Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "pcr-rflp" wg kryterium: Wszystkie pola


Wyświetlanie 1-10 z 10
Tytuł:
Zastosowanie analizy PCR-RFLP do wykrywania i identyfikacji fitoplazm w roślinach ozdobnych
Autorzy:
Sliwa, H.
Kaminska, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/808492.pdf
Data publikacji:
2005
Wydawca:
Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie. Wydawnictwo Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie
Opis:
Rośliny ozdobne - tulipan, lilia, dalia i serduszka okazała (Dicentra spectabilis) - ze zmianami w zabarwieniu i deformacją liści i kwiatów, zaburzeniami w kwitnieniu i zamieraniem pąków kwiatowych oraz nadmiernym wybijaniem pędów bocznych, zostały przetestowane na obecność fitoplazm przy pomocy analizy PCR-RFLP. Do wykrywania fitoplazm zastosowano dwuetapową reakcję PCR - do pierwszego etapu użyto parę starterów uniwersalnych dla fitoplazm (P1/P7) a do drugiego trzy pary starterów uniwersalnych (R16F2n-R16R2, fA-rA, Pc399-P1694) oraz startery specyficzne dla fitoplazm z grupy żółtaczki astra (R16IF1-R16IR1) i proliferacji jabłoni (fAT-rAS). Identyfikację fitoplazm przeprowadzono na podstawie wyników analizy restrykcyjnej wykonanej przy użyciu sześciu enzymów (Hpall, Rsal, Alul, MseI, Sspl, oraz Hhal). Na postawie analizy PCR-RFLP w testowanych roślinach stwierdzono obecność dwóch grup fitoplazm. W tulipanach, serduszkach okazałych i jednej odmianie lilii wykryto fitoplazmy z grupy żółtaczki astra (AY, 16SrI), przy czym w serduszkach okazałych stwierdzono obecność fitoplazm z dwóch podgrup: I-B lub I- A, natomiast w lilii wykryto fitoplazmę z podgrupy I-A. Fitoplazmę z grupy proliferacji jabłoni (AP, 16SrX) wykryto w jednej odmianie lilii, natomiast w badanych daliach stwierdzono obecność mieszaniny fitoplazm AY i AP.
Diseased ornamental plants - tulips, lilies, dahlias and bleeding hearts (Di- centra spectabilis) - with symptoms of flower and leaf discolouration and malformation, flower bud deficiency and abnormal shoot production were tested for the presence of phytoplasmas using PCR-RFLP assay. Phytoplasmas were detected by two-step PCR assay. The first round was done using P1-P7 primer set, universal for phytoplasmas. The nested PCRs were done with universal (R16F2n-R16R2, fA-rA, Pc399-P1694) and aster yellows group-specific (R16IF1-R16IR1) or apple proliferation group-specific (fAT-rAS) primer pairs. Identification of phytoplasmas was accomplished through RFLP analysis using Hpall, Rsa\,Alu\, MseI, Sspl, or Hha\ endonucleases. On the basis of PCR-RFLP analysis, two different phytoplasma groups were identified in tested plants. Phytoplasmas belonging to the subgroup I-B or I-A of aster yellows group (AY, 16SrI) were found in samples collected from tulips, bleeding hearts and one lily cultivar. One lily cultivar was infected with phytoplasma from apple proliferation group (AP, 16SrX), whereas mix of two different phytoplasmas - belonging to AY and AP groups - were detected in the tested dahlias.
Źródło:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych; 2005, 504, 2
0084-5477
Pojawia się w:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie markerow DNA [RAPD, SSR, PCR-RFLP i STS] w genetyce drzew lesnych, entomologii, fitopatologii i lowiectwie
Molecular markers [RAPD, SSR, PCR-RFLP and STS] in forest-tree genetics, entomology, phytopathology and game management
Autorzy:
Nowakowska, J.A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/45939.pdf
Data publikacji:
2006
Wydawca:
Instytut Badawczy Leśnictwa
Tematy:
lowiectwo
zastosowanie
genetyka roslin
markery genetyczne
entomologia lesna
metody badan
genetyka zwierzat
lesnictwo
zwierzeta lowne
metoda SSR
metoda RAPD
metoda PCR-RFLP
metoda STS
drzewa lesne
fitopatologia lesna
DNA
Źródło:
Leśne Prace Badawcze; 2006, 1; 73-101
1732-9442
2082-8926
Pojawia się w:
Leśne Prace Badawcze
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wystepowanie fitoplazm w drzewach i krzewach ozdobnych w Polsce
Autorzy:
Kaminska, M
Sliwa, H
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/799222.pdf
Data publikacji:
2006
Wydawca:
Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie. Wydawnictwo Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie
Tematy:
objawy chorobowe
fitoplazmy
metody badan
fitoplazma proliferacji jabloni
krzewy ozdobne
rosliny ozdobne
metoda PCR-RFLP
fitoplazma zoltaczki astra
disease symptom
phytoplasma
research method
apple proliferation phytoplasma
ornamental shrub
PCR-RFLP method
aster yellows phytoplasma
Opis:
W latach 1998-2005 prowadzono obserwacje i badania nad występowaniem fitoplazm w drzewach i krzewach ozdobnych w Polsce. Przedmiotem badań były krzewy z rodzaju Clematis sp., Magnolia spp. i Rosa sp. oraz drzewa z rodzaju Acer sp., Carpinus sp., Fagus sp., Fraxinus sp. i Quercus spp. wykazujące objawy chorobowe sugerujące porażenie przez fitoplazmy. Objawy te obejmowały zahamowanie wzrostu, zmiany w zabarwieniu a nawet nekrozę i deformację liści, proliferację i zamieranie pędów, czasem deformację i zielenienie lub brak kwiatów oraz zamieranie roślin. Do wykrywania i identyfikacji fitoplazm stosowano test biologiczny oparty na reakcji rośliny testowej Catharanthus roseus, zakażanej techniką szczepienia, oraz analizę PCR-RFLP. Stosując technikę szczepienia, fitoplazmy przeniesiono z chorych róży, magnolii i klonu na siewki C. roseus. Przy pomocy techniki łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR) ze starterami amplifikującymi fragment 16Sr DNA fitoplazm, obecność fitoplazmatycznego DNA wykryto w roślinach Rosa spp., Magnolia spp., Clematis sp., Fraxinus excelsior, Carpinus sp. i Acer negundo oraz w eksperymentalnie zakażonych siewkach C. roseus. Analiza RFLP produktu amplifikacji z użyciem enzymów restrykcyjnych AluI, HhaII MseI i RsaI wykazała, że rośliny grabu, jesionu, klonu, magnolii, powojnika i róży były naturalnie porażone przez fitoplazmę z grupy żółtaczki astra (16SrI-B) - 'Ca. Phytoplasma asteris’. W niektórych roślinach róży i magnolii stwierdzono także fitoplazmę z grupy proliferacji jabłoni (16SrX-A) - ‘Ca. Phytoplasma mali’. W badanych roślinach fitoplazmy występowały nierównomiernie i w stosunkowo niskiej koncentracji, przez co mogły być wykrywalne dopiero w drugiej rundzie PCR. W roślinach buka i dębu, mimo wyraźnych symptomów, nie wykryto obecności fitoplazmatycznego DNA.
The presence of phytoplasmas in six plant species (Acer sp., Carpinus sp., Fagus sp, Fraxinus sp. i Quercus spp) with severe symptoms of leaf discoloration and malformation, leaf and shoot necrosis, abnormal production of secondary shoots and decline, as well as in periwinkle plants experimentally inoculated by grafting was demonstrated by PCR with primer pairs amplifying phytoplasma 16Sr DNA fragment. The RFLP analysis of the PCR product done with restriction enzymes AluI, HhaII MseI and RsaI showed that the tested rose, magnolia, clematis, ash-leaf maple, ash and hornbeam plants were naturally infected with aster yellows phytoplasma (16SrI-B), now reclassified as ‘Candidatus Phytoplasma asteris’. Apple proliferation phytoplasma (16SrX-A), now reclassified as 'Candidatus Phytoplasma mali’, was detected in diseased roses and magnolias. The phytoplasmas were stated using nested PCR in affected woody plants, indicating their law titre and uneven distribution. We failed to detect the phytoplasma presence in diseased Quercus and Fagus trees.
Źródło:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych; 2006, 510, 1; 255-261
0084-5477
Pojawia się w:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody oparte o amplifikację DNA techniką PCR wykorzystywane w ocenie bioróżnorodności mikroorganizmów glebowych
Methods based on DNA PCR-amplification for evaluation of the soil microbial diversity
Autorzy:
Łyszcz, Małgorzata
Gałązka, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1034148.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Tematy:
soil microorganism
genetic diversity
molecular markers
PCR based methods
ARDRA
PCR-RFLP
RAPD
REP-PCR
TRFLP
Opis:
Mikroorganizmy glebowe, pod względem cech genomowych i fenotypowych, stanowią wysoce zróżnicowaną grupę organizmów żywych. Z powodu tak dużej różnorodności ważne jest dobranie odpowiednich metod, dających największy stopień różnicowania mikroorganizmów. Narzędziami umożliwiającym analizę zmienności genetycznej mikroorganizmów są techniki genetyczne, a wśród nich jedną z najważniejszych jest łańcuchowa reakcja polimerazy, czyli PCR (Polymerase Chain Reaction), technika opracowana w latach 1980. Niniejsza praca stanowi przegląd podstawowych zagadnień dotyczących badania zmienności genetycznej mikroorganizmów glebowych w oparciu o markery molekularne z wykorzystaniem technik bazujących na reakcji PCR tj. PCR-RFLP, TRFLP, ARDRA, RAPD.
Soil microorganisms represent a highly diverse group of living organisms in terms of genomic and phenotypic characteristics. Due to such a large diversity, it is important to select appropriate identification methods which would secure its most complete determination. Genetic techniques are proper tools of choice for analyzing genetic variability of microorganism, the most important of which is the polymerase chain reaction (PCR), developed in the 1980s. This work presents an overview of the basic issues concerning studies on genetic variability of soil microorganisms with help of molecular markers and application of PCR techniques such as PCR-RFLP, TRFLP, ARDRA, RAPD.
Źródło:
Kosmos; 2017, 66, 2; 193-206
0023-4249
Pojawia się w:
Kosmos
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Charakterystyka genetyczna PCR-RFLP oraz ocena zdrowotnosci wybranych populacji debu elblaskiego i krotoszynskiego
Genetic characterization in relation to the health state of oak populations in the Elblaski i Krotoszynski regions of Poland
Autorzy:
Nowakowska, J.A.
Oszako, T.
Bieniek, J.
Rakowski, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/45956.pdf
Data publikacji:
2007
Wydawca:
Instytut Badawczy Leśnictwa
Tematy:
dab elblaski
dab krotoszynski
zmiennosc genetyczna
populacje roslin
ekotypy
Quercus robur
lesnictwo
zdrowotnosc drzew
DNA chloroplastowy
dab szypulkowy
metoda PCR-RFLP
drzewa lesne
Źródło:
Leśne Prace Badawcze; 2007, 3; 33-51
1732-9442
2082-8926
Pojawia się w:
Leśne Prace Badawcze
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Struktura ektomikoryz u sadzonek sosny zwyczajnej inokulowanej wybranymi grzybami mikoryzowymi, wysadzonych na gruncie porolnym i amrginalnym
Autorzy:
Hilszczanska, D.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/45496.pdf
Data publikacji:
2005
Wydawca:
Instytut Badawczy Leśnictwa
Tematy:
grunty porolne
metody badan
sadzonki mikoryzowane
ektomikoryza
sosna zwyczajna
lesnictwo
struktura
metoda PCR-RFLP
grunty marginalne
Pinus sylvestris
uprawy lesne
Źródło:
Leśne Prace Badawcze; 2005, 1; 43-52
1732-9442
2082-8926
Pojawia się w:
Leśne Prace Badawcze
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Charakterystyka wybranych markerów molekularnych
Characteristic of selected molecular markers
Autorzy:
Bolc, Paulina
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199379.pdf
Data publikacji:
2020-10-22
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
markery molekularne
RFLP
AFLP
RAPD
SSR
ISSR
SRAP
SNP
PCR
polimorfizm
różnorodność genetyczna
molecular markers
polymorphism
genetic diversity
Opis:
Postęp, jaki nastąpił w biologii molekularnej poprzez wprowadzenie markerów molekularnych nowej generacji, w ciągu ostatnich 20 lat umożliwił znaczny rozwój wielu dziedzin badań. Możliwe stało się uzyskanie dokładniejszych informacji genetycznych pozwalających na lepsze zrozumienie zasobów genetycznych organizmów. Markerem molekularnym może być każda sekwencja nukleotydowa (wybrany fragment DNA), rozproszony w całym genomie, której zmienność między osobnikami lub grupami taksonomicznymi umożliwia precyzyjną identyfikację osobnika/taksonu. Kompilacja właściwości enzymów restrykcyjnych jak również reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) w technikach generujących markery molekularne pozwoliła na efektywne wykorzystanie ich w taksonomicznych, ewolucyjnych i ekologicznych badaniach roślin.
Over the last 20 years, the progress in molecular biology through the introduction of new generation molecular markers has allowed many areas to move forward. It has now become possible to obtain more accurate genetic information to better understand the genetic resources of organisms. A molecular marker can be any nucleotide sequence (selected DNA fragment) scattered throughout the genome, whose variability between individuals or taxonomic groups allows precise identification of the individual/taxon. The effectiveness of restriction digestion and polymerase chain reaction based on molecular markers has already proved their usefulness in taxonomic, evolutionary and ecological plant research.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2020, 290; 27-32
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody molekularne i immunologiczne stosowane w diagnostyce grzybic
Molecular and immunological methods applied in diagnosis of mycoses
Autorzy:
Kuba, K
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/841048.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
diagnostyka lekarska
diagnostyka molekularna
metody diagnostyczne
diagnostyka immunologiczna
metody molekularne
metoda nested-PCR
testy serologiczne
metoda EIA
metoda RT-PCR
metoda RAPD
markery molekularne
metoda RFLP
lancuchowa reakcja polimerazy
metoda AFLP
metody immunologiczne
grzybice
Źródło:
Annals of Parasitology; 2008, 54, 3; 187-197
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody molekularne i immunologiczne stosowane w diagnostyce grzybic
Molecular and immunological methods applied in diagnosis of mycoses
Autorzy:
Kuba, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2143775.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
diagnostyka lekarska
diagnostyka molekularna
metody diagnostyczne
diagnostyka immunologiczna
metody molekularne
metoda nested-PCR
testy serologiczne
metoda EIA
metoda RT-PCR
metoda RAPD
markery molekularne
metoda RFLP
lancuchowa reakcja polimerazy
metoda AFLP
metody immunologiczne
grzybice
Opis:
The diagnosis of fungal infections remains a problem for the management of fungal diseases, particularly in the immunocompromised patients. Systemic Candida infections and invasive aspergillosis can be a serious problem for individuals who need intensive care. Traditional methods used for the identification and typing of medically important fungi, such as morphological and biochemical analysis, are time−consuming. For the diagnosis of mycoses caused by pathogenic fungi faster and more specific methods, especially after the dramatic increase in nosocomial invasive mycoses are needed. New diagnostic tools to detect circulating fungal antigens in biological fluids and PCR−based methods to detect species or genus−specific DNA or RNA have been developed. Antigen detection is limited to searching only one genus. Molecular genetic methods, especially PCR analysis, are becoming increasingly important as a part of diagnostics in the clinical mycology laboratory. Various modifications of the PCR method are used to detect DNA in clinical material, particularly multiple, nested and real−time PCR. Molecular methods may be used to detection of nucleic acids of fungi in clinical samples, to identify fungal cultures at the species level or to evaluate strain heterogeneity differences within the species. This article reviews some of the recent advances in the possibility of molecular diagnosis of fungal infections.
Źródło:
Wiadomości Parazytologiczne; 2008, 54, 3; 187-197
0043-5163
Pojawia się w:
Wiadomości Parazytologiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-10 z 10

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies