Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "gene expression" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-4 z 4
Tytuł:
Fatty Acid and Transcript Profiling in Developing Seeds of Three Brassica Napus Cultivars
Autorzy:
Petkova, Mariana
Chao, Wun S.
Cook, Leonard
West, Mark
Rahman, Mukhlesur
Foley, Michael E.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199642.pdf
Data publikacji:
2020-06-29
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
canola
Brassica napus
fatty acid
gene expression
oilseed
rapeseed
seed
Opis:
Fatty acid levels and gene expression profiles for selected genes associated with the synthesis of fatty acids (FA), triacylglycerol, and oil body proteins were examined in three oilseed rape (Brassica napus) cultivars that have utility for cultivar development in our spring canola breeding program. The seed oil content of Bronowski, Q2, and Westar was 39.0, 40.1, and 40.6%, respectively at 40 days after flowering (DAF). During the 20 to 40 day period of seed development, cultivars had varying levels of palmitic, stearic, oleic, linoleic, α-linolenic, eicosenoic, and erucic acid. In general, the percentage of each FA was similar among the cultivars during seed development. However, the level of oleic acid was lower and the levels of eicosenoic acid and erucic acid were higher in Bronowski than in Q2 and Westar seeds; linoleic acid also tended to be lower in Bronowski. Gene expression among the cultivars was similar from 10 to 40 DAF. The few exceptions were that expression of KAS1 and SAD were higher in Westar and Q2 than in Bronowski at 25 DAF, SAD was highest in Q2, intermediate in Westar, and lowest in Bronowski at 35 DAF, FAD2 was higher in Q2 than in Bronowski at 35 DAF, FAD3 was higher in Q2 than in Bronowski at 15 DAF and Q2 and Westar at 25 and 30 DAF, and FAE1 was higher in Westar and Q2 than in Bronowski at 30 DAF. Correlation analysis for gene expression against DAF for each genotype supported a common trend in gene expression among the three cultivars with gene expression tending to decrease over time; except for LPAAT, which tended to increase. The correlation between the level of FAs and expression of genes by genotype indicated no general trend; rather correlations seem to depend on the genotype.
Źródło:
Plant Breeding and Seed Science; 2015, 72; 3-32
1429-3862
2083-599X
Pojawia się w:
Plant Breeding and Seed Science
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Przegląd badań nad regulacją ekspresji genów głównych odporności roślin na patogeny
Studies review of gene expression regulation of the plant major resistance genes against pathogens
Autorzy:
Świątek, Mariusz
Śliwka, Jadwiga
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2198190.pdf
Data publikacji:
2011-12-29
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
ekspresja genów
geny R
odporność roślin
patogeny roślin
gene expression
plant pathogens
plant resistance
R genes
Opis:
Rośliny, podobnie jak zwierzęta, wykształciły wielopoziomowe mechanizmy obronne, które nadają im odporność na szkodniki i patogeny. Pierwotna odpowiedź obronna nie zawsze jednak zapewnia wystarczający poziom odporności na patogeny, które dysponują szerokim wachlarzem mechanizmów przystosowawczych. Inny typ odporności jest warunkowany przez geny główne odporności — geny R. Kodowane przez nie białka, pełniące rolę receptorów, oddziałują z produktami genów awirulencji patogenów i uruchamiają szlak transdukcji sygnału, który prowadzi do reakcji nadwrażliwości, co zapobiega szerzeniu się infekcji. W związku z wysokimi zdolnościami adaptacyjnymi patogenów, poszukuje się nowych genów odporności w dzikich gatunkach roślin, które zapewniłyby roślinom uprawnym trwałą odporność. Mimo dużej liczby zidentyfikowanych i sklonowanych genów R, badaniami ekspresji objęto jak dotąd niewiele z nich. Geny R, pomimo podobieństw budowy, wykazują różny wzór ekspresji pod wpływem działania czynników biotycznych i abiotycznych. Większość genów R ulega konstytutywnej ekspresji, lecz obserwowane są także przypadki wzmacniania lub indukcji ekspresji w wyniku kontaktu z patogenem. Badania molekularne dotyczące ekspresji genów R mogą mieć w niedalekiej przyszłości zastosowanie aplikacyjne w selekcji roślin do hodowli odpornościowej, na co wskazują wyniki dotychczasowych doświadczeń. Celem przeglądu jest usystematyzowanie informacji uzyskanych z dotychczasowych badań nad ekspresją genów odporności roślin na patogeny.
Plants, like animals, have developed multi-layered defense mechanisms that make them resistant to pests and pathogens. Innate basal defense response do not always provide a sufficient level of resistance to pathogens that use a wide range of adaptive mechanisms. Another type of resistance is that conferred by the major resistance genes — R genes. Proteins coded by those genes act as receptors that interact with the corresponding products of avirulence genes of the pathogens. They trigger then signal transduction pathway that leads to hypersensitive reaction, thus preventing the spreading of infection. Due to the high adaptability of pathogens, scientists are forced to search for new resistance genes in wild species of plants that would provide more durable resistance in crops. Despite the fact that the large number of R genes has been identified and cloned up to date, the expression surveys were performed only on a few of them. The R genes have structural similarities but often show different pattern of expression under the influence of biotic and abiotic factors. Most of the R genes are constitutively expressed, but there are also cases of enhancing or inducing the expression as a result of interaction with the pathogen. Molecular research including gene expression issue may have an application aspect in the near future in selection of plants for resistance breeding programs, as was demonstrated in the some experiments. The objective of this review is to pool the information obtained from previous studies on gene expression of plant resistance genes to pathogens.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2011, 262; 89-101
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Metody analizy ekspresji genów w badaniach nad rzepakiem
Methods for gene expression analysis in studies of oilseed rape
Autorzy:
Olejnik, A.
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/833939.pdf
Data publikacji:
2013
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
rzepak
Brassica napus
hodowla roslin
genetyka roslin
ekspresja genow
metody analizy
mikromacierze DNA
seryjna analiza ekspresji genow
odwrotna transkrypcja
biotechnologia
badania molekularne
rape
plant breeding
plant genetics
gene expression
analysis method
transcription
biotechnology
molecular study
Opis:
W pracy przedstawiono przegląd metod analizy ekspresji genów z zastosowaniem technik: mikromacierzy DNA, seryjnej analizy ekspresji genów (SAGE), jak również odwrotnej transkrypcji – RT-PCR oraz qRT-PCR. Zaprezentowano możliwości wykorzystania poszczególnych technik wraz z przykładami ich praktycznego zastosowania w badaniach molekularnych rzepaku.
This paper presents an overview of gene expression analysis methods, including: DNA microarrays, SAGE (Serial Analysis of Gene Expression), as well as reverse transcription techniques: RT-PCR and qRT-PCR. It also includes some examples of application of the methods in molecular studies on oilseed rape genome and transcriptome.
Źródło:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops; 2013, 34, 1
1233-8273
Pojawia się w:
Rośliny Oleiste - Oilseed Crops
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Ocena zmian profilu ekspresji genów kandydujących w podkładkach jabłoni o odmiennym stopniu tolerancji mrozowej
Evaluation of changes in the expression profile of candidate genes in apple rootstockss with a different degree of frost tolerance .
Autorzy:
Keller-Przybyłkowicz, Sylwia
Lewandowski, Mariusz
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2199254.pdf
Data publikacji:
2020-12-09
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:
adnotacja funkcjonalna genów
Malus domestica Borkh.
sekwencjonowanie
profil ekspresji
ilościowa reakcja amplifikacji
expression profile
gene annotation
new generation sequencing (NGS)
quantitative transcript level (qRT-PCR)
Opis:
Celem przeprowadzonych badań była identyfikacja genów sprzężonych z cechą mrozoodporności podkładek jabłoni. Ocenę zmian w poziomie ekspresji wyizolowanych genów przeprowadzono metodami RNAseq i qRT-PCR, dla podkładek zróżnicowanych po względem stopnia tolerancji mrozowej: P 66 (tolerancyjna) i M.9 (wrażliwa).W wyniku przeprowadzonych odczytów sekwencji RNA (sekwencjonowanie de novo w systemie Illumina Solid) dla w/w podkładek zidentyfikowano około 167 milionów odczytów unikatowych sekwencji, z których do wstępnych badań weryfikacyjnych wytypowano 15 o zróżnicowanym profilu ekspresji. Sekwencje poddano adnotacji funkcjonalnej. Wytypowane geny kodują: białka strukturalne i integralne błon komórkowych i wakuoli komórkowych, czynników transkrypcyjnych, białek regulujących transport międzykomórkowy i wewnątrzkomórkowy, białek hydrolizujących wiązania C-O i C-N oraz białek wiążących makro- i mikroelementy. Celem weryfikacji typu regulacji sekwencji transkryptomu uzyskanych z sekwencjonowania nowej generacji (NGS), dla tych samych prób przeprowadzono ilościową analizę transkryptu genów (qRT-PCR). Spośród badanych genów, trzy reprezentowały identyczny typ regulacji w badanych układach eksperymentalnych RNA-seq i qRT-PCR. Wytypowane geny stanowią potencjalne sekwencje kandydujące do sporządzenia markerów funkcjonalnych, umożliwiających wczesną selekcję podkładek jabłoni tolerancyjnych na mróz.
The aim of presented study was to identify putative candidate genes associated with apple rootstock winter hardiness. The assessment of changes in expression profile of isolated differentially expressed genes, was performed using two subsequent experiments: RNAseq (based on New Generation Sequencing, NGS) and qRT-PCR (Real Time transcript amplification). In terms of traits of interests two apple rootstocks P 66 (frost tolerant) and M.9 (frost sensitive) were evaluated. As a result of the RNA sequence readings (de novo sequencing, Illumina Solid system), approximately 167 million reads of unique sequences were identified. Finally, fifteen functionally annotated expressed tags, representing different expression profile, were chosen. Selected putative genes coding: structural and integral proteins of cell membranes and cellular vacuoles, transcription factors, proteins regulating intercellular and intracellular transport, C-O and C-N bonds hydrolyzes, and proteins binding macro- and microelements. In order to verify the type of regulation of the transcriptome sequences obtained in NGS technology, qRT-PCR tests were carried out for the same samples layout. Three of studied sequences, represented identical type of regulation in both RNA-seq and qRT-PCR experiments. The selected genes seems to represent potential candidate sequences (functional molecular markers), enabling the early selection of frost-tolerant apple rootstocks.
Źródło:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2020, 291; 21-32
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:
Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
    Wyświetlanie 1-4 z 4

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies