Temat: hotspot - Katalog OPAC zbiorów

Skocz do pozycji: 1.

Tytuł:: Dengue virus (NS2B/NS3 protease) protein engineering. Part I: An automated design for hotspots stability and site-specific mutations by using HotSpot Wizard 3.0 tool
Autorzy:: Lahiri, Madhumita
Ghosh, Ipsita
Talukdar, Partha
Talapatra, Soumendra Nath
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/1062840.pdf
Data publikacji:: 2019
Wydawca:: Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:: HotSpot Wizard
NS2B/NS3 protease
Non-structural protein
computational tool
protein engineering
Opis:: The non-structural dengue virus (DNV) protein, DNV-2 NS2B/NS3 protease is a combination of two proteins as 2B and 3 and these two proteins in complex replicate faster during dengue fever. The objective of the present study was to detect hot spots and design of smart libraries for engineering protein stability, substrate specificity, tunnels and cavities as well as suitable mutability position of studied protein by using an online tool, HotSpot Wizard (version 3.0). The prediction results were obtained in output interface for functional hot spots, stability hot spots (structural flexibility), correlated hot spots and stability hot spots (sequence consensus) from the sequence string. It is concluded that the prediction of pocket and mutability of this protein can easily be identified the structural alternation especially in disease diagnosis and space for ligand binding site in pocket for the potential of new drug design. Moreover, this computational prediction is suggested to compare with experimental hotspots for studied protein in relation to therapeutic efficacies, which are lacking to prevent viral infection.
Źródło:: World Scientific News; 2019, 127, 3; 177-190
2392-2192
Pojawia się w:: World Scientific News
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 2.

Tytuł:: Molecular study of Prussian carp – an invasive species in the lakes of the Leszno Lakeland
Autorzy:: Panicz, Remigiusz
Keszka, Sławomir
Rybczyk, Agnieszka
Zawal, Andrzej
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/1386039.pdf
Data publikacji:: 2016
Wydawca:: Uniwersytet Szczeciński. Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Szczecińskiego
Tematy:: Prussian carp
hotspot
invasive species
genetic variation
karaś srebrzysty
hot spot
gatunki inwazyjne
zróżnicowanie genetyczne
Opis:: Invasions of alien species are a serious problem worldwide. In Poland, among of 30 alien species recorded in aquatic environment Prussian carp (Carassius gibelio) draw increasing attention due to its exceptionally successful colonization. Therefore the aim of the work was to perform study on Prussian carp populations, including genetic testing, which may answer questions regarding the degree of variation and the reasons for success in new locations. The material for the study consisted of fin clips from 120 specimens of the species Prussian carp collected from five lakes in the Leszno Lakeland. Genetic variation within and between groups was analysed based on sequence analysis of control region (D-loop, mtDNA). Genetic analyses revealed variability in sequence length (Indel 353A), where in the group of sequences from Lakes Wonieść and Łoniewskie there was one sequence variant, with 555 base pairs, but from Lakes Osłonińsko-Górskie, Dominickie and Wielkie, consisted of variants of 554 (30%)and 555 (70%) base pairs. Presented work indicate that presence and spread of alien species may be used as an indicator of worsening environmental conditions, therefore analysed areas should be given special attention in the process of restoration to their original state.
Inwazje gatunków obcych są ważnym problemem globalnym. Przykładowo oprócz 30 obcych gatunków ryb odnotowanych w polskich wodach, szczególną uwagę przyciąga karaś srebrzysty (Carassius gibelio) w związku z jego wyjątkowo ekspansywną strategią rozprzestrzeniania. Z tego też powodu celem niniejszego artykułu jest analiza populacji karasia srebrzystego, w tym testów genetycznych, które mogą udzielić odpowiedzi na pytanie o stopniu zróżnicowania i przyczynach sukcesu obserwowanych w kolejnych lokalizacjach. Materiał do badań stanowiły skrawki płetw 120 osobników karasia srebrzystego, które odłowiono w latach 2009i 2010 z pięciu jezior należących do obszaru Pojezierza Leszczyńskiego. Analizy genetyczne w obrębie jak i pomiędzy grupami przeprowadzono na podstawie amplifikacji oraz analizy odczytanej sekwencji regionu kontrolnego (D-loop, mtDNA). Analiza uzyskanych sekwencji ujawniła, że różnią się one długością (Indel 353A). W grupie sekwencji z jezior Wonieść oraz Łoniewskie występował jedynie jeden wariant sekwencji, 555 par zasad. Pozostałe sekwencje uzyskane na bazie prób pozyskanych z jezior Osłonińsko-Górskie, Dominickie oraz Wielkie składały się z wariantów o długości 554 (30%) i 555 (70%) par zasad. Wyniki badań dowodzą, że obecność oraz rozprzestrzenianie się obcych gatunków może wskazywać na pogarszający się stan środowiska wodnego, dlatego rozpatrywane akweny należy traktować indywidualnie podczas prób przywracania ich do stanu pierwotnego.
Źródło:: Acta Biologica; 2016, 23; 47-54
2450-8330
2353-3013
Pojawia się w:: Acta Biologica
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Informacja

Wyszukujesz frazę "hotspot" wg kryterium: Temat

Źródło danych

Dostawca treści

Kolekcja

Rok wydania

Wydawca

Temat

Autor

Typ dokumentu

Język