Temat: spacer - Katalog OPAC zbiorów

Skocz do pozycji: 1.

Tytuł:: Cotton leaf blight disease caused by Alternaria alternata in Sudan
Autorzy:: Mohamed, O.E.
Beshir, M.M.
Ahmed, N.E.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/2084617.pdf
Data publikacji:: 2019
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: Alternaria alternata
conidia
Gossypium spp.
internal transcribed spacer
(ITS)
morphological variability
pathogenicity
Opis:: Genetically modified Bt cotton (Gossypium hirsutum) leaves with typical symptoms of Alternaria early blight disease resembling that of tomato and potato were observed in the main cotton growing schemes in Sudan. Symptoms on leaves appeared as either brown 2leaf spot with gray centers or leaf blight with concentric rings. Pathogenicity tests using isolates with both symptoms showed that the isolated fungi were highly pathogenic to both G. hirsutum and G. barbadense cotton varieties. Alternaria alternata isolated from infected tomato and potato leaves with early blight symptoms was included for comparison. Microscopic examination showed that the mean length of conidia from cotton, tomato and potato isolates ranged from 26.25 to 45.45 µm, while the width ranged from 9.56 to 13.64 µm. The mean number of transverse septa among all isolates was 3.4 to 5.7 and the peak length ranged from 3.75 to 7.8 µm. Based on morphological characteristics the two isolates from cotton were identified as A. alternata. Genomic DNA was extracted directly from fungal cultures grown on potato dextrose agar (PDA) plates using a Zymo Research Quick DNA kit. A species-specific primer using the internal transcribed spacer ribosomal DNA (ITS rDNA) PCR scoring indicated the presence of A. alternata using primer pair ITS4/ITS5. Amplifications of the internal transcribed spacer region of 600 bp revealed 100% identity of the isolated fungus from cotton with A. alternata from tomato and potato. These data oblige us to reconsider the presence of A. alternata in the four main cotton growing schemes in Sudan while these symptoms have always been described for tomato and potato early blight disease.
Źródło:: Journal of Plant Protection Research; 2019, 59, 3; 412-417
1427-4345
Pojawia się w:: Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 2.

Tytuł:: Use of molecular and conventional techniques to identify and analyze genetic variability of Rhizoctonia spp. isolates
Zastosowanie metod molekularnych i konwencjonalnych do identyfikacji i analizy zroznicowania genetycznego izolatow Rhizoctonia
Autorzy:: Irzykowska, L
Zoltanska, E
Bocianowski, J
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/28502.pdf
Data publikacji:: 2005
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Botaniczne
Tematy:: pathogenicity
internal transcribed spacer region
rRNA gene
random amplified polymorphic DNA
genetic variability
Rhizoctonia
isolate
Rhizoctonia cerealis
Rhizoctonia solani
molecular technique
conventional technique
stem infection
leaf infection
plant disease
Opis:: In this study the pathogenicity of Rhizoctonia spp. isolates towards wheat seedlings in laboratory and greenhouse conditions was evaluated. In both experiments seven features were examined: plant height, roots weight, the percentage of infected stems and leaf sheaths and also the degree of stem and leaf sheaths infection. Isolates R1, R29, R39 and R59 were the most pathogenic. Percentage of infected stems ranged from 25.3 to 82.5 and roots from 35 to 82.3. The amplification of internal transcribed spacer regions (ITS1 and ITS2) between 18S, 5.8S and 28S rRNA genes and sequence analysis of these regions have been shown to be sufficiently variable to resolve two Rhizoctonia species. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) was used to assess genetic variability among isolates. The suitability of RAPD method for isolates differentiation at intraspecific level was shown. Using seven arbitrary primers in polymerase chain reaction (PCR) thirty-three RAPD markers were generated. Clustering analysis from RAPD data resolved two groups of R. cerealis isolates at the 36% similarity level. Moreover, significant associations between molecular markers and pathogenicity of R. cerealis isolates were found.
W prezentowanych badaniach oceniano patogeniczność izolatów Rhizoctonia spp. w stosunku do siewek pszenicy w warunkach laboratoryjnych i szklarniowych. W obu doświadczeniach badano 7 cech: wysokość roślin, masę korzeni, procent porażonych łodyg i pochew liściowych oraz stopień porażenia łodygi i pochwy liściowej. Najbardziej patogeniczne okazały się izolaty R1, R29, R39 i R59. Procent porażonych łodyg mieścił się w zakresie od 25.3 do 82.5, a procent porażonych korzeni od 35 do 82.3. Wykazano, że amplifikacja wewnętrznych transkrybowanych sekwencji rozdzielających (ITS1 i ITS2) geny kodujące 18S, 5.8S i 28S rRNAoraz analiza sekwencyjna tych regionów wystarczyły do rozróżnienia dwóch gatunków rodzaju Rhizoctonia. Losowo amplifikowany polimorficzny DNA (RAPD) wykorzystano do oceny zróżnicowania genetycznego między izolatami. Potwierdzono użyteczność metody RAPD w różnicowaniu izolatów na poziomie wewnątrzgatunkowym. Po zastosowaniu siedmiu losowych starterów w łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR) uzyskano 33 markery RAPD. W wyniku analizy klasterów danych uzyskanych w reakcjach RAPD wyodrębniono dwie grupy izolatów R. cerealis na poziomie podobieństwa równym 36%. Ponadto, znaleziono istotne związki pomiędzy markerami molekularnymi a patogenicznością izolatów R. cerealis.
Źródło:: Acta Agrobotanica; 2005, 58, 2; 19-32
0065-0951
2300-357X
Pojawia się w:: Acta Agrobotanica
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki