Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "Pyricularia grisea" wg kryterium: Wszystkie pola


Wyświetlanie 1-2 z 2
Tytuł:
Genetic and molecular characterization of populations of Pyricularia grisea from rice
Genetyczna i molekularna charakterystyka populacji Pyricularia grisea z ryżu
Autorzy:
Safari Motlagh, M.R.
Habibi, F.
Ebadi, A.A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11543027.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Opis:
Pyricularia grisea, the causal agent blast disease in rice, is considered as one of the most important fungus in paddy fields. Isolates of Pyricularia grisea were analyzed by SSR to determine the amount of genetic variability in populations. Fourteen primers were applied and DNA bands of 95-640 bp were produced. Cluster analysis using UPGMA method gave three groups. Group 1 was the major group and most of isolates which collected from west of Guilan belonged to this group. Groups 2 and 3 belonged to the center of Guilan isolates and the east of Guilan isolates, respectively. The results revealed although genetic distance was high between isolates of west and east of Guilan and the genetic similarity among these isolates of these two populations was low, but there was the maximum of genetic distance or the minimum of genetic similarity between the population of center of Guilan isolates and population of east of Guilan isolates. The minimum of genetic distance or the maximum of genetic similarity there was between the population of center of Guilan isolates and population of west of Guilan isolates. Overall, results confirmed that microsatellite primers are good and suitable markers for analyzing the population structure of Pyricularia grisea.
Pyricularia grisea, przyczyna choroby ryżu, jest uważany za jeden z najważniejszych grzybów na polach ryżowych. Izolaty Pyricularia grisea zostały zanalizowane przez SSR w celu określenia zróżnicowania genetycznego w populacjach. Zastosowano czternaście starterów i stworzono pasma DNA 95-640 bp. Analiza skupień przy użyciu metody UPGMA dała trzy grupy. Grupa 1 była główną grupą i większość izolatów zebranych na zachodzie prowicji Guilan należało do tej grupy. Grupy 2 i 3 to izolaty zebrane, odpowiednio, w środkowej i wschodniej części Guilan. Wyniki ukazały, że chociaż odległość genetyczna pomiędzy izolatami z zachodniej i wschodniej części Guilan była wysoka, a podobieństwo genetyczne między izolatami z tych dwóch populacji było niskie, to istniała maksymalna odległość genetyczna lub minimalne podobieństwo genetyczne między izolatami populacji ze środkowej części i wschodniej części Guilan. Najmniejsza odległość genetyczna lub największe podobieństwo genetyczne istniało między populacją ze środkowej części Guilan a populacją z zachodniej części. Podsumowując, wyniki badań potwierdziły, że mikrosatelitarne startery są dobrymi i odpowiednimi markerami do analizy struktury populacji Pyricularia grisea.
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus; 2015, 14, 5; 83-97
1644-0692
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Genetic diversity of Pyricularia grisea, the causal agent of rice blast by SRR
Genetyczna różnorodność Pyricularia grisea, czynnika wywołującego zarazę ryżową przez SRR
Autorzy:
Motlagh, M.R.S.
Hbibi, F.
Ebadi, A.A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/11543275.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie
Tematy:
genetic diversity
Pyricularia grisea
fungi
rice blast
plant disease
simple sequence repeat
Opis:
Pyricularia grisea, the rice blast fungus is the main pathological threats to rice crop in Iran and worldwide. In this research was evaluated the genetic diversity of P. grisea collected from different fields of Guilan province by using of 14 microsatellite primers. These primers produced 64 polymorphic bands by an average of 4.57 bands for each marker. An average of polymorphic information content in whole primers was 0.734, an average of effective number of alleles was 2.68, an average of Nei’s expected heterozygosity was 0.734 and an average of Shannon’s information index was 1.05. Primer SSR43,44 had the most polymorphic information content (PIC = 0.85), observed number of alleles (na = 8), effective number of alleles (ne = 3.76), Nei’s expected heterozygosity (Ne = 0.861) and Shannon’s information index (I = 1.38). This marker was the best primer between 14 used primers for evaluation the genetic diversity of P. grisea. Cluster analysis was done with simple matching similarity matrix and UPGMA method. The results showed that the studied isolates were classified into 3 lineages by cutting off the dendrogram at 0.76 similar linkage level. Number 1 was the major group and represented most of those isolates. Results of principal coordinate analysis also divided the isolates into three groups exactly similar to obtained with cluster analysis. Overall, our results confirmed that microsatellite primers were good and suitable markers for analyzing structure of P. grisea
Pyricularia grisea, grzyb zarazy ryżowej, jest zagrożeniem dla plonów ryżu w Iranie i na całym świecie. W niniejszym badaniu przy użyciu 14 markerów mikrosateklitarnych oceniano różnorodność genetyczną P. grisea zebranego z różnych pól prowincji Guilan. Markery te tworzyły 64 polimorficznych wiązać przy średnio 4,57 wiązaniach dla każdego markera. ĝrednia informacji polimorficznych we wszystkich markerach wynosiła 0,734, średnia efektywna liczba alleli – 2,68, średnia heterozygotyczność oczekiwana Nei – 0,734 a średni indeks informacji Shannon – 1,05. Marker SSR43,44 miał największą zawartość informacji polimorficznej (PIC = 0.85), największą liczbę alleli obserwowanych (na = 8), liczbę efektywnych alleli (ne = 3.76), największą heterozygotyczność oczekiwaną Nei (Ne = 0,861) i indeks informacji Shannon (I = 1.38). Był to najlepszy spośród 14 markerów użytych do oceny różnorodności genetycznej P. grisea. Analizę skupieć przeprowadzono za pomocą prostego współczynnika simple maching oraz metody UPGMA. Na podstawie wyników badać izolaty zaklasyfikowano do 3 linii przez odcięcie dendogramu na podobnym poziomie powiązać 0,76. Numer 1 był główną grupą i reprezentował większość tych izolatów. Wyniki analizy głównych współrzędnych także dzieliły izolaty na trzy grupy podobne do tych, które otrzymano za pomocą analizy skupieć. Podsumowując, wyniki badać potwierdziły, że markert mikrosatelitarne to dobre i odpowiednie markery do analizy struktury P. grisea.
Źródło:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus; 2015, 14, 1; 15-28
1644-0692
Pojawia się w:
Acta Scientiarum Polonorum. Hortorum Cultus
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-2 z 2

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies