Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "Burzynski, A." wg kryterium: Autor


Wyświetlanie 1-9 z 9
Tytuł:
Organisation of mitochondrial DNA in dreissenid bivalves
Autorzy:
Soroka, M.
Burzynski, A.
Rymaszewska, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/84655.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Uniwersytet Mikołaja Kopernika. Wydział Biologii i Ochrony Środowiska. Stowarzyszenie Malakologów Polskich
Tematy:
mitochondrial DNA
bivalve
Dreissenidae
genome
Cristaria plicata
Placopecten magellanicus
gene number
Dreissena
Dreissena polymorpha
Dreissena bugensis
Źródło:
Folia Malacologica; 2012, 20, 1
1506-7629
Pojawia się w:
Folia Malacologica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Detection of recombinant mitochondrial genomes: Implications for the mechanism of mtDNA inheritance in mussel Mytilus
Autorzy:
Filipowicz, M.
Burzyński, A.
Wenne, R.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/363232.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie
Tematy:
DNA mitochondrialne
rekombinacja
Mytilus
mitochondrial DNA
recombination
Opis:
Recombination plays a fundamental role in the creation of biodiversity. It is the mechanism inducing formation of rearrangements within the genomes which, beside mutations, are the major source of genetic variation. In the process of recombination a single or double DNA strand is broken and rejoined with unassociated DNA fragments. There are several types of recombination: homologous recombination, sitespecific recombination and transposition. Within mitochondrial genomes, inter- and intra-molecular recombination can occur. Except for intramolecular recombination of mtDNA, the other types of recombination always result in the creation of mosaic genomes. However, in the natural populations mtDNA recombination is detected extremely rarely. It is caused by the clonal inheritance of mitochondrial genomes and consequential lack of sufficient divergence between parental mitochondrial molecules. Mussels of the genus Mytilus possess two types of mitochondrial genomes inherited from males and females, respectively, and their mode of mtDNA inheritance is called doubly uniparental inheritance (DUI). The presence of two highly diverged parental molecules gives the opportunity for detection of recombinant variants. This feature of Mytilus mtDNA can be broadly exploited in the search for and characteristics of recombinant sequences. Apart from the high level of sequence divergence, fusion of mitochondria and appropriate enzymatic toolkit are principal requirements for the occurrence of recombination. The majority of phylogenetic and demographic analysis based on mtDNA assumes the lack of recombination. If this assumption turned out to be erroneous, previous analyses would be weakened. Recombination is associated with DUI abnormalities, e.g. masculinization of mitochondrial genomes. It may even lead to the breakdown of DUI system resulting in the new, unidentified mode of mtDNA inheritance in mussel Mytilus that might be regulated by stochastic events.
Źródło:
Environmental Biotechnology; 2008, 4, 2; 54-59
1734-4964
Pojawia się w:
Environmental Biotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The detection of Plasmodiophora brassicae using Loop-mediated isothermal DNA amplification
Wykrywanie Plasmodiophora brassicae przy zastosowaniu amplifikacji DNA w warunkach izotermicznych z wykorzystaniem starterów zapętlających (LAMP)
Autorzy:
Kaczmarek, J.
Irzykowski, W.
Burzynski, A.
Jedryczka, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/28420.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Opis:
Plasmodiophora brassicae, the cause of clubroot, is a very serious problem preventing from successful and profitable cultivation of oilseed rape in Poland. The pathogen was found in all main growing areas of oilseed rape; it also causes considerable problems in growing of vegetable brassicas. The aim of this work was to elaborate fast, cheap and reliable screening method to detect P. brassicae. To achieve this aim the Loopmediated isothermal DNA amplification (LAMP) technique has been elaborated. The set of three primer pairs was designed using LAMP software. The detection was performed with the GspSSD polymerase, isolated from bacteria Geobacillus sp., with strand displacement activity. DNA extraction from clubbed roots obtained from farmers’ fields of oilseed rape infected by P. brassicae was done using a modified CTAB method. The reaction was performed for 60 min at 62oC. The visual detection was done using CFX96 Real Time PCR Detection System (BioRad) or Gerie II Amplicatior (Optigen). The detection with LAMP proved its usefulness; it was easy, fast and accurate and independent of plant age. The detection limit was 5 spores per 1 μl of the spore suspension, so LAMP was less sensitive than quantitative PCR tests reported in the literature. However, the method is cheap and simple, so it is a good alternative, when it comes to practical use and the assessment of numerous samples.
Plasmodiophora brassicae powoduje kiłę kapusty, chorobę obniżającą plonowanie i redukującą rentowność uprawy rzepaku. Patogen występuje we wszystkich głównych regionach jego uprawy, a także stanowi poważny problem dla producentów warzyw kapustowatych. Celem badań było opracowanie szybkiego, taniego i niezawodnego sposobu wykrywania P. brassicae. W tym celu opracowano metodę amplifikacji DNA w warunkach izotermicznych z wykorzystaniem starterów zapętlających (LAMP). Do detekcji wykorzystano polimerazę GspSSD, wyodrębnioną z bakterii Geobacillus sp., umożliwiającą zastępowanie nici DNA bez potrzeby zmiany profilu temperatury. Ekstrakcję DNA z wyrośli na korzeniach wykonano z zastosowaniem zmodyfikowanej metody CTAB. Reakcję prowadzono przez 60 minut w temperaturze 62oC. Wyniki zbierano przy zastosowaniu systemu CFX96 Real Time PCR Detection System (BioRad) lub Gerie II Amplificator (Optigene). Opracowana metoda była łatwa do wykonania, szybka, dokładna i niezależna od wieku badanej rośliny. LAMP był testem mniej czułym aniżeli opisane w literaturze metody ilościowego PCR; umożliwił wykrywanie 5000 zarodników w 1 mL zawiesiny. Jest to jednak metoda znacznie łatwiejsza do wykonania i zdecydowanie tańsza, co czyni ją przydatną do detekcji P. brassicae w przypadku konieczności oceny jego obecności w licznych próbach polowych.
Źródło:
Acta Agrobotanica; 2014, 67, 4
0065-0951
2300-357X
Pojawia się w:
Acta Agrobotanica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Loop-mediated isothermal amplification as a good tool to study changing Leptosphaeria populations in oilseed rape plants and air samples
Amplifikacja DNA w warunkach izotermicznych z wykorzystaniem starterów zapętlających (LAMP), jako dobre narzędzie do badań zmian w populacji Leptosphaeria w roślinach rzepaku i w próbach powietrza
Autorzy:
Jedryczka, M.
Burzynski, A.
Brachaczek, A.
Langwinski, W.
Song, P.
Kaczmarek, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/27564.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Botaniczne
Opis:
LAMP is an innovative, simple, rapid, specific and cost- -effective nucleic acid amplification method. Due to the use of a special enzyme – GspSSD polymerase, the reaction takes a short time and can be performed at isothermal conditions. The sensitivity and specificity of LAMP technique is significantly higher, than standard PCR techniques, as two or three specific primer pairs are used. The technique is regarded as a useful tool for the detection and identification of plant pathogens. In this work, LAMP was used to study the composition of the population of fungi of the genus Leptosphaeria, causing a damaging disease of oilseed rape, called blackleg or stem canker. The detection concerned DNA present in fungal spores contained in air samples obtained using Hirst-type volumetric trap, in Pomerania (north Poland) in 2010. The results achieved using the LAMP technique were similar to these obtained with previously used, highly specific method of Real-time PCR. Conducting LAMP reaction was much easier and less time-and cost-consuming, due to a simplified method of DNA isolation of pathogens from plant tissues. Then, the LAMP technique was used to assess the composition of the population of Leptosphaeria spp. in plants of oilseed rape collected from the field in the Opole region (south-western part of Poland) in 2013. In contrast to studies conducted in 2002–2003, the analysis of leaf symptoms showed a higher proportion of L. maculans compared to L. biglobosa, what reflects changes in the composition of pathogen population of fungi causing blackleg on oilseed rape in this part of Poland.
Amplifikacja DNA w warunkach izotermicznych z wykorzystaniem starterów zapętlających (Loop Mediated Isothermal Amplification, LAMP) to innowacyjny, prosty, szybki, specyficzny i niedrogi sposób amplifikacji kwasów nukleinowych. Dzięki zastosowaniu specjalnego enzymu – polimerazy GspSSD, reakcja trwa krótko i można ją przeprowadzić w warunkach izotermicznych. Dzięki zastosowaniu 2–3 par starterów czułość i swoistość techniki jest znacznie wyższa, aniżeli w przypadku standardowych technik PCR. Technika LAMP jest uważana za użyteczne narzędzie do wykrywania i identyfikacji patogenów roślin. W niniejszej pracy przy pomocy LAMP badano skład populacji grzybów rodzaju Leptosphaeria, wywołujących groźną chorobę rzepaku, zwaną suchą zgnilizną kapustnych. Badania dotyczyły zarodników grzybów zawartych w próbach powietrza uzyskanych przy pomocy pułapki wolumetrycznej typu Hirsta, na Pomorzu w 2010 roku. Wyniki uzyskane przy pomocy techniki LAMP były bardzo zbliżone do uzyskanych przy zastosowaniu wysokoczułej metody Real-time PCR. Przeprowadzenie reakcji LAMP było znacznie łatwiejsze i mniej czaso- i kosztochłonne, ze względu na uproszczoną metodę izolacji DNA patogenów z tkanek roślinnych. Następnie metodę LAMP zastosowano do oceny składu populacji Leptosphaeria spp. w roślinach rzepaku z pól na Opolszczyźnie w 2013 roku. W przeciwieństwie do badań przeprowadzonych w latach 2002–2003, analiza objawów na liściach rzepaku wykazała wyższy udział gatunku L. maculans w porównaniu do L. biglobosa, co świadczy o zmianach w składzie populacji grzybów wywołujących suchą zgniliznę kapustnych na rzepaku w tej części Polski.
Źródło:
Acta Agrobotanica; 2013, 66, 4
0065-0951
2300-357X
Pojawia się w:
Acta Agrobotanica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Computing internodal conductivities in numerical modeling of two dimensional unsaturated flow on rectangular grid
Autorzy:
Szymkiewicz, A.
Burzyński, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/230950.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
strefa nienasycona
równanie Richarda
przewodność hydrauliczna
metoda różnic skończonych
metoda przepływu ustalonego
unsaturated zone
Richards' equation
hydraulic conductivity
finite difference method
finite volume method
Opis:
This paper compares numerical solutions of transient two-dimensional unsaturated flow equation by using different averaging schemes for internodal conductivities. Averaging methods such as arithmetic mean, geometric mean, upstream weighting, and integrated mean are taken into account, as well as a recent approach based on steady-state approximation. The latter method proved the most flexible, producing relatively accurate solutions for both downward and upward flow cases.
W artykule porównano rozwiązania numeryczne dwuwymiarowego równania przepływu nienasyconego z użyciem różnych metod uśredniania współczynnika przewodności hydraulicznej między sąsiednimi węzłami. Uwzględniono średnią arytmetyczną, geometryczną, 'pod prąd' oraz całkową, a także niedawno zaproponowany sposób uśredniania oparty na analizie przepływu ustalonego. Ten ostatni sposób okazał się najbardziej uniwersalny, gdyż umożliwiał otrzymanie stosunkowo dokładnych wyników dla przepływu wody w strefie nienasyconej zarówno w kierunku w dół jak i w górę.
Źródło:
Archives of Civil Engineering; 2011, 57, 2; 215-225
1230-2945
Pojawia się w:
Archives of Civil Engineering
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Unstructured finite-volume meshes for two-dimensional flow in variably saturated porous media
Autorzy:
Burzyński, K.
Szymkiewicz, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1934018.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Politechnika Gdańska
Tematy:
finite volume method
Richards' equation
unsaturated flow
unstructured mesh
Opis:
This paper presents a numerical algorithm for solving the equation describing variably saturated flow in porous media. The algorithm is based on a control volume finite element approach and can be applied to two-dimensional unstructured meshes consisting of triangular elements. Two methods of defining the dual control volume grid are discussed. We also demonstrate that the method of calculating the average permeability at the control volume face significantly influences numerical results.
Źródło:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk; 2011, 15, 3-4; 339-352
1428-6394
Pojawia się w:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Simulation of water flow in double-porosity soils on unstructured grids with the finite-volume method
Autorzy:
Szymkiewicz, A.
Burzyński, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1933157.pdf
Data publikacji:
2007
Wydawca:
Politechnika Gdańska
Tematy:
double-porosity soils
Richards' equation
unsaturated zone
finite volume method
unstructured grid
Opis:
Double-porosity soils consist of two interacting porous systems corresponding to weakly conductive aggregates and highly conductive inter-aggregate regions. The flow of water in such media can be described with a two-scale model obtained by homogenization. The model consists of a single macroscopic equation for the flow in the highly conductive porous system coupled with a number of micro-scale equations for the flow in the weakly conductive aggregates. In this paper we present a numerical algorithm to solve the resulting system of equations for the case of macroscopically two-dimensional flow. It is based on the finite volume approach for unstructured grid of triangular cells. Special attention is paid to the coupling of the micro- and macro-scale equations. An exemplary calculation is presented, concerning infiltration and redistribution of water in a hill-slope of double-porosity structure with cubic aggregates.
Źródło:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk; 2007, 11, 4; 397-410
1428-6394
Pojawia się w:
TASK Quarterly. Scientific Bulletin of Academic Computer Centre in Gdansk
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Examples of numerical simulations of two-dimensional unsaturated flow with VS2DI code using different interblock conductivity averaging schemes
Autorzy:
Szymkiewicz, A.
Tisler, W.
Burzyński, K.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/94209.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu
Tematy:
numerical modelling
Richards' equation
hydraulic conductivity
modelowanie numeryczne
równanie Richardsa
przewodnictwo hydrauliczne
Opis:
Flow in unsaturated porous media is commonly described by the Richards equation. This equation is strongly nonlinear due to interrelationships between water pressure head (negative in unsaturated conditions), water content and hydraulic conductivity. The accuracy of numerical solution of the Richards equation often depends on the method used to estimate average hydraulic conductivity between neighbouring nodes or cells of the numerical grid. The present paper discusses application of the computer simulation code VS2DI to three test problems concerning infiltration into an initially dry medium, using various methods for inter-cell conductivity calculation (arithmetic mean, geometric mean and upstream weighting). It is shown that the influence of the averaging method can be very large for coarse grid, but that it diminishes as cell size decreases. Overall, the arithmetic average produced the most reliable results for coarse grids. Moreover, the difference between results obtained with various methods is a convenient indicator of the adequacy of grid refinement.
Źródło:
Geologos; 2015, 21, 3; 161-167
1426-8981
2080-6574
Pojawia się w:
Geologos
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The first established focus of hantavirus infection in Poland, 2007
Autorzy:
Nowakowska, A
Heyman, P.
Knap, J.P.
Burzynski, W.
Witas, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/49751.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Tematy:
Hantavirus
Bunyaviridae
infection
Polska
hemorrhagic diathesis
acute renal failure
hemorrhagic fever with renal syndrome
hantavirus cardiopulmonary syndrome
hantavirus disease
Dobrava virus
Puumala virus
rodent-borne viral zoonosis
Źródło:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine; 2009, 16, 1; 79-85
1232-1966
Pojawia się w:
Annals of Agricultural and Environmental Medicine
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-9 z 9

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies