Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "ISSR markers" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
    Wyświetlanie 1-7 z 7
    Tytuł:
    Genetic variation of safflower (Carthamus tinctorius L.) and related species revealed by ISSR analysis
    Autorzy:
    Bagmohammadi, Hamed
    Pahlevani, Mohammadhadi
    Ahmadikhah, Asadollah
    Razavi, Seyed Esmaeil
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2199709.pdf
    Data publikacji:
    2012-08-20
    Wydawca:
    Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
    Tematy:
    Genetic diversity
    ISSR markers
    relationships
    safflower
    wild spices
    Opis:
    Genetic diversity of eight genotypes of Carthamus tinctorius L., two populations of C. oxyacanthus, and one population of C. lanatus was investigated using inter-simple sequence repeat (ISSR) markers. All samples were uniquely distinguished by 10 ISSR primers with 144 bands which generated 100% polymorphism. Furthermore, the ISSR markers could separate three safflower species properly, that highlights the effectiveness of this marker system for phylogenetic studies. The most and least informative primers were ISSR9 (PIC=0.367) and ISSR2 (PIC=0.254), and some primers were more efficient in detecting polymorphism in one species than for the others. Unweighed pairgroup method with arithmetical averages (UPGMA) cluster analysis enabled construction of a dendrogram  for estimating genetic distances among different populations. The result of cluster analysis suggested that cultivated and wild populations of C. oxyacanthus had close relationship with each other and far relationship with C. lanatus. The extreme genetic dissimilarity was observed between genotypes of C. tinctorius and C. lanatus populations. Based on the results, C. oxyacanthus could introduce favorable genes to cultivated safflower via inter-specific hybridization in breeding programs. Nei’s gene diversity index, Shannon’s index and percent of polymorphic loci showed that Isfahan ecotype of C. oxyacanthus had the highest variation at DNA level in relation to populations of other species. The ISSRs developed in this research along with those recently studied by other researchers will contribute to construct genetic map with a density sufficient for safflower molecular breeding.
    Źródło:
    Plant Breeding and Seed Science; 2012, 66; 139-150
    1429-3862
    2083-599X
    Pojawia się w:
    Plant Breeding and Seed Science
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Population genetic structure of Iris pumila L. in Ukraine: effects of habitat fragmentation
    Autorzy:
    Bublyk, O.
    Andreev, I.
    Parnikoza, I.
    Kunakh, V.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2117815.pdf
    Data publikacji:
    2020
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czasopisma i Monografie PAN
    Tematy:
    conservation
    genetic polymorphism
    habitat fragmentation
    ISSR markers
    population
    genetics
    Opis:
    Habitat fragmentation is one of serious threats to biodiversity of nature in today's world. The present study of a typical steppe species Iris pumila L. (Iridaceae) has analyzed the impacts of geographical isolation and population size on genetic diversity and population structure in conditions of habitat fragmentation. The key indices of population genetic variability calculated from the ISSR markers data were on average as follows: Shannon diversity index (S) – 0.188; unbiased Nei’s gene diversity (He ) – 0.123; and the average measure of Jaccard’s genetic distances between individuals within populations – 58.4%. Although the largest population had significantly higher values of S and He, the small and marginal populations also showed a comparable level of variation. Most of the genetic variation of I. pumila was distributed within the populations. A strong correlation was found between Nei’s genetic distances and geographic distances between the populations. According to the Bayesian analysis, genetic structure of the populations was highly homogeneous; however, the presence of admixed genotypes indicated the possibility of gene flow between the populations at present.
    Źródło:
    Acta Biologica Cracoviensia. Series Botanica; 2020, 62, 1; 51-61
    0001-5296
    Pojawia się w:
    Acta Biologica Cracoviensia. Series Botanica
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Zmienność genetyczna jodły pospolitej (Abies alba Mill.) zachowanej na terenie Nadleśnictwa Katowice
    Genetic variation of silver fir (Abies alba Mill.) preserved in the Katowice Forest District
    Autorzy:
    Masternak, K.
    Niebrzydowska, B.
    Głębocka, K.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1311865.pdf
    Data publikacji:
    2015
    Wydawca:
    Instytut Badawczy Leśnictwa
    Tematy:
    lesnictwo
    Nadlesnictwo Katowice
    drzewa lesne
    jodla pospolita
    Abies alba
    zmiennosc genetyczna
    markery ISSR
    genetic diversity
    ISSR markers
    growth traits
    industrial pollution
    Opis:
    Environmental pollution greatly decreases a tree’s health and results in dieback of forest stands. Due to increasing industrial activity in the 20th century, silver fir became almost totally extinct in the Katowice Forest District. Only 19 individuals have survived to this day. The aim of the present study was to analyze growth characteristics and polymorphisms of 25 inter-simple sequence repeats (ISSR) of the preserved trees. The mean height of the inventoried silver firs was 19 m with a diameter at breast height (DBH) of 29 cm. Flowers were observed on few trees only. However, all trees were of high vitality without signs of fungal pathogen infections or insect outbreaks. Parameters of genetic variability, including mean effective number of alleles per locus and expected heterozygosity, were higher than described in the literature so far and they amounted to 1,659, 0,396 respectively.
    Źródło:
    Leśne Prace Badawcze; 2015, 76, 4; 315-321
    1732-9442
    2082-8926
    Pojawia się w:
    Leśne Prace Badawcze
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Ocena zmienności fenotypowej i molekularnej okrągłonasiennej formy lędźwianu siewnego (Lathyrus sativus L.)
    Estimation of variability on phenotypic and molecular level of spherical-seeded form of grasspea (Lathyrus sativus L.)
    Autorzy:
    Pankiewicz, Katarzyna
    Rybiński, Wojciech
    Kaczmarek, Zygmunt
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2198161.pdf
    Data publikacji:
    2011-09-30
    Wydawca:
    Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
    Tematy:
    Lathyrus sativus
    doświadczenia polowe
    markery ISSR
    mutant okrągłonasienny
    skład chemiczny nasion
    struktura plonowania
    chemical composition of seeds
    field trials
    ISSR markers
    spherical-seeded mutant
    yield-contributing traits
    Opis:
    Obiekty badawcze stanowiły: mutant o okrągłych nasionach, odmiany Derek i Krab, jako potencjalny materiał z którego wywodzi się wyselekcjonowana okrągłonasienna forma oraz o obiekt kolekcyjny z Włoch (typowy przedstawiciel lędźwianów Południowej Europy). Zmienność cech na poziomie fenotypowym oceniano w oparciu o wyniki dwuletnich doświadczeń polowych w latach 2008 i 2009 założonych w czterech zróżnicowanych glebowo miejscowościach wykorzystując w tym celu wielocechową analizę statystyczną. Zmienność genetyczną wyrażoną stopniem podobieństwa genetycznego oceniano za pomocą markerów ISSR. Ponadto, oceniano skład chemiczny nasion w odniesieniu do zawartości białka, tłuszczu, profilu kwasów tłuszczowych oraz neurotoksyny — β-ODAP. Wykazano, że kulista forma lędźwianu pod względem takich cech jak: liczba rozgałęzień i strąków z rośliny, długość strąka, masa nasion ze strąka, liczba nasion z rośliny, a zwłaszcza masa 1000 nasion różni się istotnie od odmian Derek i Krab, a wszystkie trzy formy reprezentują inny morfotyp i poziom cech plonotwórczych w porównaniu z obiektem z Włoch. Ponadto, kulista forma charakteryzowała się wyższą niż u pozostałych form zawartością białka i tłuszczu, z dominującą zawartością kwasu oleinowego w profilu kwasów tłuszczowych. Wszystkie rodzime formy lędźwianu charakteryzowały się zbliżoną zawartością w nasionach neurotoksyny — β-ODAP z wyraźnie wyższą jej zawartością u formy z Włoch. Wykreślony dendrogram na podstawie wyników analizy ISSR wskazuje, że krajowe formy charakteryzują się znacznym podobieństwem genetycznym i wyraźną odrębnością od włoskiej formy. Wyniki na poziomie fenotypowym uzyskane z doświadczeń polowych wskazują ponadto, że spontaniczna mutacja kształtu nasion powstała z dużym prawdopodobieństwem w obrębie materiału populacyjnego z którego pochodzi odmiana Derek, aczkolwiek na poziomie molekularnym mutant wykazywał bliższe podobieństwo do odmiany Krab.
    A mutant with spherical seeds was investigated together with two Polish cultivars: Derek and Krab (most probable ancestors of the mutant) as well as an Italian grasspee line, typical for South-Western Europe (Mediterranean Basin region). Variation of traits on phenotypic level was estimated basing on results obtained from field trials conducted in four locations in 2008 and 2009. The multivariate analysis method was used. Genetic variation, expressed by degree of genetic similarity, was established with the use of ISSR markers. Moreover, content of protein, fat, fatty acid composition and neurotoxin content (β-ODAP) in seeds was estimated. The obtained results indicated, that the spherical-seeded mutant, as compared to the cultivars Derek and Krab, was significantly different in the following traits: number of branches and pods per plant, pod length, weight of seeds per pod, seeds number per plant, as well as weight of 1000 seeds. Moreover, all three Polish forms represented different morphotype and yield structure parameters than the Italian line. The seeds of spherical-seeded mutant showed higher content of protein and fat as compared to another analyzed forms, with domination of oleic acid in fatty acids composition. All Polish accessions were similar in neurotoxin content in seeds, markedly lower in comparison to the Italian line. Results of hierarchical grouping (after use of the ISSR method) were presented on the dendrogram which indicated that the cultivars and spherical-seeded mutant showed high level of genetic similarity and markedly differed from the Italian line. The results obtained on the phenotypic level from field trials, estimated with use of multivariate statistics, indicated the population from which the cultivar Derek was derived as the most probable ancestor of the spherical seed mutant, however on the molecular level the mutant showed closer genetic similarity to the cultivar Krab.
    Źródło:
    Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2011, 260/261; 351-365
    0373-7837
    2657-8913
    Pojawia się w:
    Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Fast and cheap identification of elite aspen clones in the North-West of Russia using ISSR markers
    Autorzy:
    Zhigunov, Anatoly V.
    Shabunin, Dmitrii A.
    Butenko, Olesia Yu.
    Lebedeva, Marina V.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2045732.pdf
    Data publikacji:
    2018
    Wydawca:
    Instytut Badawczy Leśnictwa
    Tematy:
    aspen
    elite clones
    molecular markers
    ISSR
    clonal plantations
    Opis:
    In 2001–2006, several experimental aspen plantations were established in the North-West of Russia (Leningrad region). Three in vitro propagated elite aspen (Populus tremula L.) clones from the Kostroma Forest Research Station were used as the planting stock for plantations. The planting plans of some experimental plantations were lost, which made it impossible to identify the genetic lineages. 13-years old unknown aspen clones demonstrated prominent growth rates, and reliably overtook natural aspen coppice. ISSR markers were used for fast and cheap restoring of the missing planting plan of the experimental aspen plantation under study; as a result, progenies of three elite aspen clones were recognized. The best fast-growing and stem rot resistant aspen clones was identified and called “Kostroma”.
    Źródło:
    Folia Forestalia Polonica. Series A . Forestry; 2018, 60, 4; 207-213
    0071-6677
    Pojawia się w:
    Folia Forestalia Polonica. Series A . Forestry
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Zastosowanie metod RAPD i ISSR do oceny podobieństwa genetycznego greckich form Dasypyrum villosum (L.) P. Candargy
    Application of RAPD and ISSR methods to genetic similarity estimation of Greek Dasypyrum villosum (L.) P. Candargy populations
    Autorzy:
    Grądzielewska, Agnieszka
    Paczos-Grzęda, Edyta
    Gruszecka, Daniela
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/42809908.pdf
    Data publikacji:
    2009
    Wydawca:
    Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
    Tematy:
    Dasypyrum
    ISSR
    RAPD
    markery molekularne
    podobieństwo genetyczne
    genetic similarity
    molecular markers
    Opis:
    W pracy przeprowadzono ocenę podobieństwa genetycznego 9 greckich form Dasypyrum villosum L. (P.) Candargy pochodzących z trzech regionów Grecji (Tesalii oraz Zachodniej i Środkowej Macedonii) na podstawie polimorfizmu markerów RAPD i ISSR. Analizę podobieństwa genetycznego przeprowadzono z wykorzystaniem 18 wyselekcjonowanych starterów RAPD i 17 starterów ISSR. Ogółem otrzymano 122 fragmenty RAPD i 210 ISSR, z czego 50% było polimorficznych. Technika RAPD pozwoliła na identyfikację produktów specyficznych jedynie u pięciu z dziewięciu badanych form, podczas gdy przy udziale metody ISSR otrzymano takie fragmenty dla siedmiu populacji, najwięcej dla W6 7264. Dla obu zastosowanych w badaniach metod obliczono współczynnik informacji o polimorfizmie (PIC), którego wartość zawierała się w przedziale 0,13–0,68 dla RAPD i 0,15–0,52 dla ISSR, średnio odpowiednio 0,32 i 0,33. Na podstawie polimorfizmu markerów RAPD i ISSR oraz obu technik łącznie obliczono wartości indeksów podobieństwa genetycznego Dice’a, pomiędzy parami badanych populacji. Średnie podobieństwo badanych obiektów wyniosło odpowiednio 0,854, 0,871 i 0,864. Najbardziej odmienną od pozostałych była forma W6 7264. W oparciu o matryce podobieństw Dice’a skonstruowano dendrogramy obrazujące stosunki pokrewieństwa pomiędzy badanymi populacjami.
    Estimation of genetic similarity between nine Greek Dasypyrum villosum L. (P.) Candargy populations native to three Greece regions (Thesally, West and Central Macedonia) was performed basing on polymorphism of RAPD and ISSR markers. Eighteen RAPD and seventeen ISSR selected primers were used in the genetic similarity analyses. In total, 122 RAPD and 210 ISSR products were obtained, out of which 50% were polymorphic. The RAPD method identified specific products only in five from nine populations studied, while ISSR in seven, most for W6 7264. Polymorphic information content (PIC) values calculated for the both methods, ranged from 0.13–0.68 for RAPD and 0.15–0.52 for ISSR. Mean values of PIC for RAPD and ISSR were 0.32 and 0.33, respectively. Based on the polymorphism of RAPD and ISSR markers and both methods combined, genetic similarities using Dice algorithm were estimated between pairs of populations analyzed. Mean genetic similarities were 0.854, 0.871 and 0.864, respectively. Most different from the others was W6 7264. Based on Dice matrix similarities, dendrograms showing relatedness between the analyzed populations were constructed.
    Źródło:
    Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2009, 253; 297-307
    0373-7837
    2657-8913
    Pojawia się w:
    Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Charakterystyka wybranych markerów molekularnych
    Characteristic of selected molecular markers
    Autorzy:
    Bolc, Paulina
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2199379.pdf
    Data publikacji:
    2020-10-22
    Wydawca:
    Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
    Tematy:
    markery molekularne
    RFLP
    AFLP
    RAPD
    SSR
    ISSR
    SRAP
    SNP
    PCR
    polimorfizm
    różnorodność genetyczna
    molecular markers
    polymorphism
    genetic diversity
    Opis:
    Postęp, jaki nastąpił w biologii molekularnej poprzez wprowadzenie markerów molekularnych nowej generacji, w ciągu ostatnich 20 lat umożliwił znaczny rozwój wielu dziedzin badań. Możliwe stało się uzyskanie dokładniejszych informacji genetycznych pozwalających na lepsze zrozumienie zasobów genetycznych organizmów. Markerem molekularnym może być każda sekwencja nukleotydowa (wybrany fragment DNA), rozproszony w całym genomie, której zmienność między osobnikami lub grupami taksonomicznymi umożliwia precyzyjną identyfikację osobnika/taksonu. Kompilacja właściwości enzymów restrykcyjnych jak również reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) w technikach generujących markery molekularne pozwoliła na efektywne wykorzystanie ich w taksonomicznych, ewolucyjnych i ekologicznych badaniach roślin.
    Over the last 20 years, the progress in molecular biology through the introduction of new generation molecular markers has allowed many areas to move forward. It has now become possible to obtain more accurate genetic information to better understand the genetic resources of organisms. A molecular marker can be any nucleotide sequence (selected DNA fragment) scattered throughout the genome, whose variability between individuals or taxonomic groups allows precise identification of the individual/taxon. The effectiveness of restriction digestion and polymerase chain reaction based on molecular markers has already proved their usefulness in taxonomic, evolutionary and ecological plant research.
    Źródło:
    Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2020, 290; 27-32
    0373-7837
    2657-8913
    Pojawia się w:
    Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
      Wyświetlanie 1-7 z 7

      Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies