Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "gel electrophoresis" wg kryterium: Wszystkie pola

  Lista filtrów
Wyrównaj
    Wyświetlanie 1-5 z 5
    Tytuł:
    Native nucleic acid electrophoresis as an efficient alternative for genotyping method of influenza virus
    Autorzy:
    Pajak, Beata
    Lepek, Krzysztof
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1039250.pdf
    Data publikacji:
    2014
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Biochemiczne
    Tematy:
    gel electrophoresis
    SSCP
    influenza
    minor genetic variants
    Opis:
    Influenza viruses are the worldwide major causative agents of human and animal acute respiratory infections. Some of the influenza subtypes have caused epidemics and pandemics among humans. The varieties of methods are available for the rapid isolation and identification of influenza viruses in clinical and environmental samples. Since nucleic acids amplification techniques such as RT-PCR have been adapted, fast and sensitive influenza type and subtype determination is possible. However, in some ambiguous cases other, more detailed assay might be desired. The genetic material of influenza virus is highly unstable and constantly mutates. It is known that single nucleotide polymorphisms (SNPs) results in resistance to commercially available anti-viral drugs. The genetic drift of the virus could also result in weakening of immune response to infection. Finally, in a substantial number of patients co-infection with various virus strains or types has been confirmed. Although the detection of co-infection or presence of minor genetic variants within flu-infected patients is not a routine procedure, a rapid and wide spectrum diagnostics of influenza virus infections could reveal an accurate picture of the disease and more importantly, is crucial for choosing the appropriate therapeutics and virus monitoring. Herein we present the evidences that native gel electrophoresis and MSSCP - a method based on multitemperature single strand conformation polymorphism could furnish a useful technique for minor variants, which escape discovery by conventional diagnostic assays.
    Źródło:
    Acta Biochimica Polonica; 2014, 61, 3; 479-483
    0001-527X
    Pojawia się w:
    Acta Biochimica Polonica
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Dwuwymiarowa elektroforeza żelowa: od eksperymentu po profile ekspresji. Część pierwsza - eksperyment
    Two-dimensional gel electrophoresis: from experiment to protein expresion profiles. Part one - experiment
    Autorzy:
    Suchwałko, A.
    Podbielska, H.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/262044.pdf
    Data publikacji:
    2010
    Wydawca:
    Politechnika Wrocławska. Wydział Podstawowych Problemów Techniki. Katedra Inżynierii Biomedycznej
    Tematy:
    elektroforeza żelowa
    2DE
    eksperyment
    analiza obrazu
    schemat analizy 2-DE
    gel electrophoresis
    2-DE
    experiment
    image analysis
    2-DE analysis workflow
    Opis:
    Dwuwymiarowa (dwukierunkowa) elektroforeza żelowa (2-DE) jest metodą znaną od lat 70. poprzedniego stulecia. Zainteresowanie badaczy metodą 2-DE wynika z możliwości separacji nawet kilku tysięcy białek w jednym żelu, co pozwala na ich detekcję i identyfikację. Dzięki wysokiej rozdzielczości wyników separacji możliwe staje się ustalenie roli biologicznej poszczególnych białek czy odkrywanie wpływu czynników zewnętrznych na organizmy żywe na poziomie proteomu. Metoda 2-DE wciąż ewoluuje. W ostatniej dekadzie nastąpił ogromny postęp w sposobie przeprowadzania eksperymentów z dużą powtarzalnością. Zmieniło się też całkowicie podejście do analizy obrazów żeli i wykorzystywane do tego celu algorytmy. Ze względu na tak szybki rozwój technik dwuwymiarowej elektroforezy żelowej autorzy postanowili przedstawić obecny stan wiedzy w tym zakresie. Praca składa się z dwu części. W pierwszej opisano zmiany, jakie zaszły w technikach przeprowadzania eksperymentów elektroforetycznych. Druga część skupia się na analizie obrazów uzyskanych za pomocą metody 2-DE, z uwzględnieniem zmian w schemacie analizy. Pierwsza część pracy koncentruje się na eksperymencie dwuwymiarowej elektroforezy żelowej. Opisano poszczególne kroki eksperymentu: od przygotowania próbki, przez ładowanie próbek do pierwszego wymiaru, IEF, SDS-PAGE, barwienie żeli, aż po zapis obrazów żeli. Praca nie porusza szczegółów biochemicznych eksperymentu. Opisane zostały również formaty plików, technika DIGE, wpływ eksperymentu na dalszą analizę, modyfikacje posttranslacyjne oraz pozyskanie próbek protein z żeli do ewentualne identyfikacji za pomocą innych technik proteomicznych.
    Two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) is a method commonly used since seventies of the previous century. It owns its non weakening interest of researchers because of the possibility of separation even a few thousands of proteins in one gel, what allows for protein detection and identification. Thanks to high resolution of separation results, it is possible to determine a biological role of particular proteins or to discover influence of external factors on living organisms on the proteome level. Though 2-DE is still evolving. In the last decade, a great progress has been made in the way of performing experiments and their reproducibility. Approach to the analysis of gel images and algorithms used for the analysis have been entirely changed. For the reason of such instant changes of methods and techniques of the two-dimensional gel electrophoresis, the authors decided to describe state of the art. This work consists of two parts. The first part describes changes that have been made in performing of electrophoretic experiments. The second part concentrates on the analysis of obtained images, with emphasis the analysis workflow. The first part focuses on the experiment of the dwo-dimensional gel electrophoresis. Description of particular steps of the experiment is given: from the sample preparation, through loading of samples for the first dimension, IEF, SDS-PAGE, gels staining, to recording of gel images. This work does not bring up biochemical details of the experiment. File formats, DIGE technology, influence of the expriment on the further analysis, posttraslational modifications and acquisition of protein samples from gels for identification using other proteomic techniques have been described in detail.
    Źródło:
    Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna; 2010, 16, 3; 285-292
    1234-5563
    Pojawia się w:
    Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Dwuwymiarowa elektroforeza żelowa: od eksperymentu po profile ekspresji. Część druga - analiza obrazu
    Two-dimensional gel electrophoresis: from experiment to protein expresion profiles. Part two - image analysis
    Autorzy:
    Suchwałko, A.
    Podbielska, H.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/261982.pdf
    Data publikacji:
    2010
    Wydawca:
    Politechnika Wrocławska. Wydział Podstawowych Problemów Techniki. Katedra Inżynierii Biomedycznej
    Tematy:
    elektroforeza żelowa
    2DE
    analiza porównawcza
    schemat analizy 2-DE
    mapa proteomowa
    segmentacja obrazu
    detekcja plam
    identyfikacja protein
    gel electrophoresis
    2-DE
    differential image analysis
    2-DE analysis workflow
    proteome map
    image segmentation
    spot detection
    protein identification
    Opis:
    Dwuwymiarowa (dwukierunkowa) elektroforeza żelowa (2-DE) jest metodą znaną od lat siedemdziesiątych poprzedniego stulecia. Zainteresowanie badaczy metodą 2-DE wynika z możliwości separacji nawet kilku tysięcy białek w jednym żelu, co pozwala na i ch detekcję i identyfikację. Dzięki wysokiej rozdzielczości wyników separacji możliwe staje się ustalenie roli biologicznej poszczególnych białek czy odkrywanie wpływu czynników zewnętrznych na organizmy żywe na poziomie proteomu. Metoda 2-DE wciąż ewoluuje. W ostatniej dekadzie nastąpił ogromny postęp w sposobie przeprowadzania eksperymentów z dużą powtarzalnością. Zmieniło się też całkowicie podejście do analizy obrazów żeli i wykorzystywane do tego celu algorytmy. Ze względu na tak szybki rozwój technik dwuwymiarowej elektroforezy żelowej, autorzy postanowili przedstawić obecny stan wiedzy w tym zakresie. Praca składa się z dwu części. W pierwszej opisano zmiany, jakie zaszły w technikach przeprowadzania eksperymentów elektroforetycznych. Draga część skupia się na analizie obrazów uzyskanych za pomocą metody 2-DE, z uwzględnien i em zmian w schemacie analizy. Druga część pracy to opis dwóch schematów analizy: klasycznego i obecnie stosowanego. Szczegółowo opracowane zostały metody analizy pojedynczego obrazu 2-DE oraz analizy porównawczej serii obrazów. Przedstawione są algorytmy stosowane do normalizacji, segmentacji obrazu, detekcji plam, dopasowywania do siebie obrazów czy tworzenia map proteomowych jako najważniejsze w całej analizie. Opisano również generowanie profili ekspresji, metody identyfikacji protein oraz internetowe bazy danych 2-DE. Autorzy nie pominęli tak ważnego zagadnienia, jak sposoby porównywania systemów analizujących dane 2-DE. Ta część pracy podsumowuje rozwój, jaki nastąpił wostatnim dziesięcioleciu w metodach stosowanych w analizie komputerowej obrazów 2-DE, którego najważniejszym krokiem było opracowanie nowego schematu analizy, opartego na tworzeniu map proteomowych.
    Two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) is a method commonly used since seventies of the previous cesatury. It owns its non weakening interest of researchers because of the possibility of separation even a few thousands of proteins in one gel, what allows for protein detection a n d identification. Thanks to high resolution of separation results, it is possible to determine a biological role of particular proteins or to discover influence of extemal factors on living organisms on t h e proteome level. 2-DE i s stilł evolving. In t h e last decade, a great progress has be en made in t h e way of performing experiments and their reproducibility. Approach to the analysis of gel images and algorthms used for the analysis have been entirely changed. For the reason of suchinstant changes of methods a n d techniques of the two-dimensional gel electrophoresis, the authors decided to describe state of the art. This work consists of two parts. The first part describes changes that have b e e n made in performing of electrophoretic experiments. The second part concentrates on the analysis of obtained images, with emphasis the analysis workflow. Second part is a description of two analysis workflows: the classical one and the currentiy used one. Analysis methods of the single 2-DE image and differential analysis of the image series are discussed in detail. Algorthms used for normalization, image segmentation, spot detection, image warping and creation of proteome maps are intrcduced as th e most crucial in the whole analysis. Generation of expression profiles, protein Identification methods, and the Internet databases of the 2-DE data are described. Authors have not missed as important issue as methods of comparison of systems for 2-DE data analysis. This part of the work summarises development that has been made for the last ten years in th e methods used for the computer analysis of 2-DE images. The most important step of this development was elaborat i on of the workflow based on creation of proteome maps.
    Źródło:
    Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna; 2010, 16, 4; 372-380
    1234-5563
    Pojawia się w:
    Acta Bio-Optica et Informatica Medica. Inżynieria Biomedyczna
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Linkage of two mutant allozymes for Amp2 and Aat2 with marker loci on barley [Hordeum vulgare L.] chromosomes 1 and 6
    Autorzy:
    Kucharska, M
    Kaczorowska, K.
    Ali, E.S.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2048291.pdf
    Data publikacji:
    1998
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    chromosome
    starch
    isoenzyme
    barley
    linkage
    gel electrophoresis
    mutant
    allozyme
    genetic analysis
    Hordeum vulgare
    genetic marker
    Opis:
    To saturate barley (Hordeum vulgare L.) genetic maps the linkage relationships of two isoenzyme loci Amp2 (aminopeptydase) and Aat2 (aspartate aminotransferase) with known genetic markers were investigated. Results of the genetic analysis support previous information on the localization of these loci on chromosome 1 and 6, respectively. The following recombination values were estimated: between locus Amp2 and T1-3b translocation break point 13.8 ± 2.1%, between locus Aat2 and translocation T6-7i, 17 ± 3.0% and between locus Aat2 and marker о 24.1 ± 3.0%.
    Źródło:
    Journal of Applied Genetics; 1998, 39, 2; 147-150
    1234-1983
    Pojawia się w:
    Journal of Applied Genetics
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Partial characterization of Sunn-hemp mosaic tobamovirus [SHMV] isolated from bean plants [Phaseolus vulgaris L.]
    Autorzy:
    Pospieszny, H
    Palczewska, M.
    Borodynko, N.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/65050.pdf
    Data publikacji:
    2001
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    host range
    electron microscopy
    serology
    plant protection
    coat protein
    Phaseolus vulgaris
    bean plant
    gel electrophoresis
    Sunn-hemp mosaic tobamovirus
    Opis:
    This work presents some properties of Sunn-hemp mosaic tobamovirus (SHMV) orginally isolated from bean plants. Virus infected host range and induced symptoms that were typical for SHMV. Following plant species distinquished SHMV from tobacco mosaic tobamovirus (TMV): Phaseolus vulgaris, Pisum sativum, Lupinus albus and Lycopersicon esculentum. In immunoblotting the serum against SHMV did not react with TMV and Tomato mosaic tobamovirus (ToMV). The electrophoretical patterns of whole virions and capsid proteins were characteristic for SHMV and different from that of TMV and ToMV.
    W pracy przedstawiono charakterystykę wirusa mozaiki krotalarii (SHMV) wyizolowanego z siewek fasoli wyrosłych z zainfekowanych nasion. Stwierdzono, że zakres roślin gospodarzy badanego izolatu SHMV oraz wywoływane przez niego objawy chorobowe były typowe dla tego wirusa. Gatunki roślin takie jak: Phaseolus vulgaris, Pisum sativum, Lupinus albus i Lycopersicon esculentum różnicują SHMV od TMV. W teście immunoblotingu surowica przeciwko SHMV nie reagowała z TMV-U i ToMV-2., z kolei surowica przeciwko TMV reagowała jedynie z TMV-U₁ i ToMV-2. Obrazy elektroforetyczne zarówno całych virionów jak i białek otoczki wirusowej były charakterystyczne dla SHMV i różne od tych dla TMV-U₁ oraz ToMV-2.
    Źródło:
    Journal of Plant Protection Research; 2001, 41, 2
    1427-4345
    Pojawia się w:
    Journal of Plant Protection Research
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
      Wyświetlanie 1-5 z 5

      Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies