Udział niskocząsteczkowych regulatorowych RNA (siRNA i miRNA) w regulacji szlaku transdukcji sygnału auksyn

Auksyna wpływa na większość procesów wzrostu i rozwoju roślin. Szlak transdukcji sygnału auksyn tworzony jest przez komponenty białkowe, z których kluczowe są: receptory z rodziny TAAR (TIR1 oraz AFB1-3), represory odpowiedzi na auksynę AUX/IAA i czynniki transkrypcyjne AUXIN RESPONSE FACTOR (ARF). Aktywność genów kodujących niektóre elementy tego szlaku jest regulowana przez niskocząsteczkowe regulatorowe RNA, miRNA (micro RNA), i siRNA (short-interfering RNA), endogenne, niekodujące małe RNA (small RNA, sRNA) o długości 20-25 nukleotydów, różniące się sposobem powstawania (prekursorowymi molekułami i szlakami syntezy) oraz funkcją. Sekwencje TIR1 i AFB1-3 zawierają miejsce docelowe dla miR393 i drugorzędowe dla siTAAR. Transkrypt genu IAA28 jest celem dla miR847. Ekspresja genów: ARF10, ARF16 i ARF17 podlega bezpośredniej kontroli przez miR160, ARF6 i ARF8 przez miR167, natomiast ekspresja ARF2-4 podlega regulacji przez miR390 za pośrednictwem ta-siRNA pochodzącego z locus TAS3. sRNA wpływają przede wszystkim na lokalizację tkankową i czasową opisanych elementów szlaku auksynowego.

Auxin affects almost all of the growth and development processes in plants. The auxin signal transduction pathway involves a number of proteins, among which the key elements are: TAAR auxin receptors (TIR1 and AFB1-3), AUX/IAA auxin response repressors and Auxin Response Factor (ARF) transcription factors. The activity of genes encoding some components of this pathway is affected by regulatory low-molecular-weight RNAs - miRNA (micro RNA) and siRNA (short-interfering RNA) - endogenous non-coding 20-25 nucleotides long small RNA (sRNA), differing in the way of formation (precursor molecules and biosynthesis pathways) and function. TIR1 and AFB1-3 contain miR393 target sequence and siTAAR secondary target site. IAA28 transcripts are targeted by miR847. Expression of ARF10, ARF16 i ARF17 is directly controlled by miR160, ARF6 and ARF8 by miR167, and ARF2-4 indirectly by miR390 through TAS3-derived ta-siRNAs. sRNAs influence primarily the tissue and temporal localization of described components of the auxin signal transduction pathway.