- Tytuł:
- Assessment of genetic variability in common whitefish from the catchment area of the Oder river using microsatellite markers
- Autorzy:
-
Achrem, Magdalena
Skuza, Lidia
Kirczuk, Lucyna
Domagała, Józef
Pilecka-Rapacz, Małgorzata
Czerniawski, Robert - Powiązania:
- https://bibliotekanauki.pl/articles/1386124.pdf
- Data publikacji:
- 2017
- Wydawca:
- Uniwersytet Szczeciński. Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Szczecińskiego
- Tematy:
-
Coregonus maraena
SSR
genetic variability - Opis:
-
Common whitefish (Coregonus maraena) in Poland belongs to the endangered species. The degradation of the environment causes common whitefish to lose its natural reproduction sites. The natural genetic structure of whitefish has been compromised by anthropogenetic activities involving eutrophication, river regulation, the introduction of non-native species and as well as excessive exploitation of the species. The genetic variability of common whitefish (Coregonus maraena) from 2 sites: Pomeranian Bay and the lower Oder river, was assessed using microsatellite markers. A total of 45 caught individuals were analysed (26 from Pomeranian Bay and 19 from the Oder river). Polymorphism at nine loci, Str60INRA, Str73INRA, Strutta 12, OmyFgt1TUF, Str85INRA, Str591INRA, Ssa85, Ssa197, T3-13 was assessed. The results indicated that all the investigated populations showed a high level of genetic variability. The level of genetic variability was determined using the FST parameter and was high investigated populations (0.215). Microsatellite analysis demonstrated a higher observed heterozygosity as compared with the expected heterozygosity in all the investigated populations. The FIS coefficient values below zero in all the investigated populations of common whitefish indicate the excess of heterozygotes. The high number of heterozygotes may be related with a more intense influx of genes from outside of the local population. The study demonstrated that microsatellite markers (SSR) are very useful in the assessment of the genetic variability of common whitefish (Coregonus maraena). Our results characterize the selected populations of whitefish and may be useful for further research on this endangered species.
Sieja (Coregonus maraena) w Polsce zaliczana jest do gatunków zagrożonych. Degradacja ich naturalnego środowiska spowodowała, że gatunek ten traci miejsca naturalnego rozrodu. Naturalna struktura genetyczna siei została naruszona przez działania antropogeniczne z udziałem eutrofizacji, regulacji rzek, wprowadzaniem gatunków obcych, jak również nadmierną eksploatację tego gatunku. Zmienność genetyczną dwóch populacji siei (Coregonus maraena) z Zatoki Pomorskiej i Dolnej Odry oceniano za pomocą markerów mikrosatelitarnych. W sumie analizowano 45 pozyskanych osobników (26 z Zatoki Pomorskiej i 19 z Dolnej Odry). W pracy oceniano polimorfizm dziewięciu loci: Str60INRA, Str73INRA, Strutta 12 OmyFgt1TUF, Str85INRA, Str591INRA, Ssa85, Ssa197, T3-13. Wyniki wskazują, że obie badane populacje wykazywały wysoką zmienność genetyczną. Stopień zmienności genetycznej ustalono za pomocą parametru FST i była ona wysoka dla badanych populacji – wynosiła 0,215. Analiza sekwencji mikrosatelitarnych wykazała wyższą obserwowaną heterozygotyczność w porównaniu z heterozygotycznością oczekiwaną wszystkich badanych populacji. Wartości współczynników FIS poniżej zera we wszystkich badanych populacjach siei ukazuje nadmiar heterozygot. Wysoka liczba heterozygot może być związana z bardziej intensywnym napływem genów spoza lokalnej populacji. Niniejsze badania ukazały, że markery mikrosatelitarne (SSR) markerów są bardzo przydatne w ocenie zmienności genetycznej siei (Coregonus maraena). Nasze wyniki ukazały charakterystykę dwóch wybranych populacji siei i mogą być przydatne do dalszych badań dotyczących tego zagrożonego gatunku. - Źródło:
-
Acta Biologica; 2017, 24; 5-13
2450-8330
2353-3013 - Pojawia się w:
- Acta Biologica
- Dostawca treści:
- Biblioteka Nauki
Artykuł