Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "dgge" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
    Wyświetlanie 1-5 z 5
    Tytuł:
    Nowoczesne metody badania bioróżnorodności biocenoz bakteryjnych w środowisku
    Modern techniques used for biodiversity analysis in bacterial environmental communities
    Autorzy:
    Karło, A.
    Ziembińska, A.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/142224.pdf
    Data publikacji:
    2013
    Wydawca:
    Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Przemysłu Chemicznego. Zakład Wydawniczy CHEMPRESS-SITPChem
    Tematy:
    osad czynny
    FISH
    DGGE
    cytometria przepływowa
    bioróżnorodność bakterii
    activated sludge
    flow cytometry
    bacterial biodiversity
    Opis:
    W analizach biocenoz bakteryjnych coraz powszechniej wykorzystywane są techniki biologii molekularnej. Wśród nich można wyróżnić metodę FISH – fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ oraz jej modyfikacje (RING-FISH, Clone-FISH, CARDFISH i MAR-FISH). W artykule opisano też technikę elektroforezy w gradiencie denaturacji (DGGE), bazującą na bakteryjnym markerze molekularnym 16S rRNA oraz cystometrię przepływową. Ze względu na dużą przewagę tych metod nad klasycznymi metodami mikrobiologicznymi, wynikającą między innymi z możliwości analizowania próbek pobieranych bezpośrednio ze środowiska, są one stosowane w biotechnologii środowiskowej, np. w badaniach bakteryjnej biocenozy osadu czynnego, biorącej udział w biologicznym oczyszczaniu ścieków. Możliwe jest również użycie kilku metod, których rezultaty są komplementarne i pozwalają na stworzenie całościowego obrazu badanej biocenozy.
    Molecular techniques are very popular in microbial laboratories. Among them FISH- fluorescent in situ hybridization (with modifications like: CARD-FISH, MAR-FISH, RING-FISH, Clone- FISH), DGGE – denaturing gradient gel electrophoresis based on 16S rRNA molecular marker and flow cytometry, are the most popular. These analytical methods are commonly use in bacterial biodiversity research. The analysis can be performed directly on the environmental sample, so these procedures are simpler and faster that traditional ones. Therefore, molecular techniques can be used in aqueous bacterial biocenosis research, such as activated sludge, which takes part in biological wastewater treatment. It is also possible to use a set of molecular methods in order to obtain complimentary results to present total bacterial biocenosis picture.
    Źródło:
    Chemik; 2013, 67, 11; 1105-1114
    0009-2886
    Pojawia się w:
    Chemik
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Microbial communities and relationship with biofilm spatial distributions in subsurface wastewater infiltration systems
    Autorzy:
    Zhang, L.
    Yang, J.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/207883.pdf
    Data publikacji:
    2016
    Wydawca:
    Politechnika Wrocławska. Oficyna Wydawnicza Politechniki Wrocławskiej
    Tematy:
    water treatment
    wastewater infiltration system
    DGGE
    volatile suspended solids
    oczyszczanie ścieków oczyszczanie wody
    systemy infiltracji ścieków
    lotne zawiesiny
    Opis:
    A pilot-scale subsurface wastewater infiltration system (SWIS) was designed for the treatment of polluted river water. The components of microbial communities have been identified and characterized and their dependences on some indicators of biofilm formation in the SWIS have been determined. The average efficiencies of COD, TN and removal were 43.3%, 28.8% and 79.6%, respectively. According to the denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) profile, high intensity and uniform bands were generated, indicating an abundant microbial community in each layer of the SWIS. Furthermore, the Shannon index analysis showed high correlation to the spatial distribution of microbial communities as well as the quantity of biofilm in each sample, which were characterized by measuring volatile suspended solids (VSS), phospholipids, proteins and polysaccharides. Sequencing of partial 16S rRNA gene fragments revealed that the composition of the total bacterial communities was dominated by Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Deltaproteobacteria, Pseudomonas, Bacillus, Flavobacteriaceae, TM-7, and other uncultured bacteria. These bacteria may contribute to nutrient removal in SWIS. +4 NH –N
    Źródło:
    Environment Protection Engineering; 2016, 42, 3; 55-69
    0324-8828
    Pojawia się w:
    Environment Protection Engineering
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Influence of application of attapulgite on the structure and composition of self-dynamic membrane in bioreactors
    Autorzy:
    Duan, W.
    Ling, C.
    Fu, D.
    Xu, X.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/207004.pdf
    Data publikacji:
    2016
    Wydawca:
    Politechnika Wrocławska. Oficyna Wydawnicza Politechniki Wrocławskiej
    Tematy:
    bioconversion
    electrophoresis
    polymerase chain reaction
    porosity
    bioreactor system
    DGGE
    extracellular polymeric substances
    biokonwersja
    elektroforeza
    reakcja łańcuchowa polimerazy
    porowatość
    system bioreaktorów
    zewnątrzkomórkowe substancje polimerowe
    Opis:
    The effect of application of attapulgite on the structure and composition of a dynamic membrane (DM) of a bioreactor was investigated by means of the electron microscopy, polymerase chain reaction (PCR) and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). A significant increase of microbial floc size in the bioreactors upon attapulgite application was observed. The content of cake layer in the hybrid dynamic membrane (HDM) and in the dynamic membrane (DM) in the corresponding bioreactor systems were 44.73 g/m2 and 38.12 g/m2 respectively, while the contents of mineral – 6.09 g/m2 and 5.34 g/m2, respectively. Further, with addition of attapulgite, the concentration of extracellular polymeric substances (EPS) in the HDM bioreactor system decreased, whereas the content of suspended particulate matter increased. Self-DM has a porous structure with high porosity. Mineral sub-stance, including O, Ka, Ca, P, S, Cl, Mg and Si, are the main elements in DM, but the main elements content exhibited an increase trend in DM with attapulgite administration. These results showed a positive correlation between the quantity of bacterial populations and biological removal improvement, which indicated that application of attapulgite could optimize the structure of self-DM in bioreactors.
    Źródło:
    Environment Protection Engineering; 2016, 42, 2; 171-182
    0324-8828
    Pojawia się w:
    Environment Protection Engineering
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Filtry biologiczne jako metoda ochrony siewek przed patogenami w szkółkach leśnych
    Slow Sand Filter as a method of protection forest plants against phytopathogens in forest nurseries
    Autorzy:
    Kubiak, K.
    Oszako, T.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/973901.pdf
    Data publikacji:
    2011
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Leśne
    Tematy:
    biofilmy
    bakterie
    oznaczanie
    oczyszczanie wody
    filtrowanie
    filtry piaskowe
    leśnictwo szkółki leśne
    woda użytkowa
    forest nursery
    biofilm
    Slowa Sand Filter SSF)
    Phytophthora
    DNA isolation
    DGGE
    PCR
    Opis:
    Slow sand filtration (SSF) is a low−cost method of water disinfestation that can be used as an alternative method of water irrigation treatment in nursery to control water−borne phytopathogens. Slow sand filtration relies on physical, chemical and biological activity in controlling plant pathogens. In a SSF, the filter bed is constructed of a medium−sand with the area which can be colonised by microorganisms – biofilm. This sand media also presents a physical barrier to fungal, bacterial and oomycetes plant pathogens. In the forest nursery Kiejsze an experimental slow sand filter was constructed to study the structure of a bacterial community suppressive to plant pathogens. The total bacterial community of an experimental SSF was analyzed by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) of partial 16S rRNA gene PCR products. Sequence analysis of DGGE bands from the SSF column indicated that a range of bacteria were present, among them similar to groups such as alfa−Proteobacteria, delta−Proteobacteria, beta−Proteobacteria, Planctomycetes, Actinobacteria, Firmicutes, Bacilli and an uncharacterized environmental clone. This study describes the characterization of the microbial community of SSFs used for the treatment of irrigation water in the forest nursery. Using of natural SSF filters and manipulation of microorganisms in the biofilm may be a more reproducible control method of plant pathogens in the future.
    Źródło:
    Sylwan; 2011, 155, 04; 228-235
    0039-7660
    Pojawia się w:
    Sylwan
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Detection of antibiotic resistance genes in wastewater treatment plant : molecular and classical approach
    Wykrywanie genów oporności na antybiotyki w oczyszczalni ścieków : podejście klasyczne i biologii molekularnej
    Autorzy:
    Ziembińska-Buczyńska, A.
    Felis, E.
    Folkert, J.
    Meresta, A.
    Stawicka, D.
    Gnida, A.
    Surmacz-Górska, J.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/204828.pdf
    Data publikacji:
    2015
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    DGGE
    denaturing gradient gel electrophoresi
    PCR
    polymerase chain reaction
    sulfamethoxazole
    trimethoprim resistance
    erythromycin resistance
    WWTP
    wastewater treatment plant
    antybiotyki
    reakcja łańcuchowa polimerazy
    sulfametoksazol
    geny oporności
    odporność na trimetoprim
    odporność na erytromycynę
    oczyszczalnia ścieków
    Opis:
    Antibiotics are a group of substances potentially harmful to the environment. They can play a role in bacterial resistance transfer among pathogenic and non-pathogenic bacteria. In this experiment three representatives of medically important chemotherapeutics, confirmed to be present in high concentrations in wastewater treatment plants with HPLC analysis were used: erythromycin, sulfamethoxazole and trimethoprim. Erythromycin concentration in activated sludge was not higher than 20 ng L−1. N-acetylo-sulfamethoxazole concentration was 3349 ± 719 in winter and 2933 ± 429 ng L−1 in summer. Trimethoprim was present in wastewater at concentrations 400 ± 22 and 364 ± 60 ng L−1, respectively in winter and summer. Due to a wide variety of PCR-detectable resistance mechanisms towards these substances, the most common found in literature was chosen. For erythromycin: erm and mef genes, for sulfamethoxazole: sul1, sul2, sul3 genes, in the case of trimethoprim resistance dhfrA1 and dhfr14 were used in this study. The presence of resistance genes were analyzed in pure strains isolated from activated sludge and in the activated sludge sample itself. The research revealed that the value of minimal inhibitory concentration (MIC) did not correspond with the expected presence of more than one resistance mechanisms. Most of the isolates possessed only one of the genes responsible for a particular chemotherapeutic resistance. It was confirmed that it is possible to monitor the presence of resistance genes directly in activated sludge using PCR. Due to the limited isolates number used in the experiment these results should be regarded as preliminary.
    Antybiotyki to grupa związków potencjalnie szkodliwych dla środowiska. Odgrywają one rolę w procesach transferu antybiotykooporności pomiędzy patogenami i bakteriami niechorobotwórczymi. Wykorzystując metodę wysokosprawnej chromatografii cieczowej (HPLC) wykazano obecność erytromycyny, sulfametoksazolu i trimetoprimu w miejskiej oczyszczalni ścieków w następujących stężeniach: dla erytromycyny < 20 ng L−1, N-acetylo-sulfametoksazolu 3349 ± 719 i 2933 ± 429 ng L−1, a trimetoprimu 400 ± 22 i 364 ± 60 ng L−1, odpowiednio: zimą i latem. Ponieważ antybiotykooporność bakteryjna może być stymulowana obecnością antybiotyków w środowisku, istnieje możliwość pojawienia się wielu szlaków opornościowych u bakterii narażonych na działanie tych związków. Dlatego też podjęto próbę detekcji wybranych genów oporności na badane chemioterapeutyki metodą łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR). Obecność elementów genetycznych badano zarówno w szczepach bakteryjnych, u których udowodniono oporność na badany związek bakteriobójczy, jak i w próbce osadu czynnego, z którego te bakterie izolowano. Do badań wybrano najczęściej występujące geny oporności: dla erytromycyny erm i mef, dla sulfametoksazolu: sul1, sul2, sul3, a dla trimetoprimu dhfrA1 i dhfr14. Wykazano, że wartość minimalnego stężenia inhibitującego (MIC), nie koresponduje z obecnością większej liczby mechanizmów oporności. Większość szczepów opornych wykazywała tylko jeden z badanych mechanizmów oporności na antybiotyk niezależnie od wartości MIC. Potwierdzono również możliwość monitorowania obecności genów oporności na antybiotyki metodą PCR bezpośrednio w osadzie czynnym. Ze względu na ograniczona liczbę izolatów użytych w tym eksperymencie wyniki uzyskane w pracy powinny być traktowane jako wstęp do dalszych badań.
    Źródło:
    Archives of Environmental Protection; 2015, 41, 4; 23-32
    2083-4772
    2083-4810
    Pojawia się w:
    Archives of Environmental Protection
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
      Wyświetlanie 1-5 z 5

      Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies