Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "16S rRNA gene" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-4 z 4
Tytuł:
Some corrosive bacteria isolated from the technogenic soil ecosystem in Chernihiv city (Ukraine)
Autorzy:
Tkachuk, Nataliia
Zelena, Liubov
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2026000.pdf
Data publikacji:
2021
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
16S rRNA gene
microbial induced corrosion
phenotypic characteristics
Opis:
The soil microbiome is exposed to technogenic influence during the operation of metal structures. There are quantitative and qualitative changes in the microbiota of the technogenic ecosystem. During the study of the technogenic soil ecosystem (ferrosphere), samples of which were taken in the field (Chernihiv, Ukraine: 51°29’58”N, 31°16’09”E), the presence of corrosively active microbial cenosis was established: sulfate-reducing, denitrifying, iron-reducing (using acetate as the only electron donor, and Fe (III) as the only electron acceptor) and ammonifying bacteria. The predominant representatives of corrosively active groups of bacteria were isolated. They were identified as Bacillus simplex, Streptomyces gardneri, Streptomyces canus (ammonifying bacteria), Fictibacillus sp. (ammonifying bacteria with iron-reducing ability), Anaerotignum (Clostridium) propionicum (organic acid-producing bacteria), Desulfovibrio oryzae (sulfate-reducing bacteria) based on some microbiological, physiological and biochemical, genetic features. Strains of heterotrophic and hemolitotrophic bacteria (individual representatives and their associations) isolated from the technogenic ecosystem can be used in both industrial and technological spheres. The interaction of isolated bacteria in the process of microbial induced corrosion is a prospect for further research.
Źródło:
Studia Quaternaria; 2021, 38, 2; 101-108
1641-5558
2300-0384
Pojawia się w:
Studia Quaternaria
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The Application of PCR Reaction for Identification of MHB Bacteria Species
Zastosowanie reakcji PCR do identyfikacji gatunkowej bakterii MHB
Autorzy:
Ząbkiewicz, A.
Myga-Nowak, M.
Bandurska, K.
Paczyńska, J.
Szybecka, A.
Krupa, P.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/205412.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
mycorrhiza
helper bacteria
MHB
16S rRNA gene
mikoryza
bakterie wspomagające
gen 16sRNA
Opis:
This study characterizes mycorrhiza helper bacteria (MHB) from selected unpolluted locations as well as subjected to industrial emissions. To determine the species of bacteria isolated from the roots of ectomycorrhizal pine and birch, a method based on the sequence analysis of a 16S rRNA gene was used. The isolated bacteria were initially characterized by available biochemical methods and phenotypic observation. On the selected bacteria representatives isolation of DNA was performed, on which the PCR reaction was carried out. In this way amplified samples were automatically sequenced and the obtained results were compared to public databases. Among the isolated bacteria Pseudomonas fluorescens SBW25 and Burkholderia xenovorans LB400 species were dominant.
W pracy scharakteryzowano bakterie wspomagające mikoryzę pochodzące z wybranych terenów ekologicznie czystych oraz z terenów poddanych emisji przemysłowej. Przedstawiono wykorzystanie metody opartej na analizie sekwencji genu 16S rRNA do określenia przynależności gatunkowej bakterii wyizolowanych z korzeni ektomikoryzowych sosny i brzozy. Wyizolowane bakterie zostały wstępnie scharakteryzowane przy pomocy dostępnych metod biochemicznych i obserwacji fenotypowej. Dla wybranych przedstawicieli dokonano izolacji DNA, względem którego przeprowadzono reakcję PCR. Powielone w ten sposób próbki automatycznie zsekwencjonowano, a uzyskane sekwencje porównywano w ogólnodostępnych bazach danych. Wśród wyizolowanych bakterii dominowały gatunki Pseudomonas fluorescens SBW25 oraz Burkholderia xenovorans LB400.
Źródło:
Archives of Environmental Protection; 2014, 40, 2; 115-122
2083-4772
2083-4810
Pojawia się w:
Archives of Environmental Protection
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Isolation and characterization of biosurfactants-producing bacteria isolated from palm oil industry and evaluation for biosurfactants production using low-cost substrates
Autorzy:
Saisa-Ard, K.
Manerrat, S.
Saimmai, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/81283.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
isolation
biosurfactant
phylogenetic analysis
palm oil
contaminated soil
surface tension
phylogenetic position
16S rRNA gene
Źródło:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology; 2013, 94, 3
0860-7796
Pojawia się w:
BioTechnologia. Journal of Biotechnology Computational Biology and Bionanotechnology
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Comparison of PCR-DGGE and Nested-PCR-DGGE Approach for Ammonia Oxidizers Monitoring in Membrane Bioreactors’ Activated Sludge
zalety i wady wykorzystywania techniki nested-PCR w monitoringu bakterii utleniających amoniak w osadzie czynnym bioreaktora membranowego
Autorzy:
Ziembińska-Buczyńska, A.
Wiszniowski, J.
Ciesielski, S.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/204755.pdf
Data publikacji:
2014
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Tematy:
ammonia oxidizing bacteria
AOB
16S rRNA gene
Polymerase Chain Reaction – Denaturing Gradient Gel Electrophoresis
PCR-DGGE
nested-PCR
utlenianie amoniaku
bakteria utleniająca amoniak
gen kodujący 16S rRNA
Opis:
Nitritation, the first stage of ammonia removal process is known to be limiting for total process performance. Ammonia oxidizing bacteria (AOB) which perform this process are obligatory activated sludge habitants, a mixture consisting of Bacteria, Protozoa and Metazoa used for biological wastewater treatment. Due to this fact they are an interesting bacterial group, from both the technological and ecological point of view. AOB changeability and biodiversity analyses both in wastewater treatment plants and lab-scale reactors are performed on the basis of 16S rRNA gene sequences using PCR-DGGE (Polymerase Chain Reaction – Denaturing Gradient Gel Electrophoresis) as a molecular biology tool. AOB researches are usually led with nested PCR. Because the application of nested PCR is laborious and time consuming, we have attempted to check the possibility of using only first PCR round to obtain DGGE fingerprinting of microbial communities. In this work we are comparing the nested and non-nested PCR-DGGE monitoring of an AOB community and presenting advantages and disadvantages of both methods used. The experiment revealed that PCR technique is a very sensitive tool for the amplification of even a minute amount of DNA sample. But in the case of nested-PCR, the sensitivity is higher and the template amount could be even smaller. The nested PCR-DGGE seems to be a better tool for AOB community monitoring and complexity research in activated sludge, despite shorter fragments of DNA amplification which seems to be a disadvantage in the case of bacteria identification. It is recommended that the sort of analysis approach should be chosen according to the aim of the study: nested-PCR-DGGE for community complexity analysis, while PCR-DGGE for identification of the dominant bacteria.
Nitiritacja – pierwszy etap nitryfikacji, jest uznawany za krok limitujący przebieg całości procesu utleniania amoniaku. Bakterie utleniające amoniak (ang. ammonia oxidizing bacteria, AOB), które prowadzą ten proces są stałymi mieszkańcami osadu czynnego – mieszaniny bakterii, Protozoa i Metazoa, wykorzystywanych do biologicznego oczyszczania ścieków. Z tego powodu są one interesujące zarówno z punktu widzenia technologii, jak i ekologii mikroorganizmów. Analizy zmienności i bioróżnorodności bakterii utleniających amoniak, zarówno w oczyszczalni ścieków, jak i w reaktorach w skali laboratoryjnej, są prowadzone w oparciu o sekwencje genu kodującego 16S rRNA z użyciem metody biologii molekularnej, jaką jest PCR-DGGE (Polymerase Chain Reaction – Denaturing Gradient Gel Electrophoresis). Analizy te są zazwyczaj prowadzone techniką tzw. nested-PCR. Ze względu na fakt, że metoda ta wymaga większego nakładu pracy i czasu, niż tradycyjny jednoetapowy PCR (ang. non-nested PCR) podjęto próbę sprawdzenia możliwości zastosowania techniki jednoetapowego PCR do uzyskania wzorów prążkowych DGGE bakterii utleniających amoniak. W tej pracy zaprezentowano wyniki analizy PCR-DGGE z użyciem technik nested i non-nested PCR oraz podjęto próbę wykazania ich wad i zalet.
Źródło:
Archives of Environmental Protection; 2014, 40, 4; 31-38
2083-4772
2083-4810
Pojawia się w:
Archives of Environmental Protection
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-4 z 4

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies