Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "rRNA" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-11 z 11
Tytuł:
Morphology, Ciliary Pattern and Molecular Phylogeny of Trachelophyllum brachypharynx Levander, 1894 (Litostomatea, Haptoria, Spathidiida)
Autorzy:
JANG, Seok Won
VĎAČNÝ, Peter
SHAZIB, Shahed Uddin Ahmed
SHIN, Mann Kyoon
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/763656.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Uniwersytet Jagielloński. Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego
Tematy:
18S rRNA gene, dorsal brush, Korea, lepidosomes, Trachelophyllidae
Opis:
We isolated a relatively unknown haptorian ciliate, Trachelophyllum brachypharynx, in brackish water from the mouth of the Taehwa River, South Korea. The morphology of this isolate was studied using in vivo observation and protargol impregnation, and its evolutionary history was revealed by phylogenetic analysis of the 18S rRNA gene. The main features of T. brachypharynx include (i) a very narrowly fusiform and slightly contractile body about 380 × 40 μm in size; (ii) two ellipsoidal macronuclear nodules typically connected by a fine strand; (iii) a single terminal contractile vacuole; (iv) filiform extrusomes that are typically 30 µm long; (v) an average of 24 ciliary rows, with two of them anteriorly differentiated into an isostichad dikinetidal dorsal brush; and (vi) hat-shaped lepidosomes. Based on the 18S rRNA gene phylogeny, T. brachypharynx clustered together with Trachelophyllum sp. within the order Spathidiida. Furthermore, phylogenetic trees and networks indicate some members from the genera Enchelyodon and Spathidium as the nearest relatives of trachelophyllids. Therefore, based on the present molecular and comparative-morphological analyses, we suggested a hypothesis explaining how trachelophyllids may have evolved from a spathidiid-like ancestor via an enchelyodonid-like stage.
Źródło:
Acta Protozoologica; 2015, 54, 2
1689-0027
Pojawia się w:
Acta Protozoologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Taxonomic Descriptions of Two Marine Ciliates, Euplotes dammamensis n. sp. and Euplotes balteatus (Dujardin, 1841) Kahl, 1932 (Ciliophora, Spirotrichea, Euplotida), Collected from the Arabian Gulf, Saudi Arabia
Autorzy:
Chen, Xumiao
Zhao, Yan
Al-Farraj, Saleh A.
AL-QURAISHY, Saleh
El-Serehy, Hamed A.
Shao, Chen
Al-Rasheid, Khaled A. S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/763475.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Uniwersytet Jagielloński. Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego
Tematy:
Marine ciliate, morphogenesis, morphology, new species, SSU-rRNA, taxonomy
Opis:
The morphology, morphogenesis and infraciliature of two marine euplotid ciliates, Euplotes dammamensis n. sp. and Euplotes balteatus (Dujardin, 1841) Kahl, 1932, isolated from a sandy beach of the Arabian Gulf, Saudi Arabia, were investigated using observations in vivo and protargol-impregnation methods. Euplotes dammamensis n. sp. is characterized by a combination of features including its huge body size (100–170 × 80–120 μm), 10 conspicuous dorsal ridges, 10 normal-sized frontoventral and two marginal cirri, and 11 dorsal kineties. Euplotes balteatus is mainly characterized by 10 frontoventral, two caudal, and two left marginal cirri, 7–10 dorsal kineties and 5–7 prominent dorsal ridges as well as double-eurystomus silverline system. The small subunit rRNA (SSU-rRNA) gene sequences were determined for both species and phylogenetic analyses based on these data indicated that E. dammamensis is most closely related to E. parabalteatus Jiang et al., 2010, and E. balteatus clusters with E. plicatum Valbonesi et al., 1997, E. orientalis Jiang et al., 2010, and E. bisulcatus Kahl, 1932.
Źródło:
Acta Protozoologica; 2013, 52, 2
1689-0027
Pojawia się w:
Acta Protozoologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Description of Epistylis camprubii n. sp., a Species Highly Tolerant to Ammonium and Nitrite
Autorzy:
Canals, Oriol
Salvadó, Humbert
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/763511.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Uniwersytet Jagielloński. Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego
Tematy:
Peritrichia, wastewater treatment, ciliates, 18s rRNA, ammonium, nitrite
Opis:
A new peritrich species highly tolerant to ammonium and nitrite, Epistylis camprubii n. sp., was found adhered to the biofilm of two advanced wastewater treatment plants treating high ammonium-loaded wastewater in Rubí, Spain. Its morphology, oral infraciliature and phylogenetic position in the peritrich clade were studied. The new species is a vase-shaped peritrich, constricted below the peristomial lip, with an in vivo average length of 58.7 ± 10.1 µm, average width of 32.0 ± 5.4 µm, and a longitudinally striated, compact stalk that occasionally exhibits uneven thickness and rarely shows transverse segments. The peristomial disc is commonly rounded or pointed, and rarely umbilicated. The C-shaped macronucleus is located in the adoral half of the body, and the only contractile vacuole lies in the adoral third of the zooid. The molecular analysis of the 18s gene sequence clustered E. camprubii n. sp. together with the other Epistylis, with the exception of Epistylis galea.
Źródło:
Acta Protozoologica; 2016, 55, 1
1689-0027
Pojawia się w:
Acta Protozoologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Reconstruction of Evolutionary History of Pleurostomatid Ciliates (Ciliophora, Litostomatea, Haptoria): Interplay of Morphology and Molecules
Autorzy:
VĎAČNÝ, Peter
SHIN, Mann Kyoon
KIM, Ji Hye
JANG, Seok Won
SHAZIB, Shahed Uddin Ahmed
RAJTER, Ľubomír
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/763636.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Uniwersytet Jagielloński. Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego
Tematy:
18S rRNA gene, Acineria, Epiphyllidae fam. nov., Kentrophyllum, Korea
Opis:
Pleurostomatids are raptorial ciliates that form a very distinct group within the Haptoria. Traditionally, the order Pleurostomatida was divided into two families: the Amphileptidae with two perioral kineties and a suture formed by the right side ciliary rows, and the Litonotidae with three perioral kineties and without suture. However, molecular phylogenies depicted the “traditional” Amphileptidae as a paraphyletic assemblage nesting also the Litonotidae. To overcome this problem we have analyzed genealogy of pleurostomatids using morphological data and 18S rRNA gene sequences, including newly sequenced genera Acineria and Kentrophyllum. Specifically, we have combined a morphological and molecular approach and have used also some other phylogenetic tools such as phylogenetic networks, split spectrum analysis, quartet mapping as well as the likelihood method of tracing history of morphological characters. These analyses show that: (1) there are not two but three distinct pleurostomatid lineages – Epiphyllidae fam. nov., Amphileptidae and Litonotidae; (2) epiphyllids (Epiphyllum + Kentrophyllum) represent a basal pleurostomatid group which is defined by two perioral kineties, by the presence of a suture on both the right and the left side of the body, by the loss of the oral bulge extrusomes, and by the extrusome fringe extending all around the body except for the oral region; (3) the families Amphileptidae and Litonotidae are monophyletic each, and represent sister groups; (4) Acineria belongs to the Litonotidae, as already indicated by morphological data; (5) Loxophyllum is a monophyletic and crown genus of the Litonotidae; and (6) Litonotus is paraphyletic, which could be very likely caused by a rapid radiation event that did not allow primary nucleotide homologies to be fixed.
Źródło:
Acta Protozoologica; 2015, 54, 1
1689-0027
Pojawia się w:
Acta Protozoologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A new marine ciliate, Metaurostylopsis antarctica nov. spec. (Ciliophora, Urostylida) from the Antarctic Ocean
Autorzy:
JUNG, Jae-Ho
Baek, Ye-Seul
Kim, Sanghee
Choi, Han-Gu
Min, Gi-Sik
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/763640.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Uniwersytet Jagielloński. Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego
Tematy:
Antarctic Ocean, marine ciliate, Metaurostylopsis antarctica, infraciliature, morphogenesis, SSU rRNA
Opis:
In this study, a new marine urostylid ciliate, Metaurostylopsis antarctica nov. spec. collected from the Antarctic Ocean was investigated using morphological, morphometrical, and molecular methods. Metaurostylopsis antarctica nov. spec. is characterized as follows: slender to ellipsoid form in body shape; two types of cortical granules, ellipsoid large one (type I, yellow-green, 1.5 × 1 μm) in rows along dorsal kineties and cirri, circular small one (type II, colourless, 0.3 μm in diameter) scattered throughout whole body; 19–24 adoral membranelles, 4 frontal cirri, 2–5 frontoterminal cirri, 1 buccal and 2 transverse cirri; 3–5 midventral pairs, 10–15 cirri of midventral row; 1 right and 2 left marginal rows; 3 dorsal kineties; about 43 macronuclear nodules. This new species mainly differs from the congeners by the number of marginal rows (1 vs. 3 or more on right side; 2 vs. 3 or more on left side). In addition, proter’s oral primordium  developed on the right side of the oral cavity (vs. in center of oral cavity), and the rightmost anlage splits into two parts, nam ely, the frontoterminal cirri and a transverse cirrus (vs. only frontoterminal cirri). Inter-specific dissimilarities of the SSU rRNA gene between the congeners range from 3.3 to 4.4%.
Źródło:
Acta Protozoologica; 2011, 50, 4
1689-0027
Pojawia się w:
Acta Protozoologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Dynamika ilościowa AOB w procesie biologicznego oczyszczania odcieków składowiskowych w warunkach beztlenowych
Quantitative dynamics of AOB in the biological treatment of landfill leachate in anaerobic conditions
Autorzy:
Jurczyk, Ł.
Koc-Jurczyk, J.
Różalska, P.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/296871.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Politechnika Częstochowska. Wydawnictwo Politechniki Częstochowskiej
Tematy:
odcieki składowiskowe
SBR
AOB
16S rRNA
Q-PCR
landfill leachate
Opis:
Składowanie odpadów, nawet na obiektach prawidłowo zaprojektowanych i eksploatowanych może stwarzać wiele zagrożeń dla środowiska. Jednym z najpoważniejszych jest powstawanie w obrębie składowiska odcieków, charakteryzujących się między innymi dużymi stężeniami azotu amonowego oraz znaczną zawartością trudno rozkładalnych związków organicznych. Podstawową metodą unieszkodliwiania odcieków składowiskowych jest ich oczyszczanie w reaktorach biologicznych. U podstaw tego procesu leży biochemiczny rozkład azotu amonowego przez mikroorganizmy wykazujące ekspresję genu monooksygenazy amoniaku, a jednym ze sposobów zwiększenia jego efektywności jest stosowanie różnych typów nośników stwarzających tym mikroorganizmom optymalne warunki życia. Odcieki wykorzystane w badaniach pochodziły ze składowiska odpadów komunalnych w Kozodrzy (woj. podkarpackie). Badania prowadzono w trzech sekwencyjnych reaktorach biologicznych o pojemności 2 l (SBR 1-3), w warunkach beztlenowych, w temperaturze 42°C i przy stałym czasie zatrzymania wynoszącym 6 d. SBR 1 pracował tylko z osadem czynnym zawieszonym, natomiast SBR 2 i 3 zostały wyposażone w wypełnienia z PCV o różnej średnicy porów (odpowiednio 2 ÷ 3 oraz 4 ÷ 5 mm). W pobranych z reaktorów próbkach osadu badano, za pomocą techniki ilościowej łańcuchowej reakcji polimerazy (Q-PCR), zawartość kopii genu 16S rRNA o sekwencji charakterystycznej dla wszystkich znanych β-proteobakterii mających zdolność do utleniania amoniaku. Porównując w badanych próbkach dynamikę ilości badanego genu, stwierdzono, że wypełnienie zastosowane w SBR 2 powodowało najmniejsze wahania liczebności bakterii w procesie ich adaptacji do warunków technologicznych. Efektywność usuwania azotu amonowego we wszystkich reaktorach miała związek z ilością kopii badanego genu.
Waste disposal, even on properly designed and operated landfills may be environmentally hazardous. One of the most onerous aspects of landfilling is formation of the leachate, characterized by high concentrations of ammonia nitrogen and organic compounds. One of the most common method applied for nitrogen neutralization in landfill leachate is biological treatment based on biochemical decomposition of an ammonia by micro-organisms expressing gene of ammonia monooxygenase. The way to increasing efficiency of this process is the application of different types of fillings creating optimal conditions for microorganisms life. Leachate used in the study came from a large scale municipal waste landfill in Kozodrza (podkarpackie province, Poland). The research was conducted in three sequential batch reactors of 2 l (SBR 1-3), in anaerobic conditions, high temperature (42°C) and a constant HRT of 6 d. SBR 1 ran with suspended activated sludge, while the SBR 2 and 3 were equipped with PVC filling of different pore diameters (respectively 2 ÷ 3 and 4 ÷ 5 mm). The samples of sludge were examined for number of 16S rDNA copies characterized for ammonia oxidizing β-proteobacteria. Comparing the quantitative dynamics of 16S rRNA gene in samples it was found that fillings used in the SBR 2 resulted in slightest hesitation of the number of bacteria during the process of their adaptation to technological conditions. The ammonia nitrogen removal efficiency in all reactors was related to the number of 16S rRNA gene copies.
Źródło:
Inżynieria i Ochrona Środowiska; 2011, 14, 4; 309-322
1505-3695
2391-7253
Pojawia się w:
Inżynieria i Ochrona Środowiska
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
A New Marine Cyrtophorid Ciliate, Dysteria nabia nov. spec. (Ciliophora: Phyllopharyngea: Cyrtophorida: Dysteriidae), from South Korea
Autorzy:
Park, Mi-Hyun
Min, Gi-Sik
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/763537.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Uniwersytet Jagielloński. Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego
Tematy:
Dysteriidae, Dysteria nabia nov. spec., infraciliature, marine ciliate, SSU rRNA, Korea, Yellow Sea
Opis:
We discovered a new marine cyrtophorid ciliate, Dysteria nabia nov. spec., in Incheon Harbor in the Yellow Sea and at Ihoteu Beach on Jeju-do Island, South Korea. This new species is described based on live observations, protargol impregnation, and silver nitrate impregnation. Dysteria nabia measures approximately 94 × 45 µm in vivo and has an oval to elliptical form, with a subcaudally positioned podite; 5 right kineties, with a single shortened innermost right kinety; usually 3 left frontal kineties; and 2 contractile vacuoles. The length of the small subunit ribosomal RNA (SSU rRNA) gene sequence is 1,700 bp. In comparison with the five previously identified sequences of Dysteria species, the inter-specific similarity of D. nabia ranges from 91.5 to 98.4%.
Źródło:
Acta Protozoologica; 2014, 53, 3
1689-0027
Pojawia się w:
Acta Protozoologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Electron Microscopical Investigations of a New Species of the Genus Sappinia (Thecamoebidae, Amoebozoa), Sappinia platani sp. nov., Reveal a Dictyosome in this Genus
Autorzy:
WYLEZICH, Claudia
Kudryavtsev, Alexander
Michel, Rolf
Corsaro, Daniele
Walochnik, Julia
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/763632.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Uniwersytet Jagielloński. Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego
Tematy:
Sappinia platani sp. nov., Amoebozoa, Thecamoebidae, SSU rRNA gene, diversity, dictyosome, glycocalyx, endocytobionts
Opis:
The genus Sappinia belongs to the family Thecamoebidae within the Discosea (Amoebozoa). For long time the genus comprised only two species, S. pedata and S. diploidea, based on morphological investigations. However, recent molecular studies on gene sequences of the small subunit ribosomal RNA (SSU rRNA) gene revealed a high genetic diversity within the genus Sappinia. This indicated a larger species richness than previously assumed and the establishment of new species was predicted. Here, Sappinia platani sp. nov. (strain PL-247) is described and ultrastructurally investigated. This strain was isolated from the bark of a sycamore tree (Koblenz, Germany) like the re-described neotype of S. diploidea. The new species shows the typical characteristics of the genus such as flattened and binucleate trophozoites with a differentiation of anterior hyaloplasm and without discrete pseudopodia as well as bicellular cysts. Additionally, the new species possesses numerous endocytobionts and dictyosomes. The latter could not be found in previous EM studies of the genus Sappinia. Standing forms, a character of the species S. pedata, could be formed on older cultures of the new species but appeared extremely seldom. A loose layer of irregular, bent hair-like structures cover the plasma membrane dissimilar to the glycocalyx types as formerly detected in other Sappinia strains.
Źródło:
Acta Protozoologica; 2015, 54, 1
1689-0027
Pojawia się w:
Acta Protozoologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie techniki PCR w badaniach bakteriologicznych
Applications of PCR in microbiology
Autorzy:
Adaszek, L.
Dziegiel, B.
Mazurek, L.
Winiarczyk, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/859637.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Krajowa Izba Lekarsko-Weterynaryjna
Tematy:
bakteriologia
diagnostyka bakteriologiczna
metody badan
lancuchowa reakcja polimerazy
16S rRNA
diagnostyka molekularna
Źródło:
Życie Weterynaryjne; 2018, 93, 04
0137-6810
Pojawia się w:
Życie Weterynaryjne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykorzystanie sekwencji genu rRNA w molekularnej diagnostyce parazytologicznej
Molecular diagnostic of parasites using rRNA gene sequence
Autorzy:
Dlugosz, E
Wisniewski, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/841440.pdf
Data publikacji:
2006
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
geny kodujace
diagnostyka parazytologiczna
diagnostyka weterynaryjna
wykorzystanie
parazytologia
konferencje
sekwencja genu
gen rRNA
Warszawa konferencja
Opis:
Ribosomal RNA (rRNA) is a component of the ribosomes. Eukaryotic ribosomes contain four different rRNA molecules: 18S, 5,8S, 28S and 5S rRNA. rRNA is the most conserved (least variable) gene in all cells. For this reason, genes that encode the rRNA (rDNA) are sequenced to identify an organism's taxonomic group, calculate related groups, and estimate rates of species divergence. Especially the internal transcribed spacers (ITS) are very useful for molecular diagnostic of parasite. They are noncoding regions of DNA sequence that separate genes coding for the 28S, 5.8S, and 18S ribosomal RNAs. These ribosomal RNA (rRNA) genes are highly conserved across taxa while the spacers between them may be species-specific. In this paper authors describe practical using of rRNA gene to parasite diagnostic.
Źródło:
Annals of Parasitology; 2006, 52, 4; 263-269
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykorzystanie sekwencji genu rRNA w molekularnej diagnostyce parazytologicznej
Molecular diagnostic of parasites using rRNA gene sequence
Autorzy:
Długosz, E.
Wiśniewski, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2144424.pdf
Data publikacji:
2006
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
geny kodujace
diagnostyka parazytologiczna
diagnostyka weterynaryjna
wykorzystanie
parazytologia
konferencje
sekwencja genu
gen rRNA
Warszawa konferencja
Opis:
Ribosomal RNA (rRNA) is a component of the ribosomes. Eukaryotic ribosomes contain four different rRNA molecules: 18S, 5,8S, 28S and 5S rRNA. rRNA is the most conserved (least variable) gene in all cells. For this reason, genes that encode the rRNA (rDNA) are sequenced to identify an organism's taxonomic group, calculate related groups, and estimate rates of species divergence. Especially the internal transcribed spacers (ITS) are very useful for molecular diagnostic of parasite. They are noncoding regions of DNA sequence that separate genes coding for the 28S, 5.8S, and 18S ribosomal RNAs. These ribosomal RNA (rRNA) genes are highly conserved across taxa while the spacers between them may be species-specific. In this paper authors describe practical using of rRNA gene to parasite diagnostic.
Źródło:
Wiadomości Parazytologiczne; 2006, 52, 4; 263-269
0043-5163
Pojawia się w:
Wiadomości Parazytologiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-11 z 11

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies