Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "expression profile" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-4 z 4
Tytuł:
Different gene expression profiles of AD293 and HEK293 cell lines that show contrasting susceptibility to apoptosis induced by overexpression of Bim L
Autorzy:
Zhang, Jiayi
Chen, Jinzhong
Liu, Lingfeng
Ji, Chaoneng
Gu, Shaohua
Ying, Kang
Mao, Yumin
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1041208.pdf
Data publikacji:
2006
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
Bim-L
expression profile
apoptosis
AD293
SSH
Opis:
Bim is a pro-apoptotic member of the Bcl-2 protein family. Overexpression of Bim proved to be highly cytotoxic for diverse cells.The AD293 cell line is derived directly from the HEK293 cell line but has been transfected with a gene that can improve cell adherence.We found that there was almost no apoptosis seen in Bim L-transfected AD293 cells, but more than half ofBim L-transfected HEK293 cells underwent apoptosis. Suppression subtractive hybridizationwas used to detect the different gene expression profile between these two cell lines. In 192 sequencedpositive clones, there were 30 clones repeating twice or more. Ten genes were selected for identification by semi-quantitative RT-PCR.Thetranscripts of two adhesion-relatedgenes (actin and parvin)and two apoptosis-related genes (cyclin 2 and protein phosphatase 1G) were up-regulated in AD293 cells. These results suggest that the high expression of cell adhesion-related proteins might be responsible for the different apoptosis status after the transfection of Bim L.Our data provide candidate genes responsible for the different apoptosis sensitivity of these two cell lines. Further investigation on thedifferential expression profile between AD293 and HEK293 might improve our understanding of cell apoptosis mechanism.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2006, 53, 3; 525-530
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Abscisic acid does not influence the subcellular distribution of the HYL1 protein from Arabidopsis thaliana
Autorzy:
Lesicka-Górecka, Joanna
Szarzyńska, Bogna
Sawczak, Marta
Bagdiul, Ivona
Górski, Paweł
Jarmołowski, Artur
Szweykowska-Kulińska, Zofia
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1040709.pdf
Data publikacji:
2008
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
subcellular distribution
abscisic acid
Arabidopsis thaliana
expression profile
HYL1 protein
Opis:
HYL1 is a nuclear protein involved in the processing of miRNAs but its exact function remains unknown. Arabidopsis thaliana hyl1 mutants exhibit hypersensitivity to ABA. We decided to answer the question whether ABA affects the HYL1 protein localization within the cell and show that it does not. We also studied the expression of HYL1 in different tissues and organs. In this paper we show for the first time the expression profile of the HYL1 protein using anti-HYL1 antibodies. The protein is present in seedlings and mature plants in all organs studied, with the highest amount in inflorescences. A. thaliana HYL1 protein has several repetitions of a 28-amino-acid sequence at the C-terminus that confer protein instability. Our bioinformatic analysis of HYL1 homologs in different Brassica species shows that this repetition is typical only for Arabidopsis. This may suggest a relatively late evolutionary acquisition of the C-terminal domain.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2008, 55, 3; 517-524
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The expression profile of galactinol synthase genes (VhGolS1 and VhGolS2) in developing Vicia hirsuta ([L.] S.F. Gray) seeds
Autorzy:
Podlinski, P.
Gojlo, E.
Pupel, P.
Jastrzebski, J.P.
Paukszto, L.
Gorecki, R.J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/80158.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
conference
expression profile
galactinol synthase
alpha-D-galactoside
galactosyl cyclitol
Vicia hirsuta
seed
gene expression
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Ocena zmian profilu ekspresji genów kandydujących w podkładkach jabłoni o odmiennym stopniu tolerancji mrozowej
Evaluation of changes in the expression profile of candidate genes in apple rootstockss with a different degree of frost tolerance .
Autorzy:
Keller-Przybyłkowicz, Sylwia
Lewandowski, Mariusz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199254.pdf
Data publikacji:
2020-12-09
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
adnotacja funkcjonalna genów
Malus domestica Borkh.
sekwencjonowanie
profil ekspresji
ilościowa reakcja amplifikacji
expression profile
gene annotation
new generation sequencing (NGS)
quantitative transcript level (qRT-PCR)
Opis:
Celem przeprowadzonych badań była identyfikacja genów sprzężonych z cechą mrozoodporności podkładek jabłoni. Ocenę zmian w poziomie ekspresji wyizolowanych genów przeprowadzono metodami RNAseq i qRT-PCR, dla podkładek zróżnicowanych po względem stopnia tolerancji mrozowej: P 66 (tolerancyjna) i M.9 (wrażliwa).W wyniku przeprowadzonych odczytów sekwencji RNA (sekwencjonowanie de novo w systemie Illumina Solid) dla w/w podkładek zidentyfikowano około 167 milionów odczytów unikatowych sekwencji, z których do wstępnych badań weryfikacyjnych wytypowano 15 o zróżnicowanym profilu ekspresji. Sekwencje poddano adnotacji funkcjonalnej. Wytypowane geny kodują: białka strukturalne i integralne błon komórkowych i wakuoli komórkowych, czynników transkrypcyjnych, białek regulujących transport międzykomórkowy i wewnątrzkomórkowy, białek hydrolizujących wiązania C-O i C-N oraz białek wiążących makro- i mikroelementy. Celem weryfikacji typu regulacji sekwencji transkryptomu uzyskanych z sekwencjonowania nowej generacji (NGS), dla tych samych prób przeprowadzono ilościową analizę transkryptu genów (qRT-PCR). Spośród badanych genów, trzy reprezentowały identyczny typ regulacji w badanych układach eksperymentalnych RNA-seq i qRT-PCR. Wytypowane geny stanowią potencjalne sekwencje kandydujące do sporządzenia markerów funkcjonalnych, umożliwiających wczesną selekcję podkładek jabłoni tolerancyjnych na mróz.
The aim of presented study was to identify putative candidate genes associated with apple rootstock winter hardiness. The assessment of changes in expression profile of isolated differentially expressed genes, was performed using two subsequent experiments: RNAseq (based on New Generation Sequencing, NGS) and qRT-PCR (Real Time transcript amplification). In terms of traits of interests two apple rootstocks P 66 (frost tolerant) and M.9 (frost sensitive) were evaluated. As a result of the RNA sequence readings (de novo sequencing, Illumina Solid system), approximately 167 million reads of unique sequences were identified. Finally, fifteen functionally annotated expressed tags, representing different expression profile, were chosen. Selected putative genes coding: structural and integral proteins of cell membranes and cellular vacuoles, transcription factors, proteins regulating intercellular and intracellular transport, C-O and C-N bonds hydrolyzes, and proteins binding macro- and microelements. In order to verify the type of regulation of the transcriptome sequences obtained in NGS technology, qRT-PCR tests were carried out for the same samples layout. Three of studied sequences, represented identical type of regulation in both RNA-seq and qRT-PCR experiments. The selected genes seems to represent potential candidate sequences (functional molecular markers), enabling the early selection of frost-tolerant apple rootstocks.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2020, 291; 21-32
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-4 z 4

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies