- Tytuł:
-
Gene expression in chilling sensitive and resistant lines of maize under low temperature treatment
Ekspresja genów u chłodowrażliwej i chłodoodpornej linii kukurydzy pod wpływem niskiej temperatury - Autorzy:
-
Mazza, R.
Bertoli, A.
Pasini, L.
Marocco, A. - Powiązania:
- https://bibliotekanauki.pl/articles/801874.pdf
- Data publikacji:
- 2006
- Wydawca:
- Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie. Wydawnictwo Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie
- Opis:
-
The chilling-susceptible virescent-2 and the tolerant Oh43 strains were used as a tool to identify genes involved in the response to low-temperature conditions. Plants were grown in a controlled environment chamber at 15°C under continuous light. Seedlings of maize exhibited chlorosis when grown at 15°C. Chlorotic leaves showed severely reduced level of photosynthetic pigments and the rate of photosynthesis. The cDNA-AFLP-TP technique was employed in order to identify the differentially expressed genes. This technique allows to obtain a unique restriction fragment from each cDNA. Application of the optimised protocol for isolating, reamplifying, cloning and sequencing transcript-derived fragments, allowed the identification of 329 sequences which were related to the virescent temperature-sensitive events. Most of the sequences, analysed with bioinformatic tools, showed a consistent homology with database entries and they were classified in several functional groups. Certain sequences showed similarities to ESTs isolated in cold-stressed plants. The gene list represents a potential source for genes with a critical role in plant acclimation to suboptimal temperatures.
Badano linie kukurydzy: chlodowrażliwą virescent-2 i odporną na chłód Oh43 w celu zidentyfikowania genów związanych z reakcją na niską temperaturę. Rośliny rosły w komorze wegetacyjnej w temperaturze 15°C przy ciągłym oświetleniu. Siewki rosnące w 15°C wykazywały chlorozę. Chlorotyczne liście charakteryzowały się znacznie obniżonym poziomem barwników fotosyntetycznych i intensywności fotosyntezy. W celu ujawnienia różnic w ekspresji genów posłużono się techniką cDNA-AFLP-TR Metoda ta pozwala na uzyskanie unikatowych fragmentów restrykcyjnych cDNA. Zastosowanie zoptymalizowanej metodyki izolacji, reamplifikacji, klonowania i sekwencjonowania fragmentów wyprowadzonych z transkryptu pozwoliło na identyfikację 329 sekwencji związanych z reakcją linii virescent na chłód. W analizie bioinformatycznej większość sekwencji wykazała ścisłą homologię z pozycjami umieszczonymi w bazach danych i została zaklasyfikowana do kilku grup funkcjonalnych. Pewne sekwencje wykazywały podobieństwa z sekwencjami EST izolowanymi z roślin stresowanych chłodem. Przebadane geny mogą należeć do grupy genów pełniących krytyczną rolę w aklimacji roślin do temperatur suboptymalnych. - Źródło:
-
Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych; 2006, 509
0084-5477 - Pojawia się w:
- Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych
- Dostawca treści:
- Biblioteka Nauki
Artykuł