Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "molecular methods" wg kryterium: Wszystkie pola


Tytuł:
Wykrywanie bakterii Salmonella metodami molekularnymi w produktach żywnościowych
Detection of Salmonella sp. in food using molecular methods
Autorzy:
Misiewicz, A.
Goncerzewicz, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/796639.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie. Wydawnictwo Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie
Tematy:
produkty spozywcze
bakterie
Salmonella
wykrywanie drobnoustrojow
metody molekularne
lancuchowa reakcja polimerazy
food product
bacteria
microorganism detection
molecular method
polymerase chain reaction
Opis:
Bakterie z rodzaju Salmonella są najbardziej znanymi bakteriami patogennymi występującymi w przemyśle spożywczym. Powodują zakażenia prawie wszystkich produktów żywnościowych – od mięsnych, mlecznych, jajecznych po rośliny oleiste i pasze. Wykrycie i identyfi kacja bakterii Salmonella na podstawie tradycyjnej metody mikrobiologicznej, zgodnie z normą PN-EN 6579:2003, jest ciągle powszechnie stosowane w laboratoriach. Analiza ta jest czaso- i pracochłonna, jej wykonanie trwa około 5–7 dni. Wykorzystanie nowoczesnych technik biologii molekularnej, z etapem namnożenia i izolacji DNA, do uzyskania końcowego wyniku trwa znacznie krócej. W niniejszej pracy zastosowano metodę Real-Time PCR i klasyczny PCR do identyfi kacji bakterii Salmonella w różnych produktach żywnościowych. Określono czas potrzebny do wykonania tej analizy molekularnej. Do reakcji Real-Time PCR wykorzystano komercyjny kit. Klasyczną reakcję PCR prowadzono z użyciem starterów Sal465Li Sal142F, uzyskując właściwy produkt o wielkości 343 pz. We wszystkich badanych próbkach wykryto bakterie Salmonella. Wynik analiz molekularnych uzyskano w ciągu 21–25 godzin.
Pathogenic bacteria of Salmonella genus are the most common infections in food industry. They might to contaminate wide range of products, protein food e.g. meat, milk food, eggs and egg foods, plants and its preserves, fodder and feeds. Detection and identifi cation of Salmonella sp. are made using traditional methods corresponding with standard PN-EN 6579:2003. That method is commonly used in the microbiological laboratories its time consuming and laborious analysis. Using a modern molecular biology techniques allow to confi rm the Salmonella infections in 24-hours with enrichment and isolation steps. In our study were used Real-Time PCR and traditional PCR techniques to detect Salmonella pathogens from various foods. In addition we checked time of molecular analysis. In the study was used commercial kit to Real-Time PCR analysis and primer set Sal465L, Sal142F with are based on characteristic and solid genomic fragments of Salmonella genus. In every experiment we got positive results for food contaminated by Salmonella. The results were obtained in 21–25 hours.
Źródło:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych; 2013, 573
0084-5477
Pojawia się w:
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molekularne metody stosowane w diagnostyce zespołu long-QT
Molecular methods used in diagnosis of long-QT syndrome
Autorzy:
Moric-Janiszewska, Ewa
Głowacka, Marta
Węglarz, Ludmiła
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038844.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
Tematy:
zespół long-qt
kanały jonowe
analiza molekularna
long-qt syndrome
ion channels
molecular analysis
Opis:
LQTS (long QT syndrome) is a genetic disorder caused by the mutations of genes adversely affecting the ion channel function in the cellular membranes of cardiac myocytes. Prolonged repolarization detected on a ECG as a longer QT interval (> 450 ms) is responsible for syncope, cardiac arrest and sudden cardiac death (SCD), due to transient “torsade de pointes” (TdP) or ventricular fibrillation. Currently, 12 types of long-QT syndrome have been identified, which are caused by 600 mutations of genes located on chromosomes: 3,4,6,7,11,17,21. Depending on the particular gene mutation in the LQT syndrome, subtypes from LQTS1 to LQTS12 were identified. The knowledge of genetic disorders in different types of LQTS has enabled the introduction of genotype-dependent therapy. Due to the frequent absence of clinical signs in 40% of mutant genes carriers, it is very important to develop fast and effective diagnostics. These patients do not always suit the clinical diagnostic criteria and therefore they should be diagnosed using molecular methods. In the present study we describe some molecular methods (SSCP, sequencing, quantitative PCR) most commonly used in genetic diagnostics of the long-QT syndrome.
LQTS (long-QT syndrome) oznacza wrodzony zespół wydłużonego odcinka QT i jest chorobą kanałów jonowych uwarunkowaną genetycznie. U jej podstaw leżą mutacje genów kodujących białka i podjednostki kanałów jonowych błony podstawnej kardiomiocytów, istotne dla prawidłowego ich funkcjonowania. Jej głównymi cechami są: wydłużenie odstępu QT (> 450 ms) widoczne w obrazie EKG, pojawianie się omdleń, zatrzymania akcji serca oraz nagła śmierć sercowa SCD (sudden cardiac death), spowodowana występowaniem wielokształtnego częstoskurczu komorowego typu torsade de pointes (TdP) lub też migotaniem komór. Obecnie zidentyfi kowano 12 odmian zespołu long-QT, które spowodowane są aż 600 mutacjami genów zlokalizowanych w chromosomach: 3, 4, 6, 7, 11, 17, 21. Zależnie od mutacji konkretnego genu, w zespole LQT wyodrębniono podtypy od LQTS1 do LQTS12. Poznanie zaburzeń genetycznych w poszczególnych typach LQTS umożliwiło wprowadzenie terapii zależnej od genotypu. Ze względu na częste niewystępowanie objawów klinicznych aż u 40% nosicieli zmutowanych genów bardzo ważna jest szybka i skuteczna diagnostyka. U pacjentów takich nie zawsze sprawdzają się kliniczne kryteria diagnostyczne i dlatego należy ich diagnozować metodami molekularnymi. W przedstawionej pracy opisano niektóre (SSCP, sekwencjonowanie, ilościowy PCR) najczęściej stosowane, molekularne metody diagnostyki zespołu long-QT.
Źródło:
Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2012, 66, 4; 41-47
1734-025X
Pojawia się w:
Annales Academiae Medicae Silesiensis
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molekularne metody identyfikacji gatunkowej wykorzystywane w ekspertyzach sądowych
Molecular methods of species identification used in forensic examinations
Autorzy:
Nakonieczna, S.
Grela, M.
Listos, P.
Gryzińska, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2191477.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Źródło:
Journal of Animal Science, Biology and Bioeconomy; 2019, 37, 1; 31-39
2544-4468
Pojawia się w:
Journal of Animal Science, Biology and Bioeconomy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody molekularne stosowane w badaniu różnorodności mikroorganizmów glebowych
Molecular methods used in studies of diversity of the soil microorganisms
Autorzy:
Behnke-Borowczyk, J.
Kwaśna, H.
Belka, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1006468.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Leśne
Tematy:
mikroorganizmy glebowe
identyfikacja
roznorodnosc biologiczna
metody badan
metody molekularne
ekstrakcja DNA
amplifikacja DNA
biodiversity
microbiota
molecular methods
soil
Opis:
Application of the correct methods of study is essential for a proper description and understanding of natural communities of microorganisms and their relationships. Classical methods used for detection and identification of soil microorganisms resulted in underestimation of the microbiota. It has been claimed that classical methods, based mainly on morphology, led to the identification of only 1% of the soil microbiota, usually species that predominate in culture because of their fast growth and abundant sporulation. Molecular methods allow rapid, accurate, sensitive and cost−effective identification and enumeration of microorganisms. They are designed to replace and/or support classical approaches. This review summarizes some of the current and emerging nucleic acid−based molecular approaches used for detection, discrimination and quantification of microbes in the environment, mostly in soil.
Źródło:
Sylwan; 2012, 156, 04; 294-304
0039-7660
Pojawia się w:
Sylwan
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Badania nad opracowaniem molekularnej metody identyfikacji genów warunkujących ważne cechy użytkowe pomidora
Studies on the development of molecular methods for identifying genes responsible for important traits of tomato
Autorzy:
Nowakowska, Marzena
Kłosińska, Urszula
Nowak, Katarzyna
Szczechura, Wojciech
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199521.pdf
Data publikacji:
2019-11-30
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
bakteryjna plamistość
funkcjonalna męska sterylność
fuzaryjne więdniecie
selekcja wspomagana markerami
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2019, 286; 303-307
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Ocena narażenia na aerozol grzybowy na wybranych stanowiskach pracy zanieczyszczonych pyłem organicznym o różnym pochodzeniu
Assessment of fungal aerosol exposure at selected workplaces contaminated with organic dust of different origin
Autorzy:
Ławniczek-Wałczyk, Anna
Cyprowski, Marcin
Gołofit-Szymczak, Małgorzata
Wójcik-Fatla, Angelina
Zając, Violetta
Górny, Rafał L.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2162450.pdf
Data publikacji:
2018-05-22
Wydawca:
Instytut Medycyny Pracy im. prof. dra Jerzego Nofera w Łodzi
Tematy:
narażenie zawodowe
bioaerozol
grzyby
metody molekularne
Aspergillus fumigatus
metody hodowlane
occupational exposure
bioaerosol
fungi
molecular methods
culture methods
Opis:
Wstęp W ostatnich latach obserwowany jest wzrost liczby osób cierpiących na choroby wywołane przez grzyby pleśniowe i drożdżopodobne. Mimo to wiedza na temat bioróżnorodności patogenów grzybowych w środowisku pracy jest ciągle niedostateczna. Celem pracy była ocena narażenia na grzyby rozprzestrzeniające się drogą powietrzną w środowisku pracy zanieczyszczonym pyłem organicznym pochodzenia roślinnego i zwierzęcego. Materiał i metody Próbki bioaerozolu pobrano w 3 zakładach pracy (ferma drobiu, elektrownia spalająca biomasę i oczyszczalnia ścieków) za pomocą zestawów pomiarowych złożonych z uniwersalnych aspiratorów i poborników guzikowych. Ilościową i jakościową analizę aerozolu grzybowego przeprowadzono metodą hodowlaną, opartą na analizie makro- i mikroskopowej. Wybrane szczepy poddano analizie genetycznej za pomocą łańcuchowej reakcji polimerazy (polymerase chain reaction – PCR) z użyciem par primerów do wewnętrznych regionów niekodujących (internal transcribed spacers – ITS): ITS1–ITS2, ITS3–ITS4 i ITS1–ITS4. Wyniki Średnie stężenie aerozolu grzybowego na stanowiskach pracy wynosiło 1,2×102–2,1×106 jtk/m³. Najwyższe stężenie grzybów zaobserwowano na stanowiskach pracy na fermie drobiu, a najniższe w oczyszczalni ścieków. Analiza jakościowa wykazała, że na stanowiskach pracy w elektrowni i oczyszczalni ścieków dominującym gatunkiem w stosunku do całości izolowanej mykobioty był Aspergillus fumigatus. Zgodność wyników identyfikacji tego patogenu uzyskanych metodą hodowlaną i molekularną dotyczyła 100% badanych szczepów. Wnioski Stężenie bioaerozoli zmierzone na stanowiskach pracy w fermach drobiu przekraczało polskie propozycje wartości dopuszczalnych dla grzybów, tj. 5×104 jtk/m³. Wykazano wysoką zgodność identyfikacji patogenu A. fumigatus przy użyciu metody tradycyjnej (hodowlanej) i metody genetycznej. Ponieważ długotrwałe narażenie w środowisku pracy na konidia A. fumigatus może prowadzić do wystąpienia u pracowników dolegliwości zdrowotnych, konieczne jest stosowanie przez nich odpowiednich środków ochronnych. Med. Pr. 2018;69(3):269–280
Background In recent years, the number of people suffering from diseases caused by fungi has been increasing. However, knowledge of the biodiversity of fungal pathogens in the work environment is still insufficient. The aim of this work was to evaluate the exposure to fungi being disseminated in the air of workplaces contaminated with organic dust of plant and animal origin. Material and Methods Bioaerosol samples were collected at 3 occupational settings (poultry farm, biomass burning power plant and wastewater treatment plant) using button samplers. Quantitative and qualitative analysis of fungal aerosol was conducted by employing macro- and microscopic methods. Selected strains were then studied by polymerase chain reaction (PCR) using środointernal transcribed spacers (ITS): ITS1–ITS2, ITS3–ITS4 and ITS1–ITS4 primer pairs. Results Average concentrations of fungal aerosol at workplaces ranged 1.2×102–2.1×106 cfu/m³. The highest fungal concentrations were recorded in the poultry farm, while the lowest were noted at the wastewater treatment plant. Aspergillus fumigatus was a predominant component of the mycobiota in the power plant and wastewater treatment plant. Almost 100% identification agreement of this pathogen between the traditional and molecular method was noted. Conclusions The fungal concentrations in poultry farms exceeded the Polish proposal for the threshold limit value (5×104 cfu/m³). The results of the study demonstrate a high compatibility of A. fumigatus’ identification using the traditional and molecular methods. Taking into account the fact, that a long term exposure to A. fumigatus conidia at workplaces may result in numerous health complaints, the use of proper protective equipment by workers must be a standard procedure. Med Pr 2018;69(3):269–280
Źródło:
Medycyna Pracy; 2018, 69, 3; 269-280
0465-5893
2353-1339
Pojawia się w:
Medycyna Pracy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Optyczne metody obrazowania molekularnego
Optical methods of molecular imaging
Autorzy:
Sołtysiński, T.
Liebert, A.
Zawicki, I.
Maniewski, R.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/261383.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Politechnika Wrocławska. Wydział Podstawowych Problemów Techniki. Katedra Inżynierii Biomedycznej
Tematy:
metody optyczne
obrazowanie molekularne
optical methods
molecular imaging
Opis:
Obrazowanie molekularne jest szybko rozwijającą się dziedziną badań w zakresie biotechnologii i inżynierii biomedycznej. W artykule przedstawiono przegląd technik stosowanych w obrazowaniu molekularnym, wykorzystujących metody medycyny nuklearnej oraz optyczne techniki oparte na analizie promieniowania fluorescencyjnego. W szczególności opisano metody optyczne obrazowania molekularnego stosowane w skali mikroskopowej (mikroskopia konfokalna, obrazowanie czasu relaksacji fluorescencyjnej, transfer energii Foerstera) oraz wykorzystywane w badaniach na zwierzętach doświadczalnych. Omówiono także potencjalne wykorzystanie technik optycznych w badaniach dużych objętości tkanek.
Molecular imaging (MI) is a rapidly emerging field of biomedical, biotechnological and engineering research. This study provides a brief review of the state-of-the-art techniques and methods of MI based on nuclear physics and fluorescent agents. Special attention will be focused on optical methods of MI applied in microscopic scale (multiphoton confocal microscopy, fluorescence lifetime imaging, Forster energy transfer) and in experimental animals. Potential application of MI in large tissue volumes will be also discussed.
Źródło:
Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna; 2008, 14, 4; 331-335
1234-5563
Pojawia się w:
Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie metod biologii molekularnej w ocenie narażenia zawodowego na szkodliwe czynniki biologiczne
Molecular biology methods in assessing occupational exposure to harmful biological agents
Autorzy:
Bakal, A.
Górny, R.
Ławniczek-Wałczyk, A.
Cyprowski, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/137930.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Centralny Instytut Ochrony Pracy
Tematy:
szkodliwe czynniki biologiczne
ryzyko zawodowe
biologia molekularna
PCR
diagnostyka molekularna
genotypowanie drobnoustrojów
molekularny odcisk palca
harmful biological agents
occupational risk
molecular biology
molecular diagnostics
microorganisms genotyping
Opis:
Obowiązkiem każdego pracodawcy jest zapewnienie pracownikom bezpiecznych warunków w miejscu zatrudnienia. W tym celu niezbędna jest identyfikacja i eliminacja możliwych do usunięcia zagrożeń oraz zapewnienie odpowiednich środków ochrony zarówno zbiorowej, jak i indywidualnej. Wśród szkodliwych czynników środowiska pracy, jednymi z bardziej istotnych są czynniki biologiczne. Stanowią one częstą przyczynę chorób zawodowych w Polsce. Mogą oddziaływać na organizm człowieka, powodując dolegliwości o charakterze: alergicznym, drażniącym, zakaźnym, toksycznym oraz rakotwórczym. Do tych czynników biologicznych zaliczamy: mikroorganizmy (bakterie, grzyby), wirusy, pasożyty człowieka oraz aktywne biologicznie substancje chemiczne będące produktami metabolizmu drobnoustrojów (np. mykotoksyny).W laboratoryjnej identyfikacji zagrożeń biologicznych najczęściej są obecnie wykorzystywane metody: hodowlane, mikroskopowe i biochemiczne. Mimo niewątpliwych zalet i rozpowszechnienia, mają one jednak swoje ograniczenia. Większość z nich pozwala na identyfikację jedynie mikroorganizmów żywych, zdolnych do wzrostu w warunkach laboratoryjnych. Jak wskazują wyniki badań, takie drobnoustroje stanowią jedynie niewielki odsetek w ekstremalnych przypadkach zaledwie 1%) społeczności występującej w danym środowisku. W artykule zostały przedstawione metody biologii molekularnej (wykorzystujące analizę DNA) pozwalające na: identyfikację jakościową i ilościową drobnoustrojów, określenie ich cech biochemicznych oraz uzyskanie profilu gatunkowego mikroorganizmów występujących w danym środowisku, bez konieczności ich hodowli w warunkach laboratoryjnych. Zastosowanie tych metod pozwala na dokładniejszą identyfikację drobnoustrojów występujących w środowisku pracy, umożliwiając bardziej precyzyjną ocenę narażenia na szkodliwe czynniki biologiczne.
All employers are responsible for ensuring safe working conditions for employees in their workplace. It is necessary to accurately identify and eliminate all hazards that are possible to remove and to ensure proper collective and personal protective measures. Among occupational hazards, biological agents are one of the most important. They are considered as the most frequent cause of occupational diseases in Poland. They can affect human body and cause various adverse health outcomes such as allergies, irritations, infections, toxicoses or even a cancer. Among them we can distinguish harmful microorganisms (bacteria, viruses, fungi), human parasites and biologically active chemical compounds produced by microorganisms (e.g., fungal mycotoxins). Currently, the most frequent used laboratory procedures to identify biological hazards are culture-based, microscopic and biochemical methods. Despite their unquestionable advantages and widespread presence, these techniques have also important limitations. They only enable identification of microorganisms which are viable and capable to grow in laboratory conditions. As the studies have shown, such microorganisms constitute (in extreme cases) merely 1% of their population present in the environment. This paper presents an overview of molecular biology methods (based on DNA analysis) which allow the qualitative and quantitative identification of microorganisms, determining their biochemical features and enabling to obtain their environmental species profile without the need for their culturing in laboratory conditions. Application of these methods provides more accurate identification of microorganisms present in occupational environment, allowing more precise analysis of potential health risks derived from exposure to harmful biological agents.
Źródło:
Podstawy i Metody Oceny Środowiska Pracy; 2017, 3 (93); 5-16
1231-868X
Pojawia się w:
Podstawy i Metody Oceny Środowiska Pracy
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie metody PCR-DGGE w mikrobiologii sądowej
Use of the PCR-DGGE method in forensic microbiology
Autorzy:
Ziembińska-Buczyńska, Aleksandra
Kraśnicki, Krzysztof
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2055013.pdf
Data publikacji:
2016
Wydawca:
Centralne Laboratorium Kryminalistyczne Policji
Tematy:
metody biologii molekularnej
PCR-DGGE
DNA fingerprinting
ślad mikrobiologiczny
mikrobiom naskórka
molecular biology methods
microbiological trace
epidermal microbiome
Opis:
W oparciu o najnowsze doniesienia mikrobiologii sądowej możliwe jest powiązanie sprawcy z dowodem w postępowaniu śledczym na podstawie analizy molekularnej materiału mikrobiologicznego. Wiadomo, że występujący na powierzchni naskórka człowieka mikrobiom jest nie tylko gatunkowo, ale i osobniczo specyficzny. Korzystając z tej informacji, można powiązać użytkownika danego przedmiotu (np. urządzenia elektronicznego) z takim sprzętem poprzez naniesiony w trakcie użytkowania, właściwy tylko danemu użytkownikowi, specyficzny mikrobiom. Korzystając z metod opartych na tzw. genetycznym odcisku palca (DNA fingerprinting) zbiorowiska bakterii, porównywano zgodności struktury zbiorowiska mikroorganizmów pobranych z naskórka dłoni oraz obudowy telefonu komórkowego u czternastu uczestników badania. W tym projekcie wykorzystano metodę łańcuchowej reakcji polimerazy z elektroforezą w gradiencie denaturacji PCR-DGGE (ang. Polymerase Chain Reaction – Denaturing Gradient Gel Electrophoresis). Uzyskana analiza pozwoliła na otrzymanie wyników wskazujących na wysoką zbieżność struktury genotypowej próbek pochodzących od użytkownika z mikrobiomem pobranym z jego telefonu. Metoda PCR-DGGE może być wykorzystywana jako skriningowa, poprzedzająca dodatkowe analizy potwierdzające.
The latest reports on the subject of forensic microbiology indicate that it is possible to link a perpetrator of an offence to the evidence, based on molecular analysis of microbiological material. The microbiome of human epidermis is known to be species- and individual-specific. This knowledge can be used towards finding a match between the object (e.g. electronic device) and the user, based on the individual-specific microbiome deposited onto the object’s surface. The DNA fingerprinting-based methods were used to compare similarities in the structures of bacterial communities collected from the epidermis of 14 study subjects and the housings of their mobile phones. This study was based on the Polymerase Chain Reaction – Denaturing Gel Electrophoresis method. The results obtained revealed a high degree of similarity between the structure of bacterial genotypes present on the users’ epidermis and the microbiomes recovered from their mobile phones. PCR-DGGE can be used as the screening method, preceding the additional confirmatory analyses.
Źródło:
Problemy Kryminalistyki; 2016, 292; 15-21
0552-2153
Pojawia się w:
Problemy Kryminalistyki
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie metod dynamiki molekularnej w badaniach nad układami z wiązaniami wodorowymi
An application of molecular dynamics methods in investigations of systems with hydrogen bonds
Autorzy:
Jezierska, A.
Panek, J. J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/172356.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Chemiczne
Tematy:
CPMD
dynamika molekularna Cara-Parrinello
klasyczna dynamika molekularna
wewnątrzcząsteczkowe wiązanie wodorowe
międzycząsteczkowe wiązanie wodorowe
zasada Schiffa
zasada Mannicha
N-tlenki
białka
Car-Parrinello molecular dynamics
classical MD
intramolecular HB
intermolecular HB
Schiff base
Mannich base
N-oxides
proteins
Opis:
Modern computational chemistry offers a wide variety of methods allowing us to investigate very complex systems. In the current study, we would like to focus on ab initio and classical molecular dynamics to show their applications in our research. Car-Parrinello molecular dynamics (CPMD) was carried out to study compounds possessing intra- and intermolecular hydrogen bonds. Our simulations were performed in vacuum, in solvent and in crystalline phase. It is well known that intramolecular hydrogen bonding stabilizes 3D structure of molecules. The strength of the bonding and its features are influenced by inductive and steric effects. Our short overview on CPMD application to systems with intramolecular HB we start from Schiff and Mannich bases -model compounds to investigate intramolecular hydrogen bonding. Other examples reported here derive from the class of N-oxide type compounds. Special attention was devoted to another representative structure in such investigations – picolinic acid N-oxide. In some examples listed above proton transfer phenomena occurred making these compounds interesting objects for future excited state studies. Aliphatic boronic acid was used as a model example to study intermolecular hydrogen bonds based on CPMD method. Further, classical molecular dynamics was applied to investigate proteins. Here, we would like to report our results for two biomolecules. The first one is proteinase K for which the impact of mercury(II) on its catalytic center was studied. The second one is streptavidin. For the latter one its complexes with biotinylated ligands were investigated. We close our review with a paragraph describing further development and perspectives related to CPMD method.
Źródło:
Wiadomości Chemiczne; 2017, 71, 7-8; 473-495
0043-5104
2300-0295
Pojawia się w:
Wiadomości Chemiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wyróżnianie form ziemniaka o złożonej odporności na mątwiki atakujące ziemniak przy wykorzystaniu metod konwencjonalnych i molekularnych. Charakterystyka nowego źródła odporności na Globodera pallida znalezionego w Solanum gourlayi
Selection of potato forms with accumulated resistances to nematodes attacking the potato by using conventional and molecular methods. Characterization of a new source of resistance to Globodera pallida found in Solanum gourlayi
Autorzy:
Milczarek, Dorota
Flis, Bogdan
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199560.pdf
Data publikacji:
2019-11-30
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
cechy użytkowe
mapowanie
mątwik
odporność
Solanum gourlayi
ziemniak
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2019, 286; 247-250
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody molekularne i immunologiczne stosowane w diagnostyce grzybic
Molecular and immunological methods applied in diagnosis of mycoses
Autorzy:
Kuba, K
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/841048.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
diagnostyka lekarska
diagnostyka molekularna
metody diagnostyczne
diagnostyka immunologiczna
metody molekularne
metoda nested-PCR
testy serologiczne
metoda EIA
metoda RT-PCR
metoda RAPD
markery molekularne
metoda RFLP
lancuchowa reakcja polimerazy
metoda AFLP
metody immunologiczne
grzybice
Źródło:
Annals of Parasitology; 2008, 54, 3; 187-197
0043-5163
Pojawia się w:
Annals of Parasitology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody molekularne i immunologiczne stosowane w diagnostyce grzybic
Molecular and immunological methods applied in diagnosis of mycoses
Autorzy:
Kuba, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2143775.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Tematy:
diagnostyka lekarska
diagnostyka molekularna
metody diagnostyczne
diagnostyka immunologiczna
metody molekularne
metoda nested-PCR
testy serologiczne
metoda EIA
metoda RT-PCR
metoda RAPD
markery molekularne
metoda RFLP
lancuchowa reakcja polimerazy
metoda AFLP
metody immunologiczne
grzybice
Opis:
The diagnosis of fungal infections remains a problem for the management of fungal diseases, particularly in the immunocompromised patients. Systemic Candida infections and invasive aspergillosis can be a serious problem for individuals who need intensive care. Traditional methods used for the identification and typing of medically important fungi, such as morphological and biochemical analysis, are time−consuming. For the diagnosis of mycoses caused by pathogenic fungi faster and more specific methods, especially after the dramatic increase in nosocomial invasive mycoses are needed. New diagnostic tools to detect circulating fungal antigens in biological fluids and PCR−based methods to detect species or genus−specific DNA or RNA have been developed. Antigen detection is limited to searching only one genus. Molecular genetic methods, especially PCR analysis, are becoming increasingly important as a part of diagnostics in the clinical mycology laboratory. Various modifications of the PCR method are used to detect DNA in clinical material, particularly multiple, nested and real−time PCR. Molecular methods may be used to detection of nucleic acids of fungi in clinical samples, to identify fungal cultures at the species level or to evaluate strain heterogeneity differences within the species. This article reviews some of the recent advances in the possibility of molecular diagnosis of fungal infections.
Źródło:
Wiadomości Parazytologiczne; 2008, 54, 3; 187-197
0043-5163
Pojawia się w:
Wiadomości Parazytologiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie metod biologii molekularnej do identyfikacji grzybów zasiedlających martwe drewno sosny zwyczajnej (Pinus sylvestris L.)
Application of molecular biology methods to indentify fungi inhabiting dead wood of Scots pine (Pinus sylvestris L.)
Autorzy:
Behnke-Borowczyk, J.
Cichon, J.
Wolowska, D.
Haluszczak, M.
Baranowska-Wasilewska, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/791463.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Wyższa Szkoła Zarządzania Środowiskiem w Tucholi
Tematy:
roznorodnosc biologiczna
grzyby zasiedlajace drewno
drewno martwe
identyfikacja
biologia molekularna
zbiorowiska grzybow
sklad gatunkowy
molecular biology
application
identification method
fungi
colonizing fungi
species composition
wood
dead wood
Scotch pine
Pinus sylvestris
fungi community
Źródło:
Zarządzanie Ochroną Przyrody w Lasach; 2017, 11
2081-1438
2391-4106
Pojawia się w:
Zarządzanie Ochroną Przyrody w Lasach
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie metod biotechnologicznych w hodowli molekularnej rzepaku
The use of biotechnological methods in molecular breeding of oilseed rape
Autorzy:
Olejniczak, O.
Mikolajczyk, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/832859.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
hodowla roslin
rzepak ozimy
Brassica napus
metody biotechnologiczne
markery genetyczne
transformacja genetyczna
plant breeding
winter rape
biotechnological method
genetic marker
genetic transformation
Opis:
W pracy przedstawiono przegląd literatury dotyczącej badań genetycznych ważnej uprawnej rośliny oleistej strefy klimatu umiarkowanego, jaką jest rzepak ozimy. Zaprezentowano metody biotechnologiczne, takie jak transformacje genetyczne z użyciem wektorów bakteryjnych oraz metodą wyciszania genów, ukierunkowana mutageneza, a także selekcja z użyciem markerów genetycznych, w odniesieniu do prowadzonych doświadczeń hodowlanych. Metody te stosowane są w celu modyfikacji i polepszenia ważnych gospodarczo cech, takich jak odporność na choroby i szkodniki, plon nasion, plon oleju, skład kwasów tłuszczowych w oleju nasion, występowanie związków aktywnych biologicznie w oleju i wytłoku oraz zawartość włókna w okrywie nasiennej. Podkreślono znaczenie identyfikacji specyficznych markerów genetycznych i ich zastosowania do selekcji w programach hodowli. Wskazano na rozwój nowej, interdyscyplinarnej dziedziny, określonej jako hodowla molekularna. Przedstawiono również praktyczne zastosowanie różnego rodzaju markerów genetycznych, identyfikujących geny i rejony genomu sprzężone z określonymi cechami, z włączeniem markerów opracowanych w IHAR – PIB, Oddział w Poznaniu.
This paper comprises a review of genetic studies of winter oilseed rape, an important oil crop of the moderate climate zone. Biotechnological methods, such as genetic transformation with the use of bacterial vectors and gene silencing, site-directed mutagenesis as well as selection with the use of genetic markers with respect to field experiments were presented. The methods are applied for modification and improving of economically important traits, including resistance to diseases and pests, seed yield, seed oil fatty acid composition, the presence of biologically active compounds in oil and seed meal, and also the fibre content in seed coat. The importance of specific genetic markers development and their use for selection in breeding programs was highlighted. Molecular breeding was mentioned as a new, interdisciplinary domain. Finally, practical use of several genetic markers for identifying genes and genome regions linked to specific traits, including those developed at the Plant Breeding and Acclimatization Institute – NRI, Poznan Branch, was presented.
Źródło:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops; 2013, 34, 1
1233-8273
Pojawia się w:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies