Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "lancuchowa reakcja polimerazy" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-9 z 9
Tytuł:
Wykrywanie bakterii Salmonella metodami molekularnymi w produktach żywnościowych
Detection of Salmonella sp. in food using molecular methods
Autorzy:
Misiewicz, A.
Goncerzewicz, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/796639.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie. Wydawnictwo Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie
Tematy:
produkty spozywcze
bakterie
Salmonella
wykrywanie drobnoustrojow
metody molekularne
lancuchowa reakcja polimerazy
food product
bacteria
microorganism detection
molecular method
polymerase chain reaction
Opis:
Bakterie z rodzaju Salmonella są najbardziej znanymi bakteriami patogennymi występującymi w przemyśle spożywczym. Powodują zakażenia prawie wszystkich produktów żywnościowych – od mięsnych, mlecznych, jajecznych po rośliny oleiste i pasze. Wykrycie i identyfi kacja bakterii Salmonella na podstawie tradycyjnej metody mikrobiologicznej, zgodnie z normą PN-EN 6579:2003, jest ciągle powszechnie stosowane w laboratoriach. Analiza ta jest czaso- i pracochłonna, jej wykonanie trwa około 5–7 dni. Wykorzystanie nowoczesnych technik biologii molekularnej, z etapem namnożenia i izolacji DNA, do uzyskania końcowego wyniku trwa znacznie krócej. W niniejszej pracy zastosowano metodę Real-Time PCR i klasyczny PCR do identyfi kacji bakterii Salmonella w różnych produktach żywnościowych. Określono czas potrzebny do wykonania tej analizy molekularnej. Do reakcji Real-Time PCR wykorzystano komercyjny kit. Klasyczną reakcję PCR prowadzono z użyciem starterów Sal465Li Sal142F, uzyskując właściwy produkt o wielkości 343 pz. We wszystkich badanych próbkach wykryto bakterie Salmonella. Wynik analiz molekularnych uzyskano w ciągu 21–25 godzin.
Pathogenic bacteria of Salmonella genus are the most common infections in food industry. They might to contaminate wide range of products, protein food e.g. meat, milk food, eggs and egg foods, plants and its preserves, fodder and feeds. Detection and identifi cation of Salmonella sp. are made using traditional methods corresponding with standard PN-EN 6579:2003. That method is commonly used in the microbiological laboratories its time consuming and laborious analysis. Using a modern molecular biology techniques allow to confi rm the Salmonella infections in 24-hours with enrichment and isolation steps. In our study were used Real-Time PCR and traditional PCR techniques to detect Salmonella pathogens from various foods. In addition we checked time of molecular analysis. In the study was used commercial kit to Real-Time PCR analysis and primer set Sal465L, Sal142F with are based on characteristic and solid genomic fragments of Salmonella genus. In every experiment we got positive results for food contaminated by Salmonella. The results were obtained in 21–25 hours.
Źródło:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych; 2013, 573
0084-5477
Pojawia się w:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identyfikacja wybranych gatunkow grzybow z rodzaju Fusarium z nasion niektorych gatunkow roslin uprawnych metoda tradycyjna i BIO-PCR
Identification of some Fusarium species from selected crop seeds using traditional method and BIO-PCR
Autorzy:
Kulik, T
Fordonski, G
Pszczolkowska, A
Plodzien, K
Olszewski, J
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/28557.pdf
Data publikacji:
2005
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
Fusarium graminearum
Fusarium culmorum
Fusarium poae
metoda BIO-PCR
lancuchowa reakcja polimerazy
cechy morfologiczne
Fusarium avenaceum
identyfikacja
grzyby chorobotworcze
polymerase chain reaction
morphological trait
identification
pathogenic fungi
Opis:
We identified a species level of the fungal cultures isolated from selected crop seeds using traditional method and BIO-PCR. The use of BIO-PCR did not correspond completely to the morphological analyses. Both methods showed increased infection with F. poae in winter wheat seed sample originated from north Poland. Fungal culture No 40 (isolated from faba bean and identified with traditional method as mixed culture with F. culmorum and F. graminearum) did not produce expected product after PCR reaction with species specific primers OPT18F₄₇₀ OPT18R₄₇₀ However, the use of additional primers Fc01F, Fc01R allowed for reliable identification of F. culmorum in the culture.
W pracy określono przynależność gatunkową grzybów z rodzaju Fusarium wcześniej wyizolowanych z nasion wybranych gatunków roślin uprawnych metodą tradycyjną i BIO-PCR. Zastosowanie metody BIO-PCR było podyktowane faktem, że nie wszystkie kultury zostały wstępnie poprawnie sklasyfikowane. Z przeprowadzonych analiz identyfikacji metodą tradycyjną i molekularną wykazano stosunkowo wysokie porażenie ziarna pszenicy przez F. poae. W badaniach wykazano, że kultura nr 40 (wyizolowana z nasion bobiku i oznaczona metodą tradycyjną jako mieszanka F. culmorum i F. graminearum) nie dawała wyniku pozytywnego w reakcji PCR z użyciem primerów OPT18F₄₇₀ OPT18R₄₇₀ specyficznych dla F. culmorum. Natomiast zastosowanie dodatkowej pary primerów Fc01F, Fc01R pozwoliło na wiarygodne oznaczenie F. culmorum.
Źródło:
Acta Agrobotanica; 2005, 58, 2; 33-54
0065-0951
2300-357X
Pojawia się w:
Acta Agrobotanica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Influence of application of attapulgite on the structure and composition of self-dynamic membrane in bioreactors
Autorzy:
Duan, W.
Ling, C.
Fu, D.
Xu, X.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/207004.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Politechnika Wrocławska. Oficyna Wydawnicza Politechniki Wrocławskiej
Tematy:
bioconversion
electrophoresis
polymerase chain reaction
porosity
bioreactor system
DGGE
extracellular polymeric substances
biokonwersja
elektroforeza
reakcja łańcuchowa polimerazy
porowatość
system bioreaktorów
zewnątrzkomórkowe substancje polimerowe
Opis:
The effect of application of attapulgite on the structure and composition of a dynamic membrane (DM) of a bioreactor was investigated by means of the electron microscopy, polymerase chain reaction (PCR) and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). A significant increase of microbial floc size in the bioreactors upon attapulgite application was observed. The content of cake layer in the hybrid dynamic membrane (HDM) and in the dynamic membrane (DM) in the corresponding bioreactor systems were 44.73 g/m2 and 38.12 g/m2 respectively, while the contents of mineral – 6.09 g/m2 and 5.34 g/m2, respectively. Further, with addition of attapulgite, the concentration of extracellular polymeric substances (EPS) in the HDM bioreactor system decreased, whereas the content of suspended particulate matter increased. Self-DM has a porous structure with high porosity. Mineral sub-stance, including O, Ka, Ca, P, S, Cl, Mg and Si, are the main elements in DM, but the main elements content exhibited an increase trend in DM with attapulgite administration. These results showed a positive correlation between the quantity of bacterial populations and biological removal improvement, which indicated that application of attapulgite could optimize the structure of self-DM in bioreactors.
Źródło:
Environment Protection Engineering; 2016, 42, 2; 171-182
0324-8828
Pojawia się w:
Environment Protection Engineering
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Diagnostyka szczepow Salmonella Choleraesuis i Salmonella Enteritidis wyizolowanych od zwierzat
Diagnostics of Salmonella Choleraesuis and Salmonella Enteritidis strains isolated from animals
Autorzy:
Karakulska, J
Kopron, K.
Nawrotek, P.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/44830.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie. Wydawnictwo Uczelniane ZUT w Szczecinie
Tematy:
choroby bakteryjne
salmoneloza
czynniki chorobotworcze
bakterie
Salmonella
szczepy bakteryjne
Salmonella choleraesuis
Salmonella enteritidis
patogennosc
wlasciwosci biochemiczne
diagnostyka
lancuchowa reakcja polimerazy
markery genetyczne
markery fenotypowe
bacterial disease
salmonellosis
pathogenic agent
bacteria
bacterial strain
pathogenicity
biochemical property
diagnostics
genetic marker
phenotypic marker
polymerase chain reaction
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica; 2008, 07, 1; 19-32
1644-0714
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Zootechnica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Ocena metod diagnozowania chorob korzeni i pochwy lisciowej pszenicy ozimej
The evaluation of winter wheat roots and leaf sheath diseases diagnostic methods
Autorzy:
Solarska, E
Grudzinska, M
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/27837.pdf
Data publikacji:
2005
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
Gaeumannomyces graminis
korzenie
Pseudocercosporella herpotrichoides
analiza mikologiczna
czynniki chorobotworcze
pochwy lisciowe
pszenica ozima
lancuchowa reakcja polimerazy
Fusarium
choroby lisci
choroby korzeni
grzyby chorobotworcze
identyfikacja
test ELISA
root
mycological analysis
pathogenic factor
leaf sheath
winter wheat
polymerase chain reaction
leaf disease
root disease
pathogenic fungi
identification
ELISA test
Opis:
The maltose and mineral media for isolation of Gaeumannomyces graminis from roots were assessed. The differences in numbers of obtained isolates were found depending on the medium used and sampling date. Easier identification of pathogen was possible employing maltose medium. The fungi from genus Fusarium occurring on winter wheat leaf sheaths were identified by mycological analysis and PCR, while the fungus Pseudocercosporella herpotrichoides was detected by PCR and ELISA methods. PCR and ELISA methods enabled to detect pathogens also in periods before the disease symptoms on plants occurred.
Badano przydatność podłoży maltozowego i mineralnego do izolacji Gaeumannomyces graminis z korzeni pszenicy ozimej. Stwierdzono różnice w liczebności uzyskanych izolatów w zależności od zastosowanego podłoża i terminu pobierania materiału roślinnego. Łatwiejsza identyfikacja patogena była możliwa po zastosowaniu pożywki maltozowej. Grzyby z rodzaju Fusarium występujące na pochwach liściowych pszenicy ozimej identyfikowano za pomocą analizy mykologicznej i PCR, natomiast grzyb Pseudocercosporella herpotrichoides był wykrywany przy użyciu metod PCR i ELISA. Technika PCR i test ELISA umożliwiły wykrycie patogenów w porażonych roślinach przed wystąpieniem widocznych objawów chorobowych.
Źródło:
Acta Agrobotanica; 2005, 58, 2; 271-276
0065-0951
2300-357X
Pojawia się w:
Acta Agrobotanica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykorzystanie metody PCR do badania jakosci ziarna pszenicy ozimej uprawianej w systemach ekologicznym, integrowanym, konwencjonalnym oraz monokulturze w aspekcie fitopatologicznym
The use of PCR assay for quality testing of grain of winter wheat cultivated in organic, integrated, conventional system and monoculture in phytopathological aspect
Autorzy:
Lukanowski, A
Sadowski, C
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/27419.pdf
Data publikacji:
2005
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:
uprawa ekologiczna
uprawa konwencjonalna
monokultury
ziarno
izolacja
jakosc
uprawa integrowana
analiza mikologiczna
gatunki grzybow
metody uprawy
uprawa roslin
pszenica ozima
lancuchowa reakcja polimerazy
Fusarium
grzyby chorobotworcze
ecological cultivation
conventional cultivation
monoculture
grain
isolation
quality
integrated cultivation
mycological analysis
fungi species
cultivation method
plant cultivation
winter wheat
polymerase chain reaction
pathogenic fungi
Opis:
The aim of experiments was to evaluate the occurrence of fungi on grain of winter wheat cv. Roma cultivated in four systems on the experimental fields owned by the Institute of Soil Science and Plant Cultivation. Among pathogenic species, fungi from genus Fusarium dominated. Their number was the lowest on grain harvested in organic system and the highest in integrated one. Saprotrophic species were represented mainly by Alternaria alternata, which occurred the most often in organic system. Determination of F. avenaceum, F. culmorum and F. poae with microscope was confirmed with a PCR assay. All isolates of F. culmorum and F. poae gave an amplification product of Tri 5 gene coding the possibility of trichocene production, while none of isolates of F. avenaceum
Badano zasiedlenie przez grzyby ziarn apszenicy ozimej odmiany Roma uprawianej w czterech systemach w latach 1999-2002 na polach doświadczalnych IL1NG. Wśród gatunków patogenicznych dominowały grzyby rodzaju Fusarium. Ich liczebność była najmniejsza na ziarniakach pochodzących z systemu ekologicznego. Najliczniej grzyby rodzaju Fusarium reprezentowane były na ziarnie zebranym w systemie integrowanym. Spośród gatunków saprotroficznych w każdym systemie zdecydowanie dominował Alternaria alternata. Najliczniej zasiedlał on ziarno w systemie ekologicznym. Potwierdzono poprawność oznaczenia F. avenaceum, F. culmorum oraz F. poae przy użyciu metody PCR. Wszystkie uzyskane izolaty F culmorum i F poae posiadały w swym genomie gen Tri 5, warunkujący ich potencjalną zdolność do produkcji mi- kotoksyn z grupy trichotecenów. Tego genu nie posiadał żaden z badanych izolatów F. avenaceum.
Źródło:
Acta Agrobotanica; 2005, 58, 2; 55-69
0065-0951
2300-357X
Pojawia się w:
Acta Agrobotanica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Detection of antibiotic resistance genes in wastewater treatment plant : molecular and classical approach
Wykrywanie genów oporności na antybiotyki w oczyszczalni ścieków : podejście klasyczne i biologii molekularnej
Autorzy:
Ziembińska-Buczyńska, A.
Felis, E.
Folkert, J.
Meresta, A.
Stawicka, D.
Gnida, A.
Surmacz-Górska, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/204828.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
DGGE
denaturing gradient gel electrophoresi
PCR
polymerase chain reaction
sulfamethoxazole
trimethoprim resistance
erythromycin resistance
WWTP
wastewater treatment plant
antybiotyki
reakcja łańcuchowa polimerazy
sulfametoksazol
geny oporności
odporność na trimetoprim
odporność na erytromycynę
oczyszczalnia ścieków
Opis:
Antibiotics are a group of substances potentially harmful to the environment. They can play a role in bacterial resistance transfer among pathogenic and non-pathogenic bacteria. In this experiment three representatives of medically important chemotherapeutics, confirmed to be present in high concentrations in wastewater treatment plants with HPLC analysis were used: erythromycin, sulfamethoxazole and trimethoprim. Erythromycin concentration in activated sludge was not higher than 20 ng L−1. N-acetylo-sulfamethoxazole concentration was 3349 ± 719 in winter and 2933 ± 429 ng L−1 in summer. Trimethoprim was present in wastewater at concentrations 400 ± 22 and 364 ± 60 ng L−1, respectively in winter and summer. Due to a wide variety of PCR-detectable resistance mechanisms towards these substances, the most common found in literature was chosen. For erythromycin: erm and mef genes, for sulfamethoxazole: sul1, sul2, sul3 genes, in the case of trimethoprim resistance dhfrA1 and dhfr14 were used in this study. The presence of resistance genes were analyzed in pure strains isolated from activated sludge and in the activated sludge sample itself. The research revealed that the value of minimal inhibitory concentration (MIC) did not correspond with the expected presence of more than one resistance mechanisms. Most of the isolates possessed only one of the genes responsible for a particular chemotherapeutic resistance. It was confirmed that it is possible to monitor the presence of resistance genes directly in activated sludge using PCR. Due to the limited isolates number used in the experiment these results should be regarded as preliminary.
Antybiotyki to grupa związków potencjalnie szkodliwych dla środowiska. Odgrywają one rolę w procesach transferu antybiotykooporności pomiędzy patogenami i bakteriami niechorobotwórczymi. Wykorzystując metodę wysokosprawnej chromatografii cieczowej (HPLC) wykazano obecność erytromycyny, sulfametoksazolu i trimetoprimu w miejskiej oczyszczalni ścieków w następujących stężeniach: dla erytromycyny < 20 ng L−1, N-acetylo-sulfametoksazolu 3349 ± 719 i 2933 ± 429 ng L−1, a trimetoprimu 400 ± 22 i 364 ± 60 ng L−1, odpowiednio: zimą i latem. Ponieważ antybiotykooporność bakteryjna może być stymulowana obecnością antybiotyków w środowisku, istnieje możliwość pojawienia się wielu szlaków opornościowych u bakterii narażonych na działanie tych związków. Dlatego też podjęto próbę detekcji wybranych genów oporności na badane chemioterapeutyki metodą łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR). Obecność elementów genetycznych badano zarówno w szczepach bakteryjnych, u których udowodniono oporność na badany związek bakteriobójczy, jak i w próbce osadu czynnego, z którego te bakterie izolowano. Do badań wybrano najczęściej występujące geny oporności: dla erytromycyny erm i mef, dla sulfametoksazolu: sul1, sul2, sul3, a dla trimetoprimu dhfrA1 i dhfr14. Wykazano, że wartość minimalnego stężenia inhibitującego (MIC), nie koresponduje z obecnością większej liczby mechanizmów oporności. Większość szczepów opornych wykazywała tylko jeden z badanych mechanizmów oporności na antybiotyk niezależnie od wartości MIC. Potwierdzono również możliwość monitorowania obecności genów oporności na antybiotyki metodą PCR bezpośrednio w osadzie czynnym. Ze względu na ograniczona liczbę izolatów użytych w tym eksperymencie wyniki uzyskane w pracy powinny być traktowane jako wstęp do dalszych badań.
Źródło:
Archives of Environmental Protection; 2015, 41, 4; 23-32
2083-4772
2083-4810
Pojawia się w:
Archives of Environmental Protection
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Markery molekularne w badaniach rzepaku (Brassica napus L.). I. Przegląd stosowanych technik
Molecular markers for study of oilseed rape (Brassica napus L.) I. The review of marker techniques
Autorzy:
Matuszczak, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/833585.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
rzepak
Brassica napus
markery genetyczne
markery molekularne
genotypowanie
hodowla roslin
metody wykrywania
markery izoenzymatyczne
markery RFLP
lancuchowa reakcja polimerazy
markery RAPD
markery AFLP-RGA
markery AFLP
markery DArT
mikrosatelity
markery ISSR
markery ACGM
markery SCAR
markery CAPS
markery SNP
rape
genetic marker
molecular marker
genotyping
plant breeding
detection method
isoenzyme marker
RFLP marker
polymerase chain reaction
RAPD marker
AFLP-RGA marker
AFLP marker
DArT marker
microsatellite
ISSR marker
ACGM marker
SCAR marker
CAPS marker
SNP marker
Opis:
Współczesna biologia molekularna dostarcza wciąż nowych metod pozwalających na opracowywanie markerów genetycznych, w tym przede wszystkim markerów molekularnych (markerów DNA). Znajdują one zastosowanie w różnych badaniach dotyczących rzepaku. Ich wykorzystanie w hodowli znacznie przyspiesza uzyskiwanie nowych odmian. Markery molekularne umożliwiają postęp w badaniach genomu. Istotne jest także znaczenie markerów molekularnych w badaniach pokrewieństwa oraz identyfikacji odmian. W pracy dokonano przeglądu technik poszukiwania markerów, które już znalazły lub mogą znaleźć zastosowanie w badaniach nad rzepakiem. Omówiono zarówno metody, które były stosowane na wczesnym etapie rozwoju tej dziedziny, jak i te, które stosowane są obecnie. Zasygnalizowano także prawdopodobne kierunki rozwoju nowych technologii dla pozyskiwania markerów w przyszłości.
Modern molecular biology is the continuous source of new techniques that can be applied to obtain genetic markers, including, first of all, molecular (DNA) markers. Such markers are widely used for study of oilseed rape. Their application in breeding can speed up the formation of new varieties. Molecular markers can generate the progress in study of various genomes. There are many cases of their use for relationship analysis or variety identification. The review of marker techniques, both those already applied and as yet not applied for study on oilseed rape, is presented here. In this review past and present methods are described according to the sequence of their invention and use. The prospects of new technologies that may be used for marker development in the near future are also mentioned.
Źródło:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops; 2013, 34, 2
1233-8273
Pojawia się w:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-9 z 9

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies