Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "real time PCR" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-6 z 6
Tytuł:
The multiple HPV infections and their possible significance in predicting the risk of the cervical cancer
Autorzy:
Kożańska, Aleksandra
Pisarska, Justyna
Baldy-Chudzik, Katarzyna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1070878.pdf
Data publikacji:
2019
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Tematy:
HPV co-infection
PCR-RFLP
Real-Time PCR
cervical cancer
human papillomavirus
Opis:
Infections with human papillomavirus (HPV) are detected frequently. The occurrence of persistent infection with oncogenic HPV type associates with the development of cervical cancer. However, the part of HPV infections consist of the multiple viral types. The influence of HPV co-infections on the risk of the development of cervical cancer is not clear, but the occurrence of more than one viral type seems to increase the risk of advanced lesions of the uterine cervix. Additionally, possible interactions (both positive and negative) between particular HPV types in co-infections may influence the risk of the lesions progression. Although, the issue of HPV co-infections is not well known, the previous scientific reports make that the introduction of the molecular methods, allowing the identification not only single but also multiple HPV infections, in routine diagnostics seem to be important. Here, we present the PCR-RFLP and Real-Time PCR methods as the useful tools in the diagnostics of HPV infections.
Źródło:
World Scientific News; 2019, 123; 192-207
2392-2192
Pojawia się w:
World Scientific News
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Najnowsze techniki biologii molekularnej w profilaktyce przewlekłych zakażeń wirusowych
The latest molecular biology techniques in prevention of chronic viral infections
Autorzy:
Kaczmarczyk, Grzegorz
Machnik, Grzegorz
Pelc, Ewa
Czapla, Monika
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/528526.pdf
Data publikacji:
2012
Wydawca:
Krakowska Akademia im. Andrzeja Frycza Modrzewskiego
Tematy:
ELISA
PCR
Real-Time PCR
sequencing
hybridization
viral infections
sekwencjonowanie
hybrydyzacja
infekcje wirusowe
Opis:
Progress either in medicine or molecular biology technics induces perspective possibilities of control and complication prevention in case of chronic viral diseases such as viral hepatitis and HIV infection. Accurate control of HBV viremia and seroconvertion level during infection was impossible several years ago. For the last couple of years molecular biology methods for HCV, HBV and HIV infection have been generally accepted and used for diagnosis, even without antibodies detectable in blood. Infection monitoring technics, such as Real-Time PCR, nucleic acid sequencing have been usefull and flow cytofluorometry, have been useful in rapid reacting on changes in the infected patient state. Each of the mentioned technics provides either the infection detection on the level unavailable in the past, or efficient observation and, consequently, proper treatment of the infection. Real-Time PCR allows to define the quantity of viral molecules in the volume of tested blood sample. Sequentioning technic provides viruses type ane virulence definition. The combination of all the other hand the cytofluorometry technic allows to define precisely the quantity of viral proteins presented on the infected cells and detect other blood proteins expression. The combination of all those technics provides accurate definition of virus ammount and efficient treatment
Postęp medycyny i związany z tym postęp technik biologii molekularnej stworzyły daleko idące możliwości kontrolowania i zapobiegania powikłaniom w przebiegu przewlekłych chorób wirusowych, takich jak zakażenia wirusowe wątroby oraz wirusem ludzkiego niedoboru odporności (HIV) Jeszcze kilkanaście lat wstecz niemożliwe było dokładne kontrolowanie poziomu wiremii oraz serokonwersji wirusa HBV podczas zakażeń. Od kilku lat istnieją już w pełni wystandaryzowane i wykorzystywane w diagnostyce metody biologii molekularnej, potwierdzające zakażenia HCV, HBV oraz HIV nawet podczas nieobecności przeciwciał we krwi pacjenta, wykrywające bezpośrednio obecność genomu wirusa. Coraz częściej wykorzystuje się również techniki pozwalające monitorowanie stanu zakażenia oraz szybkie reagowanie na zmiany zachodzące w organizmie zakażonego. Do wyżej wymienionych technik należy przede wszystkim odmiana reakcji PCR, czyli ilościowy PCR w czasie rzeczywistym (Real-Time PCR) czy sekwencjonowanie kwasów nukleinowych. Każda z tych technik pozwala nie tylko na wykrycie zakażenia na poziomie dotychczas nieosiągalnym, lecz również na jego skuteczne obserwowanie i skuteczne leczenie. Przy pomocy reakcji Real-Time PCR możliwe jest określenie ilości cząstek wirusa w badanej jednostce objętości krwi. Technika sekwencjonowania pozwala na dokładne określenie typu wirusa, a co za tym idzie zjadliwości. Wszystkie te techniki wzięte razem pozwalają na dokładne określenie ilości wirusów we krwi oraz na skuteczną walkę z nimi.
Źródło:
Państwo i Społeczeństwo; 2012, 2; 59-71
1643-8299
2451-0858
Pojawia się w:
Państwo i Społeczeństwo
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
CYP1A gene expression in adipose fin of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum) exposed to benzo[a]pyrene
Autorzy:
Brzuzan, P.
Woźny, M.
Łuczyński, M. K.
Góra, M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/363276.pdf
Data publikacji:
2007
Wydawca:
Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie
Tematy:
płetwa tłuszczowa
benzo(a)piren
CYP1A mRNA
skrzela
pstrąg tęczowy
real-time PCR
adipose fin
benzo(a)pyrene
gill
rainbow trout
Real-Time PCR
Opis:
Proximate to the environment, adipose fin of fish may be considered as a lipid storing tissue, and thus can be a target for either waterborne or dietary polycyclic aromatic compounds (PACs). We determined the effects of benzo[a]pyrene (B[a]P), a model PAC member, on CYP1A gene expression in adipose fin and compared that with the effects in gill of juvenile rainbow trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum) using the quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (Q-RT-PCR). The results of the study demonstrated that constitutive CYP1A mRNA was present in adipose fin of rainbow trout, but the transcripts were far less abundant than those in gill tissue. We confirmed high CYP1A gene induction potential of the gills in rainbow trout injected with benzo[a]pyrene, but also showed moderately and transiently induced CYP1A mRNA in adipose fin. The modest and transitory gene expression may preclude rainbow trout adipose fin CYP1A mRNA levels from using it as an indicator of sustained exposure of fish to the polycyclic aromatic compounds.
Źródło:
Environmental Biotechnology; 2007, 3, 1; 20-24
1734-4964
Pojawia się w:
Environmental Biotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Prevalence of the factor V Leiden mutation in patients susceptible to venous thromboembolism
Częstość występowania mutacji czynnika V Leiden u pacjentów ze skłonnością do żylnej choroby zakrzepowo-zatorowej
Autorzy:
Mitrus, J.M.
Wierszyło, E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2048961.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Akademia Bialska Nauk Stosowanych im. Jana Pawła II w Białej Podlaskiej
Tematy:
hypercoagulability
Leiden mutation
genotyping techniques
Real-Time PCR
nadkrzepliwość
mutacja Leiden
genotypowanie
Opis:
Background. A tendency to venous thromboembolism is otherwise called hypercoagulability or thrombophilia. This disease can be acquired or have a genetic background, and may lead to pulmonary embolism. The basis for analysis and selection of treatment is genetic diagnosis, which detects the G1691A mutation in the factor V gene (factor V Leiden) – the best known congenital thrombophilia marker. Material and methods. The study was carried out in the years 2015-2017 on samples taken from patients (462 men and 1284 women) with a tendency to venous thromboembolism. Real-Time PCR was used to detect G1691A mutation in factor V gene. The analyses were performed in the Hematology Laboratory of the Center of Laboratory Medicine at the Medical University of Gdańsk. Results. Significant differences in the frequency of Leiden mutation were shown. This mutation predominated in men (25%), while in women G1691A mutation was detected with a 15% frequency (p=0.04). All possible genotypes were found among the subjects and the percentage of heterozygotes and homozygotes in both genders was similar. Conclusions. Congenital t hrombophilia a ssociated w ith G1691A mutation of f actor V Leiden gene was found to be more common in men than in women. All possible genotypes were determined in the pool of test subjects. The mutation was most frequently detected in patients between 30 and 40 years of age, and rarely after 70 years of age.
Wprowadzenie. Nadkrzepliwość (trombofilia) jest to skłonność do żylnej choroby zakrzepowozatorowej. Choroba ta może być nabyta lub mieć podłoże genetyczne i może prowadzić do zatorowości płucnej. Podstawą analizy i doboru leczenia jest diagnostyka genetyczna. Celem tej diagnostyki jest wykrycie mutacji G1691A w genie czynnika V (czynnik V Leiden) – najlepiej poznanego markera trombofilii wrodzonej. Materiał i metody. Badania zostały przeprowadzone w latach 2015-2017 na próbkach pobranych od pacjentów (462 mężczyzn i 1284 kobiet) ze skłonnością do żylnej choroby zakrzepowozatorowej. W celu wykrycia mutacji G1691A w genie czynnika V zastosowano metodę Real-Time PCR. Analizy zostały wykonane w Laboratorium Hematologii Uniwersyteckiego Centrum Medycyny Laboratoryjnej przy Gdańskim Uniwersytecie Medycznym. Wyniki. Wykazano istotne statystycznie różnice w częstości występowania mutacji Leiden. Mutację częściej występowała w grupie mężczyzn (25%), zaś u kobiet mutację G1691A wykrywano z częstością 15% (p=0,04). Wśród osób badanych stwierdzono wszystkie możliwe genotypy, a procentowy udział heterozygot i homozygot u obu płci był zbliżony. Wnioski. Trombofilia wrodzona związana z mutacją G1691A w genie czynnika V Leiden częściej występowała u mężczyzn niż kobiet. W puli osób poddanych testom oznaczono wszystkie możliwe genotypy. Mutację najczęściej wykrywano u pacjentów w przedziale wiekowym 30-40 lat, a najrzadziej po 70 roku życia.
Źródło:
Health Problems of Civilization; 2020, 14, 2; 83-93
2353-6942
2354-0265
Pojawia się w:
Health Problems of Civilization
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Distinct expression, localization and function of two Rab7 proteins encoded by paralogous genes in a free-living model eukaryote
Autorzy:
Osińska, Magdalena
Wiejak, Jolanta
Wypych, Emilia
Bilski, Henryk
Bartosiewicz, Rafał
Wyroba, Elżbieta
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039860.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
glycosylation
antipeptide antibodies
Real-Time PCR
Rab7 isotypes
RNAi
2D electrophoresis
Paramecium octaurelia
STED
Opis:
Rab7 GTPases are involved in membrane trafficking in the late endosomal/lysosomal pathway. In Paramecium octaurelia Rab7a and Rab7b are encoded by paralogous genes. Antipeptide antibodies generated against divergent C-termini recognize Rab7a of 22.5 kDa and Rab7b of 25 kDa, respectively. In 2D gel electrophoresis two immunoreactive spots were identified for Rab7b at pI about 6.34 and about 6.18 and only one spot for Rab7a of pI about 6.34 suggesting post-translational modification of Rab7b. Mass spectrometry revealed eight identical phosphorylated residues in the both proteins. ProQ Emerald staining and ConA overlay of immunoprecipitated Rab7b indicated its putative glycosylation that was further supported by a faster electrophoretic mobility of this protein upon deglycosylation. Such a post-translational modification and substitution of Ala140 in Rab7a for Ser140 in Rab7b may result in distinct targeting to the oral apparatus where Rab7b associates with the microtubular structures as revealed by STED confocal and electron microscopy. Rab7a was mapped to phagosomal compartment. Absolute qReal-Time PCR analysis revealed that expression of Rab7a was 2.6-fold higher than that of Rab7b. Upon latex internalization it was further 2-fold increased for Rab7a and only slightly for Rab7b. Post-transcriptional gene silencing of rab7a suppressed phagosome formation by 70 % and impaired their acidification. Ultrastructural analysis with double immunogold labeling revealed that this effect was due to the lack of V-ATPase recruitment to phagolysosomes. No significant phenotype changes were noticed in cells upon rab7b silencing. In conclusion, Rab7b acquired a new function, whereas Rab7a can be assigned to the phagolysosomal pathway.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2011, 58, 4; 597-607
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wewnętrzna walidacja metody kwantyfikacji dna z wykorzystaniem zestawu Quantifiler® Human DNA Quantification Kit i aparatu 7500 Real-Time PCR System wraz z oprogramowaniem Hid Real-Time PCR Analysis Software V 1.1 w Zakładzie Biologii Centralnego Laboratorium Kryminalistycznego Policji
Internal validation of a DNA quantification method using the Quantifiler® Human DNA Quantification Kit and the 7500 REAL-TIME PCR SYSTEM with the HID REAL-TIME PCR ANALYSIS SOFTWARE V 1.1 at the Biology Department of the Central Forensic Laboratory of the Police
Autorzy:
Zbieć-Piekarska, Renata
Spas, Anna
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1373985.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Centralne Laboratorium Kryminalistyczne Policji
Tematy:
walidacja
kwantyfikacja DNA
Real-Time PCR
Quantifiler® Human DNA Quantification Kit
internal validation
quantification of DNA
Opis:
Celem przedstawionych badań było przeprowadzenie w Zakładzie Biologii Centralnego Laboratorium Kryminalistycznego Policji walidacji wewnętrznej metody kwantyfikacji DNA z wykorzystaniem zestawu Quantifiler® Human DNA Quantification Kit firmy Applied Biosystems, służącego do oznaczania całkowitej ilości DNA ludzkiego przy współpracy z aparatem 7500 Real-Time PCR System wraz z oprogramowaniem HID Real-Time PCR Analysis Software v1.1. Wyboru parametrów istotnych z punktu widzenia rutynowo prowadzonych badań dokonano na podstawie zaleceń grupy roboczej ds DNA ENFSI tj. Recommended Minimum Criteria of the Valiation of Various Aspects of the DNA Profiling Process. Ocenie poddano: czułość, liniowość, zakres metody oraz precyzję z uwzględnieniem powtarzalności i odtwarzalności wewnątrzlaboratoryjnej. Dodatkowo podjęto próbę ustalenia, czy zasadna jest kontynuacja analiz genetycznych, jeżeli wskazania aparatu 7500 Real-Time dają wynik negatywny, tj. nie wykazały obecności DNA jądrowego przy jednoczesnych prawidłowych wskazaniach dla kontroli wewnętrznej IPC. Na podstawie przeprowadzonych eksperymentów walidacyjnych stwierdzono, że zakres, w jakim walidowana metoda spełniła zadane wcześniej kryteria akceptacji, jest satysfakcjonujący, biorąc pod uwagę specyfikę badań wykonywanych w naszym laboratorium. Niemniej bardzo uważnie należy interpretować negatywne wskazania aparatu 7500 Real-Time PCR System, sugerujące brak obecności DNA jądrowego przy jednoczesnych prawidłowych wskazaniach dla kontroli wewnętrznej IPC. Okazuje się bowiem, że nie jest zasadne odstępowanie od dalszej analizy tego rodzaju próbek z uwagi na możliwość zastosowania nowych bardzo czułych zestawów do amplifikacji DNA, które niejednokrotnie pozwalają na uzyskanie pełnego profilu DNA. Podsumowując, walidacja metody kwantyfikacji DNA z wykorzystaniem zestawu Quantifiler® Human DNA Quantification Kit i aparatu 7500 Real-Time PCR System wraz z oprogramowaniem HID REAL-TIME PCR Analysis Software V1.1 została zakończona pozytywnie, w związku z czym metoda mogła zostać wdrożona i być rutynowo wykorzystywana do oznaczania całkowitej ilości DNA ludzkiego w próbkach biologicznych będących przedmiotem badań kryminalistycznych w Zakładzie Biologii CLKP.
The aim of the present study was the internal validation of a DNA quantification method employing the Quantifiler® Human DNA Quantification Kit from Applied Biosystems, used for the quantification of human total DNA, coupled with the 7500 Real-Time PCR System and the HID Real-Time PCR Analysis Software v1.1, performed at the Biology Department of the Central Forensic Laboratory of the Police. The selection of parameters relevant to the laboratory’s routine casework was made based on the ENFSI DNA Working Group recommendations included in the document Recommended Minimum Criteria for the Validation of Various Aspects of the DNA Profiling Process. The assessment regarded: sensitivity, linearity, range covered by the method and precision, including intralaboratory repeatability and reproducibility. Moreover, an attempt was made to determine whether continuation of genetic analyses is rational if the 7500 Real-Time system reads are negative, i.e. no nuclear DNA is detected, while the internal positive control (IPC) results are correct. Based on the conducted validation experiments, it was found that the extent to which the validated method met the predetermined acceptance criteria is satisfactory, taking into account the specificity of the tests conducted in our laboratory. However, any negative indications of the 7500 Real-Time PCR System, suggesting no presence of nuclear DNA along with correct results obtained for the IPC, should be interpreted very carefully. Apparently, it is not rational to discontinue further analyses of such samples due to the availability of very sensitive new DNA amplification kits which often allow obtaining a full DNA profile. To sum up, the validation of the DNA quantification method employing the Quantifiler® Human DNA Quantification Kit coupled with the 7500 Real-Time PCR System and the HID REAL-TIME PCR Analysis Software V1.1 was successful, therefore the method could be implemented and routinely used for the quantification of human total DNA in biological samples subject to forensic analyses conducted at the Biology Department of the Central Forensic Laboratory of the Police.
Źródło:
Problemy Kryminalistyki; 2014, 284
0552-2153
Pojawia się w:
Problemy Kryminalistyki
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-6 z 6

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies