Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "next-generation" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-5 z 5
Tytuł:
Multipleksowa detekcja gatunków Phytophthora przy użyciu platformy Fluidigm
Multiplex detection of Phytophthora spp. using the Fluidigm platform
Autorzy:
Sikora, K.
Oszako, T.
Kubiak, K.
Nowakowska, J.A.
Malewski, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2142612.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Instytut Badawczy Leśnictwa
Tematy:
forest soil
oomycetes
oak dieback
pathogens
next generation sequencing
gleby leśne
oomycety
zamieranie dębów
patogeny
sekwencjonowanie nowej generacji
Opis:
The genus Phytophthora plays an important role not only in agriculture but also in forest ecosystems. As the number of known Phytophthora species continues to grow, identifying new isolates in this genus has become increasingly challenging even by DNA sequencing. Therefore, the development of proper techniques for detection and identification is crucial for monitoring and control of these pathogens in the forestry sector. In recent years, new molecular methods using innovative approaches have indeed been developed. However, the majority of these methods was designed to detect single Phytophthora species. Techniques that are able to target multiple species would offer advantages, especially for the assessment of Phytophthora diversity in the environment. This paper describes a multiplex assay for the identification of eight Phytophthora isolates, down to the species level, based on a Fluidigm platform employing pyrosequencing. The obtained results showed that for an accurate determination of the species, it is sufficient to know the sequence of two markers, ITS and COX1. The sensitivity of this test is sufficient to identify Phytophthora in a pure culture. Unfortunately, analysis based on a pyrosequencing platform does not provide enough data to simultaneous identify multiple Phytophthora species in samples collected in the field. This problem could be resolved in the future by sequencing using more efficient platforms like Illumina or IonTorrent.
Źródło:
Leśne Prace Badawcze; 2020, 81, 4; 161-166
1732-9442
2082-8926
Pojawia się w:
Leśne Prace Badawcze
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie analiz kopalnego DNA w badaniach osadów czwartorzędowych
Applications of sedimentary ancient DNA analyses in geological Quaternary research
Autorzy:
Demianiuk, E. J.
Majewski, W.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2075809.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Państwowy Instytut Geologiczny – Państwowy Instytut Badawczy
Tematy:
analiza kopalnego DNA
sekwencjonowanie nowej generacji
NGS
paleogenetyka
paleośrodowisko
paleobioróznorodność
sedimentary ancient DNA
Next Generation Sequencing
paleogenetic
paleoenvironments
paleobiodiversity
Opis:
During the past few decades genetic research has been developed in parallel with paleogenetics. A dynamic progress in this field of studies is possible due to the advance in laboratory and computer technologies. Today, scientists have the Next Generation Sequencing methods at their disposal, which enable them to read millions ofsequences at the same time, thus furthermore significantly reducing time needed for laboratory procedures. Concurrently, costs of analysis and equipment have been decreasing, which makes paleogenetical analyses widely available. They are commonly used in medicine, biotechnology, genetic engineering, food industry and forensics, as well as in life sciences like biology, paleobiology, archeology, geology and environmental protection sciences. This paper presents seda DNA (sedimentary ancient DNA) analyses and their use in Quaternary research, as well as describes sources of DNA in sediments and main processes contributing to its degradation or preservation.
Źródło:
Przegląd Geologiczny; 2018, 66, 11; 680--691
0033-2151
Pojawia się w:
Przegląd Geologiczny
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody sekwencjonowania nowej generacji oraz ich wykorzystanie w genetyce, hodowli i biotechnologii roślin
Application of Next Generation Sequencing methods in genetics, plant breeding and biotechnology
Autorzy:
Orłowska, M.
Sobczyk, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/270478.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Centralny Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Aparatury Badawczej i Dydaktycznej, COBRABiD
Tematy:
NGS
pirosekwencjonowanie
sekwencjonowanie nowej generacji
sekwencjonowanie przez ligację
sekwencjonowanie przez syntezę
pyrosequencing
next generation sequencing
sequencing by ligation
sequencing by synthesis
Opis:
W niniejszej pracy przedstawiono i scharakteryzowano metody sekwencjonowania nowej generacji – NGS (ang. Next-Generation Sequencing). W tym krótkim przeglądzie zaprezentowano najważniejsze techniki sekwencjonowania drugiej generacji. Metody te umożliwiają odczytanie kolejności nukleotydów w łańcuchu DNA. Szybki rozwój technik sekwencjonowania zaczął się na początku lat 70. XX wieku, kiedy to opublikowano dwie techniki pierwszej generacji – metodę Sangera, na której bazują techniki NGS, oraz metodę Maxama i Gilberta. Późniejsze ich modyfikacje (m.in. wprowadzenie elektroforezy kapilarnej, fluorescencyjne znakowanie nukleotydów, zastosowanie mikroprocesora) doprowadziły do pełnej automatyzacji procesu i przyczyniły się do jego udoskonalenia. Obecnie metody NGS są narzędziem wykorzystywanym w wielu dziedzinach nauki, m.in. w genetyce, biotechnologii, biologii molekularnej i w nowoczesnej hodowli roślin. Technologie prezentowane w artykule cechują się wieloma zaletami, ale nie są też pozbawione wad. Dokładność odczytu sekwencji oraz ogólne koszty eksploatacyjne wskazują na to, że najbardziej obiecująca metoda sekwencjonowania nowej generacji opiera się na systemie SOLiD. Z kolei zaś sekwencjonowanie poprzez ligację (platforma SOLIiD) oprócz dużej dokładności charakteryzuje się dłuższym czasem analiz w porównaniu do innych omawianych metod.
In this article next generation sequencing (NGS) methods were characterized. This short review focus on the most important methods of second and third generation sequencing techniques. NGS techniques give unique opportunity to read nucleotides order in DNA strand. Fast, rapid development and progress of genetic sequencing methods began in the seventies. Then two new sequencing techniques were established – enzymatic method (Sanger’s sequencing), chemical method (Maxam’s and Gilbert’s sequencing). Later modifications such as use of capillary electrophoresis, fluorescent nucleotides and application of microprocessor led to total automation of the process and contributed to the methods improvements. Nowadays NGS methods are tools used in many scientific fields e.g. genetic, biotech- nology, molecular biology and modern plant breeding programs. Technologies presented in this article have many advantages, but are also not without flaws. Reading accuracy and the overall costs indicate that method based on SOLiD system is the most promising next generation sequencing. Sequencing by ligation (SOLiD) characterized by high precision but also run time is longer compared to the other method described in this article.
Źródło:
Aparatura Badawcza i Dydaktyczna; 2017, 22, 1; 54-61
2392-1765
Pojawia się w:
Aparatura Badawcza i Dydaktyczna
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Historia biologiczna populacji Homo sapiens zamieszkujących centralną i wschodnią części Europy
Biological history of Homo sapiens populations living in Central and Eastern Europe
Autorzy:
Marcinkowska-Swojak, Małgorzata
Stolarek, Ireneusz
Zeńczak, Michał
Handschuh, Luiza
Figlerowicz, Marek
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2197849.pdf
Data publikacji:
2023-03-31
Wydawca:
Wydawnictwo Adam Marszałek
Tematy:
historia biologiczna
Homo sapiens
archeogenomika
sekwencjonowanie nowej generacji
kopalny DNA (aDNA)
haplogrupy mitochondrialnego DNA
haplogrupy chromosomu Y
biological history
archaeogenomics
next-generation sequencing
ancient DNA (aDNA)
mitochondrial DNA haplogroups
Y-chromosome haplogroups
Opis:
Archaeogenomis is a recently developed interdisciplinary research field that utilizes advanced molecular biology techniques, especially DNA sequencing, to study the history of biological species, including humans. Analyses of ancient genomes provide independent information about human ancestors and their migrations, allowing researchers to uncover history of mankind. Here, we present the fundamental principles of archaeogenomics and its application in the studies of biological history of the populations inhabiting central-east Europe.
Źródło:
Historia Slavorum Occidentis; 2023, 1(36); 143-165
2084-1213
Pojawia się w:
Historia Slavorum Occidentis
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identyfikacja bliźniąt monozygotycznych w dobie sekwencjonowania nowej generacji
Identification of monozygotic twins in the era of next‑generation sequencing
Autorzy:
Masny, Aleksander
Wysocka, Bożena
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/27177759.pdf
Data publikacji:
2022
Wydawca:
Centralne Laboratorium Kryminalistyczne Policji
Tematy:
bliźnięta monozygotyczne
sekwencjonowanie
sekwencjonowanie nowej generacji
analiza
epigenomu
identyfikacja genetyczna bliźniąt
monozygotic twins
next‑
generation sequencin
epigenome analysis
genetic identification of twins
Opis:
Bliźnięta monozygotyczne stanowią wyzwanie dla kryminalistyki ze względu na brak standaryzowanych narzędzi do ich różnicowania w obrębie pary, utrudniający lub uniemożliwiający sądowi ustalenie, które z bliźniąt jest sprawcą przestępstwa. Pojawienie się technologii sekwencjonowania nowej generacji, sekwencjonowania całogenomowego oraz analiz epigenomu ludzkiego otworzyło drogę do identyfikacji bliźniąt monozygotycznych w celach kryminalistycznych. Kwestią otwartą pozostaje odsetek bliźniąt monozygotycznych, który można różnicować, oraz poziom wiarygodności uzyskanych wyników. Dowody uzyskane za pomocą sekwencjonowania całogenomowego, w sprawach dotyczących identyfikacji bliźniąt monozygotycznych, budzą wątpliwości sądów. Wraz z nowymi technologiami pojawiał się szereg pytań odnośnie do ich parametrów: siły różnicowania, poziomu wiarygodności wyniku, sposobów walidacji metod oraz zagadnień natury prawnej. Nowe technologie identyfikacji bliźniąt wymagają dostosowania do wymagań stawianych metodom kryminalistycznym: weryfikacji, walidacji i standaryzacji tych metod oraz jednolitego podejścia do interpretacji wyników, aby mogły być powszechnie stosowane w kryminalistyce i uznawane przez sądy za wiarygodne dowody.
Monozygotic twins pose a challenge to forensic science due to the lack of standardized tools to differentiate them within a pair, and thus making it difficult or impossible for a court to determine which of the twins is the perpetrator of the crime. The advent of next‑generation sequencing technologies, whole‑genome sequencing, and analyses of the human epigenome, has opened the way to the identification of monozygotic twins for forensic purposes. The percentage of monozygotic twins that can be differentiated and the level of reliability of results remain an issue open for investigation. Identification of monozygotic twins through whole‑genome sequencing raises doubts in the courts. New technologies raised a number of questions regarding the parameters: the power of differentiation, the level of reliability of the result, validation method and legal issues. New twin identification technologies require adapting to the requirements for forensic methods: verification, validation and standardization, as well as a uniform approach to the interpretation of results, so that they can be widely used in forensics and recognized by courts as reliable evidence.
Źródło:
Problemy Kryminalistyki; 2022, 318; 5-13 (pol), 38-45 (eng)
0552-2153
Pojawia się w:
Problemy Kryminalistyki
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-5 z 5

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies