Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "elektroforeza zelowa" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-5 z 5
Tytuł:
Elektroforetyczna charakterystyka rozpuszczalnych białek Fasciola hepatica (Linnaeus, 1758)
Electrophoretic characteristics of soluble proteins of Fasciola hepatica (Linnaeus, 1758)
Autorzy:
Pietron, W.
Gieryng, R.
Pirog, Z.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/840964.pdf
Data publikacji:
1988
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
parazytologia
pasozyty
przywry
motylica watrobowa
Fasciola hepatica
bialka
bialko rozpuszczalne
analiza elektroforetyczna
identyfikacja elektroforetyczna
elektroforeza zelowa
elektroforeza w zelu poliakrylamidowym
diagnostyka parazytologiczna
Opis:
Proteins were extracted from F. hepatica collected on cattle and sheep. The extract was purified in the column with sephadex G-25. The proteins were separated using the Davis method in electrophoretic systems constructed by the authors, in the columns and in blocks in polyacrylamid gel. The electrophoregrams served for making densometric diagrams and for calculating electrophoretic mobility coefficient (Rf) of the identified protein bands. Both in the blocks and in the columns 26 protein bands have been identified in F. hepatica from both cattle and sheep. Statistical analysis with t Student test showed significant differences in their Rf values. A high reproducibility of the results has been obtained both in the columns and in the blocks of polyacrilamid gel.
Źródło:
Annals of Parasitology; 1988, 34, 3
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Elektroforetyczna charakterystyka rozpuszczalnych białek Fasciola hepatica (Linnaeus, 1758)
Electrophoretic characteristics of soluble proteins of Fasciola hepatica (Linnaeus, 1758)
Autorzy:
Pietroń, W.
Gieryng, R.
Piróg, Z.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2152602.pdf
Data publikacji:
1988
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
parazytologia
pasozyty
przywry
motylica watrobowa
Fasciola hepatica
bialka
bialko rozpuszczalne
analiza elektroforetyczna
identyfikacja elektroforetyczna
elektroforeza zelowa
elektroforeza w zelu poliakrylamidowym
diagnostyka parazytologiczna
Opis:
Proteins were extracted from F. hepatica collected on cattle and sheep. The extract was purified in the column with sephadex G-25. The proteins were separated using the Davis method in electrophoretic systems constructed by the authors, in the columns and in blocks in polyacrylamid gel. The electrophoregrams served for making densometric diagrams and for calculating electrophoretic mobility coefficient (Rf) of the identified protein bands. Both in the blocks and in the columns 26 protein bands have been identified in F. hepatica from both cattle and sheep. Statistical analysis with t Student test showed significant differences in their Rf values. A high reproducibility of the results has been obtained both in the columns and in the blocks of polyacrilamid gel.
Źródło:
Wiadomości Parazytologiczne; 1988, 34, 3; 263-277
0043-5163
Pojawia się w:
Wiadomości Parazytologiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Dwuwymiarowa elektroforeza żelowa: od eksperymentu po profile ekspresji. Część pierwsza - eksperyment
Two-dimensional gel electrophoresis: from experiment to protein expresion profiles. Part one - experiment
Autorzy:
Suchwałko, A.
Podbielska, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/262044.pdf
Data publikacji:
2010
Wydawca:
Politechnika Wrocławska. Wydział Podstawowych Problemów Techniki. Katedra Inżynierii Biomedycznej
Tematy:
elektroforeza żelowa
2DE
eksperyment
analiza obrazu
schemat analizy 2-DE
gel electrophoresis
2-DE
experiment
image analysis
2-DE analysis workflow
Opis:
Dwuwymiarowa (dwukierunkowa) elektroforeza żelowa (2-DE) jest metodą znaną od lat 70. poprzedniego stulecia. Zainteresowanie badaczy metodą 2-DE wynika z możliwości separacji nawet kilku tysięcy białek w jednym żelu, co pozwala na ich detekcję i identyfikację. Dzięki wysokiej rozdzielczości wyników separacji możliwe staje się ustalenie roli biologicznej poszczególnych białek czy odkrywanie wpływu czynników zewnętrznych na organizmy żywe na poziomie proteomu. Metoda 2-DE wciąż ewoluuje. W ostatniej dekadzie nastąpił ogromny postęp w sposobie przeprowadzania eksperymentów z dużą powtarzalnością. Zmieniło się też całkowicie podejście do analizy obrazów żeli i wykorzystywane do tego celu algorytmy. Ze względu na tak szybki rozwój technik dwuwymiarowej elektroforezy żelowej autorzy postanowili przedstawić obecny stan wiedzy w tym zakresie. Praca składa się z dwu części. W pierwszej opisano zmiany, jakie zaszły w technikach przeprowadzania eksperymentów elektroforetycznych. Druga część skupia się na analizie obrazów uzyskanych za pomocą metody 2-DE, z uwzględnieniem zmian w schemacie analizy. Pierwsza część pracy koncentruje się na eksperymencie dwuwymiarowej elektroforezy żelowej. Opisano poszczególne kroki eksperymentu: od przygotowania próbki, przez ładowanie próbek do pierwszego wymiaru, IEF, SDS-PAGE, barwienie żeli, aż po zapis obrazów żeli. Praca nie porusza szczegółów biochemicznych eksperymentu. Opisane zostały również formaty plików, technika DIGE, wpływ eksperymentu na dalszą analizę, modyfikacje posttranslacyjne oraz pozyskanie próbek protein z żeli do ewentualne identyfikacji za pomocą innych technik proteomicznych.
Two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) is a method commonly used since seventies of the previous century. It owns its non weakening interest of researchers because of the possibility of separation even a few thousands of proteins in one gel, what allows for protein detection and identification. Thanks to high resolution of separation results, it is possible to determine a biological role of particular proteins or to discover influence of external factors on living organisms on the proteome level. Though 2-DE is still evolving. In the last decade, a great progress has been made in the way of performing experiments and their reproducibility. Approach to the analysis of gel images and algorithms used for the analysis have been entirely changed. For the reason of such instant changes of methods and techniques of the two-dimensional gel electrophoresis, the authors decided to describe state of the art. This work consists of two parts. The first part describes changes that have been made in performing of electrophoretic experiments. The second part concentrates on the analysis of obtained images, with emphasis the analysis workflow. The first part focuses on the experiment of the dwo-dimensional gel electrophoresis. Description of particular steps of the experiment is given: from the sample preparation, through loading of samples for the first dimension, IEF, SDS-PAGE, gels staining, to recording of gel images. This work does not bring up biochemical details of the experiment. File formats, DIGE technology, influence of the expriment on the further analysis, posttraslational modifications and acquisition of protein samples from gels for identification using other proteomic techniques have been described in detail.
Źródło:
Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna; 2010, 16, 3; 285-292
1234-5563
Pojawia się w:
Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Grafowa metoda segmentacji obiektów w postaci skupisk na przykładzie obrazów kometowych
Graph-based aggregate object image segmentation method on example of comet assay images
Autorzy:
Bal, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/154889.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Mechaników Polskich
Tematy:
analiza obrazów
obiekty w postaci skupisk
minimalne drzewo rozpinające
test kometowy
jednokomórkowa elektroforeza żelowa
image analysis
image segmentation
aggregate objects
minimum spanning tree
comet assay
single cell gel electrophoresis
Opis:
W pracy przedstawiono propozycję metody segmentacji obiektów będących skupiskami - przykładem takich obiektów są tzw. komety, które są wynikiem jednokomórkowej elektroforezy żelowej. Opracowana metoda działa dwuetapowo: etap 1. to segmentacja służąca wyznaczeniu elementów składowych należących do obiektów, etap 2 wykorzystuje minimalne drzewo rozpinające do określenia zbioru elementów tworzących poszczególne obiekty, obszar poszczególnych obiektów wyznaczany jest jako otoczka wypukła odpowiedniego drzewa rozpinającego.
This paper deals with a problem of segmentation of aggregate objects, that is objects which are formed by a set of unconnected elements smaller than the object itself. Images of such a type of objects are very difficult for segmentation. An example of this type of objects are "comets" (Fig. 1, left column) from Single Cell Gel Electrophoresis images (also called comet assay images). In comet assay images the comet region is formed by unconnected fragments of DNA. Because of not satisfying results of comet segmentation with use of the standard methods, a new method for segmentation of such images was developed. The new method works in two stages. The first stage is the image segmentation-for comets the Bernsen binarization method (Eqs. (1) and (2)) with median filtering of the obtained results was chosen-the result of this stage is a set of comet elements ei which represent DNA fragments (Fig. 1, the 2nd column). In the second stage the minimum spanning trees Tp are created (Fig. 1, 3th column)-graph vertexes vi represent elements ei, and length dij of edge eij between vertexes vi and vj is equal to the closest distance between pixels of elements ei and ej-then for each connected tree Tp its convex hull which defines the region of comet Kp (Fig. 1, the 4th column) is created. In case of defects appearing in comet images, the incorrect region can be rejected e.g. by use of geometrical or photometrical features of the regions.
Źródło:
Pomiary Automatyka Kontrola; 2012, R. 58, nr 4, 4; 313-315
0032-4140
Pojawia się w:
Pomiary Automatyka Kontrola
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Dwuwymiarowa elektroforeza żelowa: od eksperymentu po profile ekspresji. Część druga - analiza obrazu
Two-dimensional gel electrophoresis: from experiment to protein expresion profiles. Part two - image analysis
Autorzy:
Suchwałko, A.
Podbielska, H.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/261982.pdf
Data publikacji:
2010
Wydawca:
Politechnika Wrocławska. Wydział Podstawowych Problemów Techniki. Katedra Inżynierii Biomedycznej
Tematy:
elektroforeza żelowa
2DE
analiza porównawcza
schemat analizy 2-DE
mapa proteomowa
segmentacja obrazu
detekcja plam
identyfikacja protein
gel electrophoresis
2-DE
differential image analysis
2-DE analysis workflow
proteome map
image segmentation
spot detection
protein identification
Opis:
Dwuwymiarowa (dwukierunkowa) elektroforeza żelowa (2-DE) jest metodą znaną od lat siedemdziesiątych poprzedniego stulecia. Zainteresowanie badaczy metodą 2-DE wynika z możliwości separacji nawet kilku tysięcy białek w jednym żelu, co pozwala na i ch detekcję i identyfikację. Dzięki wysokiej rozdzielczości wyników separacji możliwe staje się ustalenie roli biologicznej poszczególnych białek czy odkrywanie wpływu czynników zewnętrznych na organizmy żywe na poziomie proteomu. Metoda 2-DE wciąż ewoluuje. W ostatniej dekadzie nastąpił ogromny postęp w sposobie przeprowadzania eksperymentów z dużą powtarzalnością. Zmieniło się też całkowicie podejście do analizy obrazów żeli i wykorzystywane do tego celu algorytmy. Ze względu na tak szybki rozwój technik dwuwymiarowej elektroforezy żelowej, autorzy postanowili przedstawić obecny stan wiedzy w tym zakresie. Praca składa się z dwu części. W pierwszej opisano zmiany, jakie zaszły w technikach przeprowadzania eksperymentów elektroforetycznych. Draga część skupia się na analizie obrazów uzyskanych za pomocą metody 2-DE, z uwzględnien i em zmian w schemacie analizy. Druga część pracy to opis dwóch schematów analizy: klasycznego i obecnie stosowanego. Szczegółowo opracowane zostały metody analizy pojedynczego obrazu 2-DE oraz analizy porównawczej serii obrazów. Przedstawione są algorytmy stosowane do normalizacji, segmentacji obrazu, detekcji plam, dopasowywania do siebie obrazów czy tworzenia map proteomowych jako najważniejsze w całej analizie. Opisano również generowanie profili ekspresji, metody identyfikacji protein oraz internetowe bazy danych 2-DE. Autorzy nie pominęli tak ważnego zagadnienia, jak sposoby porównywania systemów analizujących dane 2-DE. Ta część pracy podsumowuje rozwój, jaki nastąpił wostatnim dziesięcioleciu w metodach stosowanych w analizie komputerowej obrazów 2-DE, którego najważniejszym krokiem było opracowanie nowego schematu analizy, opartego na tworzeniu map proteomowych.
Two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) is a method commonly used since seventies of the previous cesatury. It owns its non weakening interest of researchers because of the possibility of separation even a few thousands of proteins in one gel, what allows for protein detection a n d identification. Thanks to high resolution of separation results, it is possible to determine a biological role of particular proteins or to discover influence of extemal factors on living organisms on t h e proteome level. 2-DE i s stilł evolving. In t h e last decade, a great progress has be en made in t h e way of performing experiments and their reproducibility. Approach to the analysis of gel images and algorthms used for the analysis have been entirely changed. For the reason of suchinstant changes of methods a n d techniques of the two-dimensional gel electrophoresis, the authors decided to describe state of the art. This work consists of two parts. The first part describes changes that have b e e n made in performing of electrophoretic experiments. The second part concentrates on the analysis of obtained images, with emphasis the analysis workflow. Second part is a description of two analysis workflows: the classical one and the currentiy used one. Analysis methods of the single 2-DE image and differential analysis of the image series are discussed in detail. Algorthms used for normalization, image segmentation, spot detection, image warping and creation of proteome maps are intrcduced as th e most crucial in the whole analysis. Generation of expression profiles, protein Identification methods, and the Internet databases of the 2-DE data are described. Authors have not missed as important issue as methods of comparison of systems for 2-DE data analysis. This part of the work summarises development that has been made for the last ten years in th e methods used for the computer analysis of 2-DE images. The most important step of this development was elaborat i on of the workflow based on creation of proteome maps.
Źródło:
Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna; 2010, 16, 4; 372-380
1234-5563
Pojawia się w:
Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-5 z 5

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies