Temat: accessions - Katalog OPAC zbiorów

Skocz do pozycji: 1.

Tytuł:: Transposon-associated polymorphisms of stress-responsive gene promoters in selected accessions of Arabidopsis thaliana
Autorzy:: Naydenov, Mladen
Gospodinova, Nadezhda
Apostolova, Elena
Anachkov, Nikolay
Baev, Vesselin
Gozmanova, Mariyana
Minkov, Ivan
Yahubyan, Galina
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/1038365.pdf
Data publikacji:: 2018
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:: transposable elements
promoters
natural accessions
Arabidopsis
Opis:: Genetic diversity caused by transposable element movement can play an important role in plant adaptation to local environments. Regarding genes, transposon-induced alleles were mostly related to gene bodies and a few of them to promoter regions. In this study, promoter regions of 9 stress-related genes were searched for transposable element insertions in 12 natural accessions of Arabidopsis thaliana. The promoter screening was performed via PCR amplification with primers designed to flank transposable element insertions in the promoter regions of the reference accession Col-0. Transposable element-associated insertion/deletion (indel) polymorphisms were identified in 7 of the 12 promoter loci across studied accessions that can be developed further as molecular markers. The transposable element absence in the promoter regions of orthologous genes in A. lyrata indicated that the insertion of these transposable elements in A. thaliana lineage had occurred after its divergence from A. lyrata. Sequence analysis of the promoter regions of CML41 (Calmodulin-like protein 41) and CHAP (chaperone protein dnaJ-related) confirmed the indel polymorphic sites in four accessions - Col-0, Wassilewskija, Shahdara, and Pirin. The observed indel polymorphism of the CHAP promoter region was associated with specific gene expression profiles in the different accessions grown at a normal and elevated temperature in a plant growth chamber. The collected data can be a starting point for gene expression profiling studies under conditions resembling the natural habitats of accessions.
Źródło:: Acta Biochimica Polonica; 2018, 65, 3; 391-396
0001-527X
Pojawia się w:: Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 2.

Tytuł:: Zmienność cech ilościowych u wybranych odmian lokalnych lędźwianu siewnego (Lathyrus sativus L.)
Variation of quantitative traits in Polish local grasspea accessions (Lathyrus sativus L.)
Autorzy:: Rybiński, Wojciech
Bocianowski, Jan
Dziamba, Szymon
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/2198311.pdf
Data publikacji:: 2012-06-28
Wydawca:: Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:: cechy ilościowe
doświadczenia polowe
formy lokalne
Lathyrus sativus
wielocechowa metoda statystyczna
field trials
accessions
multivariate statistic methods
quantitative traits
Opis:: W latach 2004–2006 w warunkach pola doświadczalnego IGR PAN w Poznaniu założono doświadczenia polowe z 40 obiektami reprezentującymi lokalne odmiany lędźwianu siewnego z Podlasia i innych regionów wschodniej Polski. Oceniono termin kwitnienia oraz jedenaście cech ilościowych związanych z cechami plonotwórczymi roślin. Uzyskane wyniki opracowano statystycznie za pomocą wielocechowej analizy statystycznej. Dwuczynnikowa analiza wariancji (obiekty, lata) pozwoliła stwierdzić istotne różnice pomiędzy obiektami dla długości i szerokości strąka, liczby nasion ze strąka, i masy 1000 nasion. Rok badań determinował zmienność wszystkich badanych cech za wyjątkiem liczby nasion ze strąka. Nie stwierdzono interakcji genotypy × lata dla wszystkich obserwowanych cech lędźwianu. Analizowane obiekty charakteryzowały się szerokim zakresem zmienności cech. Najbardziej korzystnym pod względem cech plonotwórczych okazał się pierwszy oraz drugi rok badań. Pośród analizowanych dwunastu cech aż dla dziewięciu uzyskano najwyższe wartości średnich w pierwszym roku, w drugim dla trzech, a w trzecim dla żadnej z cech. Najbardziej różnicującym z kolei okazał się drugi rok badań, w którym najwyższe wartości współczynnika zmienności obserwowano dla siedmiu cech, w pierwszym dla pięciu, a w trzecim dla żadnej. Cechami wyróżniającymi analizowane obiekty były między innymi: barwa kwiatu i okrywy nasiennej, kształt strąka i nasion. MTN charakteryzuje się szerokim zakresem zmienności. MTN była istotnie i pozytywnie skorelowana z szerokością strąka i masą nasion ze strąka a ujemnie z liczbą nasion ze strąka i z rośliny. Wyrażając stopień podobieństwa obiektów pod względem analizowanych cech łącznie, najmniejszym podobieństwem od kilku obiektów (DZ: 21; 31; 38; 26; 7; 30, 6; 51; 37) charakteryzowała się forma DZ 2. Na podstawie wyliczonych odległości Mahalanobisa wyróżniono pary obiektów o największym, jak i najmniejszym podobieństwie, wskazując na szeroki zakres zróżnicowania analizowanego materiału pod względem kompleksu ocenianych cech. Umożliwia to efektywną selekcję najbardziej obiecujących genotypów jako materiału rodzicielskiego do krzyżowań i tym samym ulepszenia krajowych odmian lędźwianu siewnego.
The field trials were conducted in 2004–2006 in conditions of experimental field of Cerekwica. For experiment 40 accessions (landraces) derived from Podlasie and other regions of West Poland were chosen. The flowering time and eleven quantitative traits connected with yield structure were assessed. Obtained results were analyzed with a use of multivariate statistical method. A two-way analysis of variance (genotypes, years) allowed to detect significant differences between objects concerning pod length and width, seed number per pod as well as weight of 1000 seeds. The genotypes × years interactions had no significant effect on any of the analyzed traits. Analyzed objects presented a broad range of variability in tested traits. In analyzed years of field trials the most promising yield parameters were observed in the first year and at the lower level in the second. Among the 12 estimated traits, for nine traits the highest mean values were observed in the first year, for three in the second one and for none in third year. The second year had the biggest influence on variability of traits. In this year the highest coefficient of variation were obtained for seven traits, for five in first and for none in third year. Flower and seed coat colour, pod and seed shape belong to traits which allowed to distinguish analyzed forms: 1000 seed weight showed a very broad range of variation for analyzed forms. Weight of 1000 seeds showed significant and positive correlation with width of pod and weight of seeds per pod and a negative one with seed number per pod and per plant. The similarity of objects for all traits together on phenotypic level were expressed by Mahalanobis distance. The lowest similarity was observed for accession DZ 2, as compared to DZ: 21; 31; 38; 26; 7; 30, 6; 51; 37. On the basis of Mahalanobis distance we identified pairs of accessions with highest and lowest similarities indicating broad range of phenotypic variability of landraces derived from Podlasie region and another part of West Poland. This allowed an effective selection of most promising genotypes for parental initial material for crosses and improvement of domestic cultivars of grasspea.
Źródło:: Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2012, 264; 195-209
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:: Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Informacja

Wyszukujesz frazę "accessions" wg kryterium: Temat

Źródło danych

Dostawca treści

Kolekcja

Rok wydania

Wydawca

Temat

Autor

Typ dokumentu

Język