Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Centralna Biblioteka Wojskowa Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaCentralna Biblioteka Wojskowa

Wyszukujesz frazę "dna isolation" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
    Wyświetlanie 1-15 z 15
    Tytuł:
    Isolation of DNA from bone material of selected animals from Cervidae family
    Autorzy:
    Pizoń, Klaudia
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1178691.pdf
    Data publikacji:
    2017
    Wydawca:
    Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
    Tematy:
    DNA isolation
    bone material
    Opis:
    Bone material is one of the most difficult biological samples used for extraction of DNA. The primary objective of molecular tests is to determine the concentration and quality of DNA, and these results are of significant importance in further analyses. The aim of the study was to evaluate the usefulness of a method for DNA isolation from bone material of selected animal species from Cervidae family using a commercially available GeneMatrix Bone DNA Purification Kit manufactured by Eurx. Quantitative evaluation was performed with a spectrophotometer. Pure DNA isolates were obtained from 21 out of 24 bone fragments. The efficiency of the applied isolation method varied. The difference between the lowest and highest DNA concentration was more than hundredfold. Qualitative analysis was carried out by means of electrophoresis in 1% agarose gel. No high molecular mass DNA was obtained. The genetic material was present in small quantity and it was fragmented. It was concluded that the Bone DNA Purification Kit manufactured by Eurx may be effective only in isolation of DNA from bones stored in good conditions.
    Źródło:
    World Scientific News; 2017, 67, 2; 265-276
    2392-2192
    Pojawia się w:
    World Scientific News
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Automatyzacja izolacji DNA z materiałów biologicznych
    Automation of DNA isolation from biological materials
    Autorzy:
    Staninska, J.
    Szczepaniak, J.
    Piotrowska-Cyplik, A.
    Cyplik, P.
    Czarny, J.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1366462.pdf
    Data publikacji:
    2015
    Wydawca:
    Centralny Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Aparatury Badawczej i Dydaktycznej, COBRABiD
    Tematy:
    izolacja DNA
    automatyzacja
    DNA isolation
    automation
    Opis:
    Intensywny rozwój nauk biologicznych, zarówno w dziedzinie medycyny, kryminalistyki, jak i szeroko rozumianych badań związanych z biotechnologią, stworzył potrzebę doskonalenia technik analitycznych. Na szczególną uwagę zasługują metody biologii molekularnej bazujące na analizie kwasów nukleinowych, charakteryzujące się wysoką czułością i powtarzalnością. Pozwalają one na precyzyjną identyfikację śladów biologicznych, ocenę zmian w profilach ekspresji genów, a także pełną ewaluację bioróżnorodności nisz środowiskowych. Kluczowym elementem determinującym efektywność przeprowadzanych analiz jest etap pozyskiwania (izolacji) materiału genetycznego. Wyraźnie dostrzega się tendencje rozwoju technologii w kierunku zwiększenia przepustowości oraz dokładności izolacji DNA. Aktualnie możliwe jest pokonanie ograniczeń związanych z metodą manualnej izolacji poprzez zastosowanie gotowych zestawów oraz robotów automatycznych umożliwiających pracę z wieloma setkami prób jednocześnie. Celem badań było przeprowadzenie walidacji wybranych metod izolacji genomowego DNA. Wykorzystano trzy komercyjne zestawy. Dwa z nich, dedykowane platformie automatycznej BioRobot M48 Robotic Workstation (Qiagen), bazowały na zjawisku immobilizacji DNA na złożach z cząstkami paramagnetycznymi: QIAsymphony DNA Investigator Kit (Qiagen) oraz MagAttract® DNA Mini M48 (Qiagen). Trzeci zestaw, Sherlock AX (A&A Biotechnology), przeznaczony był do manualnej izolacji genomowego DNA i wykorzystywał mechanizm adsorbcji kwasów nukleinowych na membranach jonowymiennych połączonej ze strącaniem DNA izopropanolem. Ocenie poddano wykrywalność, powtarzalność, i odtwarzalność. Wyniki wskazują, że wszystkie analizowane metody pozwalają na izolację materiału genetycznego o wysokich standardach, który może być wykorzystany w dalszych procedurach badań molekularnych.
    The intensive development of biological sciences, both in the field of medicine and broadly defined biotechnology, created the need to improve the analytical techniques. Molecular biology methods based on the analysis of nucleic acids with high sensitivity and reproducibility deserve special attention. They facilitate precise identification of biological traces, assessing changes in gene expression profiles and complete evaluation of environmental niches biodiversity. The main factor determining effectiveness of analysis is a stage of genetic material isolation. There is a clear trend to increase the capacity and accuracy of DNA isolation. Currently it is possible to overcome the limitations associated with manual isolation techniques. Using of kits and automated robots facilitates working with hundreds of samples simultaneously. The aim of the study was to validate the selected genomic DNA isolation methods. Three commercial kits were used. Two of them, which are dedicated to the automatic platform BioRobot M48 Robotic Workstation (Qiagen), are based on the DNA adsorption on silica beads convenient handling of magnetic particles: QIAsymphony Investigator DNA Kit (Qiagen) and MagAttract® DNA Mini M48 (Qiagen). A third kit Sherlock AX (A&A Biotechnology) for manual isolation of genomic DNA are based on the mechanism of nucleic acin adsorption on ion exchange beads combined with the isopropanol precipitation of DNA. The determination limit, reproducibility and repeatability were evaluated. The results indicate that all of the analysed methods allow the isolation of high-quality genetic material, which can be used in subsequent molecular testing procedures.
    Źródło:
    Aparatura Badawcza i Dydaktyczna; 2015, 20, 2; 110-121
    2392-1765
    Pojawia się w:
    Aparatura Badawcza i Dydaktyczna
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Nanocząstki magnetyczne jako separatory kwasów nukleinowych
    Magnetic nanoparticles as separators of nucleic acids
    Autorzy:
    Niemirowicz, K.
    Wilczewska, A. Z.
    Car, H.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1208173.pdf
    Data publikacji:
    2013
    Wydawca:
    Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Przemysłu Chemicznego. Zakład Wydawniczy CHEMPRESS-SITPChem
    Tematy:
    nanocząstki magnetyczne (MNP)
    separacja DNA
    oczyszczanie DNA
    FTIR
    DRIFTS
    magnetic nanoparticles (MNP)
    DNA isolation
    DNA purification
    Opis:
    Separacja i oczyszczanie kwasów nukleinowych jest podstawowym etapem większości procedur i technik stosowanych w biologii molekularnej. Istnieje wiele metod izolacji DNA, w wyniku których otrzymuje się DNA biologicznie aktywny, chemicznie stabilny oraz wolny od RNA i białek. Nanocząstki magnetyczne z rdzeniem Fe3O4 pokryte otoczką aminosilanową, zostały zsyntetyzowane celem oceny ich przydatności w zakresie separacji makromolekuł (DNA). Zastosowanie nanocząstek do izolacji kwasów nukleinowych może stanowić podstawę do ustalenia nowych standardów diagnostycznych w biologii molekularnej.
    The separation and purification of nucleic acids is an essential step in most of the procedures and techniques used in molecular biology. There are many procedures describing the method of DNA isolation, which result in obtaining a RNA-free DNA, proteins and other compounds that may interfere in subsequent analyzes. Magnetic nanoparticles coated by aminosilanes, were synthesized in order to assess their suitability for the separation of macromolecules (DNA). The use of nanoparticles for the isolation of nucleic acids may provide the basis for setting new standards for diagnostic molecular biology.
    Źródło:
    Chemik; 2013, 67, 10; 836-841
    0009-2886
    Pojawia się w:
    Chemik
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Molecular identification of Trichoderma strains collected to develop plant growth-promoting and biocontrol agents
    Autorzy:
    Oskiera, M.
    Szczech, M.
    Bartoszewski, G.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1976.pdf
    Data publikacji:
    2015
    Wydawca:
    Instytut Ogrodnictwa
    Tematy:
    Trichoderma
    strain
    molecular identification
    biological control agent
    multilocus sequence typing
    phylogenesis
    species identification
    DNA isolation
    Źródło:
    Journal of Horticultural Research; 2015, 23, 1
    2300-5009
    Pojawia się w:
    Journal of Horticultural Research
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Detekcja fitopatogenów z rodzaju Phytophthora w glebach leśnych za pomocą analiz DNA
    Detection of Phytophthora in forest soils using DNA analysis
    Autorzy:
    Kubiak, K.A.
    Oszako, T.
    Jabłoński, T.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/996874.pdf
    Data publikacji:
    2012
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Leśne
    Tematy:
    lesnictwo
    gleby lesne
    czynniki chorobotworcze
    mikroorganizmy glebowe
    Phytophthora
    identyfikacja
    analiza DNA
    metoda nested-PCR
    phytophthora
    identyfication
    dna isolation
    forest soil
    pcr
    Opis:
    Pathogenic oomycetes from the genus Phytophthora attack the base trunks and root systems of trees causing their illness and dying. Under favorable conditions, they may cause damage to even 90% of fine roots. For this reason, they are a particular threat to seedlings in nurseries of forest trees and ornamental plants. Early detection and identification of Phytophthora species is a key issue in forest protection. The aim of this study was to compare the two methods of identification of pathogenic Phytophthora in soil samples collected around 50 selected oaks in Krotoszyn and Karczma Borowa forest districts. Each of the soil samples were analyzed in parallel: 1) direct isolation of genomic DNA from soil and 2) isolation of genomic DNA from soil, preceded by its three day pre−incubation in a selective medium for Phytophthora. Species identification was performed by PCR amplification with primers specific for the species of Phytophthora. The results indicate that the use of pre−incubation phase of soil in a medium−PARP PeaBroth before isolation of DNA, increases the sensitivity of detection of these phytopathogens using PCR. With pre−incubation, the method revealed 54% of positive findings, while simultaneously conducted the same analysis of soil samples by using only direct DNA isolation from soil and PCR amplification provided only 30% of positive findings.
    Źródło:
    Sylwan; 2012, 156, 06; 437-443
    0039-7660
    Pojawia się w:
    Sylwan
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Molecular studies in osteogenesis imperfecta [OI] II. Evaluation of intragenic polymorphic sites in COL1A1 and COL1A2 loci
    Autorzy:
    Kostyk, E
    Sucharski, P.
    Pietrzyk, J.J.
    Kruczek, A.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2044212.pdf
    Data publikacji:
    1998
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    intragenic polymorphic site
    polymorphism
    haplotype
    DNA isolation
    COL1A1 gene
    electrophoresis
    collagen
    COL1A2 gene
    molecular marker
    osteogenesis imperfecta
    Opis:
    The goal of the study was to evaluate intragenic polymorphic sites in COL1A1 and COL1A2 loci. For COL1A1 the following intragenic markers were used: PCR-RFLP (COL1A1), G/A polymorphism in exon 45 of COL1A1 and C/T polymorphism in +88 position of COL1A1 non-translatable 3’ end. For COL1A2 PCR-VNTR was analyzed. 17 families were examined (6 of the "simplex" type and 11 of the "multiple" type). In 8 out of 11 "multiplex" families the segregation of the markers revealed correlation with OI, whereas the other 3 were non-informative. The method was not useful in "simplex" families.
    Źródło:
    Journal of Applied Genetics; 1998, 39, 4; 349-365
    1234-1983
    Pojawia się w:
    Journal of Applied Genetics
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Filtry biologiczne jako metoda ochrony siewek przed patogenami w szkółkach leśnych
    Slow Sand Filter as a method of protection forest plants against phytopathogens in forest nurseries
    Autorzy:
    Kubiak, K.
    Oszako, T.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/973901.pdf
    Data publikacji:
    2011
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Leśne
    Tematy:
    biofilmy
    bakterie
    oznaczanie
    oczyszczanie wody
    filtrowanie
    filtry piaskowe
    leśnictwo szkółki leśne
    woda użytkowa
    forest nursery
    biofilm
    Slowa Sand Filter SSF)
    Phytophthora
    DNA isolation
    DGGE
    PCR
    Opis:
    Slow sand filtration (SSF) is a low−cost method of water disinfestation that can be used as an alternative method of water irrigation treatment in nursery to control water−borne phytopathogens. Slow sand filtration relies on physical, chemical and biological activity in controlling plant pathogens. In a SSF, the filter bed is constructed of a medium−sand with the area which can be colonised by microorganisms – biofilm. This sand media also presents a physical barrier to fungal, bacterial and oomycetes plant pathogens. In the forest nursery Kiejsze an experimental slow sand filter was constructed to study the structure of a bacterial community suppressive to plant pathogens. The total bacterial community of an experimental SSF was analyzed by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) of partial 16S rRNA gene PCR products. Sequence analysis of DGGE bands from the SSF column indicated that a range of bacteria were present, among them similar to groups such as alfa−Proteobacteria, delta−Proteobacteria, beta−Proteobacteria, Planctomycetes, Actinobacteria, Firmicutes, Bacilli and an uncharacterized environmental clone. This study describes the characterization of the microbial community of SSFs used for the treatment of irrigation water in the forest nursery. Using of natural SSF filters and manipulation of microorganisms in the biofilm may be a more reproducible control method of plant pathogens in the future.
    Źródło:
    Sylwan; 2011, 155, 04; 228-235
    0039-7660
    Pojawia się w:
    Sylwan
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Wpływ metod izolacji DNA na podobieństwo genetyczne linii pszenicy ozimej (Triticum aestivum L.) przy zastosowaniu techniki RAPD-Pcr
    The effect of DNA isolation methods on genetic similarity of winter wheat (Triticum aestivum L.) lines using RAPD-PCR techniques
    Autorzy:
    Tomkowiak, A.
    Kurasiak-Popowska, D.
    Weigt, D.
    Mikołajczyk, S.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1366472.pdf
    Data publikacji:
    2015
    Wydawca:
    Centralny Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Aparatury Badawczej i Dydaktycznej, COBRABiD
    Tematy:
    izolacja DNA
    pszenica ozima
    polimorfizm markerów RAPD
    isolation of DNA
    winter wheat
    polymorphism of RAPD markers
    Opis:
    Celem badań było porównanie wpływu 4 metod izolacji DNA na wynik analizy markerami molekularnymi RAPD-PCR (ang. Random Amplified Polymorphic DNA - Polymerase Chain Reaction) linii pszenicy ozimej. Przeprowadzono izolację DNA metodą Thomsona i Henry'ego, metodą kolumienkową przy pomocy kitu Quiagen DNeasy Plant Kit, przy pomocy kitu Genomic Mini AX Plant firmy A&A Biotechnology oraz zestawu Maxwell® 16 LEV Plant DNA Kit firmy Promega.Po izolacji przeprowadzono analizy molekularne RAPD-PCR, które wykorzystano jako wskaźnik służący do oceny metod izolacji DNA. Najlepszą metodą izolacji okazała się metoda z wykorzystaniem Quiagen DNeasy Plant Kit. Jakość DNA otrzymanego po izolacji tym kitem była najwyższa, a otrzymane elektroforogramy były najbardziej czytelne. Jest to jednak metoda izolacji DNA najdłuższa i najdroższa, co ogranicza jej wykorzystanie przy dużej liczbie badanych genotypów. Dobrą metodą izolacji DNA ze względu na jakość otrzymanych obrazów elektroforetycznych była metoda izolacji kitem Genomic Mini AX Plant. Metodą szybką i tanią okazała się metoda Thomsona i Henry'ego, niestety mniej wydajną w porównaniu do poprzednich. Metodą o największym zróżnicowaniu ilości otrzymanego DNA była izolacja z wykorzystaniem zestawu Maxwell.
    The aim of this study was to compare the effect of 4 DNA isolation methods on the results of analyses using molecular markers of Random Amplified Polymorphic DNA - Polymerase Chain Reaction (RAPD-PCR) in winter wheat lines. DNA was isolated using the method proposed by Thomson and Henry, the column method with a Quiagen DNeasy Plant Kit, a Genomic Mini AX Plant Kit by A&A Biotechnology and the Maxwell® 16 LEV Plant DNA Kit by Promega. After isolation RAPD-PCR analyses were carried out. The molecular study was an evaluation indicator of the DNA isolation methods. The best isolation method was that using the Quiagen DNeasy Plant Kit. Isolation using this kit provided the best DNA quality and the greatest legibility of electropherograms. However, it is the most time- and cost-intensive method of DNA isolation, which limits its applicability at a large number of tested genotypes. In terms of electrophoretic image quality good DNA isolation was provided by the method using a Genomic Mini AX Plant Kit. A rapid and cheap method was that proposed by Thomson and Henry; unfortunately, it was less efficient than the former ones. The greatest variation in the amounts of obtained DNA was observed for isolation using the Maxwell kit.
    Źródło:
    Aparatura Badawcza i Dydaktyczna; 2015, 20, 2; 90-109
    2392-1765
    Pojawia się w:
    Aparatura Badawcza i Dydaktyczna
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    DNA isolation method from human blood with MasterPure DNA Purification Kit™ – review article
    Autorzy:
    Florczak, Sylwia
    Kempka, Katarzyna
    Hołderna, Karolina
    Stanek, Emilia
    Baszyński, Jędrzej
    Kamiński, Piotr
    Bogdzińska, Maria
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1179641.pdf
    Data publikacji:
    2017
    Wydawca:
    Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
    Tematy:
    DNA
    human
    isolation
    optimization
    review
    whole blood
    Opis:
    The main element of genomic molecular analysis is isolation of DNA from biological material. DNA isolation is an important process of PCR methods. Efficency of PCR processes depends of purness and concentration of DNA. Many methods allows to izolate good quality DNA. There are many Purification Kits and methods of extraction genomic material. We show available techniques and methods of increasing efficiency of the process in our studies. Previous data shows that operating with kits needs optimization, whilst protocols do not have all information about isolation process. We concentrate on Epicentre MasterPure DNA Purification Kit, which is cheap, fast and allows to purification nucleic acids from various materials. We show detailed advantages and disadvantages of this set. Our main aim is to develop protocol to get optimal concentration (50-100 ng/μL) and pureness (A 260/280; 1.6-1.9) of DNA. We also should optimize the process of DNA isolation to obtain efficiency of about 100%. Optimized methodology of DNA isolation, with using MasterPure DNA Purification Kit allows to get good quality material in laboratory without specialistic equipment. This survey contains our assumptions of ways how we can influent on purification process according to previous data.
    Źródło:
    World Scientific News; 2017, 72; 69-76
    2392-2192
    Pojawia się w:
    World Scientific News
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Skład biocenozy bakteryjnej osadu czynnego na przykładzie miejskiej oczyszczalni ścieków w Zgierzu
    Composition of activated sludge biocenosis in the example of municipal wastewater treatment plant for a city of Zgierz
    Autorzy:
    Liwarska-Bizukojć, E.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/237251.pdf
    Data publikacji:
    2017
    Wydawca:
    Polskie Zrzeszenie Inżynierów i Techników Sanitarnych
    Tematy:
    bacteria
    identification
    molecular biology
    isolation of genomic DNA
    DNA sequencing
    wastewater treatment plant
    activated sludge
    oxidoreductive conditions
    biocenosis
    bakterie
    identyfikacja
    biologia molekularna
    izolacja genomowego DNA
    sekwencjonowanie DNA
    oczyszczalnia ścieków
    osad czynny
    warunki tlenowe
    biocenoza
    Opis:
    Molecular biology techniques allow for increasingly more thorough identification and understanding of functionality of microorganisms consortia involved in wastewater treatment or waste degradation processes. In this work, the bacterial community of activated sludge from the wastewater treatment plant in Zgierz (Poland) was identified. As a result, a somewhat limited database of microorganisms living in Polish wastewater treatment plants was supplemented with new data. The composition of bacterial community was identified with molecular biology techniques in two main stages: (1) isolation of genomic DNA, (2) DNA sequencing and bioinformatics analysis of the isolated sequences. The analyses revealed that the most abundant phylum was Proteobacteria with Betaproteobacteria present in highest numbers. Composition of the activated sludge was relatively low in Chloroflexi class bacteria. It is in alignment with macroscopic observations indicating good settlement properties of the activated sludge from the wastewater treatment plant in Zgierz. It was determined that aerobic (redox) conditions in the activated sludge chamber did not influence the composition of bacterial community. They might only cause increase in the contribution of aerobic bacteria in the aerated (oxygenated) part of the chamber or the anaerobic organisms in its anaerobic (deoxygenated) section.
    Techniki biologii molekularnej pozwalają w coraz większym stopniu poznać skład i zrozumieć funkcjonowanie konsorcjów mikroorganizmów biorących udział w procesach oczyszczania ścieków czy biodegradacji odpadów. W pracy zidentyfikowano skład biocenozy osadu czynnego w oczyszczalni ścieków komunalnych w Zgierzu, dzięki czemu została poszerzona, jak na razie dość skromna, baza danych o mikroorganizmach w polskich oczyszczalniach ścieków. Skład biocenozy bakteryjnej zidentyfikowano za pomocą technik biologii molekularnej. Analiza składała się z dwóch zasadniczych etapów – izolacji genomowego DNA oraz sekwencjonowania wraz z analizą bioinformatyczną sekwencji. Badania wykazały, że na poziomie typu największy udział w biocenozie osadu czynnego miały Proteobacteria, a wśród nich najwięcej było bakterii należących do klasy Betaproteobacteria. Osad z oczyszczalni ścieków w Zgierzu wyróżniał się stosunkowo małą liczebnością bakterii z klasy Chloroflexi, co pokrywa się z obserwacjami makroskopowymi, wskazującymi na dobre właściwości sedymentacyjne tego osadu. Stwierdzono, że warunki tlenowe panujące w komorze osadu czynnego nie miały znaczącego wpływu na skład bakteryjny osadu czynnego. Mogły one powodować jedynie większy udział bakterii aerofilnych w części napowietrzanej komory (tlenowej) i/lub większy udział beztlenowców w jej części nienapowietrzanej (beztlenowej).
    Źródło:
    Ochrona Środowiska; 2017, 39, 4; 3-7
    1230-6169
    Pojawia się w:
    Ochrona Środowiska
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    • odwiedzone
    Tytuł:
    Virulence and antibiotic resistance of Escherichia coli isolated from rooks
    Autorzy:
    Kmet, V.
    Drugdova, Z.
    Kmetova, M.
    Stanko, M.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/51141.pdf
    Data publikacji:
    2013
    Wydawca:
    Instytut Medycyny Wsi
    Tematy:
    virulence
    antibiotic resistance
    Escherichia coli
    isolation
    rook
    polymerase chain reaction
    DNA microarray
    Opis:
    With regard to antibiotic resistance studies in various model animals in the urban environment, the presented study focused on the rook, many behavioural and ecological aspects of which are important from an epidemiological point of view. A total of 130 Escherichia coli strains isolated from rook faeces during a two-year period (2011–2012) were investigated for antibiotic resistance and virulence. Resistance to ampicillin (60%) and streptomycin (40%) were the most frequent, followed by resistance to fluoroquinolones (ciprofloxacin-22% and enrofloxacin-24%), tetracycline (18%), cotrimoxazol (17%) and florfenicol (14%). Ceftiofur resistance occured in 10.7 % of strains and cefquinom resistance in 1.5 % of strains. Twenty-five E.coli strains with a higher level of MICs of cephalosporins (over 2mg/L of ceftazidime and ceftriaxon) and fluoroquinolones were selected for detection of betalactamase genes (CTX-M, CMY), plasmid-mediated quinolone resistance qnrS, integrase 1, and for APEC (avian pathogenic E.coli) virulence factors (iutA, cvaC, iss, tsh, ibeA, papC, kpsII). Genes of CTX-M1, CMY-2, integrase 1, papC, cvaC, iutA were detected in one strain of E.coli, and qnrS, integrase 1, iss, cvaC, tsh were detected in another E.coli. DNA microarray revealed the absence of verotoxin and enterotoxin genes and pathogenicity islands. The results show that rooks can serve as a reservoir of antibiotic-resistant E. coli with avian pathogenic virulence factors for the human population, and potentially transmit such E.coli over long distances.
    Źródło:
    Annals of Agricultural and Environmental Medicine; 2013, 20, 2
    1232-1966
    Pojawia się w:
    Annals of Agricultural and Environmental Medicine
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Cloning of the DNA fragments reflecting the open reading frame I and II of the I-18 C gene of Chironomus tentans. I. Preparation of the bacterial cells, transformation and isolation of the bluescript plasmid
    Autorzy:
    Borowicz, B P
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/66849.pdf
    Data publikacji:
    1999
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    transformation
    promoter system
    gene expression
    cloning
    I-18 C gene
    isolation
    T7 RNA polymerase
    plasmid
    Chironomus tentans
    bacterial cell
    polymerase chain reaction
    DNA fragment
    Opis:
    The technology applied for the cloning of the open reading frame (ORF) I and II reflecting DNA fragments of the I-18 C gene of Chironomus tentans in regard to the preparation of the competent E. coli cells of the XL-1 strain needed for the transformation with the ligation reaction products, is presented. Also the transformation of these bacterial cells with the bluescript plasmid and its isolation for these cloning experiments, are described.
    Opisano technologię, którą zastosowano do klonowania fragmentów DNA odzwierciedlających translacyjną otwartą ramę odczytu I i II genu I-18 C Chironomus tentans w zakresie: przygotowania kompetentnych komórek E. coli szczepu XL-1, poddawanych następnie transformacji produktami reakcji ligacji. Przedstawiono także zastosowaną technologię transformacji wymienionych komórek bakteryjnych przy użyciu plazmidu - blueskrypt oraz izolację tego plazmidu, w celu jego zastosowania w wymienionych eksperymentach klonowania.
    Źródło:
    Journal of Plant Protection Research; 1999, 39, 1
    1427-4345
    Pojawia się w:
    Journal of Plant Protection Research
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Molecular studies in osteogenesis imperfecta [OI] III. cDNA of COL1A1 and COL1A2 analysis using the BESS-T-Scan technique
    Autorzy:
    Sucharski, P
    Sanak, M.
    Kostyk, E.
    Pietrzyk, J.J.
    Kruczek, A.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2044221.pdf
    Data publikacji:
    1998
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    COL1A1 gene
    electrophoresis
    COL1A2 gene
    collagen production
    man
    RNA isolation
    mutation
    BESS-T-Scan technique
    molecular diagnosis
    DNA
    osteogenesis imperfecta
    cDNA synthesis
    fibroblast culture
    Opis:
    A BESS-T-Scan analysis of cDNA COL1A1 and COL1A2 obtained by RT-PCR derived from five patients with sporadic forms of ostegenesis imperfecta was performed. The study was done in four patients with type I and one patient with type III OI. The analysis revealed the presence of structural changes in two regions of cDNA COL1A1 in two patients. No quantitative changes referring to COL1A2 gene were noted in any patient. The above analysis was the first application of the BESS-T-Scan technique in a molecular diagnosis of OI. The applied method seems to be useful and fulfil the basic criteria of the screening method to detect and locate mutations.
    Źródło:
    Journal of Applied Genetics; 1998, 39, 4; 367-373
    1234-1983
    Pojawia się w:
    Journal of Applied Genetics
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Applications of recent advances at the Institute of Grassland and Environmental Research in cytogenetics of the Lolium-Festuca complex
    Autorzy:
    Humphreys, M W
    Thomas, H M
    King, I P
    Morgan, W G
    Meredith, M R
    Harper, J A
    Humphreys, M O
    Bettany, A J E
    Dalton, S J
    James, A R
    Ougham, H J
    Thomas, H
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/2046675.pdf
    Data publikacji:
    1997
    Wydawca:
    Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
    Tematy:
    RNA
    in situ
    tissue culture
    gene transfer
    chromosome segment
    anther culture
    androgenesis
    plant breeding
    introgression mapping
    fluorescence
    hybridization
    Lolium-Festuca complex
    drought resistance
    gene isolation
    tetraploid hybrid
    DNA
    meiosis
    grass
    chromosome behaviour
    Opis:
    Recent advances at Institute of Grassland and Environmental Research (Aberystwyth, U.K.) in cytogenetics of the Lolium/Festuca complex places us in the advantageous position of being able to map genes of agronomic importance onto chromosome arms using fluorescence in situ hybridization (FISH). The ability to physically map genes leads to the capability for "dissecting" quantitative traits into their different components and will lead to better understanding of the complex physiological processes involved and the identification of their genetic control. By tagging genes of interest, using molecular and morphological markers, it will be possible to select and combine suites of desirable genes in a single genotype and thus produce novel cultivars by conventional breeding procedures. Programmes for introgression depend on the relationships between species and on levels of chromosome pairing. Phylogenetic relationships within the Lolium/Festuca complex are being determined using both genomic in situ hybridization (GISH) and FISH. With recent advances in genetic manipulation within the Lolium/Festuca complex, opportunities now arise for gene transfer from Lolium and Festuca species into other important agricultural crops.
    Źródło:
    Journal of Applied Genetics; 1997, 38, 3; 273-284
    1234-1983
    Pojawia się w:
    Journal of Applied Genetics
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Wpływ metodyki badań na ocenę struktury zbiorowisk mikroorganizmów w glebie leśnej
    Effect of the methodology of studies on the structure of the microorganisms communities in the forest soil
    Autorzy:
    Behnke-Borowczyk, J.
    Kwaśna, H.
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/989286.pdf
    Data publikacji:
    2016
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Leśne
    Tematy:
    lesnictwo
    gleby lesne
    mikroorganizmy glebowe
    grzyby mikroskopowe
    struktura zbiorowisk
    metodyka badan
    metody klasyczne
    metody molekularne
    startery NS1
    startery NS2
    DNA
    region 18S
    classical method of isolation
    fungi
    microorganisms
    ns1
    ns2
    18s rdna
    soil
    Opis:
    Two different communities of microorganisms were identified in soils by application of the classical method of fungi isolation (soil dilution, culturing on artificial media, morphotyping) and a molecular method (extraction of the environmental DNA, amplification with universal primers NS1 and NS2, cloning and sequencing of representative clones). No organisms were common to both communities. Apart from rare representatives of the Animalia, communities included single fungus−like Eucarya belonging to the Protista, Class Oomycota, and numerous fungi belonging to Chytridiomycota, Zygomycota, Ascomycota and Basidiomycota orders. In total, 88 species were identified in four soil samples. Fungi were mostly Ascomycota. The classical method was particularly effective in detection of fungi important for creation of phytosanitary conditions of soil, i.e. antagonists (Penicillium, Tolypocladium and Trichoderma) and potential stimulants (dark−pigmented Hormiactis candida, Humicola spp. and Phialophora spp.) of phytopathogens (including the common forest genera Armillaria and Heterobasidion). Application of the classical method allowed the detection of mycorrhizal Ascomycota from the genus Oidiodendron. Application of the molecular method allowed the detection of 13 mycorrhizal Basidiomycota. Although primers NS1 and NS2 were designed from a match with DNA of culturable organisms, they also amplified the DNA of non−culturable organisms. This emphasizes their potential usefulness in studies of the biodiversity of microorganisms in environmental samples. The shortage of reference sequences in the database discourages use of the 18S rDNA region in studies on fungal communities. The studies on the biodiversity of microorganisms need the application of a few independent methods of detection and identification.
    Źródło:
    Sylwan; 2016, 160, 06; 492-503
    0039-7660
    Pojawia się w:
    Sylwan
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
      Wyświetlanie 1-15 z 15

      Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies