Temat: genotype 3 - Katalog OPAC zbiorów

Skocz do pozycji: 1.

Tytuł:: First detection and molecular characterization of hepatitis E virus in water from wastewater treatment plants in Portugal
Autorzy:: Matos, A.
Mesquito, J.R.
Goncalves, D.
Abreu-Silva, J.
Luxo, C.
Nascimento, M.S.
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/2081721.pdf
Data publikacji:: 2018
Wydawca:: Instytut Medycyny Wsi
Tematy:: wastewater
hepatitis E virus
genotype 3
zoonotic
Opis:: Hepatitis E virus (HEV) genotype 3 is widespread in industrialized countries and widely recognized as a serious public health issue. HEV genotype 3 is excreted in both human and animal stools, having the potential to be introduced in aquatic environments through wastewater discharge. For this reason, waterborne transmission of the HEV genotype 3 is drawing increasing attention from the scientific community. Although studies in Portugal have shown that HEV circulates in both humans and swine, no study has yet focused on the presence of HEV in wastewater. Hence, a total of 60 water samples (influent and effluent) from 15 Wastewater Treatment Plants (WWTP) of different regions of Portugal were tested for the presence of HEV using a broad spectrum real-time RT-PCR with amplification within the ORF2 region of HEV genome. Positive samples were retested by nested RT-PCR with amplification within the ORF1 region, sequenced followed by phylogenetic analysis. HEV sequences were retrieved from two influent samples collected in December 2013 from WWTPs of North and Central of Portugal and classified in subgenotype 3i and 3f. This is the first study showing the presence of HEV in aquatic environments of Portugal.
Źródło:: Annals of Agricultural and Environmental Medicine; 2018, 25, 2; 364-367
1232-1966
Pojawia się w:: Annals of Agricultural and Environmental Medicine
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 2.

Tytuł:: Zastosowanie modelu mieszanego Scheffégo - Calińskiego do analizy stabilności odporności odmian ziemniaka na Phytophthora infestans (Mont.) de Bary
Application of Scheffé - Caliński mixed model in analysis of the stability of resistance to Phytophthora infestans (Mont.) de Bary in potato cultivars
Autorzy:: Tatarowska, Beata
Flis, Bogdan
Plich, Jarosław
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/2198076.pdf
Data publikacji:: 2011-12-29
Wydawca:: Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:: interakcja genotypowo-środowiskowa
P. infestans
Sergen 3
stabilność biologiczna
genotype × environment interaction
biological stability
Opis:: W pracy oceniano stabilność ekspresji odporności 22 odmian ziemniaka na Phytophthora infestans (Mont.) de Bary. Wykorzystując mieszany model analizy wariancji oceniano interakcję genotypowo-środowiskową (G × E). Odmiany ziemniaka oceniano w doświadczeniach polowych prowadzonych w południowo wschodniej części Polski przez okres czterech lat. Oceniane odmiany były zróżnicowane pod względem poziomu odporności na zarazę ziemniaka i pochodziły z różnych krajów: Polski, Rosji, Niemiec, Holandii i Węgier. Siedem z ocenianych odmian (Alpha, Bintje, Gloria, Escort, Eersteling, Robijn, Sarpo Mira) należy do grupy wzorców europejskich wybranych w ramach projektu Eucablight (www.eucablight.org). Analiza wariancji przeprowadzona na wartościach rAUDPC dla 22 odmian ziemniaka ocenianych w czterech środowiskach wykazała istotny (przy P<0.01) wpływ na wartości tego wskaźnika: efektów głównych odmian, środowisk oraz interakcji G × E. Pierwsze dwie zmienne kanoniczne (V1 i V2) wyliczone z mieszanego modelu Scheffégo - Calińskiego tłumaczą aż 96,8% obserwowanej zmienności. Szczegółowa analiza wariancji pozwoliła wyróżnić odmiany ze stabilną i niestabilną ekspresją poziomu odporności na zarazę ziemniaka. Dla odmian stabilnych interakcja G × E była statystycznie nieistotna, natomiast odmiany niestabilne posiadały istotną wartość tego parametru. Istotny efekt interakcji G × E nie był tłumaczony przez regresję efektów interakcyjnych względem efektów środowiskowych, natomiast odchylenia od regresji były istotne dla 11 odmian. Istotne odchylenia od regresji są miarą charakteryzującą niestabilną i nieprzewidywalną odpowiedź odmian na porażenie zarazą ziemniaka. Ocena stabilności odporności odmian ziemniaka na zarazę ziemniaka jest ważnym źródłem informacji dla hodowców i producentów ziemniaków o trwałości odporności odmian. Informacje o stabilności są także wykorzystywane w systemach wspomagania decyzji (DSS) w ochronie ziemniaka przed zarazą ziemniaka. Wiedza na temat stabilności odporności odmian pozwala w dużym stopniu minimalizować stosowanie fungicydów w walce z tym patogenem.
In this study, stability of resistance to Phytophthora infestans (Mont.) de Bary was tested for 22 potato cultivars. The genotype by environment interaction (G × E) was analysed using mixed model of analysis of variance. The potato cultivars were tested in Southeastern part of Poland over four years. Tested cultivars differed in level of resistance and came from various countries: Poland, Russia, Germany, Netherlands and Hungary. Seven of them (Alpha, Bintje, Gloria, Escort, Eersteling, Robijn, Sarpo Mira) form a group of Eucablight standard cultivars (www.eucablight.org). The analysis of variance of rAUDPC values for 22 cultivars in four environments indicated significant (at P<0.01) influence of cultivar, environment, and G × E interaction. The first two canonical variables (V1 and V2) of the Scheffé - Caliński mixed model together explained 96.8% of observed variability. Detailed analysis of variance identified cultivars with stable and unstable expression of resistance to late blight. For the stable cultivars G × E interaction was insignificant, while for the unstable ones this parameter was significant. Significant effect of G × E interaction was not explained by the regression of interaction effects on environmental effects, but deviations from regression were significant for 11 cultivars. Significant deviations from regression characterize unstable and unpredictable response of tested cultivars to the late blight infection. Evaluation of the potato cultivars’ stability of resistance to late blight is an important source of information for breeders and potato producers about variability and durability of cultivar resistance. Information about stability is helpful also in decision support systems (DSS) for late blight control. The knowledge about stability of the cultivars allows to minimize the use of fungicides against late blight.
Źródło:: Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2011, 262; 141-154
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:: Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Skocz do pozycji: 3.

Tytuł:: Stabilność reakcji odpornościowej odmian ziemniaka na Phytophthora infestans (Mont.) de Bary w testach laboratoryjnych
Stability of resistance reaction to Phytophthora infestans (Mont.) de Bary of potato cultivars in laboratory tests
Autorzy:: Tatarowska, Beata
Flis, Bogdan
Zimnoch-Guzowska, Ewa
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/2198645.pdf
Data publikacji:: 2014-03-31
Wydawca:: Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Tematy:: Phytophtora infestans
stabilność
interakcja genotypowo-środowiskowa
program SERGEN 3
testy laboratoryjne
stability
genotype-environment interaction
laboratory test
Opis:: Celem prezentowanej pracy była analiza stabilności reakcji odporności na Phytophthora infestans obserwowanej w badaniach laboratoryjnych. Listki i plastry bulw pobrane z różnych odmian ziemniaków inokulowano zawiesiną zarodników tego patogena. W czteroletnim doświadczeniu oceniano reakcję 22 odmian zróżnicowanych pod względem poziomu odporności i wczesności. Stabilność oceniano na podstawie udziału interakcji odmiana (tj. genotyp) × środowisko (G × E) oraz innych interakcji (genotyp × rok i genotyp × termin testu) w obserwowanej zmienności, stosując mieszany model Scheffégo-Calińskiego. Do obliczeń zastosowano program Sergen. Pozwoliło to na identyfikację odmian o stabilnej reakcji odporności w testach listkowych (Wawrzyn, Lawina, Beata, Anielka) i testach plastrowych (Meduza, Nimfy, Vistula, Klepa, Mors). Stabilność reakcji odpornościowej w testach laboratoryjnych nie odpowiadała stabilności reakcji w warunkach polowych, którą obserwowano w innych badaniach.
The aim of presented study was stability analysis of reaction observed in laboratory tests for resistance to Phytophthora infestans. In these tests, detached leaflets and tuber slices collected from plants of various potato cultivars were inoculated with suspension of spores of this pathogen. In four-year study, the reaction was evaluated in 22 potato cultivars that were diverse in terms of resistance level and maturity. Stability was evaluated on the basis of the share of cultivar (i.e. genotype) by environment interaction (G×E) and other interactions (genotype by year and genotype by date of test) in the observed variability by applying Scheffé-Caliński mixed model. For calculations Sergen program was applied. This allowed identifying cultivars with stable reaction of resistance in leaflet test (Wawrzyn, Lawina, Beata, Anielka) and in tuber slice tests (Meduza, Nimfy, Vistula, Klepa, Mors). The stability of reaction in laboratory tests did not completely correspond to the stability of reaction observed in other study performed in field conditions.
Źródło:: Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin; 2014, 271; 91-107
0373-7837
2657-8913
Pojawia się w:: Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

Zmień widok

na półce

Informacja

Wyszukujesz frazę "genotype 3" wg kryterium: Temat

Źródło danych

Dostawca treści

Kolekcja

Rok wydania

Wydawca

Temat

Autor

Typ dokumentu

Język