Wpływ soku z bulw ziemniaka na czułość wykrywania kwarantannowych bakterii Ralstonia solanacerum [sprawcy brunatnej zgnilizny ziemniaka] klasycznym testem PCR

Brunatna zgnilizna ziemniaka jest chorobą kwarantannową wymagającą czułej, szybkiej i specyficznej diagnostyki. Jedną z bardziej skutecznych metod wykrywania bakterii R. solanacearum jest moleku- larny test PCR. Przedstawiono metodę izolacji DNA, która umożliwia usunięcie inhibitorów polimerazy DNA znajdujących się m.in. w soku z bulw ziemniaka. Efektem obecności tych związków w badanej próbie DNA może być fałszywie negatywny wynik testu. Na podstawie otrzymanych rezultatów stwier- dzono skuteczność opisanej metody izolacji DNA do wykrywania bakterii R.solanacearum. Uzyskano porównywalne wyniki klasycznego testu PCR z DNA izolowanego z bakterii zawieszonych w soku z bulw ziemniaka oraz z zawiesin w wodzie – bez inhibitorów reakcji PCR. Dzięki opracowanej metody- ce izolacji DNA czułość testu PCR osiągnęła stosunkowo wysoki poziom wykrywania 5-15 komórek bakteryjnych w badanej próbie.