Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "pcr-rflp" wg kryterium: Wszystkie pola


Wyświetlanie 1-2 z 2
Tytuł:
Zastosowanie analizy PCR-RFLP do wykrywania i identyfikacji fitoplazm w roślinach ozdobnych
Autorzy:
Sliwa, H.
Kaminska, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/808492.pdf
Data publikacji:
2005
Wydawca:
Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie. Wydawnictwo Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie
Opis:
Rośliny ozdobne - tulipan, lilia, dalia i serduszka okazała (Dicentra spectabilis) - ze zmianami w zabarwieniu i deformacją liści i kwiatów, zaburzeniami w kwitnieniu i zamieraniem pąków kwiatowych oraz nadmiernym wybijaniem pędów bocznych, zostały przetestowane na obecność fitoplazm przy pomocy analizy PCR-RFLP. Do wykrywania fitoplazm zastosowano dwuetapową reakcję PCR - do pierwszego etapu użyto parę starterów uniwersalnych dla fitoplazm (P1/P7) a do drugiego trzy pary starterów uniwersalnych (R16F2n-R16R2, fA-rA, Pc399-P1694) oraz startery specyficzne dla fitoplazm z grupy żółtaczki astra (R16IF1-R16IR1) i proliferacji jabłoni (fAT-rAS). Identyfikację fitoplazm przeprowadzono na podstawie wyników analizy restrykcyjnej wykonanej przy użyciu sześciu enzymów (Hpall, Rsal, Alul, MseI, Sspl, oraz Hhal). Na postawie analizy PCR-RFLP w testowanych roślinach stwierdzono obecność dwóch grup fitoplazm. W tulipanach, serduszkach okazałych i jednej odmianie lilii wykryto fitoplazmy z grupy żółtaczki astra (AY, 16SrI), przy czym w serduszkach okazałych stwierdzono obecność fitoplazm z dwóch podgrup: I-B lub I- A, natomiast w lilii wykryto fitoplazmę z podgrupy I-A. Fitoplazmę z grupy proliferacji jabłoni (AP, 16SrX) wykryto w jednej odmianie lilii, natomiast w badanych daliach stwierdzono obecność mieszaniny fitoplazm AY i AP.
Diseased ornamental plants - tulips, lilies, dahlias and bleeding hearts (Di- centra spectabilis) - with symptoms of flower and leaf discolouration and malformation, flower bud deficiency and abnormal shoot production were tested for the presence of phytoplasmas using PCR-RFLP assay. Phytoplasmas were detected by two-step PCR assay. The first round was done using P1-P7 primer set, universal for phytoplasmas. The nested PCRs were done with universal (R16F2n-R16R2, fA-rA, Pc399-P1694) and aster yellows group-specific (R16IF1-R16IR1) or apple proliferation group-specific (fAT-rAS) primer pairs. Identification of phytoplasmas was accomplished through RFLP analysis using Hpall, Rsa\,Alu\, MseI, Sspl, or Hha\ endonucleases. On the basis of PCR-RFLP analysis, two different phytoplasma groups were identified in tested plants. Phytoplasmas belonging to the subgroup I-B or I-A of aster yellows group (AY, 16SrI) were found in samples collected from tulips, bleeding hearts and one lily cultivar. One lily cultivar was infected with phytoplasma from apple proliferation group (AP, 16SrX), whereas mix of two different phytoplasmas - belonging to AY and AP groups - were detected in the tested dahlias.
Źródło:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych; 2005, 504, 2
0084-5477
Pojawia się w:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wystepowanie fitoplazm w drzewach i krzewach ozdobnych w Polsce
Autorzy:
Kaminska, M
Sliwa, H
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/799222.pdf
Data publikacji:
2006
Wydawca:
Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie. Wydawnictwo Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie
Tematy:
objawy chorobowe
fitoplazmy
metody badan
fitoplazma proliferacji jabloni
krzewy ozdobne
rosliny ozdobne
metoda PCR-RFLP
fitoplazma zoltaczki astra
disease symptom
phytoplasma
research method
apple proliferation phytoplasma
ornamental shrub
PCR-RFLP method
aster yellows phytoplasma
Opis:
W latach 1998-2005 prowadzono obserwacje i badania nad występowaniem fitoplazm w drzewach i krzewach ozdobnych w Polsce. Przedmiotem badań były krzewy z rodzaju Clematis sp., Magnolia spp. i Rosa sp. oraz drzewa z rodzaju Acer sp., Carpinus sp., Fagus sp., Fraxinus sp. i Quercus spp. wykazujące objawy chorobowe sugerujące porażenie przez fitoplazmy. Objawy te obejmowały zahamowanie wzrostu, zmiany w zabarwieniu a nawet nekrozę i deformację liści, proliferację i zamieranie pędów, czasem deformację i zielenienie lub brak kwiatów oraz zamieranie roślin. Do wykrywania i identyfikacji fitoplazm stosowano test biologiczny oparty na reakcji rośliny testowej Catharanthus roseus, zakażanej techniką szczepienia, oraz analizę PCR-RFLP. Stosując technikę szczepienia, fitoplazmy przeniesiono z chorych róży, magnolii i klonu na siewki C. roseus. Przy pomocy techniki łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR) ze starterami amplifikującymi fragment 16Sr DNA fitoplazm, obecność fitoplazmatycznego DNA wykryto w roślinach Rosa spp., Magnolia spp., Clematis sp., Fraxinus excelsior, Carpinus sp. i Acer negundo oraz w eksperymentalnie zakażonych siewkach C. roseus. Analiza RFLP produktu amplifikacji z użyciem enzymów restrykcyjnych AluI, HhaII MseI i RsaI wykazała, że rośliny grabu, jesionu, klonu, magnolii, powojnika i róży były naturalnie porażone przez fitoplazmę z grupy żółtaczki astra (16SrI-B) - 'Ca. Phytoplasma asteris’. W niektórych roślinach róży i magnolii stwierdzono także fitoplazmę z grupy proliferacji jabłoni (16SrX-A) - ‘Ca. Phytoplasma mali’. W badanych roślinach fitoplazmy występowały nierównomiernie i w stosunkowo niskiej koncentracji, przez co mogły być wykrywalne dopiero w drugiej rundzie PCR. W roślinach buka i dębu, mimo wyraźnych symptomów, nie wykryto obecności fitoplazmatycznego DNA.
The presence of phytoplasmas in six plant species (Acer sp., Carpinus sp., Fagus sp, Fraxinus sp. i Quercus spp) with severe symptoms of leaf discoloration and malformation, leaf and shoot necrosis, abnormal production of secondary shoots and decline, as well as in periwinkle plants experimentally inoculated by grafting was demonstrated by PCR with primer pairs amplifying phytoplasma 16Sr DNA fragment. The RFLP analysis of the PCR product done with restriction enzymes AluI, HhaII MseI and RsaI showed that the tested rose, magnolia, clematis, ash-leaf maple, ash and hornbeam plants were naturally infected with aster yellows phytoplasma (16SrI-B), now reclassified as ‘Candidatus Phytoplasma asteris’. Apple proliferation phytoplasma (16SrX-A), now reclassified as 'Candidatus Phytoplasma mali’, was detected in diseased roses and magnolias. The phytoplasmas were stated using nested PCR in affected woody plants, indicating their law titre and uneven distribution. We failed to detect the phytoplasma presence in diseased Quercus and Fagus trees.
Źródło:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych; 2006, 510, 1; 255-261
0084-5477
Pojawia się w:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-2 z 2

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies