Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "PCR/DGGE" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-2 z 2
Tytuł:
Filtry biologiczne jako metoda ochrony siewek przed patogenami w szkółkach leśnych
Slow Sand Filter as a method of protection forest plants against phytopathogens in forest nurseries
Autorzy:
Kubiak, K.
Oszako, T.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/973901.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Leśne
Tematy:
biofilmy
bakterie
oznaczanie
oczyszczanie wody
filtrowanie
filtry piaskowe
leśnictwo szkółki leśne
woda użytkowa
forest nursery
biofilm
Slowa Sand Filter SSF)
Phytophthora
DNA isolation
DGGE
PCR
Opis:
Slow sand filtration (SSF) is a low−cost method of water disinfestation that can be used as an alternative method of water irrigation treatment in nursery to control water−borne phytopathogens. Slow sand filtration relies on physical, chemical and biological activity in controlling plant pathogens. In a SSF, the filter bed is constructed of a medium−sand with the area which can be colonised by microorganisms – biofilm. This sand media also presents a physical barrier to fungal, bacterial and oomycetes plant pathogens. In the forest nursery Kiejsze an experimental slow sand filter was constructed to study the structure of a bacterial community suppressive to plant pathogens. The total bacterial community of an experimental SSF was analyzed by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) of partial 16S rRNA gene PCR products. Sequence analysis of DGGE bands from the SSF column indicated that a range of bacteria were present, among them similar to groups such as alfa−Proteobacteria, delta−Proteobacteria, beta−Proteobacteria, Planctomycetes, Actinobacteria, Firmicutes, Bacilli and an uncharacterized environmental clone. This study describes the characterization of the microbial community of SSFs used for the treatment of irrigation water in the forest nursery. Using of natural SSF filters and manipulation of microorganisms in the biofilm may be a more reproducible control method of plant pathogens in the future.
Źródło:
Sylwan; 2011, 155, 04; 228-235
0039-7660
Pojawia się w:
Sylwan
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Detection of antibiotic resistance genes in wastewater treatment plant : molecular and classical approach
Wykrywanie genów oporności na antybiotyki w oczyszczalni ścieków : podejście klasyczne i biologii molekularnej
Autorzy:
Ziembińska-Buczyńska, A.
Felis, E.
Folkert, J.
Meresta, A.
Stawicka, D.
Gnida, A.
Surmacz-Górska, J.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/204828.pdf
Data publikacji:
2015
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
DGGE
denaturing gradient gel electrophoresi
PCR
polymerase chain reaction
sulfamethoxazole
trimethoprim resistance
erythromycin resistance
WWTP
wastewater treatment plant
antybiotyki
reakcja łańcuchowa polimerazy
sulfametoksazol
geny oporności
odporność na trimetoprim
odporność na erytromycynę
oczyszczalnia ścieków
Opis:
Antibiotics are a group of substances potentially harmful to the environment. They can play a role in bacterial resistance transfer among pathogenic and non-pathogenic bacteria. In this experiment three representatives of medically important chemotherapeutics, confirmed to be present in high concentrations in wastewater treatment plants with HPLC analysis were used: erythromycin, sulfamethoxazole and trimethoprim. Erythromycin concentration in activated sludge was not higher than 20 ng L−1. N-acetylo-sulfamethoxazole concentration was 3349 ± 719 in winter and 2933 ± 429 ng L−1 in summer. Trimethoprim was present in wastewater at concentrations 400 ± 22 and 364 ± 60 ng L−1, respectively in winter and summer. Due to a wide variety of PCR-detectable resistance mechanisms towards these substances, the most common found in literature was chosen. For erythromycin: erm and mef genes, for sulfamethoxazole: sul1, sul2, sul3 genes, in the case of trimethoprim resistance dhfrA1 and dhfr14 were used in this study. The presence of resistance genes were analyzed in pure strains isolated from activated sludge and in the activated sludge sample itself. The research revealed that the value of minimal inhibitory concentration (MIC) did not correspond with the expected presence of more than one resistance mechanisms. Most of the isolates possessed only one of the genes responsible for a particular chemotherapeutic resistance. It was confirmed that it is possible to monitor the presence of resistance genes directly in activated sludge using PCR. Due to the limited isolates number used in the experiment these results should be regarded as preliminary.
Antybiotyki to grupa związków potencjalnie szkodliwych dla środowiska. Odgrywają one rolę w procesach transferu antybiotykooporności pomiędzy patogenami i bakteriami niechorobotwórczymi. Wykorzystując metodę wysokosprawnej chromatografii cieczowej (HPLC) wykazano obecność erytromycyny, sulfametoksazolu i trimetoprimu w miejskiej oczyszczalni ścieków w następujących stężeniach: dla erytromycyny < 20 ng L−1, N-acetylo-sulfametoksazolu 3349 ± 719 i 2933 ± 429 ng L−1, a trimetoprimu 400 ± 22 i 364 ± 60 ng L−1, odpowiednio: zimą i latem. Ponieważ antybiotykooporność bakteryjna może być stymulowana obecnością antybiotyków w środowisku, istnieje możliwość pojawienia się wielu szlaków opornościowych u bakterii narażonych na działanie tych związków. Dlatego też podjęto próbę detekcji wybranych genów oporności na badane chemioterapeutyki metodą łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR). Obecność elementów genetycznych badano zarówno w szczepach bakteryjnych, u których udowodniono oporność na badany związek bakteriobójczy, jak i w próbce osadu czynnego, z którego te bakterie izolowano. Do badań wybrano najczęściej występujące geny oporności: dla erytromycyny erm i mef, dla sulfametoksazolu: sul1, sul2, sul3, a dla trimetoprimu dhfrA1 i dhfr14. Wykazano, że wartość minimalnego stężenia inhibitującego (MIC), nie koresponduje z obecnością większej liczby mechanizmów oporności. Większość szczepów opornych wykazywała tylko jeden z badanych mechanizmów oporności na antybiotyk niezależnie od wartości MIC. Potwierdzono również możliwość monitorowania obecności genów oporności na antybiotyki metodą PCR bezpośrednio w osadzie czynnym. Ze względu na ograniczona liczbę izolatów użytych w tym eksperymencie wyniki uzyskane w pracy powinny być traktowane jako wstęp do dalszych badań.
Źródło:
Archives of Environmental Protection; 2015, 41, 4; 23-32
2083-4772
2083-4810
Pojawia się w:
Archives of Environmental Protection
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-2 z 2

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies