Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "1H-NMR" wg kryterium: Wszystkie pola


Wyświetlanie 1-3 z 3
Tytuł:
Zastosowanie spektroskopii 1H NMR do oceny przebiegu biodegradacji zanieczyszczeń węglowodorowych
Application of 1H NMR spectroscopy in assessment of the course of hydrocarbon contaminant biodegradation
Autorzy:
Śliwka, E.
Kołwzan, B.
Kołodziej, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/237708.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polskie Zrzeszenie Inżynierów i Techników Sanitarnych
Tematy:
magnetyczny rezonans jądrowy
produkty naftowe
rozkład biologiczny
oczyszczanie gruntu
nuclear magnetic resonance (NMR)
petroleum substances
coal tar
biological degradation
soil treatment
Opis:
Oceniono przydatność techniki spektroskopii 1H NMR do charakterystyki zmian w strukturze chemicznej substancji naftowych (olej napędowy i ropa naftowa) oraz odpadowej smoły gazowniczej zachodzących w procesie ich biodegradacji. Proces biodegradacji prowadzono przez 14 dób, wykorzystując szczepy bakterii wyizolowane z gleby skażonej produktami naftowymi. Skuteczność biodegradacji była zróżnicowana i w przypadku oleju napędowego wynosiła 89%, ropy naftowej – 45% i smoły gazowniczej – 26%. Analiza widm 1H NMR substratów wykazała duże różnice w rozkładzie protonów alifatycznych i aromatycznych między próbkami naftowymi i smołą gazowniczą. Substraty naftowe charakteryzowały się około 3-krotnie mniejszym współczynnikiem aromatyczności (fA=0,12 i 0,14) oraz wzrostem wartości tego parametru w produktach biodegradacji. Potwierdza to obecność w substancjach naftowych składników alifatycznych, łatwo ulegających biodegradacji. Duże różnice wartości parametru fA wskazują, że może być on wykorzystany do różnicowania źródeł zanieczyszczeń węglowodorowych w próbkach środowiskowych. Dodatkową zaletą techniki 1H NMR jest mała ilość analitów potrzebna do analizy oraz fakt, że należy do grupy badań nieniszczących.
Suitability of 1H NMR spectroscopy for evaluation of changes in chemical structure of petroleum substances (diesel and crude oils) and coal tar waste upon their biodegradation was assessed. Biodegradation was carried out for 14 days using bacterial strains isolated from petroleum-contaminated soil. Biodegradation effectiveness varied, amounting to 89% for diesel oil, 45% for crude oil and 26% for coal tar. 1H NMR spectra analysis demonstrated major differences in the distribution of aliphatic and aromatic protons between petroleum samples and coal tar. The aromaticity factor of petroleum substrates was about 3 times lower (fA=0.12 and 0.14) and it increased in the biodegradation products. This confirms presence of aliphatic components, readily biodegradable, in petroleum substances. Major differences in the fA parameter values indicate that it can be used to differentiate between the sources of hydrocarbon contamination in environmental samples. An additional advantage of the 1H NMR technique is a small amount of analyte required for analysis and the non-destructive character of the technique.
Źródło:
Ochrona Środowiska; 2015, 37, 2; 55-60
1230-6169
Pojawia się w:
Ochrona Środowiska
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Badanie struktury i dynamiki N-terminalnych sekwencji dermorfiny i ich analogów z wykorzystaniem spektroskopii NMR w ciele stałym i rentgenografii
Studies on the structure and dynamics of N-terminal sequences of dermorphin and their analogs by means of solid state NMR spectroscopy and XRD
Autorzy:
Trzeciak-Karlikowska, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/171648.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Chemiczne
Tematy:
peptydy opioidowe
oddziaływania CH-pi
dynamika molekularna
oddziaływanie peptyd–fosfolipid
spektroskopia NMR
1H Ultra Fast MAS NMR
PISEMA MAS
PILGRIM
XRD
opioid peptides
CH-pi interactions
molecular dynamics
peptide–phospholipid interaction
NMR spectroscopy
Opis:
Deltorphin I (Tyr-d-Ala-Phe-Asp-Val-Val-Gly-NH_2) and dermorphin (Tyr-d-Ala-Phe- -Gly-Tyr-Pro-Ser-NH_2) are natural opioid peptides that have been isolated from the skin of South American frogs [1]. The presence of d-amino acid is crucial for their biological activity. The synthetic analogs of given heptapeptides containing l-alanine are not analgesics [2]. Analysis of the influence of stereochemistry on molecular packing, dynamics and biological functions of neuropeptides is still important for receptor studies and practical applications (e.g. design of new selective pain killers). Presented research is focused on the structure and dynamics of two N-terminal sequences of dermorphin: tripeptide Tyr-d-Ala-Phe 1, tetrapeptide Tyr-D-Ala-Phe-Gly 2, and their analogs with l-alanine: Tyr-Ala-Phe 3 and Tyr-Ala-Phe-Gly 4, using solid state NMR and X-ray diffraction. This study clearly demonstrates that 1 and 2 crystallized under different conditions to form exclusively one structure [3, 4]. In contrast, tripeptide and tetrapeptide with l-Ala in the sequence very easily form different crystal modifications. Tyr-Ala-Phe 3 crystallizes into two forms: 3a and 3b [5], while Tyr-Ala-Phe-Gly 4 gives three modifications: 4a, 4b and 4c [4]. It seems that one of the factors, which can be important in the preorganization mechanism anticipating the formation of crystals, is the intramolecular CH-đ interaction between aromatic rings of tyrosine and/or phenylalanine and the methyl group of alanine. Such interaction is possible only for d-Ala residue. For l-Ala in the peptide sequence, the methyl group is aligned on the opposite side with respect at least to one of the aromatic groups. It can be further speculated that such internal CH-π contacts can also occur during the interaction of ligand–receptor, making the message sequence of opioid peptides more rigid and finally selective. By employing different NMR experiments (e.g. PISEMA MAS and PILGRIM) it was proven that the main skeleton of analyzed peptides is rigid, whereas significant differences in the molecular motion of the aromatic residues were observed [4, 6]. Solid state 2H NMR spectroscopy of samples with deuterium labeled aromatic rings: Tyrd4-d-Ala-Phe 5, Tyr-d-Ala-Phed5 6, Tyrd4-Ala-Phe 7, Tyr-Ala-Phe^d5 8 was used to analyze the geometry and time scale of the molecular motion. At ambient temperature, the tyrosine ring of sample 5 is rigid and in the sample 6 the phenylalanine ring undergoes a "π -flip". The tyrosine rings of form I of 7 and 8 are static, while the phenylalanine rings of form II of 7 and 8 undergo a fast regime exchange [6]. Variable temperature 2H measurements proved that the tyrosine and phenylalanine rings of two forms of compounds 7 and 8 became more mobile with increasing temperature. In contrast, the aromatic rings of samples 5 and 6 preserve their dynamics regime (static tyrosine and "π -flip" phenylalanine) in a large range of temperatures [6]. The analysis of 13C, 15N labeled tetrapeptide Tyr-D-Ala-Phe-Gly 2’-phospholipid membrane interactions suggests that peptide 2’ is aligned on the surface of the membrane (RFDR MAS) and the sandwich-like π -CH_3-π arrangement of the pharmacophore is preserved (DARR) [7].
Źródło:
Wiadomości Chemiczne; 2012, 66, 9-10; 867-891
0043-5104
2300-0295
Pojawia się w:
Wiadomości Chemiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Benzen i metan jako wzorce przesunięcia chemicznego 1 H I 13 C NMR w obliczeniach teoretycznych
Benzene and methane as a and 13 H I 13 C NMR chemical shift references in theoretical calculations
Autorzy:
Rzepiela, Kacper
Gajda, Tomasz
Buczek, Aneta
Broda, Małgorzta A.
Kupka, Teobalt
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/172062.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Chemiczne
Tematy:
tensor ekranowania magnetycznego
wzorce przesunięcia chemicznego
benzen
metan
cytozyna
izopren
nuclear magnetic shielding tensor
chemical shift references
benzene
methane
cytosine
isoprene
Opis:
NMR spectroscopy belongs to the most versatile techniques used in chemical laboratory for testing the presence of various compounds and elucidation of their structure. In case of more complex natural products chemical intuition and experience applied to analysis of experimental spectra is often supported by theoretical modeling of NMR spectra. However, theoretical predictions should be reliable and the errors associated with the approximations inherent to the existing methods minimized. In this respect, systematic errors, present in calculation of isotropic nuclear magnetic shieldings of the studied molecule need to be minimized. Conversion of nuclear shieldings of the studied molecule to the corresponding chemical shifts is performed by using a calculated reference molecule. This way systematic errors partly cancel and the remaining inaccuracies are efficiently decreased by using a properly selected theoretical reference molecule. In this work we demonstrate the impact of calculation method (selected density functional) and basis set on the predicted isotropic nuclear magnetic shieldings of free benzene and methane in vacuum and in popular solvents using a simple PCM approach. We propose the use of B3LYP, OPBE density functionals and recently designed xOPBE one in combination with Pople’s and Dunning’s basis sets, as well as with the modified STO-3G one. The new, STO(1M)-3G basis set was designed by Leszczyński and co-workers for efficient prediction of 13C NMR parameters in large organic molecules. Two molecules were selected to demonstrate the performance of GIAO B3LYP, OPBE and xOPBE for prediction of 1H and 13C NMR chemical shifts in vacuum and solution in comparison with available experimental data.
Źródło:
Wiadomości Chemiczne; 2020, 74, 9-10; 609-627
0043-5104
2300-0295
Pojawia się w:
Wiadomości Chemiczne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-3 z 3

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies