- Tytuł:
-
Optymalizacja metod detekcji mutacji w genie Nud indukowanej przez technologię CRISPR/Cas9 w jęczmieniu zwyczajnym (Hordeum vulgare L.)
Optimization of mutation detection methods in the NUD gene induced by CRISPR / CAS9 technology in barley (Hordeum vulgare L.) - Autorzy:
-
Przyborowski, Mateusz
Gasparis, Sebastian
Orczyk, Wacław
Nadolska-Orczyk, Anna - Powiązania:
- https://bibliotekanauki.pl/articles/2199916.pdf
- Data publikacji:
- 2019-11-30
- Wydawca:
- Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
- Tematy:
-
CRISPR / Cas9
edytowanie genomu
gen Nud
jęczmień zwyczajny
sondy molekularne
genome editing
Nud gene
barley
molecular probes - Opis:
-
Celem pracy był wybór optymalnej metody detekcji mutacji w genie Nud indukowanej z wykorzystaniem technologii CRISPR/Cas9 w jęczmieniu zwyczajnym. Testowano cztery powszechnie wykorzystywane techniki genotypowania: polimorfizm długości fragmentów restrykcyjnych (RFLP), trawienie enzymatyczne przy użyciu endonukleazy I z bakteriofaga T7, wysokorozdzielczą krzywą topnienia produktu reakcji łańcuchowej polimerazy (HRM-PCR) oraz sondy molekularne. W toku prowadzonych prac stwierdzono, że najkorzystniejszym sposobem wykrywania mutacji indukowanej techniką CRISPR/Cas9 jest metoda oparta o sondy molekularne. Daje ona jednoznaczne i powtarzalne wyniki ale jednocześnie wymaga użycia zawansowanej aparatury.
The aim of the study was to select the optimal method for mutation detection in the Nud gene induced by using the CRISPR / Cas9 technology in barley. Four commonly used genotyping techniques were tested: restriction fragment length polymorphism (RFLP), enzymatic digestion using endonuclease I from T7 bacteriophage, high resolution melting curve of polymerase chain reaction product (HRM-PCR) and molecular probes. Findings in the current study suggest that the most favorable way for detecting mutations induced by the CRISPR / Cas9 technique is a method based on molecular probes. It enables to receive clear and repeatable results but at the same time requires the use of advanced equipment. - Źródło:
-
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2019, 287; 33-34
0373-7837
2657-8913 - Pojawia się w:
- Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
- Dostawca treści:
- Biblioteka Nauki
Artykuł