Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "16S" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-7 z 7
Tytuł:
Identification and phenotypic plasticity of Pseudanabaena catenata from the Svalbard archipelago
Autorzy:
Khan, Zoya
Smykla, Jerzy
Wan Omar, Wan Maznah
Merican Mohd Sidik Merican, Faradina
Asmawarnie Azizan, Asmimie
Pin Foong, Choon
Convey, Peter
Najimudin, Nazalan
Aisyah Alias, Siti
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2042152.pdf
Data publikacji:
2017
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
16S rRNA
Arctic
Cyanobacteria
Polyphasic approach
Pseudanabaena
Źródło:
Polish Polar Research; 2017, 38, 4; 445-458
0138-0338
2081-8262
Pojawia się w:
Polish Polar Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Detection and identification of potentially toxic cyanobacteria in Polish water bodies
Autorzy:
Głowacka, Joanna
Szefel-Markowska, Magdalena
Waleron, Małgorzata
Łojkowska, Ewa
Waleron, Krzysztof
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039881.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Tematy:
mcyB
microcystins
toxins
16S rRNA
Cyanobacteria
mcyE
rpoC1
Opis:
The main goal of this study was to determine the distribution of potentially toxic cyanobacteria in 39 selected Polish water bodies. From the water bodies with blooms and also from those in which blooms were not visible 87 samples were investigated. For the first time samples from ponds localized in villages with high agricultural activities were included. Lakes for which microcystin concentrations had been determined before were included as a reference for the research. The detection of cyanobacteria was conducted by microscopic observation as well as by PCR amplification of the rpoC1 gene fragment. Cyanobacteria were present in 75 out of 87 samples. The presence of potentially toxic cyanobacteria was detected by amplification of the mcyB and mcyE genes, which are involved in the biosynthesis of microcystins. Both genes were detected in 7 out of 9 blooms investigated. In the case of samples collected from water bodies in which blooms were not observed, the mcyB and mcyE genes were detected in 20 out of 36. In order to identify the cyanobacteria occurring in selected reservoirs, 16S plus ITS clone libraries were constructed. The method allowed distinguishing 18 different genotypes. After sequence analysis, cyanobacteria belonging to genera Microcystis, Planktothrix, Anabaena, Pseudanabaena, Synechocystis, Synechococcus and Woronichinia were identified. Results confirmed the usefulness of the rpoC1 and mcy genes for monitoring water bodies and detection of potentially toxic cyanobacteria. Application of molecular markers allowed detecting potentially toxic cyanobacteria before the bloom was visible. This is the first comprehensive study concerning cyanobacteria present in different types of Polish water bodies performed using molecular markers.
Źródło:
Acta Biochimica Polonica; 2011, 58, 3; 321-333
0001-527X
Pojawia się w:
Acta Biochimica Polonica
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Evidence of amorphous Ca-phosphate precipitate caused by bio mineralisation in 4-5th CE lime plasters of the previously submerged east coastal monument of Salvankuppam
Autorzy:
Singh, Manager R.
Kumar, S. Vinodh
Ganaraj, Kuntikana
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2086560.pdf
Data publikacji:
2021
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Mineralogiczne
Tematy:
Amorphous Ca-phosphate
16S rRNA
Bio-mineralization
calcite
lime plasters
Opis:
The lime plasters of the excavated monument of Salvankuppam, previously submerged and exposed by the Tsunami occurred in the Indian Ocean on 26th December 2004 was studied with different analytical techniques. The temple is dated 4-5th century CE. The XRF, XRD, FTIR, NMR, SEM-EDX analysis of the lime plasters evidenced particular occurrence of phosphatised bacterial remains in saline conditions. The formation of amorphous Ca-phosphate by bio mineralization was identified in the plasters by the analyses. The plasters are made of air-lime with coarse aggregates and seashells inclusion as confirmed by the thermal and chemical analysis. The microstructure and morphological investigations of mineralized microbial structures by SEM-EDX indicated the formation of amorphous Ca-phosphate. The unordered and fibrous spherulites have hardened and reduced porosity of the plaster by bio mineralization as observed through MIP analysis. The 16S rRNA sequencing has identified the Pseudomonas strains mainly responsible for the clustering of amorphous Ca-phosphate particles around the bacterial colony.
Źródło:
Mineralogia; 2021, 52, 1; 19--30
1899-8291
1899-8526
Pojawia się w:
Mineralogia
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Dynamika ilościowa AOB w procesie biologicznego oczyszczania odcieków składowiskowych w warunkach beztlenowych
Quantitative dynamics of AOB in the biological treatment of landfill leachate in anaerobic conditions
Autorzy:
Jurczyk, Ł.
Koc-Jurczyk, J.
Różalska, P.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/296871.pdf
Data publikacji:
2011
Wydawca:
Politechnika Częstochowska. Wydawnictwo Politechniki Częstochowskiej
Tematy:
odcieki składowiskowe
SBR
AOB
16S rRNA
Q-PCR
landfill leachate
Opis:
Składowanie odpadów, nawet na obiektach prawidłowo zaprojektowanych i eksploatowanych może stwarzać wiele zagrożeń dla środowiska. Jednym z najpoważniejszych jest powstawanie w obrębie składowiska odcieków, charakteryzujących się między innymi dużymi stężeniami azotu amonowego oraz znaczną zawartością trudno rozkładalnych związków organicznych. Podstawową metodą unieszkodliwiania odcieków składowiskowych jest ich oczyszczanie w reaktorach biologicznych. U podstaw tego procesu leży biochemiczny rozkład azotu amonowego przez mikroorganizmy wykazujące ekspresję genu monooksygenazy amoniaku, a jednym ze sposobów zwiększenia jego efektywności jest stosowanie różnych typów nośników stwarzających tym mikroorganizmom optymalne warunki życia. Odcieki wykorzystane w badaniach pochodziły ze składowiska odpadów komunalnych w Kozodrzy (woj. podkarpackie). Badania prowadzono w trzech sekwencyjnych reaktorach biologicznych o pojemności 2 l (SBR 1-3), w warunkach beztlenowych, w temperaturze 42°C i przy stałym czasie zatrzymania wynoszącym 6 d. SBR 1 pracował tylko z osadem czynnym zawieszonym, natomiast SBR 2 i 3 zostały wyposażone w wypełnienia z PCV o różnej średnicy porów (odpowiednio 2 ÷ 3 oraz 4 ÷ 5 mm). W pobranych z reaktorów próbkach osadu badano, za pomocą techniki ilościowej łańcuchowej reakcji polimerazy (Q-PCR), zawartość kopii genu 16S rRNA o sekwencji charakterystycznej dla wszystkich znanych β-proteobakterii mających zdolność do utleniania amoniaku. Porównując w badanych próbkach dynamikę ilości badanego genu, stwierdzono, że wypełnienie zastosowane w SBR 2 powodowało najmniejsze wahania liczebności bakterii w procesie ich adaptacji do warunków technologicznych. Efektywność usuwania azotu amonowego we wszystkich reaktorach miała związek z ilością kopii badanego genu.
Waste disposal, even on properly designed and operated landfills may be environmentally hazardous. One of the most onerous aspects of landfilling is formation of the leachate, characterized by high concentrations of ammonia nitrogen and organic compounds. One of the most common method applied for nitrogen neutralization in landfill leachate is biological treatment based on biochemical decomposition of an ammonia by micro-organisms expressing gene of ammonia monooxygenase. The way to increasing efficiency of this process is the application of different types of fillings creating optimal conditions for microorganisms life. Leachate used in the study came from a large scale municipal waste landfill in Kozodrza (podkarpackie province, Poland). The research was conducted in three sequential batch reactors of 2 l (SBR 1-3), in anaerobic conditions, high temperature (42°C) and a constant HRT of 6 d. SBR 1 ran with suspended activated sludge, while the SBR 2 and 3 were equipped with PVC filling of different pore diameters (respectively 2 ÷ 3 and 4 ÷ 5 mm). The samples of sludge were examined for number of 16S rDNA copies characterized for ammonia oxidizing β-proteobacteria. Comparing the quantitative dynamics of 16S rRNA gene in samples it was found that fillings used in the SBR 2 resulted in slightest hesitation of the number of bacteria during the process of their adaptation to technological conditions. The ammonia nitrogen removal efficiency in all reactors was related to the number of 16S rRNA gene copies.
Źródło:
Inżynieria i Ochrona Środowiska; 2011, 14, 4; 309-322
1505-3695
2391-7253
Pojawia się w:
Inżynieria i Ochrona Środowiska
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie techniki PCR w badaniach bakteriologicznych
Applications of PCR in microbiology
Autorzy:
Adaszek, L.
Dziegiel, B.
Mazurek, L.
Winiarczyk, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/859637.pdf
Data publikacji:
2018
Wydawca:
Krajowa Izba Lekarsko-Weterynaryjna
Tematy:
bakteriologia
diagnostyka bakteriologiczna
metody badan
lancuchowa reakcja polimerazy
16S rRNA
diagnostyka molekularna
Źródło:
Życie Weterynaryjne; 2018, 93, 04
0137-6810
Pojawia się w:
Życie Weterynaryjne
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Genetic characterization of some rhizobial isolates from various legumes
Autorzy:
El-Ghany, E.M.A.
Eissa, R.A.
Fahmi, A.I.
Nagaty, H.H.
El-Zanaty, A.M.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2097126.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
rhizobia
morphological
API 20E and API 20NE
16S rRNA
phylogenetic
Opis:
In the last few decades, there has been a growing interest in environmentally friendly sustainable agricultural practices, thus increasing the role of biofertilizers such as rhizobia, which can decrease the need for chemical fertilizers, reduce adverse environmental effects, and help to save money. Therefore, information on the distribution and genetic variation of native rhizobial isolates would aid in selecting novel rhizobial strains that could be developed and used as biofertilizers in legume production. This research was conducted to characterize 24 rhizobial isolates from five legumes on morphological, biochemical, and molecular aspects and determine the phylogenetic relationships among them. Rhizobial isolates were obtained from five Egyptian legumes: faba bean, lentil, pea, clover, and soybean. Morphological characterization classified the isolates into fast and slow growers. Biochemical characterization using API 20E and API 20NE systems showed a large diversity, which may reflect their adaptation in different environments. Moreover, molecular detection of the 16S rRNA gene enabled to characterize 19 of them to the species level. Rhizobial isolates from pea, faba bean, clover, and lentil were identified as Rhizobium leguminosarum and those from soybean were identified as Bradyrhizobium japonicum. These data reflected a narrow diversity of rhizobial species in Egypt. A phylogenetic analysis of the 19 isolates confirmed that B. japonicum isolates were divergent from all other isolates. Furthermore, the phylogram revealed that each group of isolates that originated from the root nodule of a certain legume formed a separate subcluster. The obtained data suggested a narrow range of interspecies variations, which is consistent with the idea of the presence of biovars among the species.
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2020, 101, 3; 179-191
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Soil microbiomes of reclaimed and abandoned mines of the Yamal region
Autorzy:
Pershina, Elizaveta
Ivanova, Ekaterina
Kimeklis, Anastasia
Zverev, Alexey
Kichko, Arina
Aksenova, Tatiana
Andronov, Evgeny
Abakumov, Evgeny
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2041836.pdf
Data publikacji:
2020
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
Arctic
Yamal Peninsula
microbiome
soil
high-throughput sequencing
16S rRNA
qPCR
mining
reclamation
Źródło:
Polish Polar Research; 2020, 41, 1; 95-114
0138-0338
2081-8262
Pojawia się w:
Polish Polar Research
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-7 z 7

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies