Identyfikacja wybranych gatunkow grzybow z rodzaju Fusarium z nasion niektorych gatunkow roslin uprawnych metoda tradycyjna i BIO-PCR

We identified a species level of the fungal cultures isolated from selected crop seeds using traditional method and BIO-PCR. The use of BIO-PCR did not correspond completely to the morphological analyses. Both methods showed increased infection with F. poae in winter wheat seed sample originated from north Poland. Fungal culture No 40 (isolated from faba bean and identified with traditional method as mixed culture with F. culmorum and F. graminearum) did not produce expected product after PCR reaction with species specific primers OPT18F₄₇₀ OPT18R₄₇₀ However, the use of additional primers Fc01F, Fc01R allowed for reliable identification of F. culmorum in the culture.

W pracy określono przynależność gatunkową grzybów z rodzaju Fusarium wcześniej wyizolowanych z nasion wybranych gatunków roślin uprawnych metodą tradycyjną i BIO-PCR. Zastosowanie metody BIO-PCR było podyktowane faktem, że nie wszystkie kultury zostały wstępnie poprawnie sklasyfikowane. Z przeprowadzonych analiz identyfikacji metodą tradycyjną i molekularną wykazano stosunkowo wysokie porażenie ziarna pszenicy przez F. poae. W badaniach wykazano, że kultura nr 40 (wyizolowana z nasion bobiku i oznaczona metodą tradycyjną jako mieszanka F. culmorum i F. graminearum) nie dawała wyniku pozytywnego w reakcji PCR z użyciem primerów OPT18F₄₇₀ OPT18R₄₇₀ specyficznych dla F. culmorum. Natomiast zastosowanie dodatkowej pary primerów Fc01F, Fc01R pozwoliło na wiarygodne oznaczenie F. culmorum.