Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "cluster." wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-15 z 23
Tytuł:
Genetic diversity of winter wheat cultivars and strains determined by electrophoregrams of gliadin and glutenin proteins
Autorzy:
Węgrzyn, Stanisław
Waga, Jacek
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2198933.pdf
Data publikacji:
2004-06-20
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
cluster analysis
electrophoresis
gliadins
glutenins
polymorphism
Opis:
Based on the polymorphism of gliadin and glutenin proteins relationships of 45 cultivars and strains of winter wheat were evaluated. The cluster analysis showed a considerable variation of the investigated genotypes. The similarity indices were calculated using the Nei and Li formula. The genetic distances between the cultivars ranged from 1.00 to 0.12. The highest similarity index - SI=1.00- being proof of the identical physicochemical composition of storage proteins, was found for the pair Farmer and Elena. The groups of similar and genetically distant cultivars have been presented in the form of a dendrogram. The possibility of using the results obtained from the cluster analysis in breeding programmes has been discussed.
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2004, 49; 51-61
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Gliadins polymorphism and cluster analyses of Syrian grown durum wheat.
Autorzy:
MirAli, Nizar
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2198847.pdf
Data publikacji:
2002-12-22
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
cluster analysis
durum wheat
gliadins
APAGE
Opis:
A total of 187 Triticum durum (Desf.) genotypes were studied. These included 102 mutants, 15 local genotypes, 22 lines from ACSAD and 48 lines from ICARDA. Polyacrylamide gel electrophoresis under acidic conditions of pH 3.1 (A-PAGE) was used to separate gliadins groups of storage proteins for the identification and the classification of the genotypes under study. Results showed that the region of w-gliadins had a wider range for the number of bands than all other regions of gliadins (a-,  b- ,   and  g-gliadins). Cluster analyses using the Unweighted Pair Group Mean Average (UPGMA) method put the genotypes of all groups in trees on the basis of the gliadin bands distribution. Three categories were obtained. 1) Complete correspondence of the pedigrees and the trees, reflecting the importance of the gliadins as a decisive factor for the genotype position in the cluster. 2) The presence of genotypes with similar banding patterns but were unrelated in their pedigrees. And, 3) The genotypes originate from the same cross but are unrelated in the tree. It was concluded that tree clustering based on gliadin electrophoregrams may be used as an additional tool in revealing genetical relations among genotypes. However, one should keep in mind that several factors may influence the resulting tree. These include heterogeneity, incorrect band designation and uncertain or false pedigrees.
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2002, 46, 2; 45-56
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Relationships between hybrid performance and genetic distance revealed by morphological and AFLP marker in cucumber
Autorzy:
Olfati, J. A.
Samizadeh, H.
Peyvast, Gh.
Rabiei, B.
Khodaparast, S. A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199652.pdf
Data publikacji:
2012-04-19
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
cluster analysis
diallel
heterosis
orthogonal comparison
similarity matrix
Opis:
This study investigated the relationship of morphological and molecular genetic distance with hybrid performance and heterosis in cucumber in an attempt to make use of genetic distance in predicting hybrid performance. The results of this study showed that GD, in general, correlated poorly with heterosis and SCA. Results showed that the mean values of the hybrids were significantly larger or smaller for many traits when compared with the mean of parental lines, indicating that heterosis was present for these traits. In next step we compare inter group hybrids versus intra group hybrids. This test showed that intra group hybridization although increased the yield and yield component but decrease some fruit quality such as fruit color and shape.
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2012, 65; 87-98
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The use of some morphological traits for the assessment of genetic diversity in spinach (Spinacia oleracea L.) landraces
Autorzy:
Ebadi-Segheloo, Asghar
Asadi-Gharneh, Hossein ali
Mohebodini, Mehdi
Janmohammadi, Mohsen
Nouraein, Mojtaba
Sabaghnia, Naser
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199739.pdf
Data publikacji:
2014-06-19
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
breeding
cluster analysis
diversity
landraces
principal component analysis
Opis:
Investigation of native accessions of spinach (Spinacia oleracea L.) would be aid in the development of new genetically improved varieties, so in this research 121 spinach landraces, collected from the various spinach growing areas of Iran, were evaluated to determine their diversity using several agro-morphological traits. High coefficients of variation (CV) were recorded in fresh yield, leaf area and dry yield. Using principal component (PC) analysis, the first three PCs with eigenvalues more than 0.9 contributed 80.56% of the variability among accessions. The first PC was related to leaf yield performance (fresh and dry yields, leaf numbers at flowering and lateral branches) while the PC2 was related to leaf characteristic (leaf width, petiole length, petiole diameter and leaf area). The third PC was related to seed characteristic (seed yield and 1000-seed weight) and was named as seed property component. The 121 spinach landraces were grouped into six clusters using cluster analysis. Each cluster had some specific characteristics of its own and the clusters I and II were clearly separated from clusters III and V and also from clusters IV and VI. The studied accessions are an important resource for the generation of a core collection of spinach in the world. The results of present research will support tasks of conservation and utilization of landraces in spinach breeding programs.
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2014, 69; 69-80
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Yielding of old and modern Polish wheat cultivars under different nitrogen inputs as assessed*by combined using AMMI and cluster analyses.
Autorzy:
Paderewski, J.
Mądry, W.
Rozbicki, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199590.pdf
Data publikacji:
2010-12-01
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
AMMI analysis
cluster analysis
cultivar's adaptation patterns
wheat cultivars
Opis:
The experimental material consisted of 15 winter wheat cultivars (14 Polish-bred cultivars and one British cultivar) representing the results of over 100 years of breeding. The cultivars were tested in two-factor field experiments (cultivars were one factor and nitrogen fertilization rates, the other factor) carried out in split-plot design across two consecutive years. This paper demonstrates a combined using AMMI and cluster analyses for effective and efficient estimate of grain-yield response to investigated environments (combinations of 2 years × 3 nitrogen fertilization rates). First, homogenous groups of cultivars were identified in terms of their genotypic profile of AMMI(s) estimates of GEI effects using Ward’s method of cluster analysis. Then, these groups were divided into separate homogenous subgroups with respect to genotype means. The cultivars in each subgroup have a similar grain yield response to the environments and, then, similar adaptation pattern, although the genotype groups differed in adaptation to these environments...
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2010, 62; 117-136
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Recognition and determination of related traits importance with seed yield in chickpea (Cicer aietinum)
Autorzy:
Ghorbani, Tayebeh
Cheghamirza, Kianoosh
Bardideh, Kosar
Shoar, Parastoo Basiri
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199728.pdf
Data publikacji:
2013-12-19
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
chickpea
factor analysis and cluster analysis
path analysis
yield
yield components
Opis:
To study the relationship between seed yield and its components 5 varieties and 18 different genotypes of Cicer arietinum were evaluated. This study was carried out under dryland farming during 2007 in research farm of Razi university. Path analysis showed that in the first level of yield, the highest direct effect was related to biological yield and the highest indirect effect was related to seed number per plant due to biological yield. In second level of yield due to the seed number per plant double seed pod number had the highest direct effect and the highest indirect effect was related to hundreds seed weight due to double the seed pod number. In second level of yield due to biological yield, the highest direct effect was related to high plant and the highest indirect effect was related to high plant due to second branch number. In the third level of yield due to a hundred seed weight, the highest direct effect was related to pod diameter and the highest indirect effect was related to pod length due to pod diameter. Factor analysis showed that 5 factors explained 81.65 percent of the variance. Cluster analysis based on ward method were arranged genotypes in 3 clusters.
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2013, 68; 15-24
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Multivariate diversity of Polish winter triticale cultivars for spike and other traits.
Autorzy:
Kociuba, Wanda
Mądry, Wiesław
Kramek, Aneta
Ukalski, Krzysztof
Studnicki, Marcin
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199592.pdf
Data publikacji:
2010-12-01
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
canonical variate analysis
cluster analysis
cultivars
principal component analysis
spike traits
winter triticale
Opis:
The objective of the present study was to determine the extent and pattern of genotypic diversity for six spike quantitative characters and two other traits in 36 winter triticale cultivars released in Poland, to classify the cultivars into similarity groups (clusters) and to identify those traits, among the studied ones, which mostly discriminated distinguished groups of cultivars. The 36 cultivars, released in the period from 1982 to 1999, were evaluated across three years 2002-2004 at the Experimental Field Station in Czesławice near Nałęczów, Poland. The experiments were carried out on the brown soil with loess subsoil. In each year the one-replicated experimental design was used with 2 m2 plots, rows 20 cm apart, and dense sowing using about 2 cm spacing of seeds. Analyses of variance for each trait data according to the random model (both cultivars and years were assumed to be random factors) were done. To classify and characterize genotypic diversity of the cultivars for the eight traits, the pattern analysis was used. It involved both cluster analysis using Ward’s procedure with a measure of the multivariate similarity among cultivars being Squared Euclidean Distance and canonical variate analysis (CVA) on the basis of cultivar BLUPs for the original traits. Quite different groups of cultivars for the studied traits were found, specially one group was substantially distanced to the others. As it was shown by CVA, spike length and number of spikelets per spike as negatively correlated with number of grains per spikelet in the studied set of the cultivars relatively largest contributed to overall differentiation of the distinguished eight groups and then, these traits best discriminated among the eight cultivar groups in the term of Mahalanobis distance for the considered traits. The 1000 grain weight and grain protein content much less contributed to overall discrimination of the cultivar groups than the previous four traits. The most important agronomic traits characterizing productivity of the spike grain weight and its two components, e.g. number of grains per spikelet and number of grains per spike had least discriminating power for the groups of cultivars. Grain yield per unit area of cereals is a result of spike grain yield and the number of spikes per unit area. In these studies of winter triticale cultivar diversity only grain spike yield and its components were included. Thus, the presented study are a primary evaluating of phenotypic diversity in the cultivars. The further study on the cultivar diversity evaluation for grain yield per unit area and its components is necessary...  
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2010, 62; 31-42
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wielowymiarowa ocena zmienności cech jakości technologicznej ziarna rodów i odmian pszenicy ozimej badanych w doświadczeniach przedrejestrowych
Multivariate analysis of the variability of traits determining technological quality of grains in strains and varieties of winter wheat assessed in pre-registration trials
Autorzy:
Śmiałowski, Tadeusz
Stachowicz, Maria
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/42828273.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
analiza czynnikowa
analiza skupień
cechy technologiczne
pszenica ozima
cluster analysis
multivariate analysis
technological traits
winter wheat
Opis:
Celem badań było wybranie jednej cechy lub grupy cech o dużej mocy dyskryminacyjnej wśród 13 wskaźników jakości technologicznej ziarna z 102 obiektów hodowlanych pszenicy ozimej oraz grupowanie podobnych obiektów pod względem jakości technologicznej. Zastosowano dwie metody wielowymiarowe, tj. analizę czynnikową i analizę skupień. Na podstawie analizy czynnikowej stwierdzono, że 3 cechy; liczba sedymentacji, liczba opadania i zawartość białka wyjaśniają łącznie 71% badanej zmienności obiektów pod względem wskaźników jakości technologicznej. Analiza skupień pozwoliła wyodrębnić 4 skupienia obiektów pszenicy ozimej. W grupie 1 zgromadziło się 47 form pszenicy ozimej zbliżonych wielocechowo pod względem 6 cech jakościowych wskazując na silną presję selekcyjną w kierunku hodowli jakościowej.
The aim of the work was to distinguish from among 13 traits of grain technological quality one trait or a group of traits exhibiting high discriminatory power to evaluate 102 winter wheat experimental objects, followed by grouping the objects characterized by similar technological quality. Two multivariate methods: factor analysis and cluster analysis were applied. The factor analysis showed that three traits: sedimentation value, falling number and protein content explained altogether 71% of the variability of technological quality coefficients. The cluster analysis allowed to separate four clusters of experimental objects. Group 1 included 47 winter wheat forms showing a great similarity in six qualitative traits, indicating a strong selective pressure towards the qualitative breeding.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2009, 253; 47-58
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Przydatność metod oraz miar statystycznych do oceny stabilności i adaptacji odmian: przegląd literatury
Usefulness of statistical methods and measures for evaluating cultivar stability and adaptation: an overview of research
Autorzy:
Mądry, Wiesław
Iwańska, Marzena
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2198053.pdf
Data publikacji:
2011-09-30
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
adaptacja odmian
analiza AMMI
analiza GGE
analiza skupień
AMMI analysis
cluster analysis
cultivar adaptation
GGE analysis
Opis:
W pracy przedstawiono przegląd najnowszego dorobku naukowego, publikowanego głównie w prestiżowych czasopismach, w zakresie zastosowań i badań przydatności wielu metod statystycznych do charakterystyki interakcji genotypowo-środowiskowej (interakcji GE) dla plonu i innych cech rolniczych odmian testowanych w doświadczeniach oraz analizy i interpretacji tej interakcji w kategoriach oceny odmian pod względem ich stabilności i adaptacji dla rozpatrywanych cech. Wśród rosnącego bogactwa klasycznych i oryginalnych metod, stosowanych w wymienionych badaniach nad oceną wartości gospodarczej odmian, dominują metody wielowymiarowe oparte na analizie składowych głównych, takie, jak analiza AMMI (ang. the additive main effects and multiplicative interaction model-based analysis), analiza GGE (ang. the genotype main effects and genotype × environment interaction effects model-based analysis) oraz łączna analiza skupień i AMMI lub GGE. Stosowane są także dość szeroko metody oparte na relatywnie prostych miarach stabilności i szerokiej adaptacji odmian pod względem badanych cech. To wyjątkowo bogate spektrum metod, przeznaczonych do wielostronnej oceny odmian z uwzględnieniem średnich genotypowych i efektów interakcji GE, stanowi wartościową ofertę metodyki statystycznej, z której szerzej powinni korzystać hodowcy i badacze wartości gospodarczej odmian roślin uprawnych w Polsce.
In the paper results of the newest studies on using statistical methods to analysis and interpretation of genotype x environment interaction (GEI) on the basis of multi-environment trials (MET) are presented. The methods presented here facilitate to evaluate stability and adaptability of tested cultivars for yield and other quantitative traits. Both univariate and multivariate methods are considered. The set of the discussed multivariate methods includes mostly those which are based on singular value decomposition of respective GE data matrix, e.g. the additive main effects and multiplicative interaction (AMMI) model-based analysis, the genotype main effects and genotype × environment interaction effects (GGE) model-based analysis as well as combined cluster and AMMI or GGE analyses called usually pattern analyses. Also, methods involving simple measures of cultivar stability and wide adaptability are overviewed. The all considered methods are addressed to plant breeders and cultivar evaluators who could and should use them in wider scale to improve reliability of testing new germplasm in order to implement effectively genetic gain to agricultural practice in Poland.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2011, 260/261; 193-218
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Ocena rodzajów reakcji plonowania odmian pszenicy ozimej w doświadczeniach PDO na przestrzennie zmienne warunki przyrodnicze w kraju
The estimation of winter wheat field response to variable environmental conditions in post-registration cultivar trials
Autorzy:
Drzazga, Tadeusz
Paderewski, Jakub
Krajewski, Paweł
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/42827890.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
pszenica ozima
doświadczenia PDO
analiza AMMI
analiza skupień
winter wheat
post-registration cultivar trials
AMMI analysis
cluster analysis
Opis:
Analizowano wyniki plonowania 31 odmian pszenicy ozimej, uzyskane w wielokrotnej i wieloletniej (2005–2007) serii doświadczeń PDO wykonanych w 20 Stacjach Doświadczalnych Oceny Odmian (SDOO), należących do COBORU przy pierwszym (niższym) poziomie inten¬sywności agrotechniki. Celem pracy było określenie rodzajów funkcji średniej wieloletniej plonu ziarna odmian pszenicy ozimej pod wpływem zmiennych warunków przyrodniczych (środowi¬skowych) w Polsce. Na podstawie średnich z powtórzeń, stanowiących 3-kierunkową klasyfikację odmiany × miejscowości × lata (klasyfikacja GLY) wykonano trójczynnikową analizę wariancji według modelu mieszanego. Dla średnich plonu poprzez lata (kombinacje GL), wykonano analizę AMMI. Badane odmiany pszenicy ozimej zostały podzielone na grupy o podobnym profilu efektów interakcji GL za pomocą analizy skupień metodą Warda. Odmiany w każdej takiej grupie jednorodnej podzielono na rozłączne podgrupy o jednorodnych średnich genotypowych stosując niehierarchiczną analizę skupień Calińskiego i Corstena (1985).
The yields of 31 winter wheat cultivars were assessed in post-registration cultivar trials (PDO) done in the years 2005–2007 in 20 locations. The aim of this work was to determine the patterns of grain yield response to environmental conditions, as related to the multi-year means. For the three-way classification of the GLY (genotypes × locations × years) combinations, the analysis of variance according to the mixed model was done. The AMMI analysis was carried out on the GL combinations (means for replications and years). The genotypes were classified in groups on the basis of similar GL interaction effects, measured according to Ward’s method of cluster analysis. The groups were divided into subgroups based on the uniform values of genotypic means for yield. Non-hierarchical cluster analysis, developed by Caliński and Corsten in 1985 was used.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2009, 253; 71-82
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Retrospektywne badanie reakcji plonu odmian pszenicy ozimej na warunki środowiskowe w miejscowościach za pomocą łącznej analizy AMMI i skupień: ocena postępu genetycznego w plonowaniu
Retrospective study of yield response to environmental conditions in winter wheat cultivars using combined AMMI and cluster analysis to incomplete data: genetic progress for adaptability
Autorzy:
Paderewski, Jakub
Mądry, Wiesław
Pilarczyk, Wiesław
Drzazga, Tadeusz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/41518498.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
pszenica ozima
analiza AMMI
analiza skupień
adaptacja odmian
plon
winter wheat
AMMI analysis
cluster analysis
cultivars
adaptation
grain yield
Opis:
Analizowano dane plonowania odmian pszenicy ozimej w 14 wielokrotnych seriach doświadczeń przedrejestrowych, przeprowadzonych w latach 1991–2004. Spośród nich wybrano 21 odmian (odmian testowanych lub wzorców) badanych w stacjach doświadczalnych przynajmniej w 3 latach. Odmiany te były wyhodowane w latach 1982–2004. Obliczono średnie poprawione plonu ziarna poprzez lata dla odmian w stacjach, w niekompletnej klasyfikacji GL za pomocą estymatora BLUE, uzupełniono tę klasyfikację za pomocą metody EM-AMMI, wykonano analizę AMMI (ang. additive main effects and multiplicative interaction) i analizę skupień (grupującą odmiany o podobnym profilu efektów interakcji GL i podobnej średniej genotypowej plonu). Na tej podstawie określono różne rodzaje reakcji plonu jednorodnych grup odmian pszenicy ozimej na zmienne warunki przyrodnicze w miejscowościach, i tym samym, różne rodzaje ich adaptacji. Metoda łącznej analizy AMMI i skupień, z jej modyfikacjami i uzupełnieniami specyficznymi dla danych niekompletnych, zastoso¬wana na danych z niekompletnej wielokrotnej i wieloletniej serii doświadczeń przedrejestrowych z pszenicą ozimą okazała się efektywna do badania rodzajów średniej wieloletniej reakcji plonu odmian na warunki środowiskowe w miejscowościach. Uzyskane wyniki badań są świadectwem osiągniętego postępu genetycznego w Polsce pod względem szerokiej adaptacji odmian, podobnie jak to się stało w innych krajach na świecie.
Data for winter wheat grain yield which were analyzed in the paper come from 14 multiple-environment trials (METs), called pre-registration trials, done across the years 1991–2004. Each year, new tested cultivars entered the trials network but some entries and check-cultivars retained in the network for a few year period. Among them 21 tested and check cultivars, evaluated across at least 3 years period, were taken to these considerations. The entries were released during the years the 1982 to 2004. Adjusted means of grain yield for cultivars in locations across years using BLUE estimator in REML method were calculated. These means constituted an incomplete GL classification. Some missing means in the classification were approximated by the EM-AMMI procedure. The AMMI analysis based on additive main effects and multiplicative interaction fixed model. In the second step of the statistical procedure cluster analysis was performed taking into account estimates of GL interaction effects. This method enables grouping cultivars with similar profiles of GL interaction effects and also similar genotypic means of grain yield. In this way different types of yield response of homogenous cultivar group of winter wheat to variable environmental conditions in locations (types of adaptations) were distinguished. The combined AMMI and cluster analysis including specific modifications for incomplete data was efficient to study patterns of yield response to environmental conditions in winter wheat cultivars using data from incomplete GLY classification obtained in pre-registration trials. As a result of the study, genetic progress was estimated with regard to both yield and its stability and then wide adaptability.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2008, 250; 87-106
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Porównanie efektywności metod statystycznych tworzenia kolekcji podstawowej na przykładzie pszenicy jarej
Comparison of statistical methods to development of a core collection for a spring wheat collection
Autorzy:
Studnicki, Marcin
Mądry, Wiesław
Śmiałowski, Tadeusz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/42793643.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
analiza skupień
kolekcje podstawowe
pszenica jara
zasoby genowe roślin uprawnych
cluster analysis
core collections
plant genetic resources
spring wheat
Opis:
Kolekcje podstawowe powstają z ograniczonej liczby obiektów zgromadzonych dotychczas w kolekcji zasobów genowych, wybranych tak aby reprezentowały zmienność całej kolekcji. Celem tworzenia kolekcji podstawowych jest efektywniejsze wykorzystanie aktualnie zgromadzonych zasobów genowych w programach hodowlanych roślin. Celem pracy było zaprezentowanie, a także ocena efektywności różnych metod wyboru obiektów, metod grupowania i wielkości kolekcji podstawowych. W pracy, kolekcje podstawowe, powstały w oparciu o kolekcję roboczą pszenicy jarej, zgromadzoną w Zakładzie Roślin Zbożowych Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Krakowie. 196 obiektów pszenicy jarej było ocenionych pod względem 10 cech fenotypowych w latach 1996–2001. Kolekcja podstawowa pszenicy jarej powstała w wyniku trzyetapowego podejścia. W pierwszej kolejności przeprowadzono grupowanie 196 obiektów. Oceniono dwie metody analizy skupień — metodę Warda i metodę UPMGA (średniej odległości między obiektami w skupieniach). W drugim kroku wyznaczono liczbę obiektów wchodzących do kolekcji podstawowej z wcześniej wyznaczonych grup. W pracy zastosowano dwa podejścia metodę proporcjonalną i metodę logarytmiczną. W ostatnim etapie wybrano obiekty z kolekcji wyjściowej do tworzonej kolekcji podstawowej. Wielkość utworzonych kolekcji podstawowych wynosiła 10%, 15%, 20%, 25% i 30% kolekcji wyjściowej. Procent istotnie zróżnicowanych średnich oraz procent istotnie zróżnicowanych wariancji, zostały wykorzystane do wskazania najbardziej efektywnej metody wyboru obiektów, techniki grupowania i wielkości utworzonych kolekcji podstawowych.
A core collection consists of a limited number of the accessions gathered in an existing collection, chosen to represent the genetic variability within the whole collection of plant genetic resources. The purpose of creating core collections is to improve the utilization of genetic resources in crop improvement programs. The aim of this work was both to present and evaluate different procedures of sampling and clustering and to assess the size of core collections. This paper describes the development of a core subset of the spring wheat germplasm collection maintained at the Department of Cereal Breeding and Quality Evaluation of the Plant Breeding and Acclimatization Institute in Kraków. 196 accessions of spring wheat were evaluated for 10 phenotypic traits in the seasons 1996–2001. The spring wheat core collection was established in tree steps. In the first step a total of 196 accessions were stratified into homogenous groups. Two methods of cluster analysis: Ward’s method and UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic mean) were comparatively used. In the second step, a number of entries per group was determined. Two strategies: proportional and logarithmic were used. In the final step of establishing core collections the actual entries were chosen. Five core collections contained 10%, 15%, 20%, 25% and 30% of objects from the whole collection. The mean percentage difference (MD%) and the variance difference percentage (VD%) were applied for screening optimal sampling strategy, cluster methods and size of core collections.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2009, 252; 105-117
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Przydatność wybranych miar podobieństwa dla danych binarnych do analiz wielocechowych w badaniach molekularnych
The application of chosen similarity measures for binary data in multivariate analysis in molecular experiments
Autorzy:
Mańkowski, Dariusz R.
Laudański, Zbigniew
Janaszek, Monika
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2198079.pdf
Data publikacji:
2011-12-29
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
dane binarne
analizy molekularne
miary podobieństwa
PCoA
analiza skupień
marchew jadalna
binary data
molecular analysis
similarity measures
cluster analysis
carrot
Opis:
W pracy przedstawiono możliwości wykorzystania ośmiu miar podobieństwa genetycznego w analizie danych binarnych, będących matematycznym obrazem żeli elektroforetycznych uzyskiwanych w badaniach molekularnych. Scharakteryzowano miary zgodności (Gowera), Jaccarda, Nei’a i Li (Dice’a), Hamanna, Ochiai, współczynnik Y Yule’a, współczynnik Q Yule’a oraz zero-jedynkowy odpowiednik współczynnika korelacji Pearsona (phi 4-point correlation). Na przykładzie analizy porównawczej 14 odmian marchwi jadalnej (Daucus carota L.) przedstawiono wykorzystanie tych miar w analizach wielocechowych — analizie skupień metodą UPGMA oraz analizie głównych współrzędnych PCoA. Przedstawiono i omówiono wyniki przeprowadzonych analiz oraz opisano różnice pomiędzy nimi. Porównano istniejące w literaturze miary podobieństwa dla danych molekularnych pod względem zgodności wyników uzyskiwanych z analiz statystycznych.
The article presents the possibility of using eight measures of genetic similarity in analysis of binary data which are a mathematical image of the electrophoresis gels obtained in molecular studies. We characterized similarity measures: simple matching (Gower), Jaccard, Nei and Li (Dice), Hamann, Ochiai, Yule Y coefficient, Yule Q coefficient and zero-one equivalent of the Pearson correlation coefficient (phi 4-point correlation). Then, the example of a comparative analysis of 14 varieties of carrots (Daucus carota L.) presents the use of these measures in a multivariate analysis — UPGMA cluster analysis and principal coordinates analysis PCoA. The results of the analysis and the differences between them were presented and discussed. The similarity measures for the molecular data existing in the literature were compared in terms of results compliance obtained from statistical analyses.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2011, 262; 155-173
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody statystyczne analizy danych w kompletnej klasyfikacji Odmiana ×Agrotechnika × Miejscowość × Rok (G×M×L×Y) z PDOiR
Statistical methods for data analysis in the complete classification Cultivar × Crop Management × Location × Year (G×M×L×Y) from PVTS
Autorzy:
Mądry, Wiesław
Derejko, Adriana
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2198701.pdf
Data publikacji:
2014-09-30
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
model mieszany ANOVA
łączna analiza wariancji
AMMI
analiza skupień
PDOiR
mixed linear ANOVA model
combined analysis of variance
cluster analysis
PVTS
Opis:
Doświadczenia porejestrowe są prowadzone od 1998 roku w ramach Porejestrowego Doświadczalnictwa Odmianowego i Rolniczego (PDOiR). W tym systemie wykonuje się serie doświadczeń odmianowych i odmianowo-agrotechnicznych. Doświadczenia PDOiR stanowią ostatni etap wdrażania postępu biologicznego do praktyki rolniczej. Pod względem merytorycznym i metodycznym system PDOiR jest koordynowany przez Centralny Ośrodek Badania Odmian Roślin Uprawnych. Realizacja serii doświadczeń w PDOiR odbywa się na terenie całego kraju w środowiskach (stacjach doświadczalnych) dobrze reprezentujących przestrzenną zmienność agro-ekosystemów w najważniejszych rejonach uprawy danego gatunku roślin w Polsce. W niniejszej pracy przedstawione zostały podstawy teoretyczne proponowanych, klasycznych, adaptowanych i adekwatnie rozwiniętych metod statystycznych, tj. łączna analiza wariancji, szczegółowe porównania wielokrotne, analiza AMMI oraz analiza skupień. Ponadto zaprezentowano użyteczność tych metod do wykorzystania ich w analizie danych w kompletnej klasyfikacji Odmiana × Agrotechnika × Miejscowość × Rok, pochodzących z PDOiR.
Postregistration Experiments are conducted since 1998 as part of the Post-registration Variety Testing System (PVTS). In this system series of varietal and varietal-agronomic experiments are performed. Experiments in PVTS represent the last stage in the implementation of biological progress to agricultural practice. PVTS is coordinated by the Research Centre for Cultivar Testing in terms of design and methodology. The implementation of a series of experiments in PVTS is held throughout the country in environments (Cultivar Testing Stations) representing well the spatial variability of agro-ecosystems in the major growing areas of the particular plant species in Poland. In this paper the theoretical basis is proposed, as well as classical, adapted and adequately developed statistical methods, i.e. the combined analysis of variance, multiple comparison, AMMI analysis and cluster analysis are presented. Moreover, the usefulness of these methods for analyzing the data in the complete classification of Cultivar × Crop Management × Location Year, coming from PVTS is presented.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2014, 273; 83-100
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Propozycja metody grupowania obiektów jedno- i wielocechowych z zastosowaniem odległości Mahalanobisa i analizy skupień
A proposed method for grouping uni- and multivariate treatments using Mahalanobis distance and cluster analysis
Autorzy:
Kaczmarek, Zygmunt
Czajka, Stanisław
Adamska, Elżbieta
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/41497522.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
ANOVA
MANOVA
analiza skupień
grupowanie obiektów
najmniejsza istotna odległość
odległość Mahalanobisa
cluster analysis
grouping of treatments
least significant distance
Mahalanobis distance
Opis:
Praca zawiera propozycję metody grupowania wielocechowych obiektów o rozkładach normalnych ze wspólną macierzą kowariancji. Metoda ta jest stosowana w analizie skupień i wykorzystuje odległości Mahalanobisa jako miarę podobieństwa dwóch obiektów. Grupowanie polega na łączeniu obiektów najbardziej do siebie podobnych, czyli takich między którymi odległość Mahalamnobisa jest najmniejsza. Jako kryterium zastopowania procesu grupowania, zarówno w przypadku obiektów wielocechowych jak i jednocechowych, przyjęto „najmniejszą istotną odległość” wyznaczoną każdorazowo dla porównywanych obiektów. Prezentowana metoda jest zilustrowana przykładem numerycznym grupowania linii DH rzepaku ozimego.
A method for grouping the multivariate normal treatments with common covariance matrix is proposed. The method is applicable in cluster analysis and utilizes the Mahalanobis distance as a of measure similarity of two treatments. It is based on the successive merging of two most similar samples taken from the treatments in the sense of minimal distance between them. The “least significant distance” is used as the criterion to determine a stopping rule for the grouping uni- and multivariate treatments. A numerical example from the winter oilseed rape data is included to illustrate the proposed method.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2008, 249; 9-10
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Wyświetlanie 1-15 z 23

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies