Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "geny" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
    Wyświetlanie 1-13 z 13
    Tytuł:
    Environmental Application of Reporter-Genes Based Biosensors for Chemical Contamination Screening
    Zastosowanie opartych na genach reporterowych biosensorów w screeningu chemicznych zanieczyszczeń w środowisku
    Autorzy:
    Matejczyk, M.
    Rosochacki, S. J.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/204584.pdf
    Data publikacji:
    2014
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    reporter genes
    biosensors
    chemical contamination
    geny reporterowe
    biosensor
    skażenie chemiczne
    Opis:
    The paper presents results of research concerning possibilities of applications of reporter-genes based microorganisms, including the selective presentation of defects and advantages of different new scientific achievements of methodical solutions in genetic system constructions of biosensing elements for environmental research. The most robust and popular genetic fusion and new trends in reporter genes technology – such as LacZ (β-galactosidase), xylE (catechol 2,3-dioxygenase), gfp (green fluorescent proteins) and its mutated forms, lux (prokaryotic luciferase), luc (eukaryotic luciferase), phoA (alkaline phosphatase), gusA and gurA (β-glucuronidase), antibiotics and heavy metals resistance are described. Reporter-genes based biosensors with use of genetically modified bacteria and yeast successfully work for genotoxicity, bioavailability and oxidative stress assessment for detection and monitoring of toxic compounds in drinking water and different environmental samples, surface water, soil, sediments.
    Prezentowana praca przeglądowa zawiera opis możliwości aplikacyjnych biosensorów opartych na genetycznie zmodyfikowanych mikroorganizmach wyposażonych w geny reporterowe. W pracy przedstawiono defekty i zalety nowych naukowych osiągnięć oraz metodologicznych rozwiązań dotyczących genetycznych systemów w biosensorach przeznaczonych do środowiskowego screeningu zanieczyszczeń. Opisano najbardziej użyteczne i popularne genetyczne fuzje sekwencji promotorowych z takimi genami reporterowymi jak: lacZ (β-galaktozydaza), xylE (katechol 2,3-dioxygenaza), gfp (gen białka zielonej fluorescencji) oraz jego zmutowane warianty, lux (prokariotyczna lucyferaza), luc (eukariotyczna lucyferaza), phoA (alkaliczna fosfataza), gusA i gurA (β-glukuronidaza), geny oporności na antybiotyki oraz metale ciężkie. Tego typu mikrobiologiczne biosensory znalazły szerokie zastosowanie w testach genotoksyczności, badaniach nad biodostępnością oraz stresem oksydacyjnym, a także w detekcji i monitoringu substancji toksycznych w wodzie pitnej, różnych próbach środowiskowych, wodach powierzchniowych, glebie i osadach.
    Źródło:
    Archives of Environmental Protection; 2014, 40, 4; 113-123
    2083-4772
    2083-4810
    Pojawia się w:
    Archives of Environmental Protection
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Estimation of the relative gene size of yeast mutants
    Autorzy:
    Kopocinski, B.
    Lachowicz, T.M.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/68487.pdf
    Data publikacji:
    1993
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Instytut Genetyki Roślin PAN
    Tematy:
    estymacja rozkladow
    dlugosc genow
    oddychanie
    statystyka matematyczna
    genetyka
    geny
    drozdze
    Źródło:
    Genetica Polonica; 1993, 34, 2; 99-108
    0016-6715
    Pojawia się w:
    Genetica Polonica
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Fusion of feature selection methods in gene recognition
    Autorzy:
    Gil, Fabian
    Osowski, Stanislaw
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2128155.pdf
    Data publikacji:
    2021
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    diagnostic features
    selection methods
    genes
    recognition
    biomarkers
    funkcja diagnostyczna
    metody selekcji
    geny
    rozpoznanie
    biomarkery
    Opis:
    The paper presents the fusion approach of different feature selection methods in pattern recognition problems. The following methods are examined: nearest component analysis, Fisher discriminant criterion, refiefF method, stepwise fit, Kolmogorov-Smirnov criteria, T2-test, Kruskall-Wallis test, feature correlation with class, and SVM recursive feature elimination. The sensitivity to the noisy data as well as the repeatability of the most important features are studied. Based on this study, the best selection methods are chosen and applied in the process of selection of the most important genes and gene sequences in a dataset of gene expression microarray in prostate and ovarian cancers. The results of their fusion are presented and discussed. The small selected set of such genes can be treated as biomarkers of cancer.
    Źródło:
    Bulletin of the Polish Academy of Sciences. Technical Sciences; 2021, 69, 3; e136748, 1--8
    0239-7528
    Pojawia się w:
    Bulletin of the Polish Academy of Sciences. Technical Sciences
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Testing for signatures of natural selection at molecular genes level
    Autorzy:
    Cyran, K.
    Polańska, J.
    Kimmel, M.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/333073.pdf
    Data publikacji:
    2004
    Wydawca:
    Uniwersytet Śląski. Wydział Informatyki i Nauki o Materiałach. Instytut Informatyki. Zakład Systemów Komputerowych
    Tematy:
    testowanie kwalifikacyjne
    ludzkie geny nowotworowe
    selection testing
    human cancer genes
    ATM
    RECQL
    Opis:
    The paper presents the methodology used for detecting the signatures of natural selection at the molecular level from single nucleotide polymorphism data. The results obtained from widely used approach, based on statistical testing departures from neutral evolution model, can be obscured by the presence of alternative hypotheses generating the similar to natural selection results of the tests. These hypotheses include population growth and geographic substructure. Especially for human population these alternatives are of non-negligible importance. In the paper we show how to deal with this problem, both by the analysis of a battery of statistical tests giving indication about the age of the predominant mutations, and by application of non conventional null hypotheses that assume different population scenarios. Since the critical values of the tests are known only for panmicting, constant size population, the second approach demands the intensive computer simulations of coalescence process to obtain analogous critical values for different scenarios used as a null. The methodology with the problem of detecting signatures of natural selection in four genes implicated in human familial cancers has been illustrated.
    Źródło:
    Journal of Medical Informatics & Technologies; 2004, 8; MM31-40
    1642-6037
    Pojawia się w:
    Journal of Medical Informatics & Technologies
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Zaburzenia mielinizacji i migracji neuronalnej w patogenezie schizofrenii - poszukiwanie nowych genów kandydujących
    Disorders of myelination and neuronal migration in the pathogenesis of schizophrenia – looking for new candidate genes
    Autorzy:
    Gawłowska, Marta
    Rabe-Jabłońska, Jolanta
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/945560.pdf
    Data publikacji:
    2007
    Wydawca:
    Medical Communications
    Tematy:
    HAR1
    candidate genes
    geny kandydujące
    mielinizacja
    migracja neuronalna
    myelination
    neuronal migration
    reelin
    reelina
    schizofrenia
    schizophrenia
    Opis:
    According to the neurodevelopmental hypothesis, schizophrenia may be caused by structural defects or abnormal neuronal circuits, resulting from disturbed early stages of embryonal development of the central nervous system. Disorders detected within white matter structures are considered one of possible causes of subsequent development of schizophrenia. Disorganization of white matter in patients with schizophrenia has been confirmed by neuropathological and neuroimaging studies. Novel neuroimaging techniques (diffusion tensor and magnetization transfer MRI) confirm the presence of white matter volume loss and regional misrouting and/or deficits within neuronal tracts. Schizophrenia is associated both with disorganization of oligodendrocytes participating in myelin synthesis and disturbed expression of proteins controlling this process. Results of post-mortem studies provide an indirect proof of disturbed neuronal migration taking place at early stages of neuroembryogenesis in patients with schizophrenia. It is suggested, that structural abnormalities observed may be caused by disturbed function of proteins which control this process, e. g. reelin, or substances mieacting as regulators of activity of these proteins and their receptors. Such a potential regulating factor is the product of the HAR1 gene, which may constitute the next step in the pathogenesis of schizophrenia.
    W myśl hipotezy neurorozwojowej u podłoża schizofrenii leżą deficyty strukturalne lub nieprawidłowe obwody neuronalne powstające na skutek zaburzeń wczesnych etapów rozwoju embrionalnego ośrodkowego układu nerwowego. Uważa się, że jedną z możliwych przyczyn rozwoju schizofrenii mogą być nieprawidłowości obserwowane w obrębie struktur istoty białej. Na zaburzoną organizację istoty białej wśród chorujących na schizofrenię wskazują wyniki badań neuropatologicznych i neuroobrazowych. Nowe techniki badań obrazowych (badania rezonansu magnetycznego z zastosowaniem tensora dyfuzji i transferu magnetyzacji) potwierdzają obecność ubytków objętości struktur istoty białej oraz regionalne zaburzenia przebiegu i/lub ubytki w obrębie włókien nerwowych. W schizofrenii stwierdza się zarówno nieprawidłową organizację zaangażowanych w syntezę mieliny oligodendrocytów, jak i zaburzoną ekspresję białek regulujących przebieg tego procesu. Wyniki badań pośmiertnych wskazują pośrednio także na zaburzenia migracji neuronalnej na wczesnych etapach neuroembriogenezy wśród pacjentów chorujących na schizofrenię. Sugeruje się, że u podłoża obserwowanych nieprawidłowości strukturalnych leżą zaburzenia funkcji białek zaangażowanych w kontrolę przebiegu tego procesu, takich jak reelina, lub cząstek działających jako regulatory aktywności tych białek lub ich receptorów. Takim potencjalnym czynnikiem regulacyjnym jest produkt genu HAR1, który może stanowić kolejne ogniwo w patogenezie schizofrenii.
    Źródło:
    Psychiatria i Psychologia Kliniczna; 2007, 7, 2; 66-75
    1644-6313
    2451-0645
    Pojawia się w:
    Psychiatria i Psychologia Kliniczna
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Fusion of feature selection methods in gene recognition
    Autorzy:
    Gil, Fabian
    Osowski, Stanislaw
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2173571.pdf
    Data publikacji:
    2021
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    diagnostic features
    selection methods
    genes
    recognition
    biomarkers
    funkcja diagnostyczna
    metody selekcji
    geny
    rozpoznanie
    biomarkery
    Opis:
    The paper presents the fusion approach of different feature selection methods in pattern recognition problems. The following methods are examined: nearest component analysis, Fisher discriminant criterion, refiefF method, stepwise fit, Kolmogorov-Smirnov criteria, T2-test, Kruskall-Wallis test, feature correlation with class, and SVM recursive feature elimination. The sensitivity to the noisy data as well as the repeatability of the most important features are studied. Based on this study, the best selection methods are chosen and applied in the process of selection of the most important genes and gene sequences in a dataset of gene expression microarray in prostate and ovarian cancers. The results of their fusion are presented and discussed. The small selected set of such genes can be treated as biomarkers of cancer.
    Źródło:
    Bulletin of the Polish Academy of Sciences. Technical Sciences; 2021, 69, 3; art. no. e136748
    0239-7528
    Pojawia się w:
    Bulletin of the Polish Academy of Sciences. Technical Sciences
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    The study of gene polymorphisms in neurotransmitter systems (HTR1A and SLC6A3) and morphofunctional characteristics in students with depression symptoms
    Badanie genowego polimorfizmu systemów neurotransmiterów (HTR1A oraz SLC6A3) oraz charakterystyka morfofunkcjonalna u studentów zobjawami depresji
    Autorzy:
    Negasheva, Marina
    Vasileva, Aleksandra
    Godina, Elena
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/423811.pdf
    Data publikacji:
    2018
    Wydawca:
    Lubuskie Towarzystwo Naukowe
    Tematy:
    morpho-functional characteristics
    depression symptoms
    genes of neurotransmitter systems
    charakterystyka morfofunkcjonalna
    symptomy depresji
    geny i systemy neurotransmiterów
    Opis:
    In the last decades, due to the increasing level of stress, the study of different de-pressive states and search for morpho-functional and genetic markers of depression have become important for modern society. This article is an interdisciplinary study of morpho-functional characteristics and variability of genes in the neurotransmitter systems (HTR1A and SLC6A3) in young men and women with the expression of depressive symptoms. The materials used include: morpho-functional characteristics (height, weight, body circumferences, skinfold thickness in the trunk and the extremities, and characte-ristics of cardiovascular and respiratory systems); evaluation of depression symptoms performed with the Beck questionnaire; determination of polymorphisms of the HTR1A and SLC6A3 genes for 372 students from the cities of Samara and Saransk (170 men and 202 women aged 16-23, predominantly of Russian ethnicity. The results obtained are as follows: young men and women with depression symptoms are characterized by significantly different morpho-functional characteristics (p<0.05), lower adiposity and abdominal skinfold thickness, as well as a relatively higher specific metabolic rate. No differences in the frequencies of the genotypes of the neurotransmitter systems genes (DAT1, HTR1A) were found between the groups of students with or without depression symptoms. Differences in the number of individuals with the presence of depression symptoms were revealed (p<0.05) in relation to gender: these symptoms were twice as high in women (14%) as in men (7%).
    W ostatnich dziesięcioleciach, ze względu na rosnący poziom stresu, badania nad różnymi stanami depresyjnymi i poszukiwanie morfofunkcjonalnych i genetycznych markerów depresji stają się coraz ważniejsze dla współczesnego społeczeństwa. Celem niniejszej pracy jest interdyscyplinarne badanie cech morfofunkcjonalnych i zmienności genów w układach neuroprzekaźników (HTR1A i SLC6A3) u młodych mężczyzn i kobiet z objawami depresyjnymi. Materiał: cechy morfofunkcjonalne (wysokość i masa, obwody ciała i grubości fałdów skórnych na tułowiu i kończynach, charakterystyka układu sercowo-naczyniowego i oddechowego); ocena objawów depresji za pomocą kwestionariusza Becka; określenie polimorfizmów genów HTR1A i SLC6A3 dla 372 uczniów z miast Samara i Sarańsk (170 mężczyzn i 202 kobiety w wieku 16 do 23 lat, głównie pochodzenia rosyjskiego). Wyniki: młode kobiety i mężczyźni z obecnością stanu depresyjnego charakteryzują się zmiennie odmiennymi cechami morfofunkcjonalnymi (p< 0, 05); mniejszą otyłością i grubością fałdów skórnych brzucha, względnie wyższą specyficzną przemianą materii. Nie stwierdzono różnic w częstości genotypów genów systemów nerwowych (DAT1, HTR1A) pomiędzy grupami uczniów z objawami depresji lub bez nich. Różnice między płciami w liczbie osób z objawami depresji zostały pokazane (p< 0, 05); objawy te były dwukrotnie wyższe u kobiet (14%) niż u mężczyzn (7%).
    Źródło:
    Rocznik Lubuski; 2018, 44, 2a; 43-55
    0485-3083
    Pojawia się w:
    Rocznik Lubuski
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Mechanizm zegara biologicznego. Nagroda Nobla 2017 w dziedzinie fizjologii lub medycyny
    Mechanism of circadian clock. The 2017 Nobel Prize in physiology or medicine
    Autorzy:
    Giebultowicz, Jadwiga
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1033710.pdf
    Data publikacji:
    2018
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
    Tematy:
    biological clock
    circadian rhythms
    clock genes
    Drosophila melanogaster
    Nobel Prize
    geny zegarowe
    nagroda Nobla
    rytmy okołodobowe
    zegar biologiczny
    Opis:
    Since 1901, the Nobel Prize has been awarded to scientists who have made the most important discoveries for the benefit of humanity. The 2017 Nobel Prize in Physiology or Medicine was awarded jointly to Jeffrey C. Hall, Michael Rosbash and Michael W. Young “for their discoveries of molecular mechanisms controlling the circadian rhythm.” It may be surprising to learn that those three scientists dedicated their entire careers to research on the fruit fly, Drosophila melanogaster. However, as their studies progressed, it became increasingly clear that the mechanism of the biological clock that they discovered in Drosophila is very similar to a timekeeping mechanism present in mammals, including humans. Through interdisciplinary work between scientists performing basic research on model organisms and medical doctors, we have learned over time that daily rhythms support human health while disruption of these rhythms is associated with a range of pathological disorders such as cardiovascular problems, metabolic, neurological, and many other diseases. This short review highlights critical milestones on the way to understanding biological clocks, focusing on the roles played by the three Nobel Prize winners.
    Od roku 1901 Nagroda Nobla jest przyznawana naukowcom za najważniejsze odkrycia służące dobru ludzkosci. Nagrodę Nobla w dziedzinie fizjologii lub medycyny w 2017 roku otrzymali trzej amerykańscy uczeni Jeffrey C. Hall, Michael Rosbash i Michael W. Young "za odkrycie mechanizmu molekularnego, który kontroluje rytmy okołodobowe". Może się to wydać zaskakujące, ale ci trzej nobliści poświęcili swoje kariery naukowe badaniom nad muszką owocową, Drosophila melanogaster. Jednak w miarę postępu ich badań stawało się coraz bardziej oczywiste, że mechanizm zegara biologicznego, odkryty u muszki Drosophila, jest bardzo podobny do zegara, który posiadają ssaki, łącznie z człowiekiem. Interdyscyplinarna współpraca między naukowcami prowadzącymi badania podstawowe na organizmach modelowych i lekarzami prowadzącymi badania kliniczne ujawniła istotną rolę rytmów dobowych w utrzymaniu zdrowia człowieka. Dlugotrwałe zakłócenie tych rytmów stanowi czynnik ryzyka wielu patologii, takich jak choroby serca, cukrzyca, otyłość czy choroby układu nerwowego. Artykuł krótko podsumowuje odkrycia, stanowiące kamienie milowe na drodze poznania mechanizmu zegara biologicznego, ze szczególnym uwzględnieniem roli trzech noblistów 2017 w tym procesie.
    Źródło:
    Kosmos; 2018, 67, 2; 245-249
    0023-4249
    Pojawia się w:
    Kosmos
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Resistance to the potato leafroll virus [PLRV] in the progeny of a highly resistant potato clone
    Autorzy:
    Swierzynski, M.K.
    Dziewonska, M.A.
    Ostrowska, K.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/67913.pdf
    Data publikacji:
    1993
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Instytut Genetyki Roślin PAN
    Tematy:
    wirus lisciozwoju ziemniaka
    krzyzowanie roslin
    choroby wirusowe
    wirusy
    ziemniaki
    genetyka roslin
    odpornosc roslin
    geny dominujace
    fitopatologia
    Źródło:
    Genetica Polonica; 1993, 34, 2; 139-146
    0016-6715
    Pojawia się w:
    Genetica Polonica
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Analysis of correlation between transcription activity of estrogen-dependent genes of cytochrome P450 and profile of estrogen receptor in endometrial adenocarcinoma
    Analiza zależności pomiędzy aktywnością transkrypcyjną estrogenozależnych genów cytochromu P450 a profilem receptorów estrogenowych w gruczolakoraku endometrium
    Autorzy:
    Jęda-Golonka, Agnieszka
    Witek, Andrzej
    Paul-Samojedny, Monika
    Kruszniewska-Rajs, Celina
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1035490.pdf
    Data publikacji:
    2020
    Wydawca:
    Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
    Tematy:
    endometrial cancer
    estrogen receptors
    estrogen-dependent genes
    cytochrome p450
    oligonucleotide microarray
    posttranscription modifications
    rak endometrium
    receptory estrogenowe
    estrogenozależne geny
    cytochrom p450
    mikromacierz oligonukleotydowa
    modyfikacje potranskrypcyjne
    Opis:
    INTRODUCTION: Studies show that the development of endometrial cancer is associated with the activity of estrogen-dependent genes, whose action is conditioned by the presence of estrogen receptors (ER). Analysis of the transcriptional activity of the genes which code ERs as well as the concentration profile of their isoforms could help to understand the mechanism of estrogen activity on the risk of endometrial cancer occurrence, as well as the mechanisms involved in its development and spread. The aim of the conducted studies was to compare the transcriptional activity of the genes coding ER-alpha and ER-beta estrogen receptors, determine the types of post-transcription modifications of ER mRNA in endometrial adenocarcinoma and normal endometrium as well as determine the transcriptome of estrogen-dependent genes of cytochrome P450. MATERIAL AND METHODS: Extraction of the total RNA from 47 endometrium samples was performed with the TRIzol reagent (Invitrogen). The expression profile of the estrogen-dependent genes of cytochrome P450 was determined using the HG-U133A (Affymetrix) oligonucleotide microarray technique from among 22,283 IDs of mRNA IDs. The QRT-PCR reaction for quantification of the mRNA of estrogen receptors was performed using an ABI PRISMTM 7700 (TaqMan) sequence detector. For the QRT-PCR reaction, oligonucleotide starter sequences to detect the ER-alpha and ER-beta mRNA isoforms were designed using Primer ExpressTM Version 1.0 software. RESULTS: In the presented work, it was found that estrogen receptor gene expression occurs in normal endometrium as well as in endometrial adenocarcinoma, and the dominating type is ER-alpha. The transcriptional activity of the ER-alpha and ER-beta genes decreases in adenocarcinoma with a simultaneous increase in the transcriptional activity ratio. The ER-alpha/delta5 isoform dominates in endometrial cancer. Statistical analysis conducted in the GeneSpring 11.5 programme showed that from the group of 91 mRNA IDs of the genes of cytochrome P450, 5 mRNA IDs differentiate, for p <0.5 and FC(log2) > 1.5. In the presented work, it was found that the expression of estrogen receptor genes occurs in normal endometrium and endometrial adenocarcinoma, and the dominant type is ER-alpha. The transcriptional activity of the ER-alpha and ER-beta genes decreases in adenocarcinoma, while the transcriptional activity index increases. In endometrial cancer, the ER-alpha/delta5 isoform dominates. Statistical analysis conducted in GeneSpring 11.5 showed that from the group 91 ID mRNA of cytochrome P450 genes, 5 ID mRNA is differentiating, for p < 0.5 and FC (log2) > 1.5. CONCLUSIONS: The presence of such a transcriptional profile of the studied genes in endometrial adenocarcinoma may indicate that post-transcriptional modifications of estrogen receptors are associated with changes triggering carcinogenesis.
    WSTĘP: Badania wskazują, że wzrost raka endometrium ma związek z aktywnością genów estrogenozależnych, których działanie jest uwarunkowane obecnością receptorów estrogenowych (ER). Analiza aktywności transkrypcyjnej genów kodujących ERs oraz profilu stężeń ich izoform mogłaby pomóc w zrozumieniu mechanizmów wpływu estrogenów na ryzyko wystąpienia raka endometrium, a także mechanizmów zaangażowanych w jego rozwój i rozprzestrzenianie. Celem prowadzonych badań było porównanie aktywności transkrypcyjnej genów kodujących receptory estrogenowe ER-alfa i ER-beta, wyznaczenie typów modyfikacji potranskrypcyjnych mRNA ERs w gruczolakoraku endometrium i endometrium prawidłowym oraz wyznaczenie transkryptomu estrogenozależnych genów cytochromu P450. MATERIAŁ I METODY: Ekstrakcję całkowitego RNA z 47 próbek endometrium przeprowadzono przy użyciu odczyn-nika TRIzol (Invitrogen). Techniką mikromacierzy oligonukleotydowych HG-U133A (Affymetrix) spośród 22 283 ID mRNA wyznaczono profil ekspresji estrogenozależnych genów cytochromu P450. Reakcję QRT-PCR w celu oznaczenia ilościowego mRNA receptorów estrogenowych wykonano z zastosowaniem detektora sekwencji ABI PRISMTM 7700 (TaqMan). Do reakcji QRT-PCR zaprojektowano sekwencje oligonukleotydowych starterów do detekcji izoform mRNA ER-alfa i ER-beta, wykorzystując program komputerowy Primer ExpressTM Version 1.0. WYNIKI: W przedstawionej pracy stwierdzono, że ekspresja genów receptorów estrogenowych występuje w endometrium prawidłowym oraz gruczolakoraku endometrium, a dominującym typem jest ER-alfa. Aktywność transkrypcyjna genów ER-alfa i ER-beta zmniejsza się w gruczolakoraku, przy równoczesnym wzroście wskaźnika aktywności transkrypcyjnej. W raku endometrium dominuje izoforma ER-alfa/delta5. Analiza statystyczna przeprowadzona w programie GeneSpring 11.5 wykazała, że z grupy 91 ID mRNA genów cytochromu P450 różnicujących jest 5 ID mRNA, dla p < 0,5 i FC(log2) > 1,5. WNIOSKI:Obecność takiego profilu transkrypcyjnego badanych genów w gruczolakoraku endometrium może wskazywać na związek modyfikacji potranskrypcyjnych receptorów estrogenowych ze zmianami uruchamiającymi karcinogenezę.
    Źródło:
    Annales Academiae Medicae Silesiensis; 2020, 74; 24-39
    1734-025X
    Pojawia się w:
    Annales Academiae Medicae Silesiensis
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Detection of antibiotic resistance genes in wastewater treatment plant : molecular and classical approach
    Wykrywanie genów oporności na antybiotyki w oczyszczalni ścieków : podejście klasyczne i biologii molekularnej
    Autorzy:
    Ziembińska-Buczyńska, A.
    Felis, E.
    Folkert, J.
    Meresta, A.
    Stawicka, D.
    Gnida, A.
    Surmacz-Górska, J.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/204828.pdf
    Data publikacji:
    2015
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    DGGE
    denaturing gradient gel electrophoresi
    PCR
    polymerase chain reaction
    sulfamethoxazole
    trimethoprim resistance
    erythromycin resistance
    WWTP
    wastewater treatment plant
    antybiotyki
    reakcja łańcuchowa polimerazy
    sulfametoksazol
    geny oporności
    odporność na trimetoprim
    odporność na erytromycynę
    oczyszczalnia ścieków
    Opis:
    Antibiotics are a group of substances potentially harmful to the environment. They can play a role in bacterial resistance transfer among pathogenic and non-pathogenic bacteria. In this experiment three representatives of medically important chemotherapeutics, confirmed to be present in high concentrations in wastewater treatment plants with HPLC analysis were used: erythromycin, sulfamethoxazole and trimethoprim. Erythromycin concentration in activated sludge was not higher than 20 ng L−1. N-acetylo-sulfamethoxazole concentration was 3349 ± 719 in winter and 2933 ± 429 ng L−1 in summer. Trimethoprim was present in wastewater at concentrations 400 ± 22 and 364 ± 60 ng L−1, respectively in winter and summer. Due to a wide variety of PCR-detectable resistance mechanisms towards these substances, the most common found in literature was chosen. For erythromycin: erm and mef genes, for sulfamethoxazole: sul1, sul2, sul3 genes, in the case of trimethoprim resistance dhfrA1 and dhfr14 were used in this study. The presence of resistance genes were analyzed in pure strains isolated from activated sludge and in the activated sludge sample itself. The research revealed that the value of minimal inhibitory concentration (MIC) did not correspond with the expected presence of more than one resistance mechanisms. Most of the isolates possessed only one of the genes responsible for a particular chemotherapeutic resistance. It was confirmed that it is possible to monitor the presence of resistance genes directly in activated sludge using PCR. Due to the limited isolates number used in the experiment these results should be regarded as preliminary.
    Antybiotyki to grupa związków potencjalnie szkodliwych dla środowiska. Odgrywają one rolę w procesach transferu antybiotykooporności pomiędzy patogenami i bakteriami niechorobotwórczymi. Wykorzystując metodę wysokosprawnej chromatografii cieczowej (HPLC) wykazano obecność erytromycyny, sulfametoksazolu i trimetoprimu w miejskiej oczyszczalni ścieków w następujących stężeniach: dla erytromycyny < 20 ng L−1, N-acetylo-sulfametoksazolu 3349 ± 719 i 2933 ± 429 ng L−1, a trimetoprimu 400 ± 22 i 364 ± 60 ng L−1, odpowiednio: zimą i latem. Ponieważ antybiotykooporność bakteryjna może być stymulowana obecnością antybiotyków w środowisku, istnieje możliwość pojawienia się wielu szlaków opornościowych u bakterii narażonych na działanie tych związków. Dlatego też podjęto próbę detekcji wybranych genów oporności na badane chemioterapeutyki metodą łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR). Obecność elementów genetycznych badano zarówno w szczepach bakteryjnych, u których udowodniono oporność na badany związek bakteriobójczy, jak i w próbce osadu czynnego, z którego te bakterie izolowano. Do badań wybrano najczęściej występujące geny oporności: dla erytromycyny erm i mef, dla sulfametoksazolu: sul1, sul2, sul3, a dla trimetoprimu dhfrA1 i dhfr14. Wykazano, że wartość minimalnego stężenia inhibitującego (MIC), nie koresponduje z obecnością większej liczby mechanizmów oporności. Większość szczepów opornych wykazywała tylko jeden z badanych mechanizmów oporności na antybiotyk niezależnie od wartości MIC. Potwierdzono również możliwość monitorowania obecności genów oporności na antybiotyki metodą PCR bezpośrednio w osadzie czynnym. Ze względu na ograniczona liczbę izolatów użytych w tym eksperymencie wyniki uzyskane w pracy powinny być traktowane jako wstęp do dalszych badań.
    Źródło:
    Archives of Environmental Protection; 2015, 41, 4; 23-32
    2083-4772
    2083-4810
    Pojawia się w:
    Archives of Environmental Protection
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Diagnostyka histopatologiczna rozrostów błony śluzowej trzonu macicy. Część II
    Histopathological diagnosis of endometrial hyperplasia. Part II
    Autorzy:
    Nasierowska-Guttmejer, Anna
    Grajkowska, Wiesława
    Bardadin, Krzysztof
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1030616.pdf
    Data publikacji:
    2009
    Wydawca:
    Medical Communications
    Tematy:
    DNA repair genes
    MLH1
    TP53
    endometrial cancer
    endometrioid cancer – type I
    molecular disorders PTEN
    non-edometrioid cancer – type II
    geny naprawy dna
    rak endometrioidny – i typ
    rak endometrium
    rak nieendometrioidny – ii typ
    zaburzenia molekularne pten
    Opis:
    Endometrial cancer constitutes a heterogeneous group of diseases, in terms of clinical course, underlying molecular disorders, morphology and therapeutic strategy. The most frequent variety is type I or endometrioid cancer. As compared with type II, or non-endometrioid cancer, it usually develops in younger women as a result of prolonged estrogen stimulation within endometrium with features of atypical hyperplasia or a condition defined as endometrial intraepithelial neoplasia (EIN). In terms of morphology, it usually forms an exophytic (rarely endophytic) tumor and presents a high or moderate grade of differentiation. Patients usually present at an initial stage of the disease, with tumor infiltrate rarely exceeding half of uterine wall thickness; lymph node metastases are rare too. Non-endometrioid cancer usually affects older women, where it develops within a flat, atrophic endometrium with no signs of hyperplasia. It is always qualified as poorly differentiated and according to WHO classification its degree of differentiation is not graded. It usually presents an aggressive clinical course, infiltrating over one half of uterine wall thickness, invades the serous membrane and regional lymph nodes. Types I and II of endometrial cancer differ also in terms of underlying molecular disorders. Type I is associated with mutations of genes K-ras, PTEN and MLH1 (DNA repair). Type II is associated with mutation of TP53. The key issue in developing therapeutic strategy is microscopic assessment of type and grade of histological maturity, as well as clinical-pathological stage of cancer. An important issue is to apply currently valid WHO, TNM and FIGO classifications. Objective difficulties in interpretation of microscopic features in some cases result in increasingly frequent use of molecular and immunohistochemical studies in routine pathological diagnostic work-up.
    Rak błony śluzowej trzonu macicy stanowi heterogenną grupę pod względem przebiegu klinicznego, zaburzeń molekularnych, obrazu morfologicznego i leczenia. Większość przypadków jest kwalifikowana jako typ I, zwany rakiem endometrioidnym. W porównaniu z II typem, zwanym rakiem nieendometrioidnym, nowotwór ten rozwija się przeważnie u młodszych kobiet z cechami rozrostu atypowego lub stanu określanego jako „endometrioidna neoplazja śródnabłonkowa” (EIN), w wyniku przedłużonej stymulacji estrogenowej w terenie endometrium. W obrazie morfologicznym zwykle tworzy egzofityczny (rzadziej endofityczny) rozrost i wykazuje wysoko lub średnio dojrzały stopień dojrzałości. Stopień zaawansowania jest zazwyczaj niski, a naciek raka nie przekracza połowy grubości ściany trzonu macicy; rzadko stwierdza się przerzuty do węzłów chłonnych. Rak nieendometrioidny II typu częściej dotyczy starszych kobiet, u których rozwija się w cienkim zanikowym endometrium bez cech rozrostu. Kwalifikowany jest zawsze jako rak nisko zróżnicowany, według klasyfikacji WHO jego stopień zróżnicowania nie podlega stopniowaniu. Na ogół ma agresywny przebieg, przekracza połowę grubości ściany trzonu macicy, nacieka surowicówkę oraz daje przerzuty do węzłów chłonnych. Różnice między typem I i II raka endometrium dotyczą również zaburzeń molekularnych. Typ I raka wiąże się z mutacjami genów K-ras, PTEN i naprawy DNA (MLH1), z kolei w II typie stwierdza się mutacje w TP53. Kluczowe znaczenie dla podjęcia decyzji leczniczych ma ocena mikroskopowa typu i stopnia histologicznej dojrzałości oraz stopnia kliniczno-patologicznego zaawansowania raka. Istotne jest stosowanie aktualnie obowiązujących klasyfikacji WHO, TNM i FIGO. Obiektywne trudności w interpretacji cech mikroskopowych w niektórych przypadkach powodują coraz częstsze włączanie badań molekularnych i immunohistochemicznych do rutynowej diagnostyki.
    Źródło:
    Current Gynecologic Oncology; 2009, 7, 4; 226-236
    2451-0750
    Pojawia się w:
    Current Gynecologic Oncology
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Preliminary study on adverse effects of phenanthrene and its methyl and phenyl derivatives in larval zebrafish, Danio rerio
    Autorzy:
    Wolińska, L.
    Brzuzan, P.
    Woźny, M.
    Góra, M.
    Łuczyński, M. K.
    Podlasz, P.
    Kolwicz, S.
    Piasecka, A.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/363152.pdf
    Data publikacji:
    2011
    Wydawca:
    Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie
    Tematy:
    toksyczność ostra
    CYP1A
    cyp1b1
    geny vtg
    ekspresja mRNA
    stężenie nie wywołujące efektu
    WWA
    Real-Time qPCR
    acute toxicity
    cyp1a genes
    cyp1b1 genes
    vtg genes
    mRNA expression
    No Effect Concentration
    PAHs
    Opis:
    Toxic effects of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) have been extensively studied in fish, although knowledge concerning biological activities of phenanthrene and its derivatives remains still incomplete. The aim of this work was to evaluate lethal and sublethal effects of benzo(a)pyrene, phenanthrene and phenanthrene derivatives (1-methylphenanthrene, 4-methylphenanthrene, 1-phenylphenanthrene and 4-phenylphenanthrene) on zebrafish (Danio rerio) larvae. We conducted acute toxicity test, using 96h static renewal exposure to a series of the PAH concentrations (0.05, 0.50, 5.00, 50.00µmol*l-1), to determine the No Effect Concentration (NEC) value for each compound examined. The mean NEC estimates obtained in the study were 5.16۪.45µmol*l-1 (B[a]P), 4.88۪.13µmol*l-1 (Ph), 40.24䔰.93µmol*l-1 (1P-Ph), 47.92ۭ.61µmol*l-1 (1M-Ph), 24.31۱.33µmol*l-1 (4P-Ph) and 3.11۫.01µmol*l-1 (4M-Ph) and suggested the following order of PAH toxicities on Danio rerio larvae: 4M-Ph>Ph˜B[a]P>4PPhP-Ph>1M-Ph. To gain insight into possible molecular mechanisms of apparent toxicity of phenanthrene derivatives on zebrafish larvae, we examined mRNA expression of cyp1a, cyp1b1, and vtg genes in the larvae exposed for 48h to a PAH concentration of 0.50µmol*l-1. Whereas the larvae exposed to each tested PAH displayed many developmental abnormalities (i.e. pericardial and yolk sac edema, dorsal curvature, or tail malformations), no significant upregulation of cyp1a and cyp1b1 mRNA was observed, except for zebrafish exposed to B[a]P. However, significant reduction of vtg mRNA was observed in the larvae exposed to phenanthrene and its 4P- derivative. The results may contribute to the development of a new knowledge about effects of structurally diverse phenanthrene derivatives on vertebrate organisms.
    Źródło:
    Environmental Biotechnology; 2011, 7, 1; 26-33
    1734-4964
    Pojawia się w:
    Environmental Biotechnology
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
      Wyświetlanie 1-13 z 13

      Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies