- Tytuł:
-
Wielkoskalowe symulacje biologicznych sieci neuronowych charakteryzujących się wewnętrzną topologią wielowymiarowych torusów z wykorzystaniem PGENESIS
Large-scale simulations of biological neural networks characterized by internal topology of multi-dimensional torus using PGENESIS - Autorzy:
-
Kwiatkowska, M.
Świerczewski, Ł. - Powiązania:
- https://bibliotekanauki.pl/articles/131949.pdf
- Data publikacji:
- 2015
- Wydawca:
- Wrocławska Wyższa Szkoła Informatyki Stosowanej Horyzont
- Tematy:
-
PGENESIS
biologiczne sieci neuronowe
topologia torus
biological neural networks
torus topology - Opis:
-
Praca obejmuje implementacje oraz testy wydajności i skalowania biologicznych sieci neuronowych charakteryzujących
się wewnętrzną topologią wielowymiarowych torusów. Do obliczeń wykorzystano równoległą wersję symulatora
GENESIS - PGENESIS. Symulacje przeprowadzono w środowisku równoległym na superkomputerze (klaster
wydajnościowy o architekturze x86_64) HP BladeSystem/Actina, Hydra dostępnym w Interdyscyplinarnym Centrum
Modelowania Matematycznego i Komputerowego Uniwersytetu Warszawskiego. Testy objęły procesory AMD Opteron
2435, AMD Opteron 6174, AMD Opteron 6272 oraz Intel Xeon X5660. Uwzględniono także aspekt wykorzystania interfejsów
sieciowych Infiniband QDR, Infiniband DDR oraz 10Gb Ethernet w komunikacji międzywęzłowej. Dodatkowo
wykonano analizę uzyskanego zysku wydajności dzięki zastosowaniu wersji PGENESIS skompilowanej pod kątem
wybranego procesora. W pracy skupiono się jedynie na części dotyczącej pomiarów wydajności – nie podjęto jakichkolwiek
prób analiz aktywności modelowanych biologicznych sieci neuronowych.
This paper includes implementation and performance tests and also scaling of biological neural networks characterized by internal topology of multi-dimensional toruses. For calculations there was used a parallel version of the GENESIS - PGENESIS simulator. Simulations were performed in a supercomputer's parallel environment, (a performance cluster with x86_64 architecture) HP BladeSystem/Actina, Hydra available at the Interdisciplinary Centre for Mathematical and Computational Modeling, Warsaw University. Tests included AMD Opteron 2435, AMD Opteron 6174, AMD Opteron 6272 and Intel Xeon X5660 prosessors. There was also taken into account the aspect of the use of network interfaces such like Infiniband QDR, DDR Infiniband and 10Gb Ethernet in interstitial communication. In addition, there was performed an analysis on the resulting performance gained by using the PGENESIS version compiled for the selected processor. In this paper author focused only on the section of performance measurement - there weren't taken any attempts of activity analysis of the modeled biological neural networks. - Źródło:
-
Biuletyn Naukowy Wrocławskiej Wyższej Szkoły Informatyki Stosowanej. Informatyka; 2015, 5; 19-26
2082-9892 - Pojawia się w:
- Biuletyn Naukowy Wrocławskiej Wyższej Szkoły Informatyki Stosowanej. Informatyka
- Dostawca treści:
- Biblioteka Nauki
Artykuł