Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "methylation" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
    Wyświetlanie 1-12 z 12
    Tytuł:
    Genetyka zachowania: co wnosi do wiedzy o człowieku?
    Autorzy:
    Oniszczenko, Włodzimierz
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1167863.pdf
    Data publikacji:
    2017
    Wydawca:
    Uniwersytet Kazimierza Wielkiego w Bydgoszczy
    Tematy:
    DNA
    behavioural genetics
    genetic correlation
    heritability
    methylation
    Opis:
    The aim of this article is to highlight the achievements of human behavioural genetics. It begins with a brief overview of the field of contemporary human behaviour genetics. Then, the general principles of behavioural genetics, research methods used, the concept of heritability and areas of rapid advancement in the field are identified. While classical twin studies have been a powerful tool to find heritability or the genetic correlation between different human behaviours, new tools are now available to help identify the genes responsible for individual differences. In particular, association studies and DNA methylation studies are crucial to advancing knowledge on the genetic basis of human behaviour as well as on the epigenetic factors that mediate genetic and environmental effects on behaviour. Several results on the heritability of human behaviour, relationships between genetic polymorphisms and behaviour as well as the consequences of DNA methylation are reported in this article.
    Źródło:
    Polskie Forum Psychologiczne; 2017, XXII, 1; 5-19
    1642-1043
    Pojawia się w:
    Polskie Forum Psychologiczne
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Paidagogos (παιδαγωγός) i ars educandi (αρς εδυκανδι) w kontekście epigenetyki
    Paidagogos (παιδαγωγός) and ars educandi (αρς εδυκανδι) in the context of epigenetics
    Autorzy:
    Dyk, Wiesław
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2011184.pdf
    Data publikacji:
    2020
    Wydawca:
    Uniwersytet Szczeciński. Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Szczecińskiego
    Tematy:
    epigenetics
    nutrigenomics
    nutrigenetics
    DNA methylation
    parenting
    epigenetyka
    nutrigenomika
    nutrigenetyka
    metylacja
    wychowanie
    Opis:
    Ewolucyjnie każdy żywy organizm związany jest ze swym naturalnym środowiskiem. Dostosowanie się do otoczenia i jego zmian, by przeżyć, zawsze towarzyszyło człowiekowi. Dbałość o pokarm, ale nie przejadanie się, było przepustką do obecnego i przyszłego życia. Przeżyły te gatunki, które dostosowały pokarm do potrzeb swojego organizmu. Wśród Homo sapiens przeżył gatunek Homo sapiens sapiens, kromaniończyk, gdyż dzięki wysokiej inteligencji dbał o jakość pożywienia. Współczesne technologie żywności i pęd życia wprowa¬dził degradację ludzkiej natury. Powstała niezgodność między genami i pożywieniem. Nie zawsze wyżywienie służy organizmowi człowieka i nie zawsze umożliwia jego osobowościowe, kreatywne trwanie w środowisku naturalnym. Aby działać i tworzyć najpierw trzeba się właściwie odżywiać. Kształtowanie osobowości wsparte jest rodzajem, jakością i wartością pożywienia.
    From evolution standpoint, every living organism is bound with its environment. Adaptation to the environment and its changes had always accompanied Man. Taking care of food but not overeating was a pass to current and future life. The species which did not overeat, had survived. Amongst Homo sapiens, Homo sapiens sapiens and Homo Cro-Magnon survived, because having future in mind, it took care of the food’s quality. Contemporary food technologies and rate of living introduced degeneration of human nature. A chaos had occurred between genes and food. Food is not always in benefit of human organism and its personal, creative existence in natural environment. To act and create you must be first full. Shaping the personality is supported by the type, quality and value of food.
    Źródło:
    Studia Koszalińsko-Kołobrzeskie; 2020, 27; 359-370
    1230-0780
    2719-4337
    Pojawia się w:
    Studia Koszalińsko-Kołobrzeskie
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Znaczenie epigenetyki w patogenezie czerniaka
    The role of epigenetics in the pathogenesis of melanoma
    Autorzy:
    Chodurek, Ewa
    Gołąbek, Karolina
    Orchel, Joanna
    Orchel, Arkadiusz
    Dzierżewicz, Zofia
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1038734.pdf
    Data publikacji:
    2012
    Wydawca:
    Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
    Tematy:
    epigenetyka
    czerniak
    metylacja dna
    acetylacja histonów
    epigenetics
    melanoma
    dna methylation
    histone acetylation
    Opis:
    Epigenetics represents the mechanisms that influence the regulation and modification of the expression of genetic material not related to the alterations in DNA sequences. These mechanisms include both DNA methylation and histone modifications. In the present article, we review current views on the role of aberrations of DNA hyper- and hypomethylation processes and the acetylation of histones, associated with genes that control the cell cycle, cell differentiation, DNA repair, apoptosis, cell signaling, angiogenesis, metabolism of xenobiotics and invasion, in the pathogenesis of melanoma. In addition, new strategies for treatment of melanoma associated with epigenetics are presented.
    Przez pojęcie epigenetyka należy rozumieć mechanizmy wpływające na regulację i modyfi kację ekspresji materiału genetycznego, jednocześnie niezmieniające sekwencji nukleotydów. Mechanizmy te obejmują zarówno metylację DNA, jak i modyfikacje histonów. W artykule dokonano przeglądu aktualnych poglądów dotyczących zaburzeń procesów hiperihipometylacji DNA oraz acetylacji histonów w patogenezie czerniaka, związanych z genami kontrolującymi cykl komórkowy, różnicowanie, naprawę DNA, apoptozę, sygnalizację komórkową, angiogenezę, metabolizm ksenobiotyków i powstawanie przerzutów. Ponadto przedstawiono nowe strategie leczenia czerniaka związane z epigenetyką.
    Źródło:
    Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2012, 66, 3; 44-56
    1734-025X
    Pojawia się w:
    Annales Academiae Medicae Silesiensis
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Psychology goes molecular. Epigenetics of learning
    Autorzy:
    Barciszewski, jan
    Gurda, Dorota
    Paluchowski, Władysław Jacek
    Hornowska, Elżbieta
    Jasielska, Aleksandra
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/703903.pdf
    Data publikacji:
    2016
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    behavioral epigenetics
    cognitive functions
    DNA methylation
    epigenetic inheritance
    epigenetics
    gene-environment interplay
    learning
    memory
    Opis:
    The challenge for psychology is to integrate findings from genetics and environmental (social, biological, chemical) factors, into the study of human behavior and deep understanding of the emergence of different changes in the anatomy, physiology, and chemistry of the nervous system that influence the mental health. Currently, cognitive abilities associated with learning and memory, reasoning, problem solving, and developing relationships are in scope of molecular psychology, which is the study of behavior and its underlying brain systems using the tools of molecular biology. However, studies have demonstrated that DNA sequence variations and rare mutations account for only a small fraction of the risk for inheritance of personality traits and mental illness. The large unaccounted heritability of personality traits and mental health suggest that additional molecular and cellular mechanisms are involved. Various complex gene-environment interactions can lead to different phenotypes. These structural changes may be crucial for the development of mature neural networks that support emotional, cognitive, and social behavior. The generation of different morphology, physiology, and behavioral outcomes from a single genome in response to changes in the environment forms the basis for phenotypic plasticity, which is fundamental to the way organisms cope with environmental variation, navigate the present world, and solve future problems. Epigenetics has major implications for psychology and gives the new answer for the old question- what is the biochemical basis of learning. It is bringing back the leading role of environment and behavior, by including their effects on genome function. In addition, it opens up the possibility of memory being stored in the epigenome, so that our experiences may be embedded in our genome by epigenetic mechanisms. Epigenetics can be described as the study of the complex interactions underlying the development of an organism over its lifetime.
    Źródło:
    Nauka; 2016, 4
    1231-8515
    Pojawia się w:
    Nauka
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    The analysis of Fanconi anemia/BRCA pathway genesin laryngeal carcinoma
    Autorzy:
    Szaumkessel, Marcin
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1401931.pdf
    Data publikacji:
    2014
    Wydawca:
    Index Copernicus International
    Tematy:
    Fanconi anemia/BRCA pathway
    DNA repair
    Laryngeal carcinoma
    DNA methylation
    microRNA
    mRNA level
    FANCA gene
    Opis:
    Summary of Doctoral Thesis/Streszczenie pracy doktorskiej
    Źródło:
    Polski Przegląd Otorynolaryngologiczny; 2014, 3, 4; 250-252
    2084-5308
    2300-7338
    Pojawia się w:
    Polski Przegląd Otorynolaryngologiczny
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Modyfikacje epigenetyczne jako potencjalne cele terapii antynowotworowych
    Epigenetic modifications as potential targets of anti-cancer therapy
    Autorzy:
    Kulczycka, Anna
    Bednarek, Ilona
    Dzierżewicz, Zofia
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1034844.pdf
    Data publikacji:
    2013
    Wydawca:
    Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
    Tematy:
    epigenetyka
    dna
    histony
    metylacja
    acetylacja
    fosforylacja
    terapie antynowotworowe
    epigenetics
    histones
    methylation
    acetylation
    phosphorylation
    anti-cancer treatments
    Opis:
    Epigenetics analyses inherited characteristics not directly connected to the DNA nucleotide sequence. It investigates the relationships between biochemical modifications and the expression of selected genes. Initially, it was thought that gene expression depends on information encoded in the DNA sequence. However, it was discovered that the activity of many enzymes like methylases, demethylases, acetylases, deacetylases is necessary to regulate this process and its dysregulations may lead to e.g. cancer initiation and progression. Epigenetics has an impact on neoplastic transformation by reducing the global level of DNA methylation and increasing the methylation level within tumour suppressor gene promoters, which significantly impairs the repression of carcinogenesis. Additionally, modifications of histone proteins, based on disorders of acetylation-deacetylation and methylation-demethylation processes, may lead to overexpression of genes involved in cancer development. Numerous examples have been described, among others breast, prostate and colon cancers, depending on the modification of histone amino tails, primarily of histone H3. For such reasons, the possibility of using many therapies which can reverse the negative effect of these modifications by e.g. DNA demethylation (DNA demethylating drugs) or re-acetylation of histone lysine resides (histone deacetylase inhibitors) is examined. In the near future, epigenetics probably will allow the effective treatment of some cancer diseases, although further research on the impact of enzymatic modifications on the development of carcinogenesis is still needed.
    Epigenetyka zajmuje się badaniem cech dziedzicznych, które nie zależą bezpośrednio od sekwencji nukleotydowej w DNA, ale są rezultatem modyfikacji biochemicznych na ekspresję wybranych genów. Początkowo uważano, że ekspresja genów zależy tylko od informacji zapisanej zawartej w sekwencji DNA, z czasem okazało się, że liczne modyfikacje będące rezultatem działania różnych grup enzymów, w tym metylaz, demetylaz, acetylaz czy deacetylaz, wpływają na regulację tego procesu, a zaburzenia regulacji aktywności tych enzymów mogą prowadzić do wystąpienia i rozwoju m.in. nowotworów. Epigenetyczny aspekt rozwoju transformacji nowotworowej wskazuje na obniżenie globalnego poziomu metylacji DNA oraz podwyższenie poziomu metylacji w obrębie promotorów genów supresorowych, co znacząco upośledza represję nowotworzenia. Dodatkowo, modyfikacje białek histonowych, opierające się na dysregulacji procesów acetylacji–deacetylacji i metylacji – demetylacji, prowadzą do nadekspresji genów zaangażowanych w rozwój kancerogenezy. Opisane zostały liczne przykłady zależności wystąpienia nowotworów, m.in. raka sutka, stercza czy okrężnicy od wystąpienia danej modyfikacji reszt aminokwasowych białek histonowych, w tym głównie histonu H3. Z takich też przyczyn podejmowane są próby zastosowania terapii odwracających negatywny skutek wybranych modyfikacji, np. poprzez demetylację DNA (leki demetylujące DNA) czy reacetylację reszt lizynowych histonów (inhibitory decetylaz histonów). W niedalekiej przyszłości epigenetyka najprawdopodobniej u możliwi skuteczne leczenie części chorób nowotworowych, aczkolwiek konieczne są dalsze badania wpływu modyfikacji enzymatycznych na mechanizm rozwoju kancerogenezy.
    Źródło:
    Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2013, 67, 3; 201-208
    1734-025X
    Pojawia się w:
    Annales Academiae Medicae Silesiensis
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Konformacyjne właściwości modyfikowanych reszt aminokwasowych
    Conformational properties of modified amino acid residues
    Autorzy:
    Wałęsa, R.
    Buczek, A.
    Broda, A.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/143003.pdf
    Data publikacji:
    2014
    Wydawca:
    Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Przemysłu Chemicznego. Zakład Wydawniczy CHEMPRESS-SITPChem
    Tematy:
    dehydrofenyloalanina
    N-metylowanie
    analiza konformacyjna
    obliczenia DFT
    wpływ rozpuszczalnika
    dehydrophenylalanine
    N-methylation
    conformational analysis
    DFT calculations
    solvent impact
    Opis:
    Konformacyjnie usztywnione aminokwasy są szeroko stosowane przy konstruowaniu peptydowych analogów o lepszych właściwościach farmako-kinetycznych. Jednym z sposobów modyfikacji peptydów jest wprowadzenie reszt a,b-dehydroaminokwasowych w łańcuch peptydowy. Podwójne wiązanie Ca=Cb usztywnia łańcuch boczny i umożliwia występowanie izomerii geometrycznej Z/E. Innym rodzajem modyfikacji jest zastąpienie amidowej grupy –NH grupą –NCH3, czyli tzw. N-metylowanie. Autorzy określili wpływ tych dwóch modyfikacji strukturalnych na konformację łańcucha peptydowego. Przeprowadzone badania pozwoliły ustalić, że reszta a,b-dehydrofenyloalaniny aminokwasów konformacji H. Wykazano również, że polarny rozpuszczalnik zwiększa wyraźnie udział konfiguracji cis wiązania amidowego w N-metylowanych peptydach.
    Conformationally constrained amino acids are widely used in the design of peptide analogues with better pharmacokinetic properties. One of the methods of peptide modification is the introduction of a, b -dehydroamino acid residues into peptide chain. The double bond Ca=Cb constrains side chain and enables occurrence of geometrical isomerism Z/E. The other type of modification is the replacement of amide group –NH with group –NCH3, i.e. so called N-methylation. The Authors have determined the impact of these two structural modifications on peptide chain conformation. Conducted research has lead to the conclusion that -dehydrophenylalanine residue has the ability to exhibit atypical for standard amino acids H conformation. It has also been shown that polar solvent clearly increase percentage of cis configuration of amide bond in N-methylated peptides.
    Źródło:
    Chemik; 2014, 68, 4; 329-334
    0009-2886
    Pojawia się w:
    Chemik
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Modyfikacje epigenetyczne a ekspresja genów w nowotworzeniu
    Epigenetic modifications and gene expression in cancerogenesis
    Autorzy:
    Poczęta, Marta
    Nowak, Ewa
    Bieg, Dominik
    Bednarek, Ilona
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1035756.pdf
    Data publikacji:
    2018
    Wydawca:
    Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
    Tematy:
    zmiany epigenetyczne
    nowotwory
    metylacja dna
    białka histonowe
    mikrorna
    ekspresja genów
    epigenetic modifications
    cancers
    dna methylation
    histone proteins
    microrna
    gene expression
    Opis:
    Modyfikacje epigenetyczne są zmianami regulującymi ekspresję genów. Spośród tych modyfikacji metylacja DNA w regionach promotorowych genów jest najlepiej poznaną zmianą. Za metylację DNA odpowiada rodzina metylo-transferaz DNA. Proces ten jest odwracalny w wyniku reakcji demetylacji, w których pośrednią rolę odgrywają białka TET. Hipometylacja DNA oraz hipermetylacja regionów promotorowych genów bogatych w wyspy CpG należy do epigenetycznych mechanizmów powszechnie występujących w wielu typach nowotworów. Epigenetyczny mechanizm transformacji nowotworowej związany jest nie tylko ze zmianami w poziomie metylacji poszczególnych onkogenów czy też genów supresorowych, ale także z potranslacyjnymi modyfikacjami białek histonowych wymuszających zmia-ny w strukturze chromatyny. Określone modyfikacje, takie jak: metylacja, acetylacja, fosforylacja, ubikwitynacja, biotynylacja, ADP-rybozylacja oraz sumoilacja, mogą wpływać na kondensację chromatyny oraz na białka i kom-pleksy enzymatyczne decydujące o dostępności DNA, co z kolei wpływa na upakowanie, replikację, rekombinację, procesy naprawy oraz ekspresję DNA. W mechanizmach modulacji ekspresji genów zaangażowanych w procesy prowadzące do rozwoju nowotworów znaczącą rolę odgrywają dwa główne rodzaje małych interferencyjnych RNA siRNA oraz miRNA. Uzyskiwane dane z prowadzonych badań pokazują, że mechanizmy epigenetyczne uczestniczą w procesach pro- wadzących do rozwoju nowotworów, a poszukiwanie epigenetycznych biomarkerów może być przydatne w terapii nowotworów.
    Epigenetic modifications are changes which can regulate gene expression. DNA methylation in gene promoter regions is the most well-known change among epigenetic modifications. The family of DNA methyltransferases is responsible for DNA methylation. Methylation is reversible due to the demethylation reaction, executed by TET proteins. DNA hypomethylation and hypermethylation of gene promoter regions rich in CpG islands belonging to epigenetic mechanisms commonly occur in many tumors. The epigenetic mechanism of malignant transformation is related not only to changes in the level of methylation of oncogenes or tumor suppressor genes, but also to post-translational modifications of histone proteins, forcing changes in the chromatin structure. Certain modifications, such as methy-lation, acetylation, phosphorylation, ubiquitination, biotinylation, ADP–ribosylation, and sumoylation may affect chro-matin condensation, protein and enzyme complexes that determine the availability of DNA, which then affects the condensation, replication, recombination and repair processes, as well as gene expression. Among the modulatory mechanisms of the expression of genes involved in the processes leading to cancer development, two main types of small interfering RNA play an important role: siRNA and miRNA. Research data Show that epigenetic mechanisms are involved in the processes leading to tumor development, and searching for epigenetic biomarkers may be useful in epigenetic cancer therapy.
    Źródło:
    Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2018, 72; 80-89
    1734-025X
    Pojawia się w:
    Annales Academiae Medicae Silesiensis
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Wykorzystanie reaktora fluidalnego do syntezy 2,6-dimetylofenolu
    Use of fluidized bed reactor in 2,6-dimethylphenol synthesis
    Autorzy:
    Jamanek, D.
    Zielecka, M.
    Wielgosz, Z.
    Cyruchin, K.
    Kępska, B.
    Wenda, M.
    Górska, A.
    Krakowiak, J.
    Łukomska, A.
    Baran, P.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/141847.pdf
    Data publikacji:
    2014
    Wydawca:
    Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Przemysłu Chemicznego. Zakład Wydawniczy CHEMPRESS-SITPChem
    Tematy:
    2,6-dimetylofenol
    fenol
    reaktor fluidalny
    tlenek krzemu
    reakcja metylowania fenolu
    2,6-dimethylphenol
    phenol
    fluidized bed reactor
    silicon oxide
    phenol methylation reaction
    Opis:
    Prace badawcze dotyczyły otrzymywania i przetestowania katalizatorów do syntezy 2,6-dimetylofenolu, które mogłyby pracować jako złoże fluidalne. Zsyntezowano tlenek krzemu, na który nanoszono w różnych wariantach tlenki: żelaza(III), magnezu(II), chromu(III) i miedzi(II). Ponadto przebadano katalizator TZC-3/1 produkowany przez Grupę Azoty S.A. Tlenek krzemu z naniesionym na powierzchnię tlenkiem magnezu umożliwił prawie 100% przereagowanie fenolu w temp. 733K, przy selektywności w stosunku do 2,6-dimetylofenolu bliskiej 60%. Podobny stopień przereagowania fenolu otrzymano dla katalizatora przemysłowego TZC-3/1, ale jego selektywność względem 2,6-dimetylofenolu wynosi 90%. Wyniki eksperymentów wskazują, że najlepszym spośród badanych katalizatorów jest przemysłowy katalizator TZC-3/1 pozwalający otrzymać najlepsze wyniki w najniższej temperaturze.
    Research works were focused on obtaining and testing of catalysts for 2,6-dimethylphenol synthesis that could be used as fluidized bed. Silicon oxide was synthesized, on which subsequently various variants of iron (III), magnesium (II), chrome (III) and copper (II) oxides were deposited. Moreover, catalyst TZC-3/1 produced by Grupa Azoty SA was tested. Silicon oxide with deposited magnesium oxide allowed almost 100% conversion of phenol at 733K with selectivity towards 2,6-dimethylphenol equal to 60%. Similar degree of conversion for phenol was obtained for industrial catalyst TZC-3/1, but its selectivity towards 2,6-dimethylphenol was equal to 90%. Experimental results indicate that the best one among examined catalyst is the industrial catalyst TZC-3/1 that allows obtaining best results at lowest temperature.
    Źródło:
    Chemik; 2014, 68, 5; 468-477
    0009-2886
    Pojawia się w:
    Chemik
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Metody określania struktury polisacharydów
    Methods for determining polysaccharides structure
    Autorzy:
    Samaszko-Fiertek, J.
    Kuźma, M.
    Dmochowska, B.
    Ślusarz, R.
    Madaj, J.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/172410.pdf
    Data publikacji:
    2016
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Chemiczne
    Tematy:
    polisacharydy
    monosacharydy
    degradacja oksydacyjna
    analiza metylacyjna
    acetoliza
    NMR
    magnetyczny rezonans jądrowy
    MS
    polysaccharides
    monosaccharides
    oxidative degradation
    methylation analysis
    acetolysis
    nuclear magnetic resonance (NMR)
    Opis:
    Sequencing of polysaccharides is difficult to achieve because of the heterogeneous nature of the polysaccharide structure, high molecular weight (the size of a polysaccharide varies between approximately 16,000 and 16,000,000 daltons (Da)), and polydispersity of the polymer chains. The following information is essential to determine the primary structure of a polysaccharide: • monosaccharide composition: nature and molar ratios of the monosaccharide building blocks; • relative configuration of monosaccharides: d or l; • anomeric configuration: α- or β-configuration of the glycosidic linkage; • ring size: presence and distinction of furanosidic and pyranosidic rings; • linkage patterns: linkage positions between the monosugars and branches; • sequences of monosaccharide residues in the repeating units; • substitutions: position and nature of OH–modifications, such as O–phosphorylation, acetylation, O-sulfation, etc.; • molecular weight and molecular weight distribution. A polysaccharide extracted from plant materials or food products is usually purified before being subjected to structural analysis. The first step of characterizing a polysaccharide is the determination of its purity, which is reflected by its chemical composition, including total sugar content, level of uronic acids, proteins, ash, and moisture of the preparation. The second step is the determination of monosaccharide composition, which will unveil structural information such as the number of monosaccharides present in the polysaccharide and how many of each sugar unit. NMR spectroscopy has become the most powerful and noninvasive physicochemical technique for determining polysaccharide structures. It can provide detailed structural information of carbohydrates, including identification of monosaccharide composition, elucidation of α- or β-anomeric configurations, establishment of linkage patterns, and sequences of the sugar units in oligosaccharides and/or polysaccharides. Monosaccharide composition can be determined also by analysis of totally acid hydrolyzed polysacharide using high performance liquid chromatography (HPLC) or gas chromatography (GC). The ring size and glycosidic linkage positions of sugar units in a polysaccharide could be established by methylation analysis and/or cleavage reduction. The anomeric configuration is conventionally determined by oxidation, and this method can be combined with mass spectrometry to obtain more structural information.
    Źródło:
    Wiadomości Chemiczne; 2016, 70, 5-6; 299-318
    0043-5104
    2300-0295
    Pojawia się w:
    Wiadomości Chemiczne
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Wykorzystanie spektrometrii mas do analizy modyfikacji nukleotydów i adduktów DNA
    Application of mass spectrometry methods for analysis of modified nucleotides and DNA adducts
    Autorzy:
    Hanus, J.
    Jelonek, K.
    Pietrowska, M.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/171867.pdf
    Data publikacji:
    2011
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Chemiczne
    Tematy:
    kancerogeneza
    diagnostyka molekularna
    spektrometria mas
    nukleotydy
    uszkodzenia DNA
    addukty DNA
    metylacja DNA
    carcinogenesis
    molecular diagnostics
    mass spectrometry
    nucleotides
    DNA damage
    DNA adducts
    DNA methylation
    Opis:
    Chemically modified nucleotides, which are not normally present in genetic material, are called DN A adducts. This type of DN A modifications (damage) is directly related to processes of mutagenesis and carcinogenesis. Elevated levels of DN A adducts present in genetic material reflect exposure of humans to carcinogenic factors and are markers of increased risk of cancer [1]. For this reason different methods useful for quantitative and qualitative analyses of DN A adducts are used in the field of cancer prevention and research (Tab. 1). Enzymatically-catalyzed methylation of cytosine, observed mostly in so called CpG islands, is a frequent endogenous modification of genetic material. Such a DN A methylation is a key factor involved in regulation of gene expression, and methylation status of oncogenes and tumor supressor genes is an important biomarker of carcinogenesis. As such, analytical methods for assessment of DN A methylation are of great importance for molecular diagnostics of cancer. During the last decade significant progress has been made in methods available for quantitative, qualitative and structural analyses of biological molecules. Among intensively developed tools for bioanalyses are methods of mass spectrometry. Spectrometers that are based on two methods of ionization, namely electrospray ionization (ESI ) [30] and matrix-assisted laser desorption-ionization (MALDI ) [48], are particularly suitable for analyses of biological macromolecules: proteins and nucleic acids. Currently available mass spectrometers, together with microscale methods for sample preparation and separation, significantly increased sensitivity and accessible mass range of analyses. New generation of “user-friendly” instruments is developed to bring the techniques directly into the workplaces of biological and clinical investigators. This review demonstrates representative examples of mass spectrometry techniques used for qualitative analyses of nucleotide modifications and adducts present in genetic material of humans. In this field several methods base on spectrometers with electrospray ionization. Generated ions are separated according to their mass-to-charge ratio in an analyzer by electric fields; among different ion analyzers frequently used in this methods are single or triple quadrupole and ion traps (Fig. 1). Among other methods available for assessment of DN A adducts is so called Accelerator Mass Spectrometry (Fig. 2) [41]. The most frequently applied method for the assessment of DN A methylation is based on methylation-specific PCR reaction. Products of such PCR reactions are analyzed using MALDI mass spectrometry [54] (Fig. 3). In summary, new powerful methods of mass spectrometry that made available qualitative analyses of damage and modifications of human genetic material found their important place in modern biological and medical laboratories.
    Źródło:
    Wiadomości Chemiczne; 2011, 65, 3-4; 191-205
    0043-5104
    2300-0295
    Pojawia się w:
    Wiadomości Chemiczne
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Indukowana fenobarbitalem hipermetylacja rejonu promotorowego genu p53 w watrobie szczurow szczepu Wistar
    Phenobarbital-induced hypermethylation of the p53 promoter region in the liver of Wistar rats
    Autorzy:
    Kostka, G
    Urbanek-Olejnik, K.
    Wiadrowska, B.
    Bankowski, R.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/876498.pdf
    Data publikacji:
    2008
    Wydawca:
    Narodowy Instytut Zdrowia Publicznego. Państwowy Zakład Higieny
    Tematy:
    zwierzeta doswiadczalne
    szczury
    watroba
    gen p53
    hipermetylacja
    fenobarbital
    synteza DNA
    metylotransferaza DNA
    metylacja DNA
    experimental animal
    rat
    liver
    p53 gene
    hypermethylation
    phenobarbital
    DNA synthesis
    DNA methyltransferase
    DNA methylation
    Opis:
    Indukowane niegenotoksycznymi kancerogenami (NGCs) zmiany metylacji DNA rozpatrywane są jako mechanizm ich toksycznego, w tym rakotwórczego działania. Zbadano wpływ fenobarbitalu (PB), na poziom metylacji regionu promotorowego genu p53 w wątrobie szczurów szczepu Wis tar. Zmiany metylacji genu p53 korelowano z syntezą DNA, aktywnością metylotransferaz DNA (DNMTs) oraz z masą wątroby. Samce szczurów szczepu Wistar otrzymywały PB w dawce wynoszącej 98,2 mg/ kg m.c. x dzień-1 jednorazowo, 3-krotnie i 14-krotnie. Wykazano, że PB wywoływał hipermetylację w badanych sekwencjach rejonu promotorowego genu p53. Indukowana PB hipermetylacja genu występowała w przebiegu całego okresu doświadczalnego. Stymulację syntezy DNA, która poprzedzała wzrost masy wątroby oraz indukcję DNMTs, wykazano tylko po 1 i 3 dawkach związku. Kontynuowanie narażenia zwierząt na PB (14 dawek) nie wywoływało zmian w syntezie DNA i aktywności DNMTs w porównaniu do kontroli. Przypuszcza się, że indukowana PB de novo metylacja rejonu promotorowego genu p53, nie była związana z aktywnością DNMTs.
    Non-genotoxic carcinogens (NGCs)-induced changes of DNA methylation has been proposed as a mechanism of their toxicity, including carcinogenic action. The effect of phénobarbital (PB), a rodent liver carcinogen on the methylation level of the p53 promoter region in rat liver was studied. Changes in the methylation status of the p53 gene were correlated with changes in DNA synthesis, DNA methyltransferase (DNMTs) activity and liver weight. Male Wistar rats received PB in one, three or fourteen daily oral doses of 92.8 mg/kg b.w. x day-1. We have demonstrated that PB increased the methylation of the p53 gene. Cytosine hypermethylation in the analyzed CpG sites of the p53 gene promoter occurred during the whole period of study. However, an increase in DNA synthesis was only observed after 1 and 3 days of treatment with PB and it preceded liver growth. Treatment of rats with PB for 1 and 3 days also produced an increase in nuclear DNMTs activity. After prolonged administration (14 days), no changes in DNMTs activity nor DNA synthesis were observed. It is proposed that PB- induced de novo methylation of the p53 gene was not associated with DNMTs activity.
    Źródło:
    Roczniki Państwowego Zakładu Higieny; 2008, 59, 4; 455-465
    0035-7715
    Pojawia się w:
    Roczniki Państwowego Zakładu Higieny
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
      Wyświetlanie 1-12 z 12

      Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies