutyczne skupiały się głównie na stymulowaniu lub uzupełnianiu funkcji komórek efektorowych. W ostatnim dziesięcioleciu dokonał się ogromny postęp w zrozumieniu sposobu, w jaki guzy nowotworowe nabywają zdolność do ucieczki przed układem immunologicznym. Pojawiło się pojęcie sieci immunosupresyjnej powstającej pod wpływem raka. Wykładnikiem immunosupresji w mikrośrodowisku guzów nowotworowych jest obecność regulatorowych limfocytów T (Tregs), które należą do podgrupy komórek CD4+T. Ekspresja FOXP3 jest bezpośrednio związana z supresyjną funkcją tych komórek. W innych badaniach wykazano, że indoleamina 2,3-dioksygenaza (IDO) powoduje powstawanie obwodowej tolerancji immunologicznej wobec antygenów guza. W stanie fizjologicznym IDO jest niezbędna w tworzeniu środowiska, które ogranicza zniszczenie tkanek przez „nadaktywny” układ odpornościowy. Uważa się, że zwiększanie supresji immunologicznej przez IDO umożliwia przetrwanie i wzrost komórek rakowych. Analiza ekspresji antygenów FOXP3 oraz IDO pozwoli na zbadanie, jak duża jest „sieć immunosupresyjna” w bezpośrednim sąsiedztwie komórek raka sromu oraz w przyległym do nich układzie limfatycznym. Poszukiwanie „sieci immunosupresyjnych” wytwarzanych przez nowotwór wydaje się mieć ogromne znaczenie, ponieważ mogą dostarczyć całkiem nowych miejsc dla terapeutycznej interwencji, tym razem przy użyciu małych związków molekularnych zamiast stosowanych dotychczas (w immunoterapiach) czynników biologicznych. W poniższym artykule autorzy wyjaśniają podstawy teorii immunoedycji oraz opisują udział IDO i regulatorowych limfocytów T (Tregs) w ucieczce komórek nowotworowych spod nadzoru immunologicznego.
Źródło:
Current Gynecologic Oncology; 2009, 7, 4; 282-287
2451-0750
Pojawia się w:
Current Gynecologic Oncology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Estimation of significance of AlkB and AlkA proteins in DNA repair in Escherichia coli model
Autorzy:
Sokołowska, B.
Maciejewska, A. M.
Jóźwik, A.
Kuśmierek, J. T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/333316.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Uniwersytet Śląski. Wydział Informatyki i Nauki o Materiałach. Instytut Informatyki. Zakład Systemów Komputerowych
Tematy:
rozpoznawanie obrazów
klasyfikator najbliższych sąsiadów
analiza cech pracy odbiornika
naprawa DNA
adaptacyjna odpowiedź
powstawanie mutacji
bakterie e.coli
pattern recognition
fuzzy k-NN classifier
ROC analysis
DNA repair
adaptive response
mutagenesis
AlkB dioxygenase
AlkA glycosylase
E.coli
Opis:
The paper concerns estimation of significance of differences of mutagenesis level between the wild-type strain (wt) and its derivatives which differ in DNA repair ability, namely alkA and alkB strain, devoided AlkA glycosylase and AlkB dioxygenase activity, respectively. The strains were analyzed for their ability to repair 1,N6-ethenoadenine (εA) - chloroacetaldehyde adduct to DNA. The analysis was done using classical statistical and pattern recognition methods. The obtained results confirmed that AlkB dioxygenase plays the most important role in εA repair in E. coli in the experimental modeling.
Źródło:
Journal of Medical Informatics & Technologies; 2011, 17; 321-326
1642-6037
Pojawia się w:
Journal of Medical Informatics & Technologies
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-7 z 7

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies