Temat: DNA amplification - Katalog OPAC zbiorów

Skocz do pozycji: 1.

Tytuł:: Isolation of the DNA fragment reflecting the open reading frame II of the I-18 C gene of Chironomus tentans by the polymerase chain reaction. III. The DNA amplification technology
Autorzy:: Borowicz, B P
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/66760.pdf
Data publikacji:: 1997
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: gene expression
I-18 C gene
Chironomus tentans
polymerase chain reaction
DNA fragment
DNA amplification
Opis:: The technology used to amplify and isolate the DNA fragment reflecting the Open Reading Frame II of the I-18 C gene of Chironomus tentans is described i.e. the Polymerase Chain Reactioin and the agarose gel electrophoresis of this reaction product, as well as the blunting reaction of the product and its isolation.
Opisano technologię zastosowaną do powielenia i izolacji fragmentu DNA odpowiadającego Otwartej Ramie Odczytu II genu I-18 C Chironomus tentans, tj. Reakcję Łańcuchową Polimerazy (PCR) oraz elektroforezę w żelu agarozowym produktu tej reakcji jak również reakcję tzw. Stępiania końców wyżej wymienionego produktu i ostatecznie jego izolację .
Źródło:: Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:: Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 2.

Tytuł:: The use reverse transcription and polymerase chain reaction [RT-PCR] for the detection of hop latent viroid [HLVd]
Autorzy:: Cajza, M
Wypijewski, K.
Pospieszny, H.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/65773.pdf
Data publikacji:: 1997
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: hop latent viroid
reverse transcription
viroid
hop
plant pathogen
polymerase chain reaction
detection
DNA amplification
Opis:: The simple method of nucleic acids extraction, based on guanidine thiocyanate extraction buffer, was sufficient for obtaining a good templates for RT-PCR. The RT-PCR reactions were performer from the start to the end (both the reverse transcription and the HLVd-cDNA amplification) in the same reaction mixture and in the very small volume of reaction (10 μI). Both pairs of primers designed by authors were good for reverse transcription and later for amplification of the HLVd-cDNA. The presence of gelatin as a stabilizer of DNA polymerase was indispensable for successful performance of RT-PCR.
Wiroidy, najmniejsze obecnie znane patogeny roślin, zbudowane z pojedynczej nici kolistego RNA, nie zawierające w swej budowie i nie kodujące żadnych białek, są groźnymi patogenami roślin wyższych, rozpowszechnionymi we wszystkich rejonach świata, szczególnie w uprawach roślin rozmnażanych wegetatywnie. Wiroid latentny chmielu (ang. hop latent viroid - HLVd) został wykryty dopiero w 1988 roku w chmielu. Do tej pory odnotowano go w rejonach uprawy chmielu na całym świecie. Chmiel, jedyny znany żywiciel tego patogena, ulega tylko infekcjom utajonym (latentnym). HLVd powoduje zarówno spadek masy plonu szyszek jak i zawartości alfa-kwasów w szyszkach. Bezobjawowe infekcje oraz brak białek strukturalnych i innych produktów translacji powodują, że obecnie patogena tego można wykrywać tylko przy pomocy elektroforezy (metoda bardzo zawodna, wymagająca wysokiego stężenia RNA patogena w tkance), sond hybrydyzacyjnych i rozwijanej w ostatnich latach metody RT-PCR. Podczas opracowywania RT-PCR do wykrywania HLVd w ekstraktach kwasów nukleinowych wykorzystywano dwie pary primerów specyficznych dla sekwencji nukleotydowej HLVd, charakteryzujących się różnymi temperaturami topnienia produktu. Wiroida wykrywano w ekstraktach kwasów nukleinowych z blaszek liściowych i z ogonków liściowych chmielu. Uproszczona metoda guanidynowa do izolacji totalnych kwasów nukleinowych okazała się wystarczająca do przeprowadzenia reakcji RT-PCR. Opracowana metoda charakteryzowała się bardzo dużą czułością, specyficznością (produkty amplifikacji cDNA-HLVd uzyskiwano tylko z próbek materiału roślinnego pochodzącego z roślin zawierających tego wiroida) i szybkością wykonania (dwa dni łącznie z ekstrakcją kwasów nukleinowych). Ponadto w zastosowanej metodzie opracowano warunki do przeprowadzenia zarówno odwrotnej transkrypcji i następnie amplifikacji powstałego cDNA wiroida w jednej probówce, w tej samej mieszaninie reakcyjnej . Oprócz tego wszystkie reakcje RT-PCR prowadzono w bardzo małej objętości równej 10 μl (2 μl zawiesiny kwasów nukleinowych i 8 μl mieszaniny reakcji RT-PCR). Maksymalne uproszczenie metody, wielokrotne obniżenie kosztów reakcji oraz charakterystyczna dla RT-PCR czułość, specyficzność i szybkość przeprowadzenia testu sprawiają, że może być ona wykorzystywana do rutynowego wykrywania nie tylko HLVd ale również innych wiroidów, wirusoidów i wirusów RNA.
Źródło:: Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:: Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 3.

Tytuł:: Identification of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis by the polymerase chain reaction [PCR]
Autorzy:: Cajza, M
Rezler, A.
Pospieszny, H.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/65945.pdf
Data publikacji:: 1997
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:: tomato seed
pathogen
Clavibacter michiganensis
plant protection
bacteria
polymerase chain reaction
detection
DNA amplification
seed
identification
Opis:: The PCR offers the possibility of specific and very sensitive detection and/or identification of Cl. m. subsp. michiganensis in seeds. The described PCR method for identification of this pathogen is very fast (one day) and economical, because of the very small volume (10 μI) of the PCR reaction mixture. The method based on amplification of the bacterial plasmid DNA fragment may be very useful in routine identification of Cl. m. subsp. michiganensis from all other bacteria isolated from tomato seeds and may be an alternative tool in diagnostics, especially for the quarantine services.
Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis jest bardzo groźnym patogenem kwarantannowym pomidora, wywołującym chorobę zwaną bakteryjnym rakiem pomidora. Bakteria ta łatwo przenosi się z zakażonymi nasionami i sadzonkami. Pomimo opracowania różnych technik diagnostycznych do jej wykrywania, nadal stanowi duży problem w diagnozowaniu chorób pomidora. Powszechnie stosowane w Polsce wykrywanie tej bakterii, bazujące na testach enzymoimmunologicznych (ELISA), immunofluorescencyjnych, hodowli na pożywkach półselektywnych i testach biologicznych, jest często zawodne ze względu na duże serologiczne zróżnicowanie poszczególnych szczepów tej bakterii, obecność wielu bakterii saprofitycznych, tworzących kolonie nie różniące się morfologicznie od kolonii właściwych dla Cl. m. subsp. michiganensis, czy też mało przydatne ze względu na długi czas trwania testu i obecność infekcji latentnych. Jedną z nowoczesnych metod wykrywania i identyfikacji bakterii jest amplifikacja fragmentów DNA charakterystycznych dla jej genomu przy pomocy reakcji PCR. Metoda ta dopiero zaczyna być powszechnie stosowana w diagnostyce bakterii (nieliczne doniesienia, w większości z ostatnich trzech lat). Opracowana metoda identyfikacji Cl. m. subsp. michiganensis spośród różnych bakterii saprofitycznych obecnych na nasionach pomidora, charakteryzuje się bardzo dużą czułością (do wykrycia Cl. m. subsp. michiganensis wystarczy 200-300 bakterii / 1 ml), specyficznością (produkty amplifikacji DNA bakteryjnego o oczekiwanej długości 614 bp, uzyskiwano tylko w próbkach, w których znajdował się DNA z Cl. m. subsp. michiganensis) oraz szybkością (jeden dzień, wraz z izolacją DNA bakteryjnego). Ponadto opracowana metoda charakteryzuje się bardzo niskimi kosztami, gdyż cala reakcja amplifikacji DNA zachodzi w objętości 10 μI (4 μI zawiesiny DNA i 6 μI mieszaniny reakcyjnej), co sprawia, że stosowanie tej metody w powszechnej diagnostyce chorób bakteryjnych będzie coraz częstsze i będzie ona coraz bardziej konkurencyjna w stosunku do innych, obecnie stosowanych.
Źródło:: Journal of Plant Protection Research; 1997, 37, 1-2
1427-4345
Pojawia się w:: Journal of Plant Protection Research
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Informacja

Wyszukujesz frazę "DNA amplification" wg kryterium: Temat

Źródło danych

Dostawca treści

Kolekcja

Rok wydania

Wydawca

Temat

Autor

Typ dokumentu

Język