Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "molecular markers," wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-8 z 8
Tytuł:
Assessment of Potato Resistance to Synchytrium Endobioticum
Autorzy:
Przetakiewicz, Jarosław
Plich, Jarosław
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199702.pdf
Data publikacji:
2017-12-20
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
potato wart disease
resistance
molecular markers
Opis:
In Poland the Plant Breeding and Acclimatization Institute - National Research Institute (IHAR-PIB) is responsible for officially assessing the resistance of potato breeding lines and cultivars to Synchytrium endobi-oticum. In the official assessment of wart resistance the modified Glynne-Lemmerzahl method is used. A full cycle of assessment of the wart disease resistance requires 42 - 45 tubers per cultivar/breeding line. Forty two tubers are used in laboratory tests. To complete the laboratory tests, another 10 tubers are inoculated with winter sporangia of the fungus, using ring test. The final results are available after 3 years of investigation. If necessary, the full cycle of resistance tests to S. endobioticum can be performed during one year on 15 tubers in each of the 3 replications (45 tubers in total).Molecular verification of potato genotypes resistance to pathotype 1(D1) is possible with the use of SCAR marker Nl25-1400. Nevertheless, an official phenotypical assessment of advanced breeding lines, as the final verification of their resistance, is required.
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2017, 76; 37-43
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Comparison of RAPD, ISSR and SSR markers in assessing genetic diversity among rye*(Secale cereale L.) inbred lines
Autorzy:
Myśków, Beata
Milczarski, Paweł
Masojc, Piotr
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199589.pdf
Data publikacji:
2010-12-01
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
dendrogram
genetic diversity
molecular markers
rye
Opis:
Forty eight inbred lines of winter rye, of various origin and pedigree, were analysed using 19 RAPD (random amplified polymorphic DNA) primers, 8 ISSR (inter-simple sequence repeats) primers and 13 SSR (simple sequence repeats) primer pairs. On the basis of particular marker types, there were created three separate dendrograms and one combined similarity tree, prepared on account of the whole data. Correlation coefficients for individual technique based on genetic similarity matrices were not significant. By comparing the GS data obtained on the basis of singular methods with collective matrix, it was observed that the highest correlation rate was for ISSR method (r=0.68). The utility of each marker technique was compared by using marker index MI. Diversity detecting index (DDI) was suggested in the paper, which may prove helpful in planning and comparing researches on phenetic relationships...
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2010, 62; 107-116
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Interval mapping of genes controlling growth of rye plants
Autorzy:
Milczarski, Paweł
Masojć, Piotr
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2198924.pdf
Data publikacji:
2003-12-21
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
QTLs
growth
genetic map
molecular markers
Secale cereale L.
Opis:
The F2-type population derived from the cross between DS2 and RXL1O inbred lines was used for interval mapping of five growth related traits i.e. plant height, spike length, thousand grain weight, kernel length and kernel thickness. Scanning of the whole 1,140 cM length of rye genetic map consisting of 286 marker loci revealed the existence of 6 regions containing QTL5 on chromosomes 1R-5R. Plant height was strongly affected by 1-3 linked dwarfing genes from a distal region of the chromosome 5RL and by 1 gene on the chromosome 3RL, tightly linked to a marker loci Xpsr4 75. These same genes regulated also thousand grain weight and kernel length and thickness. Spike length was determined only by the QTL from chromosome 5RL. In addition a single QTL from chromosome 2R affecting thousand grain weight and kernel thickness was identified, near the molecular marker locus Xrsq8OS. 1. Kernel length and kernel thickness were additionally controlled by QTL5 on chromosomes 2R and 1R and 4R, respectively.
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2003, 48; 135-142
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zastosowanie metod RAPD i ISSR do oceny podobieństwa genetycznego greckich form Dasypyrum villosum (L.) P. Candargy
Application of RAPD and ISSR methods to genetic similarity estimation of Greek Dasypyrum villosum (L.) P. Candargy populations
Autorzy:
Grądzielewska, Agnieszka
Paczos-Grzęda, Edyta
Gruszecka, Daniela
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/42809908.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
Dasypyrum
ISSR
RAPD
markery molekularne
podobieństwo genetyczne
genetic similarity
molecular markers
Opis:
W pracy przeprowadzono ocenę podobieństwa genetycznego 9 greckich form Dasypyrum villosum L. (P.) Candargy pochodzących z trzech regionów Grecji (Tesalii oraz Zachodniej i Środkowej Macedonii) na podstawie polimorfizmu markerów RAPD i ISSR. Analizę podobieństwa genetycznego przeprowadzono z wykorzystaniem 18 wyselekcjonowanych starterów RAPD i 17 starterów ISSR. Ogółem otrzymano 122 fragmenty RAPD i 210 ISSR, z czego 50% było polimorficznych. Technika RAPD pozwoliła na identyfikację produktów specyficznych jedynie u pięciu z dziewięciu badanych form, podczas gdy przy udziale metody ISSR otrzymano takie fragmenty dla siedmiu populacji, najwięcej dla W6 7264. Dla obu zastosowanych w badaniach metod obliczono współczynnik informacji o polimorfizmie (PIC), którego wartość zawierała się w przedziale 0,13–0,68 dla RAPD i 0,15–0,52 dla ISSR, średnio odpowiednio 0,32 i 0,33. Na podstawie polimorfizmu markerów RAPD i ISSR oraz obu technik łącznie obliczono wartości indeksów podobieństwa genetycznego Dice’a, pomiędzy parami badanych populacji. Średnie podobieństwo badanych obiektów wyniosło odpowiednio 0,854, 0,871 i 0,864. Najbardziej odmienną od pozostałych była forma W6 7264. W oparciu o matryce podobieństw Dice’a skonstruowano dendrogramy obrazujące stosunki pokrewieństwa pomiędzy badanymi populacjami.
Estimation of genetic similarity between nine Greek Dasypyrum villosum L. (P.) Candargy populations native to three Greece regions (Thesally, West and Central Macedonia) was performed basing on polymorphism of RAPD and ISSR markers. Eighteen RAPD and seventeen ISSR selected primers were used in the genetic similarity analyses. In total, 122 RAPD and 210 ISSR products were obtained, out of which 50% were polymorphic. The RAPD method identified specific products only in five from nine populations studied, while ISSR in seven, most for W6 7264. Polymorphic information content (PIC) values calculated for the both methods, ranged from 0.13–0.68 for RAPD and 0.15–0.52 for ISSR. Mean values of PIC for RAPD and ISSR were 0.32 and 0.33, respectively. Based on the polymorphism of RAPD and ISSR markers and both methods combined, genetic similarities using Dice algorithm were estimated between pairs of populations analyzed. Mean genetic similarities were 0.854, 0.871 and 0.864, respectively. Most different from the others was W6 7264. Based on Dice matrix similarities, dendrograms showing relatedness between the analyzed populations were constructed.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2009, 253; 297-307
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zróżnicowanie genetyczne linii wsobnych kukurydzy a plonowanie odmian mieszańcowych
Genetic distance among inbred lines of maize and its association with hybrid performance
Autorzy:
Rogacki, Janusz
Bulińska-Radomska, Zofia
Dzienkiewicz, Jakub
Adamaczyk, Józef
Cygert, Henryk
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/42821662.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
markery molekularne
plon mieszańców
Zea mays L.
hybrid performance
molecular markers,
Opis:
Celem pracy była ocena zróżnicowania genetycznego 10 linii wsobnych o ziarnie zębokształtnym (dent) i 7 linii o ziarnie szklistym (flint) kukurydzy w relacji do plonowania 70 mieszańców eksperymentalnych powstałych w wyniku czynnikowego układu krzyżowania „dent × flint”. Do oceny zróżnicowania genetycznego 17 linii wsobnych kukurydzy użyto markerów RAPD generowanych w oparciu o technikę PCR. Do powielania znaczników (markerów) wykorzystano 12 semi-specyficznych 18.-nukleotydowych starterów. Wyliczenie wartości współczynnika dystansu genetycznego Nei’a pomiędzy poszczególnymi badanymi liniami zostało przeprowadzone w oparciu o 404 polimorficzne fragmenty DNA. Wartości współczynników dystansu genetycznego wyliczono wg metody Nei & Li (1979). Większość wykorzystanych starterów generowała obrazy z wysokim udziałem fragmentów polimorficznych. Wartości współczynników dystansu genetycznego uzyskane dla par linii były stosunkowo wysokie i zawierały się w przedziale od 0,29 do 0,72. Analiza skupień przeprowadzona metodą średnich połączeń (UPGMA) wartości współczynników dystansu genetycznego dała podstawę do wyodrębnienia trzech różniących się między sobą grup linii kukurydzy; dwóch w obrębie linii o ziarnie zębokształtnym oraz jednej wspólnej dla linii szklistych. Średnia wartość współczynnika dystansu genetycznego w obrębie linii zębokształtnych wyniosła 0,56, natomiast w obrębie linii szklistych 0,46. Regresja plonów 70 mieszańców (dent × flint) względem dystansu genetycznego linii rodzicielskich tworzących ich formuły, wskazuje na bardzo słaby związek obu cech. Reasumując, przedstawiona metoda jest bardziej przydatna do poprawnego zaszeregowania linii do właściwej grupy heterotycznej niż do prognozowania wysokości plonu ziarna mieszańca na podstawie dystansu genetycznego pomiędzy liniami rodzicielskimi.
The main objective of the present study was to evaluate the genetic diversity of 17 (10 dent and 7 flint) inbred lines of maize in relation to yield performance of 70 hybrids produced according to North Carolina II design “dent × flint”. To assess genetic divergence among 17 inbred lines, random amplified polymorphic DNA (RAPD) molecular markers were used. Twelve different, primers consisting of 18 nucleotides were used to produce a total of 404 reproducible amplification DNA fragments, the majority of which were polymorphic. The values of genetic distance were calculated according to Nei & Li method (1979). The genetic distance among pairs of inbred lines ranged from 0.29 to 0.72. A dendrogram was constructed by an unweighted pair-group method using arithmetic averages (UPGMA). Cluster analysis divided the inbred lines into three groups: one including the flint lines only, and two groups composed of the dent type lines. The average value of genetic distance for pair comparison between the dent lines was higher (GD = 0.56) than that for the flint lines (GD = 0.46). Regression of hybrids grain yield on a genetic distance of their parental inbred lines showed very low correlation. The method used in this research is useful to allocate lines into a heterotic group rather than predict hybrid yield performance.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2009, 253; 231-243
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Efektywność markerów molekularnych SCAR z chromosomu 4RL w selekcji genotypów męskopłodnych oraz ich związek z wybranymi cechami morfologicznymi żyta (Secale cereale L.)
Efficiency of the SCAR markers from 4RL chromosome in selection of male fertile genotypes and their relation to some morphological traits in rye (Secale cereale L.)
Autorzy:
Kociuba, Monika
Stojałowski, Stefan
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/42791302.pdf
Data publikacji:
2009
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
cytoplazmatyczna męska sterylność
cytoplazma Pampa
markery molekularne
żyto
cytoplasmic male sterility
Pampa cytoplasm
molecular markers
rye
Opis:
Celem prezentowanych badań było sprawdzenie efektywności znanych wcześniej z literatury oraz nowo opracowanych markerów SCAR z chromosomu 4RL przy selekcjonowaniu męskopłodnych genotypów posiadających cytoplazmę Pampa. Materiał badawczy stanowiła populacja F2 mieszańca pomiędzy męskosterylną linią wsobną 541P, a pojedynczą, losowo wybraną rośliną z populacji prymitywnego żyta irańskiego — IRAN IX. W pracy oceniono też związek pomiędzy płodnością roślin, a kilkoma cechami morfologicznymi mieszańca: liczbą kłosków w kłosie, długością kłosa oraz wysokością roślin, ale nie wykryto pomiędzy nimi silnych zależności. Z czternastu testowanych markerów zmapowanych na długim ramieniu chromosomu 4R jedynie cztery ujawniły polimorfizm w badanym materiale i utworzyły grupę sprzężeń. Skonstruowana w oparciu o segregacje tych markerów mapa genetyczna obejmuje obszar 24cM, a wszystkie markery należące do tej grupy wykazują statystycznie istotny związek z płodnością roślin badanego mieszańca. Najefektywniejszy przy ewentualnym selekcjonowaniu genotypów męskopłodnych okazał się marker SCP16M58. Średnio, w badanej populacji rośliny posiadające prążek markerowy zawiązywały czterokrotnie więcej ziaren pod izolatorami w porównaniu do osobników bez prążka. Marker ten wykazywał równocześnie istotny statystycznie związek z locus kontrolującym długość źdźbła, pomimo że współczynnik korelacji między płodnością roślin, a ich wysokością nie osiągał w badanej populacji wysokich wartości.
The study aimed at a verification if previously published as well as newly developed SCAR markers located on the 4RL chromosome can be efficient in selecting male fertile genotypes with the Pampa cytoplasm. Research material constituted a F2 population developed after crossing the male sterile inbred line 541 with a single randomly chosen plant from the IRAN IX population of primitive rye. Correlations between male fertility and some morphological traits of plants i.e.: number of spikelets per ear, length of ear and plant height were also examined but no strong dependences were detected. Only 4 out of 14 tested markers mapped on the long arm of 4R chromosome revealed polymorphism between parental genotypes of the studied hybrid. These four SCAR markers formed one linkage group. The constructed genetic map covered the distance of 24cM and all markers belonging to this linkage group showed a statistically significant relation to male fertility of the studied individuals. The most effective tool for selection of male fertile genotypes proved to be the SCP16M58 marker. On average, in the analyzed population, seed set under bags was four times higher on plants with the marker band vs. individuals without the band. This marker showed as well a significant relation to the locus controlling plant height, although the correlation coefficient between male fertility of plants and their height was rather low.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2009, 252; 139-149
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Charakterystyka wybranych markerów molekularnych
Characteristic of selected molecular markers
Autorzy:
Bolc, Paulina
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199379.pdf
Data publikacji:
2020-10-22
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
markery molekularne
RFLP
AFLP
RAPD
SSR
ISSR
SRAP
SNP
PCR
polimorfizm
różnorodność genetyczna
molecular markers
polymorphism
genetic diversity
Opis:
Postęp, jaki nastąpił w biologii molekularnej poprzez wprowadzenie markerów molekularnych nowej generacji, w ciągu ostatnich 20 lat umożliwił znaczny rozwój wielu dziedzin badań. Możliwe stało się uzyskanie dokładniejszych informacji genetycznych pozwalających na lepsze zrozumienie zasobów genetycznych organizmów. Markerem molekularnym może być każda sekwencja nukleotydowa (wybrany fragment DNA), rozproszony w całym genomie, której zmienność między osobnikami lub grupami taksonomicznymi umożliwia precyzyjną identyfikację osobnika/taksonu. Kompilacja właściwości enzymów restrykcyjnych jak również reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) w technikach generujących markery molekularne pozwoliła na efektywne wykorzystanie ich w taksonomicznych, ewolucyjnych i ekologicznych badaniach roślin.
Over the last 20 years, the progress in molecular biology through the introduction of new generation molecular markers has allowed many areas to move forward. It has now become possible to obtain more accurate genetic information to better understand the genetic resources of organisms. A molecular marker can be any nucleotide sequence (selected DNA fragment) scattered throughout the genome, whose variability between individuals or taxonomic groups allows precise identification of the individual/taxon. The effectiveness of restriction digestion and polymerase chain reaction based on molecular markers has already proved their usefulness in taxonomic, evolutionary and ecological plant research.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2020, 290; 27-32
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Wykorzystanie biotechnologii przez polską hodowlę roślin
Exploitation of biotechnology by Polish plant breeding
Autorzy:
Zimnoch-Guzowska, Ewa
Gołębiewska, Małgorzata
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2198015.pdf
Data publikacji:
2011-03-31
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
kierunki hodowli
ograniczenia postępu hodowlanego
wykorzystanie markerów molekularnych
hodowla wstępna
usługi biotechnologiczne
breeding directions
difficulties in breeding
use of molecular markers
pre-breeding
biotechnological services
Opis:
W ramach koordynacji projektu badawczego zamawianego PBZ-MNiSW-2/3/2006 pt. „Nowe metody genetyki molekularnej i genomiki służące doskonaleniu odmian roślin uprawnych” przeprowadzono badania ankietowe wśród krajowych ośrodków hodowli roślin na temat wykorzystania biotechnologii w procesie hodowlanym roślin uprawnych. W badaniach wzięło udział 18 krajowych ośrodków hodowli roślin. Ankieta obejmowała 14 rozbudowanych pytań, ukazujących obecny stan wykorzystania biotechnologii w hodowli twórczej, trudności w uzyskaniu oczekiwanego postępu hodowlanego, znacznie pożądanych kierunków hodowli w poszczególnych gatunkach, obecne i przyszłe zastosowanie markerów molekularnych, zainteresowanie firm hodowlanych w szkoleniu własnego personelu, celowości prowadzenia programu hodowli wstępnej przez wyspecjalizowane ośrodki oraz korzystania z usług biotechnologicznych oferowanych hodowcom.
Survey on application of biotechnology in the breeding process of cultivated plants was organized in the frame of coordination of the PBZ-MNiSW-2/3/2006 project entitled: “New methods of molecular genetics and genomics served to variety improvement in cultivated plants”. All of the eighteen invited domestic breeding centers took part in the survey. Fourteen extended questions were focused on current status of biotechnology application to plant breeding, difficulties in achieving expected breeding progress, importance of desired directions in breeding of respective plant species, use of molecular markers — currently and in the future, interest of breeding companies in training of their own staff, necessity of pre-breeding program realization by specialized centers and use of biotechnological services offered to breeders.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2011, 259; 121-129
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-8 z 8

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies