- Tytuł:
-
Semi-automatic count of hepatic stellate cells from microscopic in-vitro images by modeling elliptical nuclei
Półautomatyczna metoda zliczania komórek gwiaździstych wątroby na mikroskopowych obrazach in-vitro przez modelowanie ich eliptycznych jąder - Autorzy:
-
Bołdak, C.
Sadowski, M.
Jaroszewicz, J. - Powiązania:
- https://bibliotekanauki.pl/articles/341137.pdf
- Data publikacji:
- 2008
- Wydawca:
- Politechnika Białostocka. Oficyna Wydawnicza Politechniki Białostockiej
- Tematy:
-
przetwarzanie obrazów medycznych
zliczanie komórek
komórki gwiaździste wątroby
medical image processing
cell count
hepatic stellate cells - Opis:
-
A new method of semi-automatic liver cell counting is presented. Instead of segmenting the cells bodies (not regular and fragmented in some stages of the cells life) it localizes the cells nuclei which are bright, homogeneous and elliptical structures with darker body (body fragments) on their circumference. The nuclei are modeled by ellipses which can be found in two manners: by local region growing algorithm and by reconstruction of the ellipse equation from its contour points. The found ellipses set is then downsized (since all possible ellipses are initially considered) by eliminating the closest one to another and the worst ones by mean of a special fitness function. The method is implemented as a visual, multiplatform JAVA application, easy to use in the scientific every-day work. It is evaluated on real microscopic in-vitro images of the hepatic stellate cells.
W artykule tym zaprezentowana jest nowa, półautomatyczna metoda zliczania komórek wątroby. Zamiast skupiać sięna ciałach komórek (w niektórych fazach ich życia nieregularnych i pofragmentowanych) lokalizuje ona ich jądra, które są jasnymi, jednolitymi i eliptycznymi strukturami otoczonymi przez ciemniejsze ciało (lub jego fragmenty). Jądra komórek są modelowane na 2 sposoby: przez lokalny algorytm rozrostu obszaru i przez odtworzenie równania elipsy z jej punktów na obwodzie.Wśród wszystkich znalezionych elips (początkowa każda jej potencjalna lokalizacja jest brana pod uwagę) wybierane są lokalnie najlepsze oraz te, których dopasowanie, mierzone specjalną funkcją, jest powyżej pewnego progu. Metoda została zaimplementowana jako graficzna, wieloplatformowa, przyjazna dla użytkownika aplikacja w języku JAVA. Jej działanie zostało ocenione na rzeczywistych mikroskopowych obraz in-vitro komórek wątroby. - Źródło:
-
Zeszyty Naukowe Politechniki Białostockiej. Informatyka; 2008, 3; 23-38
1644-0331 - Pojawia się w:
- Zeszyty Naukowe Politechniki Białostockiej. Informatyka
- Dostawca treści:
- Biblioteka Nauki
Artykuł